More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_1261 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_1261  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  100 
 
 		 156 aa  312  9.999999999999999e-85  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.835969 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0555  cold-shock DNA-binding protein family protein  39.19 
 
 		 155 aa  102  2e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.804868  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4006  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  40.31 
 
 		 197 aa  102  3e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4209  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  38.76 
 
 		 197 aa  102  3e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2556  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  67.69 
 
 		 179 aa  100  6e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.115723  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51840  cold-shock protein  52.22 
 
 		 204 aa  99.8  1e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.192967  hitchhiker  0.0041484 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3069  cold-shock DNA-binding protein family protein  68.66 
 
 		 69 aa  98.2  4e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0986156  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4415  cold-shock DNA-binding protein  38.46 
 
 		 200 aa  97.8  5e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0245079  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1263  cold-shock DNA-binding protein family protein  42.62 
 
 		 205 aa  96.7  1e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.18948  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4547  cold-shock protein  62.5 
 
 		 203 aa  94.7  4e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1238  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  38.76 
 
 		 197 aa  94.4  5e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.267087  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39180  Cold-shock-like protein  67.69 
 
 		 69 aa  94  7e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.197755  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49410  cold-shock protein  65.67 
 
 		 69 aa  93.2  1e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000191939  normal  0.274128 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4220  cold-shock protein  65.67 
 
 		 69 aa  93.2  1e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0769  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  65.15 
 
 		 71 aa  92  3e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000056179  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2186  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  57.75 
 
 		 73 aa  90.9  7e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.541208  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2098  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  57.75 
 
 		 73 aa  90.9  7e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1543  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  63.49 
 
 		 68 aa  90.5  9e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1209  cold-shock domain-contain protein  64.06 
 
 		 91 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.953881  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3984  cold shock domain family protein  64.06 
 
 		 73 aa  89  2e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.231003  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1403  cold-shock protein, DNA-binding  64.06 
 
 		 73 aa  89  2e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.861967  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05396  hypothetical protein  56.72 
 
 		 69 aa  88.6  3e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1731  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  61.19 
 
 		 69 aa  88.2  4e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.0000000915529  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4356  cold-shock DNA-binding protein family protein  63.08 
 
 		 66 aa  87.8  5e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.184389 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0559  putative cold-shock protein  59.7 
 
 		 69 aa  87.4  7e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05960  putative cold-shock protein  59.7 
 
 		 69 aa  87.4  7e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.979044  normal  0.17642 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1085  cold-shock DNA-binding protein family protein  65.08 
 
 		 69 aa  87  8e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0927739  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4097  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  65.08 
 
 		 69 aa  87  8e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0272616  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1693  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  65.08 
 
 		 68 aa  87  9e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1522  cold shock protein CspA  63.49 
 
 		 69 aa  86.3  1e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.310546  normal  0.49084 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1127  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  63.49 
 
 		 69 aa  86.3  1e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.53927  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1110  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  59.7 
 
 		 69 aa  86.3  1e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0603017  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1614  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  63.49 
 
 		 68 aa  86.7  1e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.074349  hitchhiker  0.00762568 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4202  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  63.49 
 
 		 69 aa  86.3  1e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.713161  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1572  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  65.08 
 
 		 69 aa  86.3  1e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.259211  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2614  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  63.49 
 
 		 68 aa  86.7  1e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0114712 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1092  cold shock DNA-binding domain-containing protein  58.73 
 
 		 69 aa  86.7  1e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.000741991  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1894  cold-shock DNA-binding protein family protein  61.54 
 
 		 66 aa  86.7  1e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00218073  hitchhiker  0.000840233 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0792  cold shock protein  57.35 
 
 		 69 aa  85.9  2e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.000000912185  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2787  cold shock domain-contain protein  63.49 
 
 		 69 aa  85.5  2e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2659  cold-shock DNA-binding domain protein  63.49 
 
 		 69 aa  85.5  2e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00019694  hitchhiker  0.00182123 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1625  cold-shock DNA-binding domain protein  56.72 
 
 		 69 aa  85.9  2e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.778402  normal  0.204275 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2485  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  61.9 
 
 		 68 aa  85.9  2e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.109641  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3614  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  63.49 
 
 		 70 aa  86.3  2e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.44614  hitchhiker  0.00284754 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1748  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  63.49 
 
 		 69 aa  85.5  2e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000249775  normal  0.291294 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1705  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  63.49 
 
 		 69 aa  85.5  2e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000671273  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2052  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  61.9 
 
 		 68 aa  85.9  2e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0435864  normal  0.0231014 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2197  cold-shock DNA-binding domain protein  65.57 
 
 		 66 aa  85.5  2e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000000106738  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3612  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  66.67 
 
 		 68 aa  85.5  2e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00000433441  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2569  cold-shock DNA-binding protein family protein  63.49 
 
 		 69 aa  85.5  2e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.608616  normal  0.369821 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2338  cold-shock DNA-binding domain protein  34.92 
 
 		 143 aa  85.5  2e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00428193  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1708  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  63.49 
 
 		 69 aa  85.5  2e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000316023  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2285  cold-shock protein, DNA-binding  63.49 
 
 		 69 aa  85.9  2e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2407  cold-shock DNA-binding protein family protein  63.49 
 
 		 69 aa  85.5  2e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0284217  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2477  cold-shock DNA-binding protein family protein  63.49 
 
 		 69 aa  85.5  2e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.916903  normal  0.105419 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2536  cold-shock DNA-binding protein family protein  61.19 
 
 		 69 aa  85.9  2e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.532819  normal  0.0603654 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001460  cold shock protein CspE  58.73 
 
 		 69 aa  85.5  3e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1336  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  68.33 
 
 		 68 aa  85.5  3e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0244  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  58.82 
 
 		 69 aa  85.1  3e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1862  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  63.93 
 
 		 69 aa  85.1  3e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.861564  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2649  cold-shock DNA-binding domain protein  58.21 
 
 		 69 aa  85.5  3e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.139093  normal  0.222327 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1846  cold-shock DNA-binding protein family protein  56.72 
 
 		 69 aa  84.7  4e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.174737  normal  0.594257 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2133  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  56.72 
 
 		 69 aa  84.7  4e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.415341  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4529  cold shock DNA-binding domain-containing protein  63.33 
 
 		 68 aa  84.3  5e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4145  cold shock protein CapB  56.72 
 
 		 69 aa  84.3  5e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1505  cold-shock DNA-binding protein family protein  66.13 
 
 		 66 aa  84.7  5e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.248091  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1855  cold acclimation protein B  56.72 
 
 		 69 aa  84.3  5e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0386681  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3884  cold-shock protein, DNA-binding  56.72 
 
 		 69 aa  84.3  5e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.218294  normal  0.489383 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1201  cold-shock DNA-binding protein family protein  56.72 
 
 		 69 aa  84.3  5e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.227908 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21760  cold acclimation protein B  56.72 
 
 		 69 aa  84.3  5e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.342335  normal  0.456476 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1970  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  61.9 
 
 		 69 aa  84  6e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00428125  normal  0.0463669 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0755  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  61.67 
 
 		 68 aa  84  7e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4519  cold-shock DNA-binding protein family protein  60 
 
 		 66 aa  84  8e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3523  cold-shock DNA-binding protein family protein  56.72 
 
 		 70 aa  84  8e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.32154 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2955  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  65.57 
 
 		 68 aa  83.6  9e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1128  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  56.06 
 
 		 69 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1881  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  60.66 
 
 		 69 aa  83.2  0.000000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0395263  normal  0.068791 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11700  Cold shock domain family protein  56.72 
 
 		 70 aa  83.2  0.000000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0476912  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1407  cold-shock DNA-binding protein family protein  55.22 
 
 		 69 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0231172  normal  0.970454 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2609  cold-shock protein, DNA-binding  55.22 
 
 		 69 aa  83.2  0.000000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000617346  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4313  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  56.06 
 
 		 69 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1475  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  59.09 
 
 		 71 aa  82.8  0.000000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0207  cold-shock domain-contain protein  64.06 
 
 		 66 aa  82.4  0.000000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000092661  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0985  cold-shock domain-contain protein  53.73 
 
 		 165 aa  82.4  0.000000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.693181  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2017  cold-shock DNA-binding protein family protein  59.38 
 
 		 65 aa  82.4  0.000000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.679038  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4269  cold-shock DNA-binding protein family protein  63.08 
 
 		 67 aa  82.8  0.000000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0942  cold-shock DNA-binding protein family protein  61.9 
 
 		 71 aa  82.8  0.000000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3558  cold-shock DNA-binding protein family protein  56.92 
 
 		 69 aa  82.4  0.000000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.914458 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3760  cold-shock DNA-binding protein family protein  58.73 
 
 		 69 aa  82  0.000000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.780435  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1655  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  56.25 
 
 		 69 aa  82  0.000000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.260165  normal  0.588405 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3098  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  56.25 
 
 		 69 aa  82  0.000000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.208356  normal  0.0206903 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1512  cold shock protein CspB  62.3 
 
 		 65 aa  81.6  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0532666  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1484  cold shock protein  62.3 
 
 		 65 aa  81.6  0.000000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00463121  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2891  cold-shock DNA-binding domain protein  64.52 
 
 		 66 aa  82  0.000000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.87323e-28 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1629  cold shock protein CspB  62.3 
 
 		 65 aa  81.6  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1960  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  59.09 
 
 		 70 aa  82  0.000000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.507319  normal  0.106232 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1391  cold-shock DNA-binding domain protein  64.52 
 
 		 66 aa  81.6  0.000000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000000857842  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4019  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  60 
 
 		 66 aa  81.3  0.000000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000020604  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1057  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  61.67 
 
 		 68 aa  81.6  0.000000000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3009  cold-shock DNA-binding domain protein  62.5 
 
 		 66 aa  81.6  0.000000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000000338094  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>