164 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_2631 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_2631  cytochrome c class I  100 
 
 		 181 aa  355  9.999999999999999e-98  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.292913 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4215  cytochrome c class I  53.51 
 
 		 184 aa  186  2e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.26019  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1769  cytochrome c, class I  55.74 
 
 		 183 aa  179  2e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.027087 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3913  cytochrome c class I  51.4 
 
 		 182 aa  176  1e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1618  cytochrome c class I  50.28 
 
 		 179 aa  174  7e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.278765  normal  0.160763 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7056  cytochrome c  56.59 
 
 		 182 aa  174  9e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.654005  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3730  cytochrome c, class I  56.52 
 
 		 184 aa  172  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0250  cytochrome c class I  50.59 
 
 		 220 aa  172  1.9999999999999998e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.312298  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0377  cytochrome c, class I  55.43 
 
 		 184 aa  169  3e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3648  cytochrome c class I  50.83 
 
 		 323 aa  167  1e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.238166  normal  0.256494 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3536  cytochrome c, class I  53.72 
 
 		 183 aa  165  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.347775  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0513  cytochrome c class I  51.69 
 
 		 180 aa  162  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.702649  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0039  cytochrome c, membrane-bound  51.65 
 
 		 202 aa  159  2e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.450907  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0287  cytochrome c, class I  46.2 
 
 		 185 aa  159  2e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0386  cytochrome c class I  49.17 
 
 		 305 aa  155  2e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0274347  normal  0.666851 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0039  cytochrome c, membrane-bound  53.22 
 
 		 192 aa  155  3e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0341  cytochrome c class I  49.17 
 
 		 305 aa  155  3e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3357  cytochrome c class I  47.19 
 
 		 179 aa  155  4e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.614662  normal  0.166545 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3474  cytochrome c, class I  45.35 
 
 		 186 aa  149  2e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4085  cytochrome c class I  50.85 
 
 		 188 aa  149  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0420  cytochrome c class I  47.16 
 
 		 307 aa  149  3e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.556176  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4405  cytochrome c class I  51.14 
 
 		 187 aa  148  5e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0102  cytochrome c  50 
 
 		 185 aa  147  9e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.108181  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1443  cytochrome c, class I  56.25 
 
 		 149 aa  145  2.0000000000000003e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0016  cytochrome c class I  49.72 
 
 		 224 aa  145  3e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.6838  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4085  cytochrome c, class I  44.57 
 
 		 286 aa  142  4e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.699648  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0712  cytochrome c, class I  46.51 
 
 		 184 aa  138  4.999999999999999e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.586308  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3426  cytochrome c class I  46.11 
 
 		 263 aa  136  1e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0678  cytochrome c, class I  39.88 
 
 		 173 aa  131  6e-30  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0621  cytochrome c, class I  43.27 
 
 		 212 aa  129  2.0000000000000002e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.276705  normal  0.860065 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0327  cytochrome C, membrane-bound  39.88 
 
 		 172 aa  124  7e-28  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4687  cytochrome c, class I  46.2 
 
 		 209 aa  122  4e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0285175  normal  0.266621 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0431  cytochrome c, class I  38.67 
 
 		 236 aa  116  1.9999999999999998e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0468  cytochrome c, class I  42.05 
 
 		 296 aa  114  1.0000000000000001e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.610669  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0644  cytochrome c, class I  40.78 
 
 		 474 aa  112  3e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.865539  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4582  cytochrome c class I  41.86 
 
 		 228 aa  111  5e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0803  cytochrome c family protein  40.67 
 
 		 158 aa  108  3e-23  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0473  cytochrome c  34.27 
 
 		 179 aa  109  3e-23  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.591637  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2553  cytochrome c, class I  44.08 
 
 		 166 aa  107  7.000000000000001e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0215476 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1808  cytochrome c, class I  43.75 
 
 		 176 aa  106  2e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.115108 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1235  cytochrome c family protein  40.19 
 
 		 185 aa  103  2e-21  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0620  cytochrome c, class I  48.94 
 
 		 147 aa  99.8  2e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.363015  normal  0.813784 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_78490  cytochrome c  42.72 
 
 		 110 aa  99.4  2e-20  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.635362  normal  0.967273 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0525  cytochrome c, class I  40.91 
 
 		 175 aa  100  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0840816  normal  0.414033 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0654  cytochrome c552  35.88 
 
 		 174 aa  98.6  5e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1946  cytochrome c, class I  56.38 
 
 		 143 aa  98.2  5e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.719262  normal  1 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_20948  predicted protein  48.48 
 
 		 104 aa  98.2  6e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0705  cytochrome cy  42.94 
 
 		 174 aa  97.1  1e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.229097  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2360  cytochrome c, class I  42.94 
 
 		 174 aa  97.1  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.442911  normal  0.208879 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3289  cytochrome c class I  39.5 
 
 		 169 aa  95.5  4e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.181782  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0011  cytochrome c class I  46.88 
 
 		 132 aa  94.7  6e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_15043  predicted protein  51.06 
 
 		 112 aa  94.7  7e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000188327  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2582  cytochrome c, class I  45.19 
 
 		 133 aa  94.4  8e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.170551 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3471  cytochrome c, class I  51.69 
 
 		 199 aa  94  1e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3255  cytochrome c, class I  52.69 
 
 		 124 aa  93.2  2e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000474848  decreased coverage  0.000193536 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2577  isocytochrome c2  47.47 
 
 		 144 aa  92  4e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1235  cytochrome c, class I  47.47 
 
 		 144 aa  92  4e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.978444 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3205  cytochrome c, class I  45.74 
 
 		 133 aa  90.9  8e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.983514  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0817  cytochrome c, class I  49.51 
 
 		 149 aa  90.9  9e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.419035  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA06950  electron carrier, putative  43.56 
 
 		 111 aa  90.5  1e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.073604  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2800  cytochrome c  36.36 
 
 		 235 aa  90.1  1e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.318955 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2511  cytochrome c class I  44.33 
 
 		 132 aa  89.7  2e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.657545  normal  0.0330621 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0675  cytochrome c class I  48.31 
 
 		 121 aa  89.4  2e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1172  cytochrome c class I  44.95 
 
 		 121 aa  88.2  5e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.109894  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2218  cytochrome c class I  44.9 
 
 		 132 aa  88.6  5e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.925658 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3864  cytochrome c, class I  34.32 
 
 		 170 aa  87.8  7e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.166005  normal  0.942386 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3501  cytochrome c, class I  43.4 
 
 		 225 aa  87.8  7e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.466234 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4156  cytochrome c, class I  50 
 
 		 382 aa  87.8  8e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.1533  normal  0.864347 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3944  cytochrome c class I  46.32 
 
 		 136 aa  85.5  3e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.696873  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4138  cytochrome c, class I  44.21 
 
 		 133 aa  85.5  4e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1835  cytochrome c, class I  35 
 
 		 166 aa  85.5  4e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.315382  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4157  cytochrome c, class I  38.69 
 
 		 236 aa  85.5  4e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.362968  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0257  cytochrome c class I  39.81 
 
 		 148 aa  84  0.000000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.466449  hitchhiker  0.00512389 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3552  cytochrome c, class I  38.39 
 
 		 128 aa  84  0.000000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.296099 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1287  cytochrome c class I  49.41 
 
 		 122 aa  84  0.000000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.208797  normal  0.579933 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4103  cytochrome c class I  43.12 
 
 		 130 aa  84  0.000000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.721934  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0032  cytochrome c, class I  44.32 
 
 		 160 aa  83.6  0.000000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00501524  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2670  cytochrome c class I  39.81 
 
 		 148 aa  84  0.000000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.340076 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6382  cytochrome c class I  46 
 
 		 131 aa  84  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.832746  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0011  cytochrome c class I  41.86 
 
 		 132 aa  83.2  0.000000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0553485  normal  0.905582 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4583  cytochrome c class I  43.62 
 
 		 118 aa  82.4  0.000000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00400374  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1723  cytochrome c, class I  44.09 
 
 		 124 aa  82.4  0.000000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0174  cytochrome c2  37.29 
 
 		 131 aa  82  0.000000000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  hitchhiker  0.000396379  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2595  cytochrome c class I  46.46 
 
 		 129 aa  82  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0211957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0153  cytochrome c heme-binding site:cytochrome c, class IA/ IB:cytochrome c, class I  37.29 
 
 		 131 aa  82  0.000000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.00000226956  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2327  cytochrome c  43.3 
 
 		 119 aa  81.6  0.000000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2126  cytochrome c, class I  40 
 
 		 140 aa  81.3  0.000000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00970187  hitchhiker  0.00260519 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0240  putative cytochrome c  43.48 
 
 		 130 aa  81.6  0.000000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3076  cytochrome c class I  35.77 
 
 		 165 aa  81.3  0.000000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4608  cytochrome c class I  46.6 
 
 		 120 aa  81.6  0.000000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0752945 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1601  cytochrome c, class I  43.14 
 
 		 125 aa  81.6  0.000000000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.402085 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1792  cytochrome c class I  42.2 
 
 		 132 aa  81.3  0.000000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0298135  normal  0.587019 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2269  cytochrome c class I  47 
 
 		 129 aa  81.3  0.000000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0688156  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3817  cytochrome c, class I  44.55 
 
 		 127 aa  80.9  0.000000000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.376417  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3032  cytochrome c class I  41.49 
 
 		 118 aa  80.1  0.00000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.289896  normal  0.0165662 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1661  cytochrome C  40 
 
 		 115 aa  80.5  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1791  cytochrome c class I  43.81 
 
 		 224 aa  79.7  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.147068  normal  0.48223 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3651  cytochrome c, class I  42.42 
 
 		 158 aa  80.1  0.00000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.278584  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6323  cytochrome c class I  40.86 
 
 		 130 aa  79.7  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2801  cytochrome c  40 
 
 		 342 aa  79  0.00000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.26281 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>