163 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_1443 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_1443  cytochrome c, class I  100 
 
 		 149 aa  307  2.9999999999999997e-83  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3474  cytochrome c, class I  71.76 
 
 		 186 aa  204  2e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0712  cytochrome c, class I  70.34 
 
 		 184 aa  168  2e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.586308  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3648  cytochrome c class I  56.76 
 
 		 323 aa  134  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.238166  normal  0.256494 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3913  cytochrome c class I  51.61 
 
 		 182 aa  130  7.999999999999999e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2631  cytochrome c class I  61.26 
 
 		 181 aa  128  3e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.292913 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1618  cytochrome c class I  51.79 
 
 		 179 aa  125  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.278765  normal  0.160763 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0341  cytochrome c class I  54.05 
 
 		 305 aa  121  3e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0386  cytochrome c class I  54.05 
 
 		 305 aa  121  3e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0274347  normal  0.666851 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4085  cytochrome c class I  54.31 
 
 		 188 aa  121  3e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0420  cytochrome c class I  52.73 
 
 		 307 aa  120  9e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.556176  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4405  cytochrome c class I  53.45 
 
 		 187 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0513  cytochrome c class I  50 
 
 		 180 aa  118  3e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.702649  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0039  cytochrome c, membrane-bound  48.46 
 
 		 202 aa  117  3.9999999999999996e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.450907  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0039  cytochrome c, membrane-bound  48.46 
 
 		 192 aa  117  3.9999999999999996e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3357  cytochrome c class I  50.45 
 
 		 179 aa  117  6e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.614662  normal  0.166545 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0250  cytochrome c class I  46.83 
 
 		 220 aa  116  7.999999999999999e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.312298  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4215  cytochrome c class I  46.97 
 
 		 184 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.26019  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1769  cytochrome c, class I  49.11 
 
 		 183 aa  113  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.027087 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0287  cytochrome c, class I  48.28 
 
 		 185 aa  112  2.0000000000000002e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4085  cytochrome c, class I  48.76 
 
 		 286 aa  110  8.000000000000001e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.699648  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1235  cytochrome c family protein  43.24 
 
 		 185 aa  108  3e-23  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0102  cytochrome c  49.57 
 
 		 185 aa  108  4.0000000000000004e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.108181  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7056  cytochrome c  47.86 
 
 		 182 aa  107  8.000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.654005  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0468  cytochrome c, class I  49.11 
 
 		 296 aa  106  1e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.610669  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0377  cytochrome c, class I  53.26 
 
 		 184 aa  105  2e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0016  cytochrome c class I  50.46 
 
 		 224 aa  105  2e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.6838  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3536  cytochrome c, class I  49.15 
 
 		 183 aa  104  3e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.347775  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0431  cytochrome c, class I  41.38 
 
 		 236 aa  103  8e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3730  cytochrome c, class I  46.22 
 
 		 184 aa  102  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0644  cytochrome c, class I  40 
 
 		 474 aa  102  2e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.865539  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3426  cytochrome c class I  46.55 
 
 		 263 aa  102  2e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4687  cytochrome c, class I  46.85 
 
 		 209 aa  100  5e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0285175  normal  0.266621 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0473  cytochrome c  36.91 
 
 		 179 aa  99.8  1e-20  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.591637  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0621  cytochrome c, class I  39.39 
 
 		 212 aa  99  2e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.276705  normal  0.860065 
 
 
-
 
NC_002978  WD0803  cytochrome c family protein  42.48 
 
 		 158 aa  98.2  3e-20  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2974  cytochrome c class I  51.69 
 
 		 124 aa  96.7  1e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.835842  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4582  cytochrome c class I  44.04 
 
 		 228 aa  93.6  8e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0620  cytochrome c, class I  40.65 
 
 		 147 aa  92.8  1e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.363015  normal  0.813784 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1808  cytochrome c, class I  47.17 
 
 		 176 aa  92  2e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.115108 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3471  cytochrome c, class I  51.09 
 
 		 199 aa  92.4  2e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0678  cytochrome c, class I  36.22 
 
 		 173 aa  89.7  1e-17  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3289  cytochrome c class I  39.32 
 
 		 169 aa  89.4  1e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.181782  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1835  cytochrome c, class I  37.74 
 
 		 166 aa  87.8  5e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.315382  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0327  cytochrome C, membrane-bound  36.67 
 
 		 172 aa  86.7  1e-16  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4156  cytochrome c, class I  43.69 
 
 		 382 aa  85.5  2e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.1533  normal  0.864347 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2099  cytochrome c, class I  44.23 
 
 		 123 aa  85.9  2e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2553  cytochrome c, class I  43.93 
 
 		 166 aa  85.1  3e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0215476 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4583  cytochrome c class I  48.94 
 
 		 118 aa  84.7  4e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00400374  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_20948  predicted protein  44.44 
 
 		 104 aa  84.7  4e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0675  cytochrome c class I  43.97 
 
 		 121 aa  83.6  8e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3032  cytochrome c class I  46.81 
 
 		 118 aa  82.8  0.000000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.289896  normal  0.0165662 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2582  cytochrome c, class I  39.42 
 
 		 133 aa  82.4  0.000000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.170551 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3076  cytochrome c class I  36.92 
 
 		 165 aa  82.4  0.000000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2424  cytochrome c class I  43.33 
 
 		 132 aa  82  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.385069 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0817  cytochrome c, class I  48.51 
 
 		 149 aa  81.6  0.000000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.419035  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1172  cytochrome c class I  42.24 
 
 		 121 aa  81.6  0.000000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.109894  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1791  cytochrome c class I  41.23 
 
 		 224 aa  81.6  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.147068  normal  0.48223 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1601  cytochrome c, class I  41.51 
 
 		 125 aa  81.3  0.000000000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.402085 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2800  cytochrome c  34.86 
 
 		 235 aa  80.9  0.000000000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.318955 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2327  cytochrome c  41.84 
 
 		 119 aa  80.9  0.000000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3255  cytochrome c, class I  48.42 
 
 		 124 aa  80.9  0.000000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000474848  decreased coverage  0.000193536 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1946  cytochrome c, class I  41.75 
 
 		 143 aa  80.1  0.000000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.719262  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3864  cytochrome c, class I  42.57 
 
 		 170 aa  80.1  0.00000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.166005  normal  0.942386 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4608  cytochrome c class I  45.83 
 
 		 120 aa  79  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0752945 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3552  cytochrome c, class I  39.62 
 
 		 128 aa  79  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.296099 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4157  cytochrome c, class I  36.7 
 
 		 236 aa  79  0.00000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.362968  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3480  cytochrome c, class I  36.43 
 
 		 127 aa  79.3  0.00000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2218  cytochrome c class I  33.33 
 
 		 132 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.925658 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0011  cytochrome c class I  42.39 
 
 		 132 aa  78.2  0.00000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0705  cytochrome cy  43.88 
 
 		 174 aa  78.2  0.00000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.229097  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2360  cytochrome c, class I  43.88 
 
 		 174 aa  78.2  0.00000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.442911  normal  0.208879 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2948  cytochrome c class I  40.91 
 
 		 130 aa  77.8  0.00000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_15043  predicted protein  43.43 
 
 		 112 aa  77.4  0.00000000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000188327  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0525  cytochrome c, class I  39.09 
 
 		 175 aa  77.4  0.00000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0840816  normal  0.414033 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4131  cytochrome c, class I  42.7 
 
 		 146 aa  77  0.00000000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.102323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0654  cytochrome c552  37.74 
 
 		 174 aa  76.6  0.0000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2577  isocytochrome c2  39.39 
 
 		 144 aa  76.3  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3205  cytochrome c, class I  39.56 
 
 		 133 aa  76.6  0.0000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.983514  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1287  cytochrome c class I  47.83 
 
 		 122 aa  76.6  0.0000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.208797  normal  0.579933 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1235  cytochrome c, class I  39.39 
 
 		 144 aa  76.3  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.978444 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2511  cytochrome c class I  40.21 
 
 		 132 aa  76.6  0.0000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.657545  normal  0.0330621 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1661  cytochrome C  40.22 
 
 		 115 aa  76.6  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0240  putative cytochrome c  36.28 
 
 		 130 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2269  cytochrome c class I  43 
 
 		 129 aa  75.1  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0688156  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2595  cytochrome c class I  41 
 
 		 129 aa  73.6  0.0000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0211957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_78490  cytochrome c  34.91 
 
 		 110 aa  73.6  0.0000000000008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.635362  normal  0.967273 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0011  cytochrome c class I  35.24 
 
 		 132 aa  72.8  0.000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0553485  normal  0.905582 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4138  cytochrome c, class I  38.95 
 
 		 133 aa  73.2  0.000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2961  cytochrome c class I  37.5 
 
 		 113 aa  72.8  0.000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0666033  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0032  cytochrome c, class I  39.77 
 
 		 160 aa  72.4  0.000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00501524  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2670  cytochrome c class I  34.95 
 
 		 148 aa  72  0.000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.340076 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0257  cytochrome c class I  34.95 
 
 		 148 aa  72  0.000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.466449  hitchhiker  0.00512389 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3817  cytochrome c, class I  42.57 
 
 		 127 aa  72  0.000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.376417  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3205  cytochrome c class I  42.22 
 
 		 143 aa  72  0.000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.111252 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0174  cytochrome c2  38.14 
 
 		 131 aa  71.6  0.000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  hitchhiker  0.000396379  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5367  cytochrome c class I  37.72 
 
 		 224 aa  71.6  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.503612  normal  0.846076 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0153  cytochrome c heme-binding site:cytochrome c, class IA/ IB:cytochrome c, class I  38.14 
 
 		 131 aa  71.6  0.000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.00000226956  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3944  cytochrome c class I  36.46 
 
 		 136 aa  72  0.000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.696873  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6323  cytochrome c class I  38 
 
 		 130 aa  71.2  0.000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>