158 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene NSE_0473 on replicon NC_007798
Organism: Neorickettsia sennetsu str. Miyayama



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007798  NSE_0473  cytochrome c  100 
 
 		 179 aa  372  1e-102  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.591637  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0803  cytochrome c family protein  54.78 
 
 		 158 aa  186  1e-46  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0678  cytochrome c, class I  48.62 
 
 		 173 aa  184  8e-46  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0327  cytochrome C, membrane-bound  50.58 
 
 		 172 aa  183  1.0000000000000001e-45  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0341  cytochrome c class I  44.94 
 
 		 305 aa  159  3e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0386  cytochrome c class I  44.38 
 
 		 305 aa  157  6e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0274347  normal  0.666851 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0420  cytochrome c class I  43.5 
 
 		 307 aa  154  9e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.556176  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3648  cytochrome c class I  41.76 
 
 		 323 aa  142  3e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.238166  normal  0.256494 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4215  cytochrome c class I  38.67 
 
 		 184 aa  131  6e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.26019  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0250  cytochrome c class I  39.44 
 
 		 220 aa  130  7.999999999999999e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.312298  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4085  cytochrome c, class I  40.98 
 
 		 286 aa  129  3e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.699648  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1769  cytochrome c, class I  38.33 
 
 		 183 aa  128  5.0000000000000004e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.027087 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1618  cytochrome c class I  35.2 
 
 		 179 aa  127  8.000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.278765  normal  0.160763 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3913  cytochrome c class I  37.99 
 
 		 182 aa  126  2.0000000000000002e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0513  cytochrome c class I  34.44 
 
 		 180 aa  125  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.702649  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3357  cytochrome c class I  38.67 
 
 		 179 aa  122  3e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.614662  normal  0.166545 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0431  cytochrome c, class I  37.3 
 
 		 236 aa  120  9.999999999999999e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0039  cytochrome c, membrane-bound  36.26 
 
 		 202 aa  118  6e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.450907  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0287  cytochrome c, class I  36.22 
 
 		 185 aa  116  1.9999999999999998e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0039  cytochrome c, membrane-bound  37.58 
 
 		 192 aa  115  3.9999999999999997e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7056  cytochrome c  39.44 
 
 		 182 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.654005  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4687  cytochrome c, class I  35.2 
 
 		 209 aa  112  2.0000000000000002e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0285175  normal  0.266621 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3730  cytochrome c, class I  35 
 
 		 184 aa  110  8.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0621  cytochrome c, class I  37.5 
 
 		 212 aa  110  8.000000000000001e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.276705  normal  0.860065 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3536  cytochrome c, class I  37.78 
 
 		 183 aa  109  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.347775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3426  cytochrome c class I  45.3 
 
 		 263 aa  108  3e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0016  cytochrome c class I  34.83 
 
 		 224 aa  108  4.0000000000000004e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.6838  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3474  cytochrome c, class I  37.06 
 
 		 186 aa  107  8.000000000000001e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1235  cytochrome c family protein  34.27 
 
 		 185 aa  107  9.000000000000001e-23  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0468  cytochrome c, class I  36.84 
 
 		 296 aa  107  1e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.610669  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4582  cytochrome c class I  35.03 
 
 		 228 aa  104  7e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0102  cytochrome c  40.34 
 
 		 185 aa  100  1e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.108181  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1443  cytochrome c, class I  36.91 
 
 		 149 aa  99.8  2e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0377  cytochrome c, class I  38.98 
 
 		 184 aa  97.8  8e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4405  cytochrome c class I  34.76 
 
 		 187 aa  95.5  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0712  cytochrome c, class I  45.95 
 
 		 184 aa  94.4  7e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.586308  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4085  cytochrome c class I  36.53 
 
 		 188 aa  94.7  7e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1835  cytochrome c, class I  37.62 
 
 		 166 aa  89.4  3e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.315382  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0644  cytochrome c, class I  30.39 
 
 		 474 aa  88.6  4e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.865539  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_15043  predicted protein  45.87 
 
 		 112 aa  88.2  6e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000188327  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1946  cytochrome c, class I  40.38 
 
 		 143 aa  86.3  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.719262  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2553  cytochrome c, class I  34.01 
 
 		 166 aa  85.9  3e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0215476 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2631  cytochrome c class I  34.27 
 
 		 181 aa  85.9  3e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.292913 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_20948  predicted protein  46.07 
 
 		 104 aa  84.7  7e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2511  cytochrome c class I  41.18 
 
 		 132 aa  84.3  8e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.657545  normal  0.0330621 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3289  cytochrome c class I  40.34 
 
 		 169 aa  84.3  9e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.181782  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2801  cytochrome c  38.61 
 
 		 342 aa  82.8  0.000000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.26281 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1808  cytochrome c, class I  37.4 
 
 		 176 aa  83.2  0.000000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.115108 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0620  cytochrome c, class I  41.05 
 
 		 147 aa  82.4  0.000000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.363015  normal  0.813784 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2800  cytochrome c  33.64 
 
 		 235 aa  82.4  0.000000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.318955 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3169  cytochrome c2  45 
 
 		 126 aa  82  0.000000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_78490  cytochrome c  40 
 
 		 110 aa  82.4  0.000000000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.635362  normal  0.967273 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1791  cytochrome c class I  35.96 
 
 		 224 aa  81.6  0.000000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.147068  normal  0.48223 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3255  cytochrome c, class I  41.49 
 
 		 124 aa  80.9  0.00000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000474848  decreased coverage  0.000193536 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2577  isocytochrome c2  38.24 
 
 		 144 aa  80.1  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1235  cytochrome c, class I  38.24 
 
 		 144 aa  80.1  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.978444 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0654  cytochrome c552  30.82 
 
 		 174 aa  79.3  0.00000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4156  cytochrome c, class I  40.38 
 
 		 382 aa  77  0.0000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.1533  normal  0.864347 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3817  cytochrome c, class I  37.86 
 
 		 127 aa  77.4  0.0000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.376417  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2424  cytochrome c class I  39.25 
 
 		 132 aa  77.4  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.385069 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3864  cytochrome c, class I  40 
 
 		 170 aa  76.3  0.0000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.166005  normal  0.942386 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3076  cytochrome c class I  31.62 
 
 		 165 aa  76.3  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4157  cytochrome c, class I  30.07 
 
 		 236 aa  76.6  0.0000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.362968  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA06950  electron carrier, putative  39.56 
 
 		 111 aa  75.5  0.0000000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.073604  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0817  cytochrome c, class I  40.2 
 
 		 149 aa  75.5  0.0000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.419035  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1723  cytochrome c, class I  35.79 
 
 		 124 aa  75.5  0.0000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3501  cytochrome c, class I  33.94 
 
 		 225 aa  74.3  0.0000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.466234 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0174  cytochrome c2  36.36 
 
 		 131 aa  73.6  0.000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  hitchhiker  0.000396379  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5367  cytochrome c class I  33.93 
 
 		 224 aa  73.9  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.503612  normal  0.846076 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0860  cytochrome c class I  38.14 
 
 		 120 aa  73.9  0.000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.425021 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0924  cytochrome c class I  38.14 
 
 		 120 aa  73.6  0.000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.269512  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0153  cytochrome c heme-binding site:cytochrome c, class IA/ IB:cytochrome c, class I  36.36 
 
 		 131 aa  73.6  0.000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.00000226956  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0885  cytochrome c class I  38.14 
 
 		 120 aa  73.9  0.000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.752679 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0257  cytochrome c class I  33.33 
 
 		 148 aa  72  0.000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.466449  hitchhiker  0.00512389 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2670  cytochrome c class I  33.33 
 
 		 148 aa  72  0.000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.340076 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3032  cytochrome c class I  41.05 
 
 		 118 aa  71.6  0.000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.289896  normal  0.0165662 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2948  cytochrome c class I  35.83 
 
 		 130 aa  71.2  0.000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4583  cytochrome c class I  41.05 
 
 		 118 aa  71.2  0.000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00400374  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3471  cytochrome c, class I  36.19 
 
 		 199 aa  70.9  0.000000000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2099  cytochrome c, class I  35.58 
 
 		 123 aa  70.9  0.00000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1020  cytochrome c, class I  37.74 
 
 		 135 aa  69.7  0.00000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2269  cytochrome c class I  39.25 
 
 		 129 aa  69.3  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0688156  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4031  class I cytochrome c  31.37 
 
 		 129 aa  69.7  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.586339 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3480  cytochrome c, class I  31 
 
 		 154 aa  68.2  0.00000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.453541  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0525  cytochrome c, class I  36.54 
 
 		 175 aa  68.2  0.00000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0840816  normal  0.414033 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0414  cytochrome c class I  39.18 
 
 		 126 aa  67.8  0.00000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.299698  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1601  cytochrome c, class I  32 
 
 		 125 aa  67.8  0.00000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.402085 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2595  cytochrome c class I  38.32 
 
 		 129 aa  68.2  0.00000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0211957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3944  cytochrome c class I  38.3 
 
 		 136 aa  67.8  0.00000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.696873  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1172  cytochrome c class I  39.18 
 
 		 121 aa  67  0.0000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.109894  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1287  cytochrome c class I  39.36 
 
 		 122 aa  67  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.208797  normal  0.579933 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2922  cytochrome c, class I  34.26 
 
 		 133 aa  67  0.0000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0675  cytochrome c class I  39.18 
 
 		 121 aa  65.9  0.0000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0011  cytochrome c class I  37.5 
 
 		 132 aa  65.9  0.0000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0705  cytochrome cy  36.36 
 
 		 174 aa  65.1  0.0000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.229097  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2360  cytochrome c, class I  36.36 
 
 		 174 aa  65.1  0.0000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.442911  normal  0.208879 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2218  cytochrome c class I  29.29 
 
 		 132 aa  63.9  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.925658 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2974  cytochrome c class I  36.67 
 
 		 124 aa  63.9  0.000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.835842  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1661  cytochrome C  37.5 
 
 		 115 aa  63.9  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0240  putative cytochrome c  30.85 
 
 		 130 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>