156 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_0420 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_0420  cytochrome c class I  100 
 
 		 307 aa  603  1.0000000000000001e-171  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.556176  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0386  cytochrome c class I  87.12 
 
 		 305 aa  483  1e-135  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0274347  normal  0.666851 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0341  cytochrome c class I  86.78 
 
 		 305 aa  483  1e-135  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3648  cytochrome c class I  63.36 
 
 		 323 aa  275  5e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.238166  normal  0.256494 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1618  cytochrome c class I  64.97 
 
 		 179 aa  241  1e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.278765  normal  0.160763 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0513  cytochrome c class I  64.04 
 
 		 180 aa  230  2e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.702649  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3913  cytochrome c class I  54.14 
 
 		 182 aa  190  2e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3357  cytochrome c class I  50.85 
 
 		 179 aa  178  9e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.614662  normal  0.166545 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0250  cytochrome c class I  41.85 
 
 		 220 aa  173  3.9999999999999995e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.312298  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4085  cytochrome c, class I  50.28 
 
 		 286 aa  172  5e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.699648  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4215  cytochrome c class I  47.28 
 
 		 184 aa  172  7.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.26019  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1769  cytochrome c, class I  49.18 
 
 		 183 aa  165  6.9999999999999995e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.027087 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0473  cytochrome c  43.82 
 
 		 179 aa  160  3e-38  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.591637  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3536  cytochrome c, class I  48.63 
 
 		 183 aa  159  8e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.347775  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0678  cytochrome c, class I  42.77 
 
 		 173 aa  153  2.9999999999999998e-36  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3730  cytochrome c, class I  47.83 
 
 		 184 aa  150  2e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0327  cytochrome C, membrane-bound  44.25 
 
 		 172 aa  148  9e-35  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0803  cytochrome c family protein  46.5 
 
 		 158 aa  148  1.0000000000000001e-34  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0039  cytochrome c, membrane-bound  44.5 
 
 		 202 aa  148  1.0000000000000001e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.450907  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3426  cytochrome c class I  47.09 
 
 		 263 aa  148  1.0000000000000001e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7056  cytochrome c  46.15 
 
 		 182 aa  146  5e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.654005  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3474  cytochrome c, class I  43.26 
 
 		 186 aa  143  3e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0016  cytochrome c class I  44.32 
 
 		 224 aa  144  3e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.6838  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0039  cytochrome c, membrane-bound  44.97 
 
 		 192 aa  142  5e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0102  cytochrome c  46.2 
 
 		 185 aa  142  7e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.108181  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0431  cytochrome c, class I  42.16 
 
 		 236 aa  141  9.999999999999999e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4085  cytochrome c class I  46.7 
 
 		 188 aa  140  3e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0377  cytochrome c, class I  42.93 
 
 		 184 aa  138  1e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4405  cytochrome c class I  46.41 
 
 		 187 aa  132  6e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0287  cytochrome c, class I  38.04 
 
 		 185 aa  132  6.999999999999999e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0712  cytochrome c, class I  46.82 
 
 		 184 aa  130  2.0000000000000002e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.586308  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2631  cytochrome c class I  47.51 
 
 		 181 aa  127  2.0000000000000002e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.292913 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1443  cytochrome c, class I  47.41 
 
 		 149 aa  123  5e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0621  cytochrome c, class I  38.55 
 
 		 212 aa  120  3e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.276705  normal  0.860065 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4687  cytochrome c, class I  50.42 
 
 		 209 aa  120  3e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0285175  normal  0.266621 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2553  cytochrome c, class I  38.1 
 
 		 166 aa  105  6e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0215476 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0468  cytochrome c, class I  48.31 
 
 		 296 aa  105  7e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.610669  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1808  cytochrome c, class I  41.71 
 
 		 176 aa  103  4e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.115108 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0654  cytochrome c552  38.95 
 
 		 174 aa  102  7e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3864  cytochrome c, class I  38.6 
 
 		 170 aa  99.4  6e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.166005  normal  0.942386 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0644  cytochrome c, class I  33.7 
 
 		 474 aa  99  8e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.865539  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1235  cytochrome c family protein  37.93 
 
 		 185 aa  98.2  1e-19  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4582  cytochrome c class I  34.29 
 
 		 228 aa  91.7  2e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_20948  predicted protein  44.83 
 
 		 104 aa  89.4  7e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1835  cytochrome c, class I  34.78 
 
 		 166 aa  89.4  7e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.315382  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_78490  cytochrome c  43.53 
 
 		 110 aa  88.6  1e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.635362  normal  0.967273 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0620  cytochrome c, class I  39.67 
 
 		 147 aa  87.8  2e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.363015  normal  0.813784 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3076  cytochrome c class I  37 
 
 		 165 aa  87.8  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_15043  predicted protein  48.84 
 
 		 112 aa  87.8  2e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000188327  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA06950  electron carrier, putative  44.33 
 
 		 111 aa  85.9  7e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.073604  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3032  cytochrome c class I  47.13 
 
 		 118 aa  85.9  9e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.289896  normal  0.0165662 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4583  cytochrome c class I  48.28 
 
 		 118 aa  85.1  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00400374  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1172  cytochrome c class I  46.07 
 
 		 121 aa  84.3  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.109894  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4157  cytochrome c, class I  38.89 
 
 		 236 aa  84.7  0.000000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.362968  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0675  cytochrome c class I  45 
 
 		 121 aa  83.2  0.000000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1946  cytochrome c, class I  44 
 
 		 143 aa  82.4  0.000000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.719262  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2974  cytochrome c class I  43.3 
 
 		 124 aa  82.4  0.000000000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.835842  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2577  isocytochrome c2  44 
 
 		 144 aa  82  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1235  cytochrome c, class I  44 
 
 		 144 aa  82  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.978444 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0525  cytochrome c, class I  38.29 
 
 		 175 aa  82  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0840816  normal  0.414033 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4156  cytochrome c, class I  48.39 
 
 		 382 aa  81.3  0.00000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.1533  normal  0.864347 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2800  cytochrome c  33.62 
 
 		 235 aa  80.5  0.00000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.318955 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3471  cytochrome c, class I  45.1 
 
 		 199 aa  80.1  0.00000000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1791  cytochrome c class I  38.39 
 
 		 224 aa  78.6  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.147068  normal  0.48223 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3944  cytochrome c class I  43.01 
 
 		 136 aa  78.6  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.696873  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2099  cytochrome c, class I  42.16 
 
 		 123 aa  78.2  0.0000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0257  cytochrome c class I  35.51 
 
 		 148 aa  78.2  0.0000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.466449  hitchhiker  0.00512389 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2670  cytochrome c class I  35.51 
 
 		 148 aa  78.2  0.0000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.340076 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1287  cytochrome c class I  47.67 
 
 		 122 aa  77  0.0000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.208797  normal  0.579933 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0705  cytochrome cy  45.05 
 
 		 174 aa  77  0.0000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.229097  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2360  cytochrome c, class I  45.05 
 
 		 174 aa  77  0.0000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.442911  normal  0.208879 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3255  cytochrome c, class I  44.21 
 
 		 124 aa  76.6  0.0000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000474848  decreased coverage  0.000193536 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1601  cytochrome c, class I  37.25 
 
 		 125 aa  76.3  0.0000000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.402085 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1020  cytochrome c, class I  39.22 
 
 		 135 aa  75.9  0.0000000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0817  cytochrome c, class I  41.82 
 
 		 149 aa  75.1  0.000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.419035  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2218  cytochrome c class I  40.91 
 
 		 132 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.925658 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0240  putative cytochrome c  37.62 
 
 		 130 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3817  cytochrome c, class I  38.83 
 
 		 127 aa  74.7  0.000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.376417  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0414  cytochrome c class I  38.18 
 
 		 126 aa  74.3  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.299698  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1723  cytochrome c, class I  34.29 
 
 		 124 aa  73.9  0.000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2582  cytochrome c, class I  37.17 
 
 		 133 aa  73.6  0.000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.170551 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2327  cytochrome c  39.13 
 
 		 119 aa  73.6  0.000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2511  cytochrome c class I  36.07 
 
 		 132 aa  73.2  0.000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.657545  normal  0.0330621 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2595  cytochrome c class I  42.72 
 
 		 129 aa  72.4  0.000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0211957  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2269  cytochrome c class I  42.72 
 
 		 129 aa  72  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0688156  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1792  cytochrome c class I  41.75 
 
 		 132 aa  72.4  0.00000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0298135  normal  0.587019 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3289  cytochrome c class I  36.27 
 
 		 169 aa  70.9  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.181782  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0011  cytochrome c class I  44.19 
 
 		 132 aa  71.2  0.00000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4103  cytochrome c class I  43.27 
 
 		 130 aa  70.9  0.00000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.721934  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0100  cytochrome c class I  36.99 
 
 		 175 aa  70.1  0.00000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.102431  normal  0.12668 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2424  cytochrome c class I  39.83 
 
 		 132 aa  70.1  0.00000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.385069 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5367  cytochrome c class I  35.4 
 
 		 224 aa  70.5  0.00000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.503612  normal  0.846076 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0011  cytochrome c class I  35.58 
 
 		 132 aa  70.1  0.00000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0553485  normal  0.905582 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2922  cytochrome c, class I  40.95 
 
 		 133 aa  70.1  0.00000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4138  cytochrome c, class I  35.05 
 
 		 133 aa  68.9  0.0000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0131  cytochrome c, class I  35.11 
 
 		 329 aa  68.6  0.0000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.320568  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3501  cytochrome c, class I  36.27 
 
 		 225 aa  67.8  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.466234 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0885  cytochrome c class I  42.22 
 
 		 120 aa  67.4  0.0000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.752679 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0924  cytochrome c class I  42.22 
 
 		 120 aa  67.4  0.0000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.269512  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0860  cytochrome c class I  42.22 
 
 		 120 aa  67  0.0000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.425021 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>