157 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_0341 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010172  Mext_0341  cytochrome c class I  100 
 
 
305 aa  599  1e-170  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0386  cytochrome c class I  98.36 
 
 
305 aa  591  1e-168  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0274347  normal  0.666851 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0420  cytochrome c class I  86.64 
 
 
307 aa  478  1e-134  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.556176  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3648  cytochrome c class I  68.05 
 
 
323 aa  276  2e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.238166  normal  0.256494 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1618  cytochrome c class I  61.58 
 
 
179 aa  226  3e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.278765  normal  0.160763 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0513  cytochrome c class I  61.8 
 
 
180 aa  219  3.9999999999999997e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.702649  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3913  cytochrome c class I  55.25 
 
 
182 aa  194  2e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3357  cytochrome c class I  51.98 
 
 
179 aa  182  9.000000000000001e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.614662  normal  0.166545 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0250  cytochrome c class I  42.58 
 
 
220 aa  170  3e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.312298  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4085  cytochrome c, class I  49.72 
 
 
286 aa  167  2e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.699648  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1769  cytochrome c, class I  49.18 
 
 
183 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.027087 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4215  cytochrome c class I  45.65 
 
 
184 aa  163  3e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.26019  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0473  cytochrome c  44.94 
 
 
179 aa  162  5.0000000000000005e-39  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.591637  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3536  cytochrome c, class I  49.73 
 
 
183 aa  162  5.0000000000000005e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.347775  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0678  cytochrome c, class I  44.19 
 
 
173 aa  155  6e-37  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0327  cytochrome C, membrane-bound  45.4 
 
 
172 aa  152  5.9999999999999996e-36  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3730  cytochrome c, class I  48.91 
 
 
184 aa  150  3e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0803  cytochrome c family protein  45.22 
 
 
158 aa  144  1e-33  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0039  cytochrome c, membrane-bound  43.65 
 
 
202 aa  144  1e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.450907  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7056  cytochrome c  46.15 
 
 
182 aa  143  4e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.654005  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3474  cytochrome c, class I  43.82 
 
 
186 aa  141  9.999999999999999e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0039  cytochrome c, membrane-bound  44.12 
 
 
192 aa  139  7e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0016  cytochrome c class I  42.61 
 
 
224 aa  137  2e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.6838  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4085  cytochrome c class I  46.7 
 
 
188 aa  136  4e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0431  cytochrome c, class I  38.1 
 
 
236 aa  136  5e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0377  cytochrome c, class I  45.41 
 
 
184 aa  135  6.0000000000000005e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3426  cytochrome c class I  43.16 
 
 
263 aa  135  9.999999999999999e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0102  cytochrome c  44.02 
 
 
185 aa  133  3e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.108181  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0287  cytochrome c, class I  39.13 
 
 
185 aa  133  3.9999999999999996e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4405  cytochrome c class I  46.96 
 
 
187 aa  132  5e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2631  cytochrome c class I  49.17 
 
 
181 aa  130  3e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.292913 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0712  cytochrome c, class I  46.37 
 
 
184 aa  127  3e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.586308  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0621  cytochrome c, class I  40.11 
 
 
212 aa  124  3e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.276705  normal  0.860065 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4687  cytochrome c, class I  52.14 
 
 
209 aa  123  5e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0285175  normal  0.266621 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1443  cytochrome c, class I  48.15 
 
 
149 aa  122  9.999999999999999e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2553  cytochrome c, class I  39.18 
 
 
166 aa  109  7.000000000000001e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0215476 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0468  cytochrome c, class I  49.15 
 
 
296 aa  106  4e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.610669  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1235  cytochrome c family protein  40.17 
 
 
185 aa  103  3e-21  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1808  cytochrome c, class I  41.81 
 
 
176 aa  101  1e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.115108 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0644  cytochrome c, class I  34.78 
 
 
474 aa  102  1e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.865539  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3864  cytochrome c, class I  40.7 
 
 
170 aa  100  4e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.166005  normal  0.942386 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0654  cytochrome c552  39.53 
 
 
174 aa  99  8e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0620  cytochrome c, class I  41.86 
 
 
147 aa  92.8  7e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.363015  normal  0.813784 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4582  cytochrome c class I  34.86 
 
 
228 aa  92.4  9e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1835  cytochrome c, class I  36.52 
 
 
166 aa  92  1e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.315382  normal 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_78490  cytochrome c  45.88 
 
 
110 aa  92  1e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.635362  normal  0.967273 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_20948  predicted protein  47.13 
 
 
104 aa  91.3  2e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA06950  electron carrier, putative  46.39 
 
 
111 aa  87.4  3e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.073604  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3076  cytochrome c class I  37 
 
 
165 aa  87.4  3e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_15043  predicted protein  50 
 
 
112 aa  87.4  3e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000188327  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0705  cytochrome cy  48.35 
 
 
174 aa  81.3  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.229097  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4157  cytochrome c, class I  39.22 
 
 
236 aa  81.3  0.00000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.362968  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2360  cytochrome c, class I  48.35 
 
 
174 aa  81.3  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.442911  normal  0.208879 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2974  cytochrome c class I  44.21 
 
 
124 aa  80.5  0.00000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.835842  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3471  cytochrome c, class I  46.08 
 
 
199 aa  80.9  0.00000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0525  cytochrome c, class I  38.86 
 
 
175 aa  79.7  0.00000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0840816  normal  0.414033 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1172  cytochrome c class I  43.88 
 
 
121 aa  79.3  0.00000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.109894  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2099  cytochrome c, class I  43.14 
 
 
123 aa  79  0.00000000000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3255  cytochrome c, class I  46.32 
 
 
124 aa  79  0.0000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000474848  decreased coverage  0.000193536 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3032  cytochrome c class I  43.88 
 
 
118 aa  78.2  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.289896  normal  0.0165662 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0817  cytochrome c, class I  43.64 
 
 
149 aa  77.8  0.0000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.419035  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0675  cytochrome c class I  44.9 
 
 
121 aa  78.2  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2327  cytochrome c  43.68 
 
 
119 aa  77.8  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2800  cytochrome c  33.63 
 
 
235 aa  77.8  0.0000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.318955 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3944  cytochrome c class I  44.09 
 
 
136 aa  77.8  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.696873  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0414  cytochrome c class I  40.91 
 
 
126 aa  77  0.0000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.299698  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4156  cytochrome c, class I  46.24 
 
 
382 aa  77  0.0000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.1533  normal  0.864347 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3817  cytochrome c, class I  41.75 
 
 
127 aa  77  0.0000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.376417  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4583  cytochrome c class I  47.13 
 
 
118 aa  77  0.0000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00400374  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1791  cytochrome c class I  41.58 
 
 
224 aa  76.6  0.0000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.147068  normal  0.48223 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1946  cytochrome c, class I  41 
 
 
143 aa  76.3  0.0000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.719262  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1723  cytochrome c, class I  36.19 
 
 
124 aa  75.9  0.0000000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2577  isocytochrome c2  40 
 
 
144 aa  75.1  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1287  cytochrome c class I  48.86 
 
 
122 aa  75.1  0.000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.208797  normal  0.579933 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1601  cytochrome c, class I  38.24 
 
 
125 aa  75.5  0.000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.402085 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1235  cytochrome c, class I  40 
 
 
144 aa  75.1  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.978444 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3289  cytochrome c class I  36.89 
 
 
169 aa  74.7  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.181782  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2582  cytochrome c, class I  38.05 
 
 
133 aa  73.6  0.000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.170551 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2511  cytochrome c class I  36.89 
 
 
132 aa  73.2  0.000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.657545  normal  0.0330621 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3501  cytochrome c, class I  32.97 
 
 
225 aa  72.4  0.000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.466234 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4608  cytochrome c class I  47.78 
 
 
120 aa  72.4  0.000000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0752945 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2218  cytochrome c class I  38.64 
 
 
132 aa  72.4  0.000000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.925658 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1020  cytochrome c, class I  39.22 
 
 
135 aa  72.4  0.00000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0257  cytochrome c class I  37.37 
 
 
148 aa  72  0.00000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.466449  hitchhiker  0.00512389 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2670  cytochrome c class I  37.37 
 
 
148 aa  72  0.00000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.340076 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0011  cytochrome c class I  44.21 
 
 
132 aa  71.6  0.00000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0131  cytochrome c, class I  37.23 
 
 
329 aa  71.6  0.00000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.320568  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0032  cytochrome c, class I  40.91 
 
 
160 aa  70.9  0.00000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00501524  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4138  cytochrome c, class I  36.08 
 
 
133 aa  70.5  0.00000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0011  cytochrome c class I  37.5 
 
 
132 aa  70.5  0.00000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0553485  normal  0.905582 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0240  putative cytochrome c  35.64 
 
 
130 aa  69.7  0.00000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0885  cytochrome c class I  45.45 
 
 
120 aa  68.9  0.0000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.752679 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3205  cytochrome c, class I  41.18 
 
 
133 aa  68.6  0.0000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.983514  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0100  cytochrome c class I  40.54 
 
 
175 aa  68.6  0.0000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.102431  normal  0.12668 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0924  cytochrome c class I  45.45 
 
 
120 aa  68.6  0.0000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.269512  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3552  cytochrome c, class I  38.1 
 
 
128 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.296099 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5367  cytochrome c class I  35.4 
 
 
224 aa  68.2  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.503612  normal  0.846076 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2922  cytochrome c, class I  41.58 
 
 
133 aa  68.2  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3480  cytochrome c, class I  37.84 
 
 
127 aa  67.8  0.0000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2411  cytochrome c, class I  33.71 
 
 
121 aa  67.8  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0911024 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>