186 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC7_0870 on replicon NC_009637
Organism: Methanococcus maripaludis C7



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009637  MmarC7_0870  ferredoxin  100 
 
 
170 aa  341  2.9999999999999997e-93  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00207801 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1786  ferredoxin  95.29 
 
 
170 aa  331  3e-90  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1047  ferredoxin  95.88 
 
 
170 aa  330  4e-90  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0932  ferredoxin  79.41 
 
 
170 aa  290  9e-78  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1358  ferredoxin  64.12 
 
 
176 aa  233  1.0000000000000001e-60  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4080  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  28.23 
 
 
197 aa  57.8  0.00000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0562629 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0885  putative oxidoreductase  46.67 
 
 
612 aa  55.8  0.0000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1054  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  42.19 
 
 
180 aa  54.7  0.0000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0281  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  35.48 
 
 
165 aa  53.1  0.000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000516884 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1302  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  32.97 
 
 
167 aa  53.1  0.000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2135  protein of unknown function DUF362  36.71 
 
 
375 aa  52.8  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1222  putative oxidoreductase  26.57 
 
 
616 aa  53.1  0.000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0767368  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1601  putative oxidoreductase  37.35 
 
 
615 aa  52.8  0.000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1736  putative oxidoreductase  44.83 
 
 
615 aa  52.4  0.000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1899  NADH dehydrogenase subunit I  36.51 
 
 
169 aa  52  0.000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.00550248  normal  0.26939 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2235  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  29.31 
 
 
165 aa  50.4  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.272952  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3407  F420H2 dehydrogenase subunit I  40 
 
 
136 aa  49.3  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00224717  normal  0.799807 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2701  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  33.33 
 
 
85 aa  50.1  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.118959  hitchhiker  0.0000735154 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3387  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  28.45 
 
 
165 aa  49.3  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.533197  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0374  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  34.15 
 
 
160 aa  48.1  0.00005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2205  putative oxidoreductase  39.34 
 
 
598 aa  48.1  0.00005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.204646  normal  0.261416 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0770  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  32.1 
 
 
546 aa  48.1  0.00006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1072  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  34.48 
 
 
233 aa  48.1  0.00006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0372  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  42.03 
 
 
418 aa  47.8  0.00007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02503  ferredoxin  38.03 
 
 
165 aa  47.4  0.00008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1083  NADH dehydrogenase subunit I  28.21 
 
 
156 aa  47.4  0.00009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0657  NADH dehydrogenase subunit I  36.92 
 
 
156 aa  47.4  0.00009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0146  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  32.74 
 
 
204 aa  47  0.0001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00110619  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0475  ferredoxin hydrogenase  38.81 
 
 
458 aa  47  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0725  hydrogenase-like  40 
 
 
483 aa  47  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000665726  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0820  NADH dehydrogenase subunit I  36.36 
 
 
160 aa  46.6  0.0001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5106  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  31.07 
 
 
188 aa  47.4  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2548  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  39.66 
 
 
399 aa  46.2  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2588  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit F  39.66 
 
 
486 aa  46.6  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.228886 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1292  F420H2 dehydrogenase subunit I  39.66 
 
 
135 aa  46.2  0.0002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000000020121  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1363  NADH dehydrogenase subunit I  33.96 
 
 
162 aa  46.6  0.0002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.353821  normal  0.140777 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1632  NADH dehydrogenase subunit I  32.8 
 
 
159 aa  46.2  0.0002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.285912  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0152  aldo/keto reductase  26.04 
 
 
315 aa  46.2  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.145765  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0516  NADH dehydrogenase subunit I  35.38 
 
 
155 aa  46.2  0.0002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2519  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  32.29 
 
 
85 aa  46.6  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0546  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  41.51 
 
 
749 aa  46.2  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0478  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  37.5 
 
 
180 aa  45.8  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.195582 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3216  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  35.29 
 
 
168 aa  45.8  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0553  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit F  40 
 
 
436 aa  45.8  0.0003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.238228  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1977  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  34.78 
 
 
1021 aa  45.8  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1896  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  30.68 
 
 
109 aa  45.4  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0647  NADH dehydrogenase subunit I  34.85 
 
 
154 aa  45.8  0.0003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.413211  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0708  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  32.14 
 
 
393 aa  45.8  0.0003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.748005 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0265  iron-sulfur cluster-binding protein, putative  32.56 
 
 
427 aa  45.4  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1845  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  26.13 
 
 
175 aa  45.4  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1308  hypothetical protein  31.76 
 
 
396 aa  45.4  0.0004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.241183  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0092  protein of unknown function DUF362  36.62 
 
 
378 aa  45.4  0.0004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0327  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  29.81 
 
 
132 aa  45.4  0.0004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0774  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  32.95 
 
 
394 aa  45.4  0.0004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.290777  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1210  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  30.95 
 
 
393 aa  45.4  0.0004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1086  NADH dehydrogenase (quinone)  33.33 
 
 
526 aa  45.1  0.0005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05703  hypothetical protein similar to : Formate hydrogenlyase subunit 6/NADH:ubiquinone oxidoreductase 23 kD subunit (Broad)  34.12 
 
 
224 aa  44.7  0.0006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.803618 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4074  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  31.91 
 
 
165 aa  44.7  0.0006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.138304  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_88630  mitochondrial complex I NUIM TYKY subunit (proton translocation)  35.63 
 
 
226 aa  44.7  0.0006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.970128  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0115  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  32.14 
 
 
393 aa  44.7  0.0006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1334  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  42.11 
 
 
368 aa  44.7  0.0006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0262596 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3818  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  24.41 
 
 
171 aa  44.7  0.0007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.121238  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4108  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  33.33 
 
 
543 aa  44.7  0.0007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00112813  normal  0.10156 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0590  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  26.26 
 
 
193 aa  44.7  0.0007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.321199  normal  0.0726 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4569  formate hydrogenlyase complex iron-sulfur subunit  37.7 
 
 
189 aa  44.3  0.0008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_14260  predicted protein  34.12 
 
 
163 aa  44.3  0.0009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0318  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  32.76 
 
 
175 aa  44.3  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.188751  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1563  NADH dehydrogenase subunit I  40 
 
 
162 aa  43.9  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.339949  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1301  NADH dehydrogenase subunit I  35.29 
 
 
162 aa  43.5  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  decreased coverage  0.00320411  normal  0.488956 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1575  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  42.62 
 
 
429 aa  43.9  0.001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2238  NADH dehydrogenase subunit I  31.13 
 
 
163 aa  43.5  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.180184 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0182  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  28.7 
 
 
194 aa  44.3  0.001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3476  molybdopterin oxidoreductase, iron-sulfur binding subunit  35.23 
 
 
1031 aa  43.9  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.460173  normal  0.230979 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1636  formate hydrogenlyase complex iron-sulfur subunit  36.67 
 
 
179 aa  44.3  0.001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0109811  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0585  coenzyme F420 hydrogenase/dehydrogenase beta subunit  31.25 
 
 
395 aa  42.7  0.002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.00081136  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0298  pyruvate flavodoxin/ferredoxin oxidoreductase domain protein  37.5 
 
 
1178 aa  43.1  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1794  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  28.85 
 
 
132 aa  43.1  0.002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.178845  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2292  NADH dehydrogenase subunit I  34.12 
 
 
161 aa  43.1  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0579  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  34.38 
 
 
75 aa  43.1  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1161  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  39.22 
 
 
519 aa  42.7  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1043  NADH dehydrogenase subunit I  36.67 
 
 
163 aa  43.1  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1159  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  33.77 
 
 
1002 aa  43.1  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0829  NADH dehydrogenase subunit I  36.67 
 
 
163 aa  43.1  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.260339  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1437  NADH dehydrogenase subunit I  35.94 
 
 
210 aa  43.1  0.002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2523  NADH dehydrogenase subunit I  38.33 
 
 
167 aa  42.4  0.003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.208294  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1869  NADH-quinone oxidoreductase chain I  36.92 
 
 
177 aa  42.4  0.003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5665  putative iron-sulfur binding oxidoreductase  35.29 
 
 
1037 aa  42.4  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.858878  normal  0.730626 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0166  NADH dehydrogenase (quinone)  35.19 
 
 
612 aa  42.4  0.003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0754  NADH dehydrogenase subunit I  31.13 
 
 
164 aa  42.4  0.003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.180315  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0879  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  27.88 
 
 
381 aa  42.4  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4109  pyruvate flavodoxin/ferredoxin oxidoreductase domain-containing protein  33.33 
 
 
1193 aa  42.4  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.118304  normal  0.224474 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3296  NADH dehydrogenase subunit I  28.19 
 
 
139 aa  42.7  0.003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0961  NADH-plastoquinone oxidoreductase subunit  31.03 
 
 
146 aa  42.4  0.003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.195043  normal  0.804187 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1185  NADH dehydrogenase subunit I  38.33 
 
 
167 aa  42.4  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0684834  normal  0.389473 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1501  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  32 
 
 
442 aa  42.4  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0886  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  29.79 
 
 
373 aa  42.4  0.003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.38221  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1997  NADH dehydrogenase subunit I  38.33 
 
 
167 aa  42.4  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0446418  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3193  formate hydrogenlyase complex iron-sulfur subunit  31.67 
 
 
180 aa  42.4  0.003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3865  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  35.48 
 
 
222 aa  42.4  0.003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0691  NADH dehydrogenase subunit I  30.93 
 
 
169 aa  42  0.004  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.438917  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>