197 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_3817 on replicon NC_009427
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009427  Saro_3817  cytochrome c, class I  100 
 
 
127 aa  250  4.0000000000000004e-66  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.376417  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2099  cytochrome c, class I  52.17 
 
 
123 aa  114  6e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3480  cytochrome c, class I  50 
 
 
127 aa  111  3e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3471  cytochrome c, class I  49.04 
 
 
199 aa  105  2e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1723  cytochrome c, class I  45.61 
 
 
124 aa  104  4e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0414  cytochrome c class I  52.53 
 
 
126 aa  100  8e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.299698  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1601  cytochrome c, class I  48.48 
 
 
125 aa  100  8e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.402085 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3255  cytochrome c, class I  55.79 
 
 
124 aa  98.2  3e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000474848  decreased coverage  0.000193536 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0621  cytochrome c, class I  46.09 
 
 
212 aa  96.7  1e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.276705  normal  0.860065 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3076  cytochrome c class I  47.96 
 
 
165 aa  96.7  1e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0817  cytochrome c, class I  49.04 
 
 
149 aa  93.6  8e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.419035  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4583  cytochrome c class I  47.37 
 
 
118 aa  93.6  8e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00400374  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4031  class I cytochrome c  47.52 
 
 
129 aa  93.2  1e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.586339 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4131  cytochrome c, class I  50.52 
 
 
146 aa  92  2e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.102323  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3501  cytochrome c, class I  41.32 
 
 
225 aa  92  2e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.466234 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1287  cytochrome c class I  49.48 
 
 
122 aa  92.8  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.208797  normal  0.579933 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0468  cytochrome c, class I  51.04 
 
 
296 aa  91.7  3e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.610669  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0257  cytochrome c class I  41.32 
 
 
148 aa  91.7  3e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.466449  hitchhiker  0.00512389 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2670  cytochrome c class I  41.32 
 
 
148 aa  91.7  3e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.340076 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1835  cytochrome c, class I  39.5 
 
 
166 aa  90.9  5e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.315382  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3032  cytochrome c class I  44.44 
 
 
118 aa  90.9  5e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.289896  normal  0.0165662 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1172  cytochrome c class I  43.7 
 
 
121 aa  90.5  8e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.109894  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5367  cytochrome c class I  41.46 
 
 
224 aa  89.4  1e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.503612  normal  0.846076 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0032  cytochrome c, class I  43.18 
 
 
160 aa  89  2e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00501524  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0131  cytochrome c, class I  42.31 
 
 
329 aa  89.4  2e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.320568  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1791  cytochrome c class I  42.28 
 
 
224 aa  89.4  2e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.147068  normal  0.48223 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1792  cytochrome c class I  41.41 
 
 
132 aa  88.2  3e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0298135  normal  0.587019 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0675  cytochrome c class I  42.62 
 
 
121 aa  88.6  3e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4360  cytochrome c, class I  43.75 
 
 
235 aa  87.8  4e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4085  cytochrome c, class I  42.99 
 
 
286 aa  88.2  4e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.699648  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1946  cytochrome c, class I  46 
 
 
143 aa  87.4  6e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.719262  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3480  cytochrome c, class I  44.55 
 
 
154 aa  86.7  9e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.453541  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0039  cytochrome c, membrane-bound  44.34 
 
 
202 aa  86.3  1e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.450907  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4138  cytochrome c, class I  38.71 
 
 
133 aa  86.3  1e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2974  cytochrome c class I  45.83 
 
 
124 aa  85.9  2e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.835842  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0678  cytochrome c, class I  34.81 
 
 
173 aa  85.5  2e-16  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3552  cytochrome c, class I  39.32 
 
 
128 aa  85.9  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.296099 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0654  cytochrome c552  43 
 
 
174 aa  85.5  2e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0039  cytochrome c, membrane-bound  44.34 
 
 
192 aa  85.9  2e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4103  cytochrome c class I  37.9 
 
 
130 aa  85.1  3e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.721934  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3913  cytochrome c class I  45.1 
 
 
182 aa  85.1  3e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6382  cytochrome c class I  43.16 
 
 
131 aa  85.1  3e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.832746  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1584  cytochrome c, class I  38.46 
 
 
126 aa  84.3  4e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0893762  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0651  cytochrome c oxidase assembly protein CtaG/Cox11  46.46 
 
 
308 aa  84.3  4e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_78490  cytochrome c  40.62 
 
 
110 aa  84.7  4e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.635362  normal  0.967273 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0174  cytochrome c2  35 
 
 
131 aa  84.3  5e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  hitchhiker  0.000396379  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4608  cytochrome c class I  47.42 
 
 
120 aa  84.3  5e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0752945 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3944  cytochrome c class I  46.32 
 
 
136 aa  84.3  5e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.696873  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0153  cytochrome c heme-binding site:cytochrome c, class IA/ IB:cytochrome c, class I  35 
 
 
131 aa  84.3  5e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.00000226956  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4687  cytochrome c, class I  47.47 
 
 
209 aa  84.3  6e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0285175  normal  0.266621 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0327  cytochrome C, membrane-bound  42.16 
 
 
172 aa  84  6e-16  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0860  cytochrome c class I  45.74 
 
 
120 aa  84  7e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.425021 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0924  cytochrome c class I  45.74 
 
 
120 aa  84  7e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.269512  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2411  cytochrome c, class I  38.98 
 
 
121 aa  83.6  9e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0911024 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2577  isocytochrome c2  42.31 
 
 
144 aa  82.8  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3864  cytochrome c, class I  40.4 
 
 
170 aa  83.2  0.000000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.166005  normal  0.942386 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0885  cytochrome c class I  44.68 
 
 
120 aa  82.8  0.000000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.752679 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2961  cytochrome c class I  44.12 
 
 
113 aa  83.2  0.000000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0666033  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1235  cytochrome c, class I  42.31 
 
 
144 aa  82.8  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.978444 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0011  cytochrome c class I  37.5 
 
 
132 aa  83.2  0.000000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0553485  normal  0.905582 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2582  cytochrome c, class I  31.75 
 
 
133 aa  82  0.000000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.170551 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3651  cytochrome c, class I  43.88 
 
 
158 aa  82  0.000000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.278584  normal 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_15043  predicted protein  42 
 
 
112 aa  82  0.000000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000188327  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3439  cytochrome c2  34.45 
 
 
126 aa  82  0.000000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0016  cytochrome c class I  42.45 
 
 
224 aa  80.9  0.000000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.6838  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1618  cytochrome c class I  40.78 
 
 
179 aa  80.9  0.000000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.278765  normal  0.160763 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2595  cytochrome c class I  35.2 
 
 
129 aa  80.9  0.000000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0211957  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2511  cytochrome c class I  39.52 
 
 
132 aa  80.9  0.000000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.657545  normal  0.0330621 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3426  cytochrome c class I  38.32 
 
 
263 aa  80.5  0.000000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA06950  electron carrier, putative  39.62 
 
 
111 aa  80.5  0.000000000000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.073604  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2327  cytochrome c  39.18 
 
 
119 aa  80.1  0.000000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0705  cytochrome cy  44.9 
 
 
174 aa  79.7  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.229097  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4582  cytochrome c class I  40.91 
 
 
228 aa  79.7  0.00000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2360  cytochrome c, class I  44.9 
 
 
174 aa  79.7  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.442911  normal  0.208879 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2126  cytochrome c, class I  36.36 
 
 
140 aa  79  0.00000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00970187  hitchhiker  0.00260519 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2269  cytochrome c class I  35.2 
 
 
129 aa  79.3  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0688156  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0157  cytochrome c class I  44.55 
 
 
133 aa  79  0.00000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2922  cytochrome c, class I  39.02 
 
 
133 aa  79.3  0.00000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0250  cytochrome c class I  39.22 
 
 
220 aa  79  0.00000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.312298  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2800  cytochrome c  35.71 
 
 
235 aa  79.3  0.00000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.318955 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0513  cytochrome c class I  38.83 
 
 
180 aa  78.6  0.00000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.702649  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_20948  predicted protein  40.62 
 
 
104 aa  78.2  0.00000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4157  cytochrome c, class I  38.35 
 
 
236 aa  78.2  0.00000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.362968  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0102  cytochrome c  38.32 
 
 
185 aa  78.2  0.00000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.108181  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3357  cytochrome c class I  41.18 
 
 
179 aa  78.2  0.00000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.614662  normal  0.166545 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0488  cytochrome c, class I  33.6 
 
 
169 aa  77.8  0.00000000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00131648  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0341  cytochrome c class I  41.75 
 
 
305 aa  78.2  0.00000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0386  cytochrome c class I  41.75 
 
 
305 aa  78.2  0.00000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0274347  normal  0.666851 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3289  cytochrome c class I  46 
 
 
169 aa  77.8  0.00000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.181782  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2553  cytochrome c, class I  40.4 
 
 
166 aa  77.4  0.00000000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0215476 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0620  cytochrome c, class I  43.43 
 
 
147 aa  77.4  0.00000000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.363015  normal  0.813784 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4405  cytochrome c class I  41.12 
 
 
187 aa  77.4  0.00000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2424  cytochrome c class I  33.88 
 
 
132 aa  77  0.00000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.385069 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4085  cytochrome c class I  41.12 
 
 
188 aa  77.4  0.00000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0473  cytochrome c  37.86 
 
 
179 aa  77.4  0.00000000000007  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.591637  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0240  putative cytochrome c  41.38 
 
 
130 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3648  cytochrome c class I  39.6 
 
 
323 aa  76.3  0.0000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.238166  normal  0.256494 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1235  cytochrome c family protein  40.2 
 
 
185 aa  76.3  0.0000000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0525  cytochrome c, class I  41.75 
 
 
175 aa  76.3  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0840816  normal  0.414033 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1769  cytochrome c, class I  37.86 
 
 
183 aa  75.9  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.027087 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>