167 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BRA0174 on replicon NC_004311
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004311  BRA0174  cytochrome c2  100 
 
 
131 aa  268  2e-71  Brucella suis 1330  Bacteria  hitchhiker  0.000396379  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0153  cytochrome c heme-binding site:cytochrome c, class IA/ IB:cytochrome c, class I  100 
 
 
131 aa  268  2e-71  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.00000226956  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2582  cytochrome c, class I  54.33 
 
 
133 aa  154  5.0000000000000005e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.170551 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3205  cytochrome c, class I  52.76 
 
 
133 aa  140  4e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.983514  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0257  cytochrome c class I  52.25 
 
 
148 aa  134  5e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.466449  hitchhiker  0.00512389 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2670  cytochrome c class I  52.25 
 
 
148 aa  134  5e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.340076 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0011  cytochrome c class I  54.95 
 
 
132 aa  133  7.000000000000001e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0553485  normal  0.905582 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1661  cytochrome C  59.22 
 
 
115 aa  132  9.999999999999999e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3552  cytochrome c, class I  45.9 
 
 
128 aa  122  2e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.296099 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1287  cytochrome c class I  52.88 
 
 
122 aa  112  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.208797  normal  0.579933 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3032  cytochrome c class I  51.55 
 
 
118 aa  111  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.289896  normal  0.0165662 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4583  cytochrome c class I  54.84 
 
 
118 aa  110  5e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00400374  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1172  cytochrome c class I  45.38 
 
 
121 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.109894  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0011  cytochrome c class I  49.04 
 
 
132 aa  108  3e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2511  cytochrome c class I  43.31 
 
 
132 aa  107  4.0000000000000004e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.657545  normal  0.0330621 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3480  cytochrome c, class I  43 
 
 
154 aa  107  6e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.453541  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0675  cytochrome c class I  46.49 
 
 
121 aa  106  9.000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2070  cytochrome c2  46.6 
 
 
122 aa  103  7e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.170009  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4031  class I cytochrome c  40 
 
 
129 aa  102  2e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.586339 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3169  cytochrome c2  44.66 
 
 
126 aa  102  2e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1880  cytochrome c, class I  45.36 
 
 
122 aa  100  8e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2595  cytochrome c class I  43.4 
 
 
129 aa  99  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0211957  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2948  cytochrome c class I  39.53 
 
 
130 aa  99.4  2e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2801  cytochrome c  39.39 
 
 
342 aa  98.6  3e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.26281 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_20948  predicted protein  50 
 
 
104 aa  98.6  3e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2269  cytochrome c class I  44.34 
 
 
129 aa  97.4  6e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0688156  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4156  cytochrome c, class I  43.14 
 
 
382 aa  97.1  7e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.1533  normal  0.864347 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_15043  predicted protein  46.6 
 
 
112 aa  96.7  1e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000188327  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4103  cytochrome c class I  39.85 
 
 
130 aa  95.5  2e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.721934  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1792  cytochrome c class I  39.85 
 
 
132 aa  95.5  2e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0298135  normal  0.587019 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4360  cytochrome c, class I  39.82 
 
 
235 aa  95.1  3e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1946  cytochrome c, class I  40.59 
 
 
143 aa  94.7  3e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.719262  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1307  cytochrome c, class I  36.03 
 
 
147 aa  94.7  4e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.806426 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2800  cytochrome c  38.24 
 
 
235 aa  94  5e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.318955 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0860  cytochrome c class I  43.1 
 
 
120 aa  94  6e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.425021 
 
 
-
 
NC_006670  CNA06950  electron carrier, putative  42.42 
 
 
111 aa  92.8  1e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.073604  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2577  isocytochrome c2  38.1 
 
 
144 aa  93.2  1e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3076  cytochrome c class I  39.37 
 
 
165 aa  93.2  1e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1235  cytochrome c, class I  38.1 
 
 
144 aa  93.2  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.978444 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6323  cytochrome c class I  38.71 
 
 
130 aa  93.2  1e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0885  cytochrome c class I  46.81 
 
 
120 aa  92.4  2e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.752679 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0924  cytochrome c class I  46.81 
 
 
120 aa  92  2e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.269512  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2424  cytochrome c class I  38.93 
 
 
132 aa  92.4  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.385069 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2099  cytochrome c, class I  35.9 
 
 
123 aa  91.3  4e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4157  cytochrome c, class I  40.16 
 
 
236 aa  90.5  6e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.362968  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3944  cytochrome c class I  40.21 
 
 
136 aa  90.5  7e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.696873  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2961  cytochrome c class I  43 
 
 
113 aa  89.4  1e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0666033  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3501  cytochrome c, class I  36.89 
 
 
225 aa  90.1  1e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.466234 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_78490  cytochrome c  43.53 
 
 
110 aa  89.4  1e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.635362  normal  0.967273 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6382  cytochrome c class I  42.86 
 
 
131 aa  89.7  1e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.832746  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3651  cytochrome c, class I  44.9 
 
 
158 aa  89.4  2e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.278584  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1601  cytochrome c, class I  36.94 
 
 
125 aa  87.8  4e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.402085 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1791  cytochrome c class I  35.43 
 
 
224 aa  87.4  6e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.147068  normal  0.48223 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2327  cytochrome c  37.5 
 
 
119 aa  87  7e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0032  cytochrome c, class I  40.23 
 
 
160 aa  85.9  2e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00501524  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1723  cytochrome c, class I  37.7 
 
 
124 aa  85.9  2e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6426  cytochrome c2  35 
 
 
144 aa  85.9  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0039  cytochrome c, membrane-bound  41.67 
 
 
192 aa  84.7  3e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0039  cytochrome c, membrane-bound  41.67 
 
 
202 aa  84.7  4e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.450907  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0240  putative cytochrome c  34 
 
 
130 aa  84.3  4e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3817  cytochrome c, class I  35 
 
 
127 aa  84.3  5e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.376417  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1808  cytochrome c, class I  40.74 
 
 
176 aa  84  6e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.115108 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4138  cytochrome c, class I  37.25 
 
 
133 aa  83.2  0.000000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3471  cytochrome c, class I  36.44 
 
 
199 aa  83.2  0.000000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0131  cytochrome c, class I  38.18 
 
 
329 aa  82  0.000000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.320568  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5367  cytochrome c class I  32.28 
 
 
224 aa  81.6  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.503612  normal  0.846076 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0654  cytochrome c552  37.61 
 
 
174 aa  80.9  0.000000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1835  cytochrome c, class I  27.59 
 
 
166 aa  80.9  0.000000000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.315382  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2922  cytochrome c, class I  40.21 
 
 
133 aa  80.9  0.000000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2126  cytochrome c, class I  37.25 
 
 
140 aa  80.5  0.000000000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00970187  hitchhiker  0.00260519 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3480  cytochrome c, class I  35.24 
 
 
127 aa  80.5  0.000000000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0817  cytochrome c, class I  37.04 
 
 
149 aa  79.3  0.00000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.419035  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3913  cytochrome c class I  39.8 
 
 
182 aa  79  0.00000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1584  cytochrome c, class I  39.84 
 
 
126 aa  78.6  0.00000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0893762  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0620  cytochrome c, class I  37.63 
 
 
147 aa  78.6  0.00000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.363015  normal  0.813784 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0621  cytochrome c, class I  33.64 
 
 
212 aa  78.2  0.00000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.276705  normal  0.860065 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2218  cytochrome c class I  34.51 
 
 
132 aa  77.4  0.00000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.925658 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4687  cytochrome c, class I  37 
 
 
209 aa  77.4  0.00000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0285175  normal  0.266621 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3443  cytochrome c, class I  35.71 
 
 
155 aa  77.4  0.00000000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.719104  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1235  cytochrome c family protein  34.55 
 
 
185 aa  76.6  0.0000000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0016  cytochrome c class I  38.89 
 
 
224 aa  76.3  0.0000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.6838  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0678  cytochrome c, class I  33.33 
 
 
173 aa  75.5  0.0000000000002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0414  cytochrome c class I  35 
 
 
126 aa  75.5  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.299698  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3439  cytochrome c2  29.6 
 
 
126 aa  75.1  0.0000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0287  cytochrome c, class I  33.04 
 
 
185 aa  74.7  0.0000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0488  cytochrome c, class I  36 
 
 
169 aa  74.7  0.0000000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00131648  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0525  cytochrome c, class I  35 
 
 
175 aa  74.3  0.0000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0840816  normal  0.414033 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0468  cytochrome c, class I  37.23 
 
 
296 aa  73.9  0.0000000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.610669  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4131  cytochrome c, class I  34.04 
 
 
146 aa  74.3  0.0000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.102323  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0473  cytochrome c  36.36 
 
 
179 aa  73.6  0.0000000000009  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.591637  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1724  cytochrome c class I  36.44 
 
 
139 aa  72.8  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.20972  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3357  cytochrome c class I  38.14 
 
 
179 aa  72.8  0.000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.614662  normal  0.166545 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4215  cytochrome c class I  33.91 
 
 
184 aa  73.2  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.26019  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3426  cytochrome c class I  31.25 
 
 
263 aa  72.4  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1618  cytochrome c class I  37.76 
 
 
179 aa  72  0.000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.278765  normal  0.160763 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1443  cytochrome c, class I  38.14 
 
 
149 aa  71.6  0.000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2974  cytochrome c class I  36.75 
 
 
124 aa  72  0.000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.835842  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0513  cytochrome c class I  36.73 
 
 
180 aa  70.9  0.000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.702649  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5293  cytochrome c class I  36.08 
 
 
426 aa  70.5  0.000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.325519  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3742  cytochrome c, class I  36.84 
 
 
139 aa  70.5  0.000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.443469  hitchhiker  0.000332538 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>