More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_1072 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008698  Tpen_1072  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  100 
 
 
233 aa  471  1e-132  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3407  F420H2 dehydrogenase subunit I  34.29 
 
 
136 aa  71.6  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00224717  normal  0.799807 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1292  F420H2 dehydrogenase subunit I  35.19 
 
 
135 aa  70.9  0.00000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000000020121  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1609  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  35.4 
 
 
187 aa  64.7  0.000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.999472 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2631  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  46.75 
 
 
230 aa  64.3  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.87866  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3216  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  36.54 
 
 
168 aa  62.8  0.000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0885  putative oxidoreductase  34.31 
 
 
612 aa  62.4  0.000000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1251  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  31.43 
 
 
147 aa  62.4  0.000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1736  putative oxidoreductase  34 
 
 
615 aa  62  0.000000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1279  hydrogenase 4 subunit H  35.59 
 
 
189 aa  61.2  0.00000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.641192  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1735  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  34.95 
 
 
120 aa  60.5  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.19658  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0092  protein of unknown function DUF362  37.04 
 
 
378 aa  60.8  0.00000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1302  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  38.2 
 
 
167 aa  60.1  0.00000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1238  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  34.29 
 
 
181 aa  59.7  0.00000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1083  NADH dehydrogenase subunit I  39.74 
 
 
156 aa  60.1  0.00000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2687  NADH dehydrogenase subunit I  37.65 
 
 
183 aa  59.7  0.00000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0721276  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1536  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  33.62 
 
 
170 aa  59.7  0.00000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5061  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  35.42 
 
 
185 aa  58.9  0.00000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.451376  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1011  NADH dehydrogenase subunit I  36.36 
 
 
162 aa  59.3  0.00000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.210818  normal  0.566427 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0347  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  40.7 
 
 
269 aa  58.9  0.00000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4398  NADH dehydrogenase subunit I  35.35 
 
 
162 aa  58.9  0.00000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4057  NADH dehydrogenase subunit I  37.62 
 
 
211 aa  58.9  0.00000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.819652  normal  0.545712 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1619  ech hydrogenase subunit F  31.73 
 
 
124 aa  58.9  0.00000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4134  NADH dehydrogenase subunit I  35.35 
 
 
162 aa  58.9  0.00000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.181277  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0547  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  40.28 
 
 
226 aa  58.5  0.00000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.481769 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1978  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta-component ferrodoxin domain protein  37.78 
 
 
314 aa  58.5  0.00000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.996407  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2592  NADH-plastoquinone oxidoreductase subunit  30.11 
 
 
134 aa  58.5  0.00000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1206  NADH dehydrogenase subunit I  35.35 
 
 
162 aa  57.8  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2242  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta-component ferrodoxin domain protein  37.78 
 
 
314 aa  57.8  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0477  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  41.33 
 
 
300 aa  57.8  0.0000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.376416  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7683  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  40 
 
 
203 aa  57.8  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1077  NADH dehydrogenase subunit I  35.35 
 
 
162 aa  57.8  0.0000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.280148 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2279  pyruvate ferredoxin oxidoreductase subunit gamma/delta  40 
 
 
312 aa  57.8  0.0000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.00253279  normal  0.440233 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0275  NADH dehydrogenase subunit I  37.65 
 
 
199 aa  57.8  0.0000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0528  NADH dehydrogenase subunit I  34.52 
 
 
196 aa  58.2  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4455  NADH dehydrogenase subunit I  36.63 
 
 
211 aa  57.8  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.829117  normal  0.833546 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3941  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  37.08 
 
 
315 aa  57.8  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000105876  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4410  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  35.29 
 
 
194 aa  57.4  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4550  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  37.65 
 
 
211 aa  57.4  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2052  pyruvate ferredoxin oxidoreductase subunit gamma/delta  41.67 
 
 
312 aa  57.4  0.0000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.227977 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2714  hydrogenase 4 subunit H  30 
 
 
189 aa  57  0.0000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.594807  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0289  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  32.23 
 
 
171 aa  57  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.998746  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0476  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  35.56 
 
 
455 aa  57.4  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.474236  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2235  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  35.85 
 
 
165 aa  57  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.272952  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1686  NADH ubiquinone oxidoreductase 20 kDa subunit  30.23 
 
 
266 aa  56.6  0.0000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0374  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  33 
 
 
160 aa  56.6  0.0000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4080  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  31.53 
 
 
197 aa  57  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0562629 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07460  NADH dehydrogenase subunit I  38.36 
 
 
252 aa  56.6  0.0000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0206751 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3019  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  34.29 
 
 
128 aa  56.6  0.0000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4489  NADH dehydrogenase subunit I  34.86 
 
 
175 aa  57  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.159742 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2708  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  35.42 
 
 
247 aa  57  0.0000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3176  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  30.28 
 
 
167 aa  56.2  0.0000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2276  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  26.56 
 
 
132 aa  56.2  0.0000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0276213  normal  0.374891 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0886  NADH ubiquinone oxidoreductase, 20 kDa subunit  34.21 
 
 
263 aa  56.6  0.0000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0786  NADH dehydrogenase subunit I  33.33 
 
 
163 aa  56.2  0.0000004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.079686  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4074  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  42.42 
 
 
165 aa  55.8  0.0000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.138304  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0592  Formate hydrogenlyase subunit 6/NADH:ubiquinone oxidoreductase 23 kD subunit (chain I)-like protein  37.65 
 
 
171 aa  56.2  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1542  NADH dehydrogenase subunit I  35.8 
 
 
174 aa  55.8  0.0000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.383544  normal  0.0726132 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0546  NADH dehydrogenase subunit I  37.65 
 
 
217 aa  55.8  0.0000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.175795  normal  0.434998 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1210  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  33.65 
 
 
160 aa  55.8  0.0000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00161694  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1572  NADH dehydrogenase subunit I  35.8 
 
 
174 aa  56.2  0.0000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0126  formate hydrogenlyase complex iron-sulfur subunit  32.08 
 
 
176 aa  55.8  0.0000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1596  NADH dehydrogenase subunit I  35.8 
 
 
174 aa  56.2  0.0000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.557888  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1351  iron-sulfur cluster-binding protein  37.78 
 
 
322 aa  55.5  0.0000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5106  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  32.63 
 
 
188 aa  55.8  0.0000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2729  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  31.96 
 
 
125 aa  55.8  0.0000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.396003  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0657  NADH dehydrogenase subunit I  28.57 
 
 
156 aa  55.8  0.0000006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3221  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  32.69 
 
 
254 aa  55.8  0.0000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.129277 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0324  pyruvate ferredoxin oxidoreductase subunit gamma/delta  39.19 
 
 
312 aa  55.8  0.0000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2051  NADH dehydrogenase subunit I  33.33 
 
 
162 aa  55.5  0.0000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.100158  normal  0.722093 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1899  NADH dehydrogenase subunit I  36.23 
 
 
169 aa  55.5  0.0000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.00550248  normal  0.26939 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2926  NADH dehydrogenase subunit I  33.33 
 
 
162 aa  55.5  0.0000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2390  NADH dehydrogenase subunit I  33.33 
 
 
162 aa  55.5  0.0000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0000573568  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2212  NADH dehydrogenase subunit I  32.99 
 
 
162 aa  55.1  0.0000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.199823  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2225  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  29.01 
 
 
119 aa  55.5  0.0000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0182  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  33.98 
 
 
194 aa  55.1  0.0000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1282  NADH-quinone oxidoreductase chain I  40.58 
 
 
185 aa  55.5  0.0000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.425102 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1794  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  25.78 
 
 
132 aa  55.5  0.0000008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.178845  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0868  hydrogenase, EchF subunit, putative  34.34 
 
 
114 aa  55.1  0.0000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.246901  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0394  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  35.8 
 
 
175 aa  55.1  0.0000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0982  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  39.73 
 
 
214 aa  55.1  0.0000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3387  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  32.69 
 
 
165 aa  54.3  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.533197  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13174  NADH dehydrogenase subunit I  34.86 
 
 
218 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0591  NADH dehydrogenase subunit I  37.97 
 
 
182 aa  54.3  0.000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0623179  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0647  NADH dehydrogenase subunit I  25.85 
 
 
154 aa  54.7  0.000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.413211  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1570  Iron-sulfur cluster-binding protein  36.67 
 
 
320 aa  54.7  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0018133  normal  0.554511 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0666  pyruvate ferredoxin oxidoreductase, delta subunit  41.67 
 
 
103 aa  54.7  0.000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1222  putative oxidoreductase  30.97 
 
 
616 aa  54.7  0.000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0767368  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2412  NADH dehydrogenase subunit I  32.65 
 
 
162 aa  54.3  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0701412  normal  0.0109704 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1845  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  38.46 
 
 
175 aa  54.7  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1374  NADH dehydrogenase I chain I  38.1 
 
 
175 aa  55.1  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00228535  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03240  NADH dehydrogenase subunit I  41.18 
 
 
187 aa  54.7  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1664  NADH dehydrogenase subunit I  37.04 
 
 
212 aa  54.7  0.000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.910659  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1877  NADH dehydrogenase subunit I  36.47 
 
 
174 aa  55.1  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1797  pyruvate ferredoxin oxidoreductase subunit gamma/delta  36.56 
 
 
312 aa  54.7  0.000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.549394 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1879  NADH dehydrogenase subunit I  32.22 
 
 
162 aa  54.3  0.000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.508831  normal  0.262119 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4553  NADH dehydrogenase subunit I  34.34 
 
 
162 aa  54.3  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.128776 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4569  formate hydrogenlyase complex iron-sulfur subunit  32.14 
 
 
189 aa  54.3  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2877  NADH dehydrogenase subunit I  32.22 
 
 
162 aa  53.9  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.670141  normal  0.245456 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0580  NADH dehydrogenase subunit I  37.5 
 
 
182 aa  54.3  0.000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0627884  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>