157 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_4582 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_4582  cytochrome c class I  100 
 
 		 228 aa  445  1.0000000000000001e-124  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0250  cytochrome c class I  38.62 
 
 		 220 aa  124  1e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.312298  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0621  cytochrome c, class I  40.68 
 
 		 212 aa  122  5e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.276705  normal  0.860065 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4085  cytochrome c, class I  40.32 
 
 		 286 aa  121  9.999999999999999e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.699648  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0039  cytochrome c, membrane-bound  39.11 
 
 		 202 aa  120  1.9999999999999998e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.450907  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0468  cytochrome c, class I  45.65 
 
 		 296 aa  116  1.9999999999999998e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.610669  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0039  cytochrome c, membrane-bound  40.53 
 
 		 192 aa  116  3e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4405  cytochrome c class I  39.78 
 
 		 187 aa  115  3.9999999999999997e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0473  cytochrome c  35.87 
 
 		 179 aa  115  6e-25  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.591637  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3913  cytochrome c class I  40.96 
 
 		 182 aa  112  5e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0678  cytochrome c, class I  36.52 
 
 		 173 aa  111  7.000000000000001e-24  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0016  cytochrome c class I  36.12 
 
 		 224 aa  111  7.000000000000001e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.6838  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3426  cytochrome c class I  40.1 
 
 		 263 aa  110  1.0000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4085  cytochrome c class I  40.11 
 
 		 188 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0327  cytochrome C, membrane-bound  36.93 
 
 		 172 aa  109  3e-23  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3648  cytochrome c class I  38.46 
 
 		 323 aa  108  5e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.238166  normal  0.256494 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0431  cytochrome c, class I  37.17 
 
 		 236 aa  108  5e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1618  cytochrome c class I  38.25 
 
 		 179 aa  105  6e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.278765  normal  0.160763 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0513  cytochrome c class I  40.22 
 
 		 180 aa  104  1e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.702649  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3357  cytochrome c class I  39.89 
 
 		 179 aa  103  3e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.614662  normal  0.166545 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1769  cytochrome c, class I  35.59 
 
 		 183 aa  100  1e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.027087 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0102  cytochrome c  44.44 
 
 		 185 aa  100  2e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.108181  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0386  cytochrome c class I  36.32 
 
 		 305 aa  100  2e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0274347  normal  0.666851 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1443  cytochrome c, class I  40.71 
 
 		 149 aa  99.8  3e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0341  cytochrome c class I  35.78 
 
 		 305 aa  99  5e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0644  cytochrome c, class I  33.49 
 
 		 474 aa  98.6  7e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.865539  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0420  cytochrome c class I  34.29 
 
 		 307 aa  97.4  1e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.556176  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4215  cytochrome c class I  35.26 
 
 		 184 aa  96.3  3e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.26019  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2511  cytochrome c class I  45.54 
 
 		 132 aa  96.7  3e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.657545  normal  0.0330621 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3730  cytochrome c, class I  40.11 
 
 		 184 aa  95.5  6e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0287  cytochrome c, class I  35.87 
 
 		 185 aa  93.6  2e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7056  cytochrome c  38.5 
 
 		 182 aa  91.7  8e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.654005  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4687  cytochrome c, class I  40 
 
 		 209 aa  90.9  1e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0285175  normal  0.266621 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3076  cytochrome c class I  45.45 
 
 		 165 aa  90.1  2e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2631  cytochrome c class I  41.85 
 
 		 181 aa  89.4  4e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.292913 
 
 
-
 
NC_002978  WD0803  cytochrome c family protein  40.62 
 
 		 158 aa  89.4  5e-17  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3536  cytochrome c, class I  35.63 
 
 		 183 aa  89  5e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.347775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0525  cytochrome c, class I  42.99 
 
 		 175 aa  86.7  3e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0840816  normal  0.414033 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4156  cytochrome c, class I  43.88 
 
 		 382 aa  85.9  4e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.1533  normal  0.864347 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0620  cytochrome c, class I  45.45 
 
 		 147 aa  85.1  9e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.363015  normal  0.813784 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1235  cytochrome c family protein  38.94 
 
 		 185 aa  84.7  0.000000000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2099  cytochrome c, class I  45.71 
 
 		 123 aa  84  0.000000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3474  cytochrome c, class I  37.93 
 
 		 186 aa  82.8  0.000000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2948  cytochrome c class I  42.27 
 
 		 130 aa  82.8  0.000000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0705  cytochrome cy  44.9 
 
 		 174 aa  82.4  0.000000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.229097  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2360  cytochrome c, class I  44.9 
 
 		 174 aa  82.4  0.000000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.442911  normal  0.208879 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2424  cytochrome c class I  43.75 
 
 		 132 aa  81.6  0.000000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.385069 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2553  cytochrome c, class I  37.86 
 
 		 166 aa  80.9  0.00000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0215476 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_20948  predicted protein  42.55 
 
 		 104 aa  81.3  0.00000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0377  cytochrome c, class I  34.78 
 
 		 184 aa  80.9  0.00000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2800  cytochrome c  33.61 
 
 		 235 aa  80.1  0.00000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.318955 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2801  cytochrome c  34.03 
 
 		 342 aa  79.3  0.00000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.26281 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3032  cytochrome c class I  43.43 
 
 		 118 aa  79  0.00000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.289896  normal  0.0165662 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1808  cytochrome c, class I  41.86 
 
 		 176 aa  79  0.00000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.115108 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1946  cytochrome c, class I  40.5 
 
 		 143 aa  79  0.00000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.719262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3817  cytochrome c, class I  42.72 
 
 		 127 aa  77.4  0.0000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.376417  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2595  cytochrome c class I  43.75 
 
 		 129 aa  76.6  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0211957  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4608  cytochrome c class I  47.83 
 
 		 120 aa  76.3  0.0000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0752945 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2577  isocytochrome c2  39 
 
 		 144 aa  75.5  0.0000000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1235  cytochrome c, class I  39 
 
 		 144 aa  75.5  0.0000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.978444 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1791  cytochrome c class I  42.24 
 
 		 224 aa  75.1  0.0000000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.147068  normal  0.48223 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3169  cytochrome c2  37.76 
 
 		 126 aa  75.1  0.0000000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0675  cytochrome c class I  44.44 
 
 		 121 aa  74.3  0.000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2269  cytochrome c class I  42.71 
 
 		 129 aa  73.6  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0688156  normal  1 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_15043  predicted protein  44 
 
 		 112 aa  73.9  0.000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000188327  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1723  cytochrome c, class I  39.18 
 
 		 124 aa  73.2  0.000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1835  cytochrome c, class I  35 
 
 		 166 aa  73.2  0.000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.315382  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1172  cytochrome c class I  42.42 
 
 		 121 aa  73.2  0.000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.109894  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0011  cytochrome c class I  38.83 
 
 		 132 aa  73.2  0.000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0553485  normal  0.905582 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4583  cytochrome c class I  42.27 
 
 		 118 aa  72.8  0.000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00400374  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0032  cytochrome c, class I  43.96 
 
 		 160 aa  72.4  0.000000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00501524  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3255  cytochrome c, class I  44.21 
 
 		 124 aa  72.4  0.000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000474848  decreased coverage  0.000193536 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1601  cytochrome c, class I  34.62 
 
 		 125 aa  72  0.000000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.402085 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_78490  cytochrome c  38.3 
 
 		 110 aa  72  0.000000000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.635362  normal  0.967273 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4157  cytochrome c, class I  35.29 
 
 		 236 aa  71.6  0.000000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.362968  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3475  cytochrome c, class I  38.24 
 
 		 281 aa  71.6  0.000000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.234706  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA06950  electron carrier, putative  38.04 
 
 		 111 aa  71.2  0.00000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.073604  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0011  cytochrome c class I  41.94 
 
 		 132 aa  71.6  0.00000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3944  cytochrome c class I  36.46 
 
 		 136 aa  71.2  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.696873  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0817  cytochrome c, class I  41.9 
 
 		 149 aa  70.5  0.00000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.419035  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3480  cytochrome c, class I  40.2 
 
 		 154 aa  70.1  0.00000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.453541  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3480  cytochrome c, class I  40.59 
 
 		 127 aa  69.7  0.00000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2582  cytochrome c, class I  36.04 
 
 		 133 aa  69.3  0.00000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.170551 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2961  cytochrome c class I  39.81 
 
 		 113 aa  69.3  0.00000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0666033  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0712  cytochrome c, class I  35.9 
 
 		 184 aa  68.9  0.00000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.586308  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3651  cytochrome c, class I  41.18 
 
 		 158 aa  68.9  0.00000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.278584  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0174  cytochrome c2  34.55 
 
 		 131 aa  68.6  0.00000000009  Brucella suis 1330  Bacteria  hitchhiker  0.000396379  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0153  cytochrome c heme-binding site:cytochrome c, class IA/ IB:cytochrome c, class I  34.55 
 
 		 131 aa  68.6  0.00000000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.00000226956  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6323  cytochrome c class I  37.07 
 
 		 130 aa  68.6  0.00000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0100  cytochrome c class I  41.35 
 
 		 175 aa  67.8  0.0000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.102431  normal  0.12668 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2670  cytochrome c class I  35.19 
 
 		 148 aa  67.8  0.0000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.340076 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0257  cytochrome c class I  35.19 
 
 		 148 aa  67.8  0.0000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.466449  hitchhiker  0.00512389 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1307  cytochrome c, class I  36.84 
 
 		 147 aa  67.4  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.806426 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1287  cytochrome c class I  43.3 
 
 		 122 aa  67.4  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.208797  normal  0.579933 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2218  cytochrome c class I  37.37 
 
 		 132 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.925658 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3471  cytochrome c, class I  39.81 
 
 		 199 aa  67.4  0.0000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4138  cytochrome c, class I  38 
 
 		 133 aa  66.6  0.0000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3205  cytochrome c, class I  36.63 
 
 		 133 aa  66.6  0.0000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.983514  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4031  class I cytochrome c  38.83 
 
 		 129 aa  65.9  0.0000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.586339 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0654  cytochrome c552  29.41 
 
 		 174 aa  65.1  0.000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>