159 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_1708 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_1708  putative cytochrome c  100 
 
 		 135 aa  278  1e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.329257 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1644  cytochrome c class I  49.46 
 
 		 133 aa  101  3e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.265287 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6323  cytochrome c class I  42.86 
 
 		 130 aa  96.3  1e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3205  cytochrome c class I  43.86 
 
 		 143 aa  92.4  2e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.111252 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3480  cytochrome c, class I  41.38 
 
 		 127 aa  90.1  8e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0817  cytochrome c, class I  40.29 
 
 		 149 aa  87.4  6e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.419035  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_15043  predicted protein  40.78 
 
 		 112 aa  83.6  8e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000188327  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0011  cytochrome c class I  41.49 
 
 		 132 aa  81.3  0.000000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4608  cytochrome c class I  41.94 
 
 		 120 aa  80.9  0.000000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0752945 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1172  cytochrome c class I  38.46 
 
 		 121 aa  79.3  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.109894  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA06950  electron carrier, putative  37.89 
 
 		 111 aa  78.6  0.00000000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.073604  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0651  cytochrome c oxidase assembly protein CtaG/Cox11  36.73 
 
 		 308 aa  78.2  0.00000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_78490  cytochrome c  37.14 
 
 		 110 aa  78.2  0.00000000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.635362  normal  0.967273 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4583  cytochrome c class I  43.62 
 
 		 118 aa  77  0.00000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00400374  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2800  cytochrome c  41.18 
 
 		 235 aa  77  0.00000000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.318955 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0675  cytochrome c class I  38.14 
 
 		 121 aa  76.3  0.0000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_20948  predicted protein  39.36 
 
 		 104 aa  75.9  0.0000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0414  cytochrome c class I  42.86 
 
 		 126 aa  75.1  0.0000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.299698  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1601  cytochrome c, class I  41.38 
 
 		 125 aa  75.1  0.0000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.402085 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3032  cytochrome c class I  41.49 
 
 		 118 aa  72.8  0.000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.289896  normal  0.0165662 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5367  cytochrome c class I  35 
 
 		 224 aa  72  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.503612  normal  0.846076 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3076  cytochrome c class I  37.5 
 
 		 165 aa  72.8  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0157  cytochrome c class I  41.38 
 
 		 133 aa  72  0.000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4157  cytochrome c, class I  34.96 
 
 		 236 aa  71.2  0.000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.362968  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0011  cytochrome c class I  34.41 
 
 		 132 aa  71.2  0.000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0553485  normal  0.905582 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1835  cytochrome c, class I  33.87 
 
 		 166 aa  70.9  0.000000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.315382  normal  1 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3471  cytochrome c, class I  37.62 
 
 		 199 aa  70.5  0.000000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2327  cytochrome c  38.1 
 
 		 119 aa  70.5  0.000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4138  cytochrome c, class I  42.05 
 
 		 133 aa  70.1  0.000000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0404  cytochrome c, class I  39.42 
 
 		 427 aa  69.7  0.00000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.06087  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1287  cytochrome c class I  39.77 
 
 		 122 aa  68.9  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.208797  normal  0.579933 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1584  cytochrome c, class I  33.08 
 
 		 126 aa  68.9  0.00000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0893762  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1946  cytochrome c, class I  41.76 
 
 		 143 aa  69.3  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.719262  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2577  isocytochrome c2  38.38 
 
 		 144 aa  68.2  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0240  putative cytochrome c  36.67 
 
 		 130 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4156  cytochrome c, class I  40.62 
 
 		 382 aa  68.2  0.00000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.1533  normal  0.864347 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1235  cytochrome c, class I  38.38 
 
 		 144 aa  68.2  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.978444 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3501  cytochrome c, class I  39.18 
 
 		 225 aa  68.2  0.00000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.466234 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1791  cytochrome c class I  35.65 
 
 		 224 aa  68.2  0.00000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.147068  normal  0.48223 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2099  cytochrome c, class I  34.26 
 
 		 123 aa  68.2  0.00000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0039  cytochrome c, membrane-bound  40 
 
 		 202 aa  67.8  0.00000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.450907  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2974  cytochrome c class I  41.38 
 
 		 124 aa  67.8  0.00000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.835842  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0287  cytochrome c, class I  38.14 
 
 		 185 aa  67.4  0.00000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0621  cytochrome c, class I  34.31 
 
 		 212 aa  67.4  0.00000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.276705  normal  0.860065 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0039  cytochrome c, membrane-bound  40 
 
 		 192 aa  67.4  0.00000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1792  cytochrome c class I  34.4 
 
 		 132 aa  67.4  0.00000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0298135  normal  0.587019 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0016  cytochrome c class I  40 
 
 		 224 aa  66.2  0.0000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.6838  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1723  cytochrome c, class I  33.33 
 
 		 124 aa  65.9  0.0000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4103  cytochrome c class I  36.19 
 
 		 130 aa  65.5  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.721934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4687  cytochrome c, class I  35.92 
 
 		 209 aa  65.5  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0285175  normal  0.266621 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2511  cytochrome c class I  34.96 
 
 		 132 aa  65.9  0.0000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.657545  normal  0.0330621 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1443  cytochrome c, class I  38.64 
 
 		 149 aa  64.7  0.0000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3648  cytochrome c class I  38.64 
 
 		 323 aa  64.7  0.0000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.238166  normal  0.256494 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1235  cytochrome c family protein  37.5 
 
 		 185 aa  64.7  0.0000000004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4085  cytochrome c, class I  39 
 
 		 286 aa  64.7  0.0000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.699648  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0644  cytochrome c, class I  31.58 
 
 		 474 aa  64.3  0.0000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.865539  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2126  cytochrome c, class I  34.65 
 
 		 140 aa  63.9  0.0000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00970187  hitchhiker  0.00260519 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3817  cytochrome c, class I  35.14 
 
 		 127 aa  63.9  0.0000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.376417  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3255  cytochrome c, class I  40.86 
 
 		 124 aa  63.9  0.0000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000474848  decreased coverage  0.000193536 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3357  cytochrome c class I  36.78 
 
 		 179 aa  63.9  0.0000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.614662  normal  0.166545 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2269  cytochrome c class I  39.18 
 
 		 129 aa  63.5  0.0000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0688156  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0860  cytochrome c class I  40.23 
 
 		 120 aa  63.5  0.0000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.425021 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0885  cytochrome c class I  40.23 
 
 		 120 aa  63.5  0.0000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.752679 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3475  cytochrome c, class I  38.3 
 
 		 281 aa  63.5  0.000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.234706  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3944  cytochrome c class I  36.67 
 
 		 136 aa  63.2  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.696873  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2424  cytochrome c class I  34.81 
 
 		 132 aa  63.2  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.385069 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0174  cytochrome c2  32.98 
 
 		 131 aa  62.4  0.000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  hitchhiker  0.000396379  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2595  cytochrome c class I  37.11 
 
 		 129 aa  62  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0211957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0153  cytochrome c heme-binding site:cytochrome c, class IA/ IB:cytochrome c, class I  32.98 
 
 		 131 aa  62.4  0.000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.00000226956  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0250  cytochrome c class I  35.56 
 
 		 220 aa  62.4  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.312298  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0513  cytochrome c class I  35.23 
 
 		 180 aa  62  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.702649  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4360  cytochrome c, class I  36.67 
 
 		 235 aa  62  0.000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1618  cytochrome c class I  36.36 
 
 		 179 aa  61.6  0.000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.278765  normal  0.160763 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2218  cytochrome c class I  33.66 
 
 		 132 aa  62  0.000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.925658 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0924  cytochrome c class I  39.08 
 
 		 120 aa  61.6  0.000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.269512  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2922  cytochrome c, class I  36.08 
 
 		 133 aa  60.8  0.000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2670  cytochrome c class I  33.33 
 
 		 148 aa  61.2  0.000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.340076 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0257  cytochrome c class I  33.33 
 
 		 148 aa  61.2  0.000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.466449  hitchhiker  0.00512389 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1769  cytochrome c, class I  33.33 
 
 		 183 aa  60.8  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.027087 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0420  cytochrome c class I  36.05 
 
 		 307 aa  60.8  0.000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.556176  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3426  cytochrome c class I  34 
 
 		 263 aa  60.5  0.000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3439  cytochrome c2  32.04 
 
 		 126 aa  59.7  0.00000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3552  cytochrome c, class I  29.91 
 
 		 128 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.296099 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2801  cytochrome c  33.08 
 
 		 342 aa  59.7  0.00000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.26281 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0468  cytochrome c, class I  37.5 
 
 		 296 aa  60.1  0.00000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.610669  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0377  cytochrome c, class I  39.29 
 
 		 184 aa  59.7  0.00000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2070  cytochrome c2  28.12 
 
 		 122 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.170009  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6382  cytochrome c class I  37 
 
 		 131 aa  59.3  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.832746  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00210  cytochrome C2  36.45 
 
 		 113 aa  59.3  0.00000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2672  hypothetical protein  36.84 
 
 		 139 aa  59.3  0.00000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0619272  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3474  cytochrome c, class I  33.33 
 
 		 186 aa  58.9  0.00000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4215  cytochrome c class I  33.33 
 
 		 184 aa  59.3  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.26019  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4031  class I cytochrome c  30.85 
 
 		 129 aa  58.5  0.00000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.586339 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3913  cytochrome c class I  34.09 
 
 		 182 aa  58.5  0.00000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0032  cytochrome c, class I  33.72 
 
 		 160 aa  58.2  0.00000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00501524  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2411  cytochrome c, class I  29.06 
 
 		 121 aa  58.2  0.00000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0911024 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2582  cytochrome c, class I  25.47 
 
 		 133 aa  57.8  0.00000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.170551 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4131  cytochrome c, class I  36.36 
 
 		 146 aa  57.8  0.00000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.102323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2948  cytochrome c class I  34.11 
 
 		 130 aa  57.4  0.00000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2440  WD-40 repeat-containing protein  37.08 
 
 		 433 aa  57.4  0.00000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00410064  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>