136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_3553 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_3553  cytochrome c, class I  100 
 
 		 135 aa  274  3e-73  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000573518  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0296  cytochrome c2  50.53 
 
 		 145 aa  95.5  2e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.109332  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1940  cytochrome c, class I  50.53 
 
 		 145 aa  95.5  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.402903  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3443  cytochrome c, class I  42.74 
 
 		 155 aa  82.8  0.000000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.719104  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1020  cytochrome c, class I  42.45 
 
 		 135 aa  82  0.000000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3547  cytochrome c2  38.18 
 
 		 146 aa  79  0.00000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.421654  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0998  cytochrome c, class I  38.32 
 
 		 155 aa  75.9  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1937  cytochrome c, class I  36.11 
 
 		 155 aa  75.1  0.0000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00818219 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2801  cytochrome c  37.17 
 
 		 342 aa  71.2  0.000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.26281 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4156  cytochrome c, class I  39.64 
 
 		 382 aa  70.1  0.00000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.1533  normal  0.864347 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3169  cytochrome c2  47.37 
 
 		 126 aa  68.9  0.00000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1307  cytochrome c, class I  33.58 
 
 		 147 aa  66.2  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.806426 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2511  cytochrome c class I  30.83 
 
 		 132 aa  65.5  0.0000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.657545  normal  0.0330621 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0287  cytochrome c, class I  32.81 
 
 		 185 aa  64.3  0.0000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2424  cytochrome c class I  37.04 
 
 		 132 aa  63.9  0.0000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.385069 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1724  cytochrome c class I  35.77 
 
 		 139 aa  63.5  0.0000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.20972  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3076  cytochrome c class I  35 
 
 		 165 aa  63.2  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6426  cytochrome c2  33.57 
 
 		 144 aa  63.5  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3742  cytochrome c, class I  35.25 
 
 		 139 aa  62  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.443469  hitchhiker  0.000332538 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0620  cytochrome c, class I  35.19 
 
 		 147 aa  61.6  0.000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.363015  normal  0.813784 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2577  isocytochrome c2  35.78 
 
 		 144 aa  61.2  0.000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0148  cytochrome c, class I  32.73 
 
 		 148 aa  60.8  0.000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1235  cytochrome c, class I  35.78 
 
 		 144 aa  61.2  0.000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.978444 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4582  cytochrome c class I  32.43 
 
 		 228 aa  60.8  0.000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3987  cytochrome c, class I  36.09 
 
 		 139 aa  60.8  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.855884  normal  0.188367 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0468  cytochrome c, class I  34.23 
 
 		 296 aa  60.5  0.000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.610669  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0039  cytochrome c, membrane-bound  33.94 
 
 		 202 aa  60.1  0.00000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.450907  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA06950  electron carrier, putative  33.01 
 
 		 111 aa  59.7  0.00000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.073604  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0039  cytochrome c, membrane-bound  33.94 
 
 		 192 aa  59.7  0.00000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3944  cytochrome c class I  36.79 
 
 		 136 aa  60.1  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.696873  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2327  cytochrome c  33.58 
 
 		 119 aa  58.5  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3255  cytochrome c, class I  32.41 
 
 		 124 aa  58.5  0.00000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000474848  decreased coverage  0.000193536 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_15043  predicted protein  32.46 
 
 		 112 aa  58.2  0.00000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000188327  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1723  cytochrome c, class I  31.16 
 
 		 124 aa  57.8  0.00000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0621  cytochrome c, class I  35.45 
 
 		 212 aa  57.8  0.00000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.276705  normal  0.860065 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1946  cytochrome c, class I  34.62 
 
 		 143 aa  57  0.00000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.719262  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3648  cytochrome c class I  33 
 
 		 323 aa  56.2  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.238166  normal  0.256494 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4608  cytochrome c class I  31.65 
 
 		 120 aa  56.6  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0752945 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_20948  predicted protein  32.41 
 
 		 104 aa  56.2  0.0000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3426  cytochrome c class I  38.89 
 
 		 263 aa  56.6  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1618  cytochrome c class I  32.67 
 
 		 179 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.278765  normal  0.160763 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0817  cytochrome c, class I  34.62 
 
 		 149 aa  55.8  0.0000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.419035  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1792  cytochrome c class I  35.61 
 
 		 132 aa  55.1  0.0000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0298135  normal  0.587019 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3205  cytochrome c class I  29.01 
 
 		 143 aa  54.7  0.0000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.111252 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0513  cytochrome c class I  33.66 
 
 		 180 aa  54.7  0.0000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.702649  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1601  cytochrome c, class I  32.14 
 
 		 125 aa  54.7  0.0000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.402085 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_78490  cytochrome c  29.81 
 
 		 110 aa  54.7  0.0000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.635362  normal  0.967273 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3471  cytochrome c, class I  32.38 
 
 		 199 aa  55.1  0.0000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4103  cytochrome c class I  35.71 
 
 		 130 aa  54.7  0.0000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.721934  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3913  cytochrome c class I  30.52 
 
 		 182 aa  54.3  0.0000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4157  cytochrome c, class I  32.26 
 
 		 236 aa  54.7  0.0000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.362968  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2800  cytochrome c  26.62 
 
 		 235 aa  54.3  0.0000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.318955 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2269  cytochrome c class I  35 
 
 		 129 aa  53.9  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0688156  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0032  cytochrome c, class I  31.73 
 
 		 160 aa  53.9  0.0000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00501524  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3357  cytochrome c class I  33.96 
 
 		 179 aa  53.9  0.0000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.614662  normal  0.166545 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0016  cytochrome c class I  33.03 
 
 		 224 aa  53.9  0.0000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.6838  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2582  cytochrome c, class I  35.48 
 
 		 133 aa  53.5  0.0000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.170551 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0250  cytochrome c class I  31.73 
 
 		 220 aa  53.5  0.0000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.312298  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0174  cytochrome c2  30.47 
 
 		 131 aa  53.1  0.000001  Brucella suis 1330  Bacteria  hitchhiker  0.000396379  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4085  cytochrome c, class I  35.48 
 
 		 286 aa  52.8  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.699648  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1708  putative cytochrome c  29.46 
 
 		 135 aa  53.1  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.329257 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0153  cytochrome c heme-binding site:cytochrome c, class IA/ IB:cytochrome c, class I  30.47 
 
 		 131 aa  53.1  0.000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.00000226956  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0157  cytochrome c class I  29.13 
 
 		 133 aa  52.4  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3480  cytochrome c, class I  29.92 
 
 		 127 aa  52.4  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0240  putative cytochrome c  28.33 
 
 		 130 aa  51.6  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0011  cytochrome c class I  29.67 
 
 		 132 aa  51.6  0.000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0553485  normal  0.905582 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6323  cytochrome c class I  30.09 
 
 		 130 aa  51.2  0.000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1443  cytochrome c, class I  32.08 
 
 		 149 aa  50.8  0.000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2948  cytochrome c class I  32.67 
 
 		 130 aa  50.8  0.000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4215  cytochrome c class I  31.78 
 
 		 184 aa  50.4  0.000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.26019  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4687  cytochrome c, class I  31.13 
 
 		 209 aa  50.1  0.000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0285175  normal  0.266621 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1677  cytochrome C2  32.35 
 
 		 151 aa  49.7  0.00001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0377  cytochrome c, class I  31.31 
 
 		 184 aa  50.1  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3205  cytochrome c, class I  35.42 
 
 		 133 aa  49.7  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.983514  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3474  cytochrome c, class I  30.37 
 
 		 186 aa  50.1  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1946  cytochrome c, class I  32.69 
 
 		 151 aa  50.1  0.00001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3474  cytochrome c, class I  36.99 
 
 		 138 aa  50.1  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0293116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1661  cytochrome C  35.23 
 
 		 115 aa  50.1  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1172  cytochrome c class I  36.84 
 
 		 121 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.109894  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0488  cytochrome c, class I  27.35 
 
 		 169 aa  49.7  0.00001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00131648  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3480  cytochrome c, class I  31.88 
 
 		 154 aa  49.3  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.453541  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1769  cytochrome c, class I  31.73 
 
 		 183 aa  49.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.027087 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2595  cytochrome c class I  35.82 
 
 		 129 aa  48.9  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0211957  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0102  cytochrome c  32.14 
 
 		 185 aa  48.9  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.108181  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2099  cytochrome c, class I  28.46 
 
 		 123 aa  49.3  0.00002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3289  cytochrome c class I  29.81 
 
 		 169 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.181782  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0414  cytochrome c class I  31.2 
 
 		 126 aa  47.8  0.00005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.299698  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0473  cytochrome c  32.35 
 
 		 179 aa  47.4  0.00007  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.591637  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3032  cytochrome c class I  37.5 
 
 		 118 aa  47.4  0.00007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.289896  normal  0.0165662 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0860  cytochrome c class I  35.82 
 
 		 120 aa  47.4  0.00007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.425021 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1584  cytochrome c, class I  33.05 
 
 		 126 aa  47  0.00008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0893762  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0131  cytochrome c, class I  35.82 
 
 		 329 aa  47  0.00009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.320568  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00210  cytochrome C2  33.85 
 
 		 113 aa  47  0.00009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0011  cytochrome c class I  28.78 
 
 		 132 aa  46.6  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0678  cytochrome c, class I  28.85 
 
 		 173 aa  46.6  0.0001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4031  class I cytochrome c  28.75 
 
 		 129 aa  46.2  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.586339 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1835  cytochrome c, class I  27.45 
 
 		 166 aa  47  0.0001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.315382  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0712  cytochrome c, class I  33.02 
 
 		 184 aa  45.4  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.586308  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0327  cytochrome C, membrane-bound  29.41 
 
 		 172 aa  45.4  0.0002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3475  cytochrome c, class I  27.62 
 
 		 281 aa  45.8  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.234706  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>