135 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_0148 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_0148  cytochrome c, class I  100 
 
 
148 aa  301  3.0000000000000004e-81  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3547  cytochrome c2  63.19 
 
 
146 aa  176  1e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.421654  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0998  cytochrome c, class I  54.24 
 
 
155 aa  143  6e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0296  cytochrome c2  50 
 
 
145 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.109332  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1940  cytochrome c, class I  50 
 
 
145 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.402903  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3443  cytochrome c, class I  45.71 
 
 
155 aa  122  2e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.719104  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1937  cytochrome c, class I  35.25 
 
 
155 aa  92  3e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00818219 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3169  cytochrome c2  38.14 
 
 
126 aa  74.3  0.0000000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1020  cytochrome c, class I  28.83 
 
 
135 aa  72.4  0.000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4156  cytochrome c, class I  35.09 
 
 
382 aa  71.6  0.000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.1533  normal  0.864347 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2595  cytochrome c class I  32.14 
 
 
129 aa  70.5  0.000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0211957  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2800  cytochrome c  33.55 
 
 
235 aa  70.5  0.000000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.318955 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2424  cytochrome c class I  33.91 
 
 
132 aa  69.7  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.385069 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2801  cytochrome c  36.94 
 
 
342 aa  68.2  0.00000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.26281 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2269  cytochrome c class I  33.57 
 
 
129 aa  67.8  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0688156  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1724  cytochrome c class I  33.56 
 
 
139 aa  67.8  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.20972  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1946  cytochrome c, class I  35.45 
 
 
143 aa  67.8  0.00000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.719262  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2577  isocytochrome c2  34.78 
 
 
144 aa  65.9  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1235  cytochrome c, class I  34.78 
 
 
144 aa  65.9  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.978444 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1661  cytochrome C  34.51 
 
 
115 aa  66.2  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0414  cytochrome c class I  33.1 
 
 
126 aa  65.9  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.299698  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3553  cytochrome c, class I  30.3 
 
 
135 aa  65.1  0.0000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000573518  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4085  cytochrome c, class I  35.54 
 
 
286 aa  63.5  0.0000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.699648  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3742  cytochrome c, class I  29.86 
 
 
139 aa  63.5  0.0000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.443469  hitchhiker  0.000332538 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6426  cytochrome c2  31.79 
 
 
144 aa  63.2  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2582  cytochrome c, class I  32.12 
 
 
133 aa  62.4  0.000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.170551 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1307  cytochrome c, class I  31.47 
 
 
147 aa  62.4  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.806426 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3552  cytochrome c, class I  35 
 
 
128 aa  61.6  0.000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.296099 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3987  cytochrome c, class I  32.17 
 
 
139 aa  61.6  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.855884  normal  0.188367 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0174  cytochrome c2  37.76 
 
 
131 aa  60.5  0.000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  hitchhiker  0.000396379  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0153  cytochrome c heme-binding site:cytochrome c, class IA/ IB:cytochrome c, class I  37.76 
 
 
131 aa  60.5  0.000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.00000226956  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3474  cytochrome c, class I  32.5 
 
 
186 aa  60.1  0.000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3471  cytochrome c, class I  34.78 
 
 
199 aa  59.7  0.00000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3426  cytochrome c class I  34.75 
 
 
263 aa  60.1  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3076  cytochrome c class I  34.38 
 
 
165 aa  58.9  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2511  cytochrome c class I  29.17 
 
 
132 aa  58.9  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.657545  normal  0.0330621 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1172  cytochrome c class I  33.96 
 
 
121 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.109894  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0675  cytochrome c class I  34.29 
 
 
121 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1235  cytochrome c family protein  32.28 
 
 
185 aa  58.5  0.00000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0011  cytochrome c class I  34.43 
 
 
132 aa  58.5  0.00000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0553485  normal  0.905582 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3032  cytochrome c class I  37.35 
 
 
118 aa  58.2  0.00000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.289896  normal  0.0165662 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0039  cytochrome c, membrane-bound  31.09 
 
 
192 aa  58.2  0.00000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0039  cytochrome c, membrane-bound  31.09 
 
 
202 aa  57.8  0.00000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.450907  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1287  cytochrome c class I  40.7 
 
 
122 aa  57.8  0.00000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.208797  normal  0.579933 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0475  cytochrome c class I  33.09 
 
 
133 aa  57.4  0.00000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0712  cytochrome c, class I  31.67 
 
 
184 aa  56.6  0.0000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.586308  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1443  cytochrome c, class I  32.09 
 
 
149 aa  57  0.0000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1835  cytochrome c, class I  31.97 
 
 
166 aa  56.6  0.0000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.315382  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1601  cytochrome c, class I  32.35 
 
 
125 aa  56.6  0.0000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.402085 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0102  cytochrome c  31.36 
 
 
185 aa  55.5  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.108181  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0620  cytochrome c, class I  36.73 
 
 
147 aa  55.8  0.0000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.363015  normal  0.813784 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6323  cytochrome c class I  33.56 
 
 
130 aa  55.8  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0250  cytochrome c class I  31.4 
 
 
220 aa  55.1  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.312298  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0257  cytochrome c class I  35.42 
 
 
148 aa  55.5  0.0000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.466449  hitchhiker  0.00512389 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2670  cytochrome c class I  35.42 
 
 
148 aa  55.5  0.0000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.340076 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1618  cytochrome c class I  30.83 
 
 
179 aa  54.3  0.0000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.278765  normal  0.160763 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3944  cytochrome c class I  29.46 
 
 
136 aa  54.3  0.0000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.696873  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0431  cytochrome c, class I  37.5 
 
 
236 aa  54.3  0.0000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0016  cytochrome c class I  30.25 
 
 
224 aa  53.5  0.0000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.6838  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4085  cytochrome c class I  33.06 
 
 
188 aa  53.5  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_20948  predicted protein  29.57 
 
 
104 aa  52.8  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2553  cytochrome c, class I  35.04 
 
 
166 aa  52.8  0.000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0215476 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2922  cytochrome c, class I  30.07 
 
 
133 aa  52  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3480  cytochrome c, class I  36.27 
 
 
127 aa  52.4  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0488  cytochrome c, class I  29.13 
 
 
169 aa  52.8  0.000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00131648  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0513  cytochrome c class I  34.88 
 
 
180 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.702649  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0473  cytochrome c  29.17 
 
 
179 aa  51.6  0.000003  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.591637  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1791  cytochrome c class I  30.91 
 
 
224 aa  52  0.000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.147068  normal  0.48223 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3205  cytochrome c, class I  31.13 
 
 
133 aa  51.6  0.000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.983514  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4583  cytochrome c class I  35.44 
 
 
118 aa  51.6  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00400374  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1792  cytochrome c class I  27.74 
 
 
132 aa  51.2  0.000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0298135  normal  0.587019 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0817  cytochrome c, class I  32.95 
 
 
149 aa  50.8  0.000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.419035  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0240  putative cytochrome c  34.52 
 
 
130 aa  50.8  0.000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3864  cytochrome c, class I  34.17 
 
 
170 aa  50.8  0.000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.166005  normal  0.942386 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5367  cytochrome c class I  30 
 
 
224 aa  50.4  0.000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.503612  normal  0.846076 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_15043  predicted protein  31.03 
 
 
112 aa  50.4  0.000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000188327  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3070  WD-40 repeat protein  31.2 
 
 
438 aa  50.4  0.000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.444201  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4103  cytochrome c class I  26.87 
 
 
130 aa  50.4  0.000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.721934  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0705  cytochrome cy  29.2 
 
 
174 aa  50.4  0.000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.229097  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4405  cytochrome c class I  47.37 
 
 
187 aa  50.4  0.000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2360  cytochrome c, class I  29.2 
 
 
174 aa  50.4  0.000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.442911  normal  0.208879 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0621  cytochrome c, class I  32.54 
 
 
212 aa  50.1  0.00001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.276705  normal  0.860065 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1808  cytochrome c, class I  29.84 
 
 
176 aa  50.1  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.115108 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2962  cytochrome c class I  38.36 
 
 
448 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.832203  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2948  cytochrome c class I  28.21 
 
 
130 aa  49.7  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA06950  electron carrier, putative  31.11 
 
 
111 aa  49.3  0.00002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.073604  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1584  cytochrome c, class I  34.74 
 
 
126 aa  49.3  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0893762  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0157  cytochrome c class I  35.9 
 
 
133 aa  48.9  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0525  cytochrome c, class I  30 
 
 
175 aa  49.7  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0840816  normal  0.414033 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0654  cytochrome c552  33.06 
 
 
174 aa  48.9  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2844  WD-40 repeat-containing protein  30.4 
 
 
440 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1723  cytochrome c, class I  32.69 
 
 
124 aa  48.5  0.00003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4360  cytochrome c, class I  32.08 
 
 
235 aa  48.5  0.00003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4031  class I cytochrome c  36.14 
 
 
129 aa  48.5  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.586339 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_78490  cytochrome c  27.97 
 
 
110 aa  48.5  0.00003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.635362  normal  0.967273 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1708  putative cytochrome c  33.66 
 
 
135 aa  47.4  0.00007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.329257 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3205  cytochrome c class I  31.62 
 
 
143 aa  46.6  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.111252 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0287  cytochrome c, class I  31.86 
 
 
185 aa  46.6  0.0001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1880  cytochrome c, class I  35.71 
 
 
122 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0678  cytochrome c, class I  27.87 
 
 
173 aa  45.8  0.0002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>