More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_2276 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009376  Pars_2276  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  100 
 
 
132 aa  276  5e-74  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0276213  normal  0.374891 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2049  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  79.55 
 
 
132 aa  228  2e-59  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0933914 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0327  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  78.79 
 
 
132 aa  228  3e-59  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1794  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  77.27 
 
 
132 aa  225  2e-58  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.178845  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0304  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  47.93 
 
 
166 aa  108  3e-23  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.792307 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0657  NADH dehydrogenase subunit I  43.8 
 
 
156 aa  107  6e-23  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0516  NADH dehydrogenase subunit I  43.07 
 
 
155 aa  102  1e-21  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1632  NADH dehydrogenase subunit I  44.17 
 
 
159 aa  103  1e-21  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.285912  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0647  NADH dehydrogenase subunit I  43.31 
 
 
154 aa  99.8  1e-20  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.413211  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1736  putative oxidoreductase  47.42 
 
 
615 aa  91.3  4e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0323  NADH dehydrogenase subunit I  42.45 
 
 
176 aa  82.8  0.000000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4236  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  38.53 
 
 
132 aa  83.2  0.000000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000114859  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3918  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  34.4 
 
 
132 aa  82.4  0.000000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4002  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  34.4 
 
 
132 aa  82.4  0.000000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.89067e-17 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0211  NADH dehydrogenase subunit I  39.64 
 
 
176 aa  82  0.000000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1302  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  34.86 
 
 
167 aa  80.9  0.000000000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3818  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  38.6 
 
 
171 aa  81.3  0.000000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.121238  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0374  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  37.72 
 
 
160 aa  80.9  0.000000000000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0346  NADH dehydrogenase I, I subunit  38.1 
 
 
132 aa  80.1  0.00000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1352  NADH dehydrogenase subunit I  39.32 
 
 
171 aa  79.3  0.00000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3130  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  35 
 
 
135 aa  79.7  0.00000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1292  F420H2 dehydrogenase subunit I  41 
 
 
135 aa  79.7  0.00000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000000020121  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1222  putative oxidoreductase  41.24 
 
 
616 aa  79  0.00000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0767368  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1899  NADH dehydrogenase subunit I  38 
 
 
169 aa  78.6  0.00000000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.00550248  normal  0.26939 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3434  NADH dehydrogenase subunit I  40.54 
 
 
176 aa  78.6  0.00000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.460482  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0885  putative oxidoreductase  41.44 
 
 
612 aa  78.6  0.00000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0163  NADH dehydrogenase subunit I  40.54 
 
 
184 aa  78.2  0.00000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0825  NADH dehydrogenase subunit I  37.4 
 
 
163 aa  77.4  0.00000000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3347  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  37.14 
 
 
131 aa  77  0.00000000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.715886  normal  0.525186 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3407  F420H2 dehydrogenase subunit I  31.97 
 
 
136 aa  76.6  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00224717  normal  0.799807 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3387  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  36.59 
 
 
165 aa  76.3  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.533197  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2235  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  37.4 
 
 
165 aa  75.9  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.272952  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1083  NADH dehydrogenase subunit I  33.05 
 
 
156 aa  75.5  0.0000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1601  putative oxidoreductase  44.68 
 
 
615 aa  75.1  0.0000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0289  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  35.34 
 
 
171 aa  74.7  0.0000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.998746  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3216  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  34.04 
 
 
168 aa  74.7  0.0000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1284  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  35.14 
 
 
284 aa  74.7  0.0000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.218939  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1432  NADH dehydrogenase subunit I  36.61 
 
 
165 aa  74.3  0.0000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.277545  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0917  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  41.07 
 
 
179 aa  74.3  0.0000000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.5865  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0172  NADH dehydrogenase subunit I  36.45 
 
 
176 aa  73.9  0.0000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1099  NADH dehydrogenase subunit I  38.89 
 
 
162 aa  73.9  0.0000000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4736  NADH dehydrogenase subunit I  35.54 
 
 
173 aa  73.9  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.161018  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1743  NADH dehydrogenase subunit I  36.84 
 
 
164 aa  73.9  0.0000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00386762  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0107  NADH dehydrogenase subunit I  36.84 
 
 
164 aa  73.9  0.0000000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.807538  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2867  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  34.19 
 
 
171 aa  73.6  0.0000000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.708253  normal  0.0292468 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1069  NADH dehydrogenase subunit I  36.61 
 
 
162 aa  73.6  0.0000000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.74272  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1940  NADH dehydrogenase subunit I  36.94 
 
 
178 aa  73.6  0.0000000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.509162 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0421  NADH dehydrogenase subunit I  36.61 
 
 
162 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.735915  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2265  NADH dehydrogenase subunit I  36.61 
 
 
162 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.477325  normal  0.254179 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1821  NADH dehydrogenase subunit I  36.61 
 
 
162 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0154  NADH dehydrogenase subunit I  37.5 
 
 
176 aa  73.2  0.000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.947551 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1298  NADH dehydrogenase subunit I  36.61 
 
 
162 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1443  NADH dehydrogenase subunit I  36.61 
 
 
162 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.798759  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1307  NADH dehydrogenase subunit I  36.61 
 
 
162 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.91191  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0729  NADH dehydrogenase subunit I  36.61 
 
 
162 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.384636  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1113  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  37.07 
 
 
170 aa  72.8  0.000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.182151  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1629  NADH dehydrogenase subunit I  36.61 
 
 
162 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2241  NADH dehydrogenase subunit I  36.61 
 
 
162 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.493495  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1138  NADH dehydrogenase subunit I  36.61 
 
 
162 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.299701  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05703  hypothetical protein similar to : Formate hydrogenlyase subunit 6/NADH:ubiquinone oxidoreductase 23 kD subunit (Broad)  35.71 
 
 
224 aa  72.4  0.000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.803618 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2158  NADH dehydrogenase subunit I  36.61 
 
 
162 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.394971  normal  0.941111 
 
 
-
 
NC_006681  CNL05770  conserved hypothetical protein  36.19 
 
 
273 aa  72.4  0.000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1373  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  33.59 
 
 
267 aa  72.4  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.340666  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1150  NADH dehydrogenase subunit I  37.61 
 
 
162 aa  72.4  0.000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1120  NADH dehydrogenase subunit I  35.4 
 
 
180 aa  72  0.000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.311189  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1036  NADH dehydrogenase subunit I  36.61 
 
 
162 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.160572  normal  0.248767 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1020  NADH dehydrogenase subunit I  35.4 
 
 
171 aa  72.4  0.000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.755319  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0546  NADH dehydrogenase subunit I  36.52 
 
 
217 aa  72  0.000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.175795  normal  0.434998 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1354  NADH dehydrogenase subunit I  36 
 
 
171 aa  72.4  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.253044  normal  0.161644 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1956  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  40.38 
 
 
162 aa  72  0.000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.198639  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3248  NADH dehydrogenase subunit I  37.04 
 
 
165 aa  72.4  0.000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.779883  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1272  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  33.59 
 
 
270 aa  72.4  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2279  NADH dehydrogenase subunit I  36.61 
 
 
162 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.336058  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2001  NADH dehydrogenase subunit I  36.61 
 
 
162 aa  72  0.000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0496982 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0994  NADH dehydrogenase subunit I  38.68 
 
 
163 aa  71.6  0.000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3206  NADH dehydrogenase subunit I  36.61 
 
 
162 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00643522  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1197  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  33.33 
 
 
183 aa  72  0.000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1351  NADH dehydrogenase subunit I  36.61 
 
 
162 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0309776  hitchhiker  0.0086006 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0957  NADH dehydrogenase subunit I  39.42 
 
 
162 aa  71.6  0.000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0765322  normal  0.470027 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2576  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  32.82 
 
 
264 aa  71.6  0.000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1742  NADH dehydrogenase subunit I  35.04 
 
 
213 aa  70.9  0.000000000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4064  NADH dehydrogenase subunit I  35.2 
 
 
171 aa  70.9  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0149353  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2523  NADH dehydrogenase subunit I  35.66 
 
 
167 aa  70.9  0.000000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.208294  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5569  NADH dehydrogenase subunit I  35.71 
 
 
162 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.156755 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6086  NADH dehydrogenase subunit I  34.78 
 
 
211 aa  70.9  0.000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00224994  normal  0.0520295 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2053  NADH dehydrogenase subunit I  38.46 
 
 
163 aa  70.9  0.000000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.330204  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1185  NADH dehydrogenase subunit I  35.66 
 
 
167 aa  70.9  0.000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0684834  normal  0.389473 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0716  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  38.46 
 
 
162 aa  70.5  0.000000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.479335  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1696  NADH dehydrogenase subunit I  35.96 
 
 
164 aa  70.5  0.000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00251501  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3627  NADH dehydrogenase subunit I  31.58 
 
 
164 aa  70.5  0.000000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0704772 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1750  NADH dehydrogenase subunit I  34.26 
 
 
161 aa  70.5  0.000000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4410  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  36.21 
 
 
194 aa  70.5  0.000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1509  NADH dehydrogenase subunit I  38.54 
 
 
165 aa  70.1  0.000000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00304735 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2828  NADH dehydrogenase subunit I  41.05 
 
 
166 aa  69.3  0.00000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3502  NADH dehydrogenase subunit I  37.5 
 
 
181 aa  69.7  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1501  NADH dehydrogenase subunit I  34.82 
 
 
177 aa  70.1  0.00000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0649483  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1333  NADH dehydrogenase subunit I  35.2 
 
 
171 aa  70.1  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0935  NADH dehydrogenase subunit I  37.04 
 
 
163 aa  69.7  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.13658  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0597  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  36.36 
 
 
129 aa  69.3  0.00000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2805  NADH dehydrogenase subunit I  37.5 
 
 
169 aa  68.9  0.00000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.166718 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>