174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_0705 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_0705  cytochrome cy  100 
 
 		 174 aa  348  2e-95  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.229097  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2360  cytochrome c, class I  100 
 
 		 174 aa  348  2e-95  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.442911  normal  0.208879 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0525  cytochrome c, class I  81.71 
 
 		 175 aa  281  4.0000000000000003e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0840816  normal  0.414033 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0654  cytochrome c552  50.28 
 
 		 174 aa  172  2.9999999999999996e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1808  cytochrome c, class I  56.42 
 
 		 176 aa  171  5e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.115108 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2553  cytochrome c, class I  52.6 
 
 		 166 aa  162  3e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0215476 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3864  cytochrome c, class I  46.02 
 
 		 170 aa  141  6e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.166005  normal  0.942386 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4085  cytochrome c, class I  40 
 
 		 286 aa  114  6.9999999999999995e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.699648  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4215  cytochrome c class I  39.88 
 
 		 184 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.26019  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0468  cytochrome c, class I  51.33 
 
 		 296 aa  112  3e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.610669  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0102  cytochrome c  53.21 
 
 		 185 aa  111  6e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.108181  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4085  cytochrome c class I  43.53 
 
 		 188 aa  110  9e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4405  cytochrome c class I  44.51 
 
 		 187 aa  108  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3944  cytochrome c class I  52.08 
 
 		 136 aa  107  7.000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.696873  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0039  cytochrome c, membrane-bound  48 
 
 		 202 aa  106  2e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.450907  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0039  cytochrome c, membrane-bound  45.24 
 
 		 192 aa  106  2e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4156  cytochrome c, class I  51.49 
 
 		 382 aa  105  4e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.1533  normal  0.864347 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0250  cytochrome c class I  37.36 
 
 		 220 aa  103  1e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.312298  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0016  cytochrome c class I  43.28 
 
 		 224 aa  102  2e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.6838  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2948  cytochrome c class I  46.9 
 
 		 130 aa  102  4e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1618  cytochrome c class I  38.2 
 
 		 179 aa  101  5e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.278765  normal  0.160763 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2511  cytochrome c class I  45.28 
 
 		 132 aa  101  6e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.657545  normal  0.0330621 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3913  cytochrome c class I  47.06 
 
 		 182 aa  100  7e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3426  cytochrome c class I  38.32 
 
 		 263 aa  99  3e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0621  cytochrome c, class I  43.64 
 
 		 212 aa  98.2  6e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.276705  normal  0.860065 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0475  cytochrome c class I  47.41 
 
 		 133 aa  97.8  7e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4687  cytochrome c, class I  48.62 
 
 		 209 aa  95.5  4e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0285175  normal  0.266621 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3357  cytochrome c class I  45.05 
 
 		 179 aa  95.1  5e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.614662  normal  0.166545 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2800  cytochrome c  40.4 
 
 		 235 aa  95.1  5e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.318955 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2577  isocytochrome c2  43.14 
 
 		 144 aa  93.2  2e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0011  cytochrome c class I  41.67 
 
 		 132 aa  92.8  2e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0553485  normal  0.905582 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2801  cytochrome c  44.96 
 
 		 342 aa  92.8  2e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.26281 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1235  cytochrome c, class I  43.14 
 
 		 144 aa  93.2  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.978444 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4582  cytochrome c class I  44.86 
 
 		 228 aa  92  3e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3474  cytochrome c, class I  43.1 
 
 		 186 aa  91.7  4e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3169  cytochrome c2  43.69 
 
 		 126 aa  91.7  4e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0011  cytochrome c class I  49 
 
 		 132 aa  92  4e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4157  cytochrome c, class I  45 
 
 		 236 aa  91.7  5e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.362968  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0513  cytochrome c class I  45.05 
 
 		 180 aa  91.7  5e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.702649  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1235  cytochrome c family protein  30.25 
 
 		 185 aa  90.9  7e-18  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3471  cytochrome c, class I  48.08 
 
 		 199 aa  91.3  7e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1769  cytochrome c, class I  34.5 
 
 		 183 aa  88.6  4e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.027087 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0386  cytochrome c class I  46.23 
 
 		 305 aa  88.2  5e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0274347  normal  0.666851 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0431  cytochrome c, class I  43.52 
 
 		 236 aa  88.2  5e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0341  cytochrome c class I  46.23 
 
 		 305 aa  88.2  6e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0287  cytochrome c, class I  34.24 
 
 		 185 aa  87.4  8e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3817  cytochrome c, class I  41.35 
 
 		 127 aa  87.8  8e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.376417  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0257  cytochrome c class I  42.31 
 
 		 148 aa  87  1e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.466449  hitchhiker  0.00512389 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3552  cytochrome c, class I  42.99 
 
 		 128 aa  86.7  1e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.296099 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3536  cytochrome c, class I  37.14 
 
 		 183 aa  87.4  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.347775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2670  cytochrome c class I  42.31 
 
 		 148 aa  87  1e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.340076 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1287  cytochrome c class I  46.46 
 
 		 122 aa  87  1e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.208797  normal  0.579933 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1946  cytochrome c, class I  44.9 
 
 		 143 aa  86.7  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.719262  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1443  cytochrome c, class I  42.24 
 
 		 149 aa  84.7  5e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2424  cytochrome c class I  40.19 
 
 		 132 aa  84.3  7e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.385069 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_15043  predicted protein  43.14 
 
 		 112 aa  84.3  8e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000188327  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0420  cytochrome c class I  43.4 
 
 		 307 aa  84  9e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.556176  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0327  cytochrome C, membrane-bound  31.82 
 
 		 172 aa  84  0.000000000000001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_20948  predicted protein  42.86 
 
 		 104 aa  83.2  0.000000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2582  cytochrome c, class I  40 
 
 		 133 aa  83.2  0.000000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.170551 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2218  cytochrome c class I  43.64 
 
 		 132 aa  82.8  0.000000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.925658 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1601  cytochrome c, class I  42.98 
 
 		 125 aa  83.2  0.000000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.402085 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2631  cytochrome c class I  51.79 
 
 		 181 aa  82.8  0.000000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.292913 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0377  cytochrome c, class I  35.71 
 
 		 184 aa  82.4  0.000000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3255  cytochrome c, class I  46.46 
 
 		 124 aa  81.6  0.000000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000474848  decreased coverage  0.000193536 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0675  cytochrome c class I  42.57 
 
 		 121 aa  81.6  0.000000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_78490  cytochrome c  39.56 
 
 		 110 aa  81.3  0.000000000000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.635362  normal  0.967273 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7056  cytochrome c  36.36 
 
 		 182 aa  81.3  0.000000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.654005  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1723  cytochrome c, class I  42 
 
 		 124 aa  80.9  0.000000000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4138  cytochrome c, class I  43.16 
 
 		 133 aa  80.9  0.000000000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0678  cytochrome c, class I  30.77 
 
 		 173 aa  80.1  0.00000000000001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3730  cytochrome c, class I  35.43 
 
 		 184 aa  80.1  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1835  cytochrome c, class I  36.79 
 
 		 166 aa  80.5  0.00000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.315382  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3032  cytochrome c class I  42.57 
 
 		 118 aa  80.5  0.00000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.289896  normal  0.0165662 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0712  cytochrome c, class I  37.27 
 
 		 184 aa  79.7  0.00000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.586308  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3648  cytochrome c class I  41.51 
 
 		 323 aa  79.7  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.238166  normal  0.256494 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3205  cytochrome c, class I  40.43 
 
 		 133 aa  79  0.00000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.983514  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3076  cytochrome c class I  38.32 
 
 		 165 aa  79.3  0.00000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4031  class I cytochrome c  42.31 
 
 		 129 aa  78.6  0.00000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.586339 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4608  cytochrome c class I  45.28 
 
 		 120 aa  78.6  0.00000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0752945 
 
 
-
 
NC_006670  CNA06950  electron carrier, putative  40 
 
 		 111 aa  78.2  0.00000000000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.073604  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0620  cytochrome c, class I  42.86 
 
 		 147 aa  77.8  0.00000000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.363015  normal  0.813784 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2595  cytochrome c class I  40.82 
 
 		 129 aa  76.6  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0211957  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4583  cytochrome c class I  41.24 
 
 		 118 aa  77  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00400374  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1172  cytochrome c class I  39.6 
 
 		 121 aa  76.3  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.109894  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2922  cytochrome c, class I  42.86 
 
 		 133 aa  75.9  0.0000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2099  cytochrome c, class I  42.31 
 
 		 123 aa  76.3  0.0000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1584  cytochrome c, class I  43.93 
 
 		 126 aa  75.5  0.0000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0893762  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6382  cytochrome c class I  41.24 
 
 		 131 aa  75.5  0.0000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.832746  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2269  cytochrome c class I  40.82 
 
 		 129 aa  74.3  0.0000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0688156  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0174  cytochrome c2  35 
 
 		 131 aa  72.8  0.000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  hitchhiker  0.000396379  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0644  cytochrome c, class I  39.05 
 
 		 474 aa  73.2  0.000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.865539  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2327  cytochrome c  42.27 
 
 		 119 aa  73.2  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0153  cytochrome c heme-binding site:cytochrome c, class IA/ IB:cytochrome c, class I  35 
 
 		 131 aa  72.8  0.000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.00000226956  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1880  cytochrome c, class I  36.27 
 
 		 122 aa  72.4  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4103  cytochrome c class I  36.89 
 
 		 130 aa  72.4  0.000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.721934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1792  cytochrome c class I  36.45 
 
 		 132 aa  72.4  0.000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0298135  normal  0.587019 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0240  putative cytochrome c  37.61 
 
 		 130 aa  72.4  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0414  cytochrome c class I  42.86 
 
 		 126 aa  72.4  0.000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.299698  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3480  cytochrome c, class I  42.86 
 
 		 127 aa  72.4  0.000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>