More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_0281 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010085  Nmar_0281  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  100 
 
 
165 aa  344  3e-94  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000516884 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1302  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  36.69 
 
 
167 aa  80.9  0.000000000000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4455  NADH dehydrogenase subunit I  32.28 
 
 
211 aa  80.1  0.00000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.829117  normal  0.833546 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4057  NADH dehydrogenase subunit I  32.28 
 
 
211 aa  80.1  0.00000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.819652  normal  0.545712 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1899  NADH dehydrogenase subunit I  32.64 
 
 
169 aa  78.2  0.00000000000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.00550248  normal  0.26939 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2687  NADH dehydrogenase subunit I  41.84 
 
 
183 aa  76.6  0.0000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0721276  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0547  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  41.84 
 
 
226 aa  75.9  0.0000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.481769 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7011  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  32.45 
 
 
169 aa  75.9  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07460  NADH dehydrogenase subunit I  40.62 
 
 
252 aa  76.6  0.0000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0206751 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3221  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  43 
 
 
254 aa  75.9  0.0000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.129277 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0289  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  31.43 
 
 
171 aa  75.5  0.0000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.998746  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4236  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  32.64 
 
 
132 aa  75.1  0.0000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000114859  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0477  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  38.89 
 
 
300 aa  74.7  0.0000000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.376416  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7683  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  35.38 
 
 
203 aa  74.7  0.0000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3347  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  34.04 
 
 
131 aa  74.7  0.0000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.715886  normal  0.525186 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4410  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  38.78 
 
 
194 aa  73.9  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6086  NADH dehydrogenase subunit I  38.78 
 
 
211 aa  73.6  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00224994  normal  0.0520295 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0592  Formate hydrogenlyase subunit 6/NADH:ubiquinone oxidoreductase 23 kD subunit (chain I)-like protein  34.56 
 
 
171 aa  73.2  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2708  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  42.11 
 
 
247 aa  72.8  0.000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0546  NADH dehydrogenase subunit I  33.59 
 
 
217 aa  73.2  0.000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.175795  normal  0.434998 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0711  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  27.78 
 
 
170 aa  72.4  0.000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0425782  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1054  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  36.79 
 
 
180 aa  72.8  0.000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0275  NADH dehydrogenase subunit I  38.78 
 
 
199 aa  72.4  0.000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1157  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  30.2 
 
 
177 aa  72  0.000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3130  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  32.39 
 
 
135 aa  72  0.000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4550  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  37.76 
 
 
211 aa  72  0.000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4080  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  32.24 
 
 
197 aa  72  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0562629 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1282  NADH-quinone oxidoreductase chain I  30.41 
 
 
185 aa  72.4  0.000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.425102 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1120  NADH dehydrogenase subunit I  27.08 
 
 
180 aa  72  0.000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.311189  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3818  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  28.67 
 
 
171 aa  71.2  0.000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.121238  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0346  NADH dehydrogenase I, I subunit  32.39 
 
 
132 aa  70.9  0.000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0647  NADH dehydrogenase subunit I  33.58 
 
 
154 aa  70.9  0.000000000008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.413211  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5061  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  37 
 
 
185 aa  70.9  0.000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.451376  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4126  NADH dehydrogenase subunit I  30.87 
 
 
182 aa  70.1  0.00000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1739  NADH dehydrogenase subunit I  30.87 
 
 
182 aa  70.1  0.00000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.235938  normal  0.220023 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3698  NADH dehydrogenase subunit I  30.87 
 
 
182 aa  70.1  0.00000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.380267  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1344  NADH dehydrogenase subunit I  28.39 
 
 
202 aa  70.5  0.00000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1866  NADH dehydrogenase subunit I  30.87 
 
 
182 aa  70.1  0.00000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0422789 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28510  NADH dehydrogenase subunit I  30.07 
 
 
182 aa  69.7  0.00000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.559317  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3407  F420H2 dehydrogenase subunit I  30 
 
 
136 aa  69.7  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00224717  normal  0.799807 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3610  NADH dehydrogenase subunit I  30.87 
 
 
182 aa  69.7  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.487333  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0516  NADH dehydrogenase subunit I  29.37 
 
 
155 aa  69.7  0.00000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1736  putative oxidoreductase  32.17 
 
 
615 aa  69.3  0.00000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1083  NADH dehydrogenase subunit I  30.28 
 
 
156 aa  69.3  0.00000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3372  NADH dehydrogenase I, I subunit  30.2 
 
 
182 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.675448  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3204  NADH dehydrogenase subunit I  30.2 
 
 
182 aa  68.9  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0843328  normal  0.169624 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5106  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  32 
 
 
188 aa  68.9  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3125  NADH dehydrogenase subunit I  28.28 
 
 
179 aa  68.9  0.00000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3918  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  29.86 
 
 
132 aa  68.6  0.00000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2867  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  27.97 
 
 
171 aa  68.6  0.00000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.708253  normal  0.0292468 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1526  NADH dehydrogenase subunit I  28.03 
 
 
218 aa  68.2  0.00000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4002  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  29.86 
 
 
132 aa  68.6  0.00000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.89067e-17 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02321  NADH dehydrogenase subunit I  28.03 
 
 
218 aa  68.2  0.00000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26891  NADH dehydrogenase subunit I  28.57 
 
 
218 aa  68.2  0.00000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2562  NADH dehydrogenase subunit I  30.07 
 
 
182 aa  67.8  0.00000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29920  NADH dehydrogenase subunit I  30.07 
 
 
182 aa  67.8  0.00000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.546828  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1238  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  29.63 
 
 
181 aa  67.4  0.00000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0657  NADH dehydrogenase subunit I  33.33 
 
 
156 aa  67.4  0.00000000008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1113  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  27.61 
 
 
170 aa  67.4  0.00000000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.182151  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13174  NADH dehydrogenase subunit I  34.82 
 
 
218 aa  67  0.0000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0394  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  36.73 
 
 
175 aa  66.6  0.0000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4074  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  29.41 
 
 
165 aa  66.6  0.0000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.138304  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2419  NADH dehydrogenase subunit I  29.33 
 
 
182 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.193406 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1014  NADH dehydrogenase subunit I  27.97 
 
 
180 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4064  NADH dehydrogenase subunit I  28.86 
 
 
171 aa  66.2  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0149353  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1292  F420H2 dehydrogenase subunit I  30.71 
 
 
135 aa  66.2  0.0000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000000020121  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4489  NADH dehydrogenase subunit I  36.73 
 
 
175 aa  65.9  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.159742 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0528  NADH dehydrogenase subunit I  34.15 
 
 
196 aa  66.2  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1632  NADH dehydrogenase subunit I  30.53 
 
 
159 aa  66.2  0.0000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.285912  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1877  NADH dehydrogenase subunit I  36.73 
 
 
174 aa  66.2  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1352  NADH dehydrogenase subunit I  27.08 
 
 
171 aa  65.9  0.0000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1692  NADH dehydrogenase subunit I  26.39 
 
 
182 aa  65.5  0.0000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3615  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  33.33 
 
 
211 aa  65.5  0.0000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1374  NADH dehydrogenase I chain I  29.41 
 
 
175 aa  65.5  0.0000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00228535  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0591  NADH dehydrogenase subunit I  32.32 
 
 
182 aa  65.1  0.0000000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0623179  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0161  NADH dehydrogenase subunit I  27.81 
 
 
208 aa  65.1  0.0000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.646634  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0982  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  37.23 
 
 
214 aa  65.1  0.0000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01881  NADH dehydrogenase subunit I  26.75 
 
 
208 aa  65.1  0.0000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1461  NADH dehydrogenase subunit I  29.37 
 
 
180 aa  65.1  0.0000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1809  NADH dehydrogenase subunit I  29.37 
 
 
180 aa  65.1  0.0000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.693845 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0323  NADH dehydrogenase subunit I  30.61 
 
 
176 aa  65.1  0.0000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3176  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  32.12 
 
 
167 aa  65.5  0.0000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1567  NADH dehydrogenase subunit I  29.37 
 
 
180 aa  65.1  0.0000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.997394  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01761  NADH dehydrogenase subunit I  27.15 
 
 
215 aa  65.1  0.0000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.273282  normal 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_18502  predicted protein  27.78 
 
 
167 aa  64.7  0.0000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0613487 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0820  NADH dehydrogenase subunit I  26.71 
 
 
160 aa  64.7  0.0000000006  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0281  NADH dehydrogenase subunit I  26.75 
 
 
210 aa  64.3  0.0000000007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01771  NADH dehydrogenase subunit I  27.15 
 
 
208 aa  64.3  0.0000000007  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.351878  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2041  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  27.4 
 
 
165 aa  64.3  0.0000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000212693  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2528  NADH dehydrogenase subunit I  30.32 
 
 
200 aa  64.3  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01791  NADH dehydrogenase subunit I  28.37 
 
 
208 aa  63.9  0.0000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0374  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  32.59 
 
 
160 aa  63.9  0.0000000009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1601  putative oxidoreductase  40.45 
 
 
615 aa  63.5  0.000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0980  NADH dehydrogenase subunit I  26.97 
 
 
169 aa  63.5  0.000000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0211  NADH dehydrogenase subunit I  34.69 
 
 
176 aa  63.5  0.000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2411  NADH dehydrogenase subunit I  26.53 
 
 
215 aa  63.5  0.000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1020  NADH dehydrogenase subunit I  26.12 
 
 
171 aa  63.5  0.000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.755319  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1222  putative oxidoreductase  37.36 
 
 
616 aa  63.5  0.000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0767368  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0580  NADH dehydrogenase subunit I  31.31 
 
 
182 aa  63.2  0.000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0627884  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1997  NADH dehydrogenase subunit I  29.58 
 
 
167 aa  63.5  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0446418  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>