27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_3088 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_3088  protein of unknown function DUF169  100 
 
 		 261 aa  536  1e-151  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2658  hypothetical protein  89.23 
 
 		 261 aa  478  1e-134  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0762202 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2693  hypothetical protein  88.14 
 
 		 263 aa  463  1e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0392853  normal  0.922392 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4610  hypothetical protein  85.04 
 
 		 261 aa  450  1e-125  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.166166 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4088  hypothetical protein  29.22 
 
 		 260 aa  99.8  4e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.284123 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1866  hypothetical protein  27.27 
 
 		 258 aa  88.2  1e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21020  hypothetical protein  26.38 
 
 		 250 aa  88.2  1e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000192212  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2553  hypothetical protein  29.11 
 
 		 269 aa  84.7  0.000000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1141  hypothetical protein  28.95 
 
 		 263 aa  75.5  0.0000000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0516  hypothetical protein  23.56 
 
 		 229 aa  60.8  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3467  hypothetical protein  23.11 
 
 		 229 aa  59.3  0.00000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.453769  hitchhiker  0.00174039 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0328  hypothetical protein  24.86 
 
 		 226 aa  58.9  0.00000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0220965  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0351  protein of unknown function DUF169  24.7 
 
 		 254 aa  58.9  0.00000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0211601  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0504  hypothetical protein  22.17 
 
 		 227 aa  51.6  0.00001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.798992  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2347  protein of unknown function DUF169  24.89 
 
 		 238 aa  51.2  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.547457  normal  0.341579 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0429  hypothetical protein  25.1 
 
 		 229 aa  49.3  0.00006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.97921 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0901  hypothetical protein  25.81 
 
 		 237 aa  49.3  0.00006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0078805  normal  0.30633 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0780  hypothetical protein  26.23 
 
 		 227 aa  48.9  0.00009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.664572  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0919  protein of unknown function DUF169  22.07 
 
 		 318 aa  45.4  0.0008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0942  hypothetical protein  25.25 
 
 		 230 aa  45.1  0.001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.988388  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0969  hypothetical protein  30.39 
 
 		 238 aa  44.3  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.853539  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1923  hypothetical protein  22.71 
 
 		 243 aa  43.9  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.154092  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1875  protein of unknown function DUF169  23.08 
 
 		 319 aa  43.1  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0581  hypothetical protein  24.41 
 
 		 236 aa  42.7  0.006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.213239  normal  0.0817202 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1034  hypothetical protein  24.11 
 
 		 230 aa  42.7  0.006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1771  hypothetical protein  24.11 
 
 		 230 aa  42.4  0.008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0910  hypothetical protein  24.11 
 
 		 230 aa  42.4  0.008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.836359 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>