More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_1735 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_1735  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  100 
 
 
120 aa  250  4.0000000000000004e-66  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.19658  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3019  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  62.39 
 
 
128 aa  157  7e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2649  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  52 
 
 
124 aa  114  5e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3366  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  45.63 
 
 
124 aa  108  3e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0802  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  52.08 
 
 
143 aa  108  3e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2729  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  39.45 
 
 
125 aa  105  2e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.396003  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1575  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  41.28 
 
 
118 aa  105  3e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.378738 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1087  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  43.43 
 
 
126 aa  104  4e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.199515  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0029  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  49.48 
 
 
132 aa  104  5e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.740591  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07270  NADH:ubiquinone oxidoreductase chain I-like protein  41 
 
 
144 aa  97.1  8e-20  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.194831  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1746  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  41.58 
 
 
126 aa  96.7  1e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.117316  normal  0.169635 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13390  NADH:ubiquinone oxidoreductase chain I-like protein  38.46 
 
 
300 aa  88.2  4e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0359  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  38.53 
 
 
137 aa  86.7  1e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.389244  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1668  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  40.59 
 
 
133 aa  86.3  1e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1523  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  36 
 
 
131 aa  85.5  2e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2506  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  37 
 
 
130 aa  84.7  4e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1619  ech hydrogenase subunit F  36.89 
 
 
124 aa  84.7  4e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4119  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  38.89 
 
 
104 aa  84.3  5e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0840817  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0147  ech hydrogenase subunit F  36.56 
 
 
122 aa  82.4  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0554  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  35.78 
 
 
127 aa  76.3  0.0000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0786  ech hydrogenase subunit F  37.89 
 
 
114 aa  71.2  0.000000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1251  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  30.25 
 
 
147 aa  70.5  0.000000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1103  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  33.65 
 
 
126 aa  66.2  0.0000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0374  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  37.37 
 
 
250 aa  64.3  0.0000000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0161  NADH dehydrogenase subunit I  34.62 
 
 
208 aa  63.9  0.0000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.646634  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01791  NADH dehydrogenase subunit I  37.86 
 
 
208 aa  64.3  0.0000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1526  NADH dehydrogenase subunit I  36.46 
 
 
218 aa  63.9  0.0000000007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01771  NADH dehydrogenase subunit I  34.62 
 
 
208 aa  63.9  0.0000000007  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.351878  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02321  NADH dehydrogenase subunit I  36.46 
 
 
218 aa  63.9  0.0000000007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2276  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  38.38 
 
 
132 aa  63.9  0.0000000008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0276213  normal  0.374891 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3216  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  31.03 
 
 
168 aa  62.8  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_771  hydrogenase, EchF subunit  34.38 
 
 
114 aa  63.2  0.000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2411  NADH dehydrogenase subunit I  36.89 
 
 
215 aa  63.2  0.000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1344  NADH dehydrogenase subunit I  36.46 
 
 
202 aa  62.8  0.000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2528  NADH dehydrogenase subunit I  34.95 
 
 
200 aa  63.2  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01761  NADH dehydrogenase subunit I  36.46 
 
 
215 aa  62.8  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.273282  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01881  NADH dehydrogenase subunit I  37.5 
 
 
208 aa  63.2  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26891  NADH dehydrogenase subunit I  37.5 
 
 
218 aa  63.2  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0868  hydrogenase, EchF subunit, putative  33.68 
 
 
114 aa  62  0.000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.246901  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0281  NADH dehydrogenase subunit I  36.46 
 
 
210 aa  62.4  0.000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2185  formate hydrogenlyase complex iron-sulfur subunit  34.95 
 
 
184 aa  62.4  0.000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.233255 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1040  NADH dehydrogenase subunit I  36.46 
 
 
193 aa  62  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000326556 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1011  NADH dehydrogenase subunit I  36.46 
 
 
193 aa  62  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2715  NADH dehydrogenase subunit I  36.46 
 
 
194 aa  62  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.451197 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0401  NADH-plastoquinone oxidoreductase subunit I  34.95 
 
 
194 aa  61.2  0.000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1578  NADH dehydrogenase subunit I  33.98 
 
 
209 aa  61.2  0.000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.116678  normal  0.902926 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1072  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  34.95 
 
 
233 aa  61.2  0.000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4569  formate hydrogenlyase complex iron-sulfur subunit  32.08 
 
 
189 aa  60.5  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2235  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  29.57 
 
 
165 aa  59.7  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.272952  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3387  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  30.43 
 
 
165 aa  59.3  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.533197  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0677  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  27.27 
 
 
148 aa  58.9  0.00000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0257  NADH-plastoquinone oxidoreductase subunit I  34.38 
 
 
207 aa  59.3  0.00000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2714  hydrogenase 4 subunit H  34 
 
 
189 aa  58.5  0.00000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.594807  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4913  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  31.07 
 
 
507 aa  58.5  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.339374  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1667  NADH dehydrogenase subunit I  34.38 
 
 
193 aa  58.2  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2225  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  30.93 
 
 
119 aa  57.4  0.00000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3130  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  29.17 
 
 
135 aa  57.4  0.00000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0374  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  33.06 
 
 
160 aa  57  0.00000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0346  NADH dehydrogenase I, I subunit  30.33 
 
 
132 aa  57  0.00000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1867  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  34.38 
 
 
179 aa  56.2  0.0000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2619  NADH:ubiquinone oxidoreductase chain I  30.28 
 
 
427 aa  56.2  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.487115  normal  0.135541 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0289  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  28.3 
 
 
171 aa  56.6  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.998746  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2429  formate hydrogenlyase complex iron-sulfur subunit  33.33 
 
 
181 aa  56.2  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.839749  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02380  hydrogenase 4, Fe-S subunit  33.04 
 
 
179 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2860  hydrogenase 4 subunit H  33.04 
 
 
179 aa  55.5  0.0000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1188  hydrogenase 4 subunit H  33.04 
 
 
179 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.40586 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4489  NADH dehydrogenase subunit I  28.32 
 
 
175 aa  55.5  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.159742 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2592  NADH-plastoquinone oxidoreductase subunit  31.87 
 
 
134 aa  55.8  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0277  NADH dehydrogenase subunit I  35.56 
 
 
162 aa  55.5  0.0000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.587133  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02342  hypothetical protein  33.04 
 
 
179 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2622  hydrogenase 4 subunit H  33.04 
 
 
179 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1794  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  30.3 
 
 
132 aa  55.5  0.0000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.178845  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0182  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  29.73 
 
 
194 aa  55.8  0.0000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0248  NADH dehydrogenase subunit I  35.56 
 
 
162 aa  55.5  0.0000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0327  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  34.38 
 
 
132 aa  55.8  0.0000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1877  NADH dehydrogenase subunit I  30.7 
 
 
174 aa  55.5  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2845  formate hydrogenlyase complex iron-sulfur subunit  33.33 
 
 
180 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.105843 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02570  formate hydrogenlyase complex iron-sulfur protein  32.32 
 
 
180 aa  55.1  0.0000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0969  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  32.32 
 
 
180 aa  55.1  0.0000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0992  formate hydrogenlyase complex iron-sulfur subunit  32.32 
 
 
180 aa  55.1  0.0000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0453581 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1128  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  28.46 
 
 
140 aa  55.5  0.0000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1279  hydrogenase 4 subunit H  34.41 
 
 
189 aa  55.1  0.0000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.641192  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3971  formate hydrogenlyase complex iron-sulfur subunit  32.32 
 
 
180 aa  55.1  0.0000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3407  F420H2 dehydrogenase subunit I  31.43 
 
 
136 aa  55.5  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00224717  normal  0.799807 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0211  NADH dehydrogenase subunit I  32 
 
 
176 aa  55.5  0.0000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2049  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  35.29 
 
 
132 aa  55.1  0.0000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0933914 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3156  formate hydrogenlyase complex iron-sulfur subunit  32.32 
 
 
180 aa  55.1  0.0000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4503  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  29.17 
 
 
166 aa  55.1  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.149188 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3191  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  26.26 
 
 
229 aa  55.1  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.662861 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4736  NADH dehydrogenase subunit I  30.09 
 
 
173 aa  55.1  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.161018  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5499  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  30.99 
 
 
679 aa  55.1  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.948929  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2856  formate hydrogenlyase complex iron-sulfur subunit  32.32 
 
 
180 aa  55.1  0.0000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02535  hypothetical protein  32.32 
 
 
180 aa  55.1  0.0000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0966  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  25.25 
 
 
211 aa  55.1  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0635309 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3008  formate hydrogenlyase complex iron-sulfur subunit  32.32 
 
 
180 aa  55.1  0.0000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01295  NADH dehydrogenase subunit I  35.96 
 
 
162 aa  54.7  0.0000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.356089  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3347  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  29.51 
 
 
131 aa  54.7  0.0000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.715886  normal  0.525186 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1212  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  35.63 
 
 
441 aa  54.7  0.0000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.72306  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4410  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  28.32 
 
 
194 aa  55.1  0.0000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3051  formate hydrogenlyase complex iron-sulfur subunit  32.32 
 
 
180 aa  54.3  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.266242 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>