More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_0647 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009376  Pars_0647  NADH dehydrogenase subunit I  100 
 
 
154 aa  315  2e-85  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.413211  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0657  NADH dehydrogenase subunit I  85.91 
 
 
156 aa  275  2e-73  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0516  NADH dehydrogenase subunit I  84.77 
 
 
155 aa  273  8e-73  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1632  NADH dehydrogenase subunit I  77.78 
 
 
159 aa  257  5.0000000000000005e-68  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.285912  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0304  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  43.94 
 
 
166 aa  119  1.9999999999999998e-26  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.792307 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1899  NADH dehydrogenase subunit I  36.05 
 
 
169 aa  112  1.0000000000000001e-24  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.00550248  normal  0.26939 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1302  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  36.42 
 
 
167 aa  110  6e-24  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1083  NADH dehydrogenase subunit I  40.46 
 
 
156 aa  100  9e-21  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2276  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  43.31 
 
 
132 aa  99.8  1e-20  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0276213  normal  0.374891 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1794  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  41.94 
 
 
132 aa  94  6e-19  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.178845  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0327  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  41.96 
 
 
132 aa  93.6  9e-19  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2049  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  47.57 
 
 
132 aa  92  2e-18  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0933914 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1292  F420H2 dehydrogenase subunit I  42.4 
 
 
135 aa  77  0.00000000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000000020121  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1667  NADH dehydrogenase subunit I  38.6 
 
 
193 aa  72.4  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0281  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  33.58 
 
 
165 aa  70.9  0.000000000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000516884 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2528  NADH dehydrogenase subunit I  35.82 
 
 
200 aa  70.5  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1040  NADH dehydrogenase subunit I  33.33 
 
 
193 aa  70.5  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000326556 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1011  NADH dehydrogenase subunit I  33.33 
 
 
193 aa  70.5  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1736  putative oxidoreductase  45.1 
 
 
615 aa  68.9  0.00000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1054  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  37.5 
 
 
180 aa  68.6  0.00000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3407  F420H2 dehydrogenase subunit I  35.83 
 
 
136 aa  67.8  0.00000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00224717  normal  0.799807 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1128  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  36.45 
 
 
140 aa  67.8  0.00000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1578  NADH dehydrogenase subunit I  37 
 
 
209 aa  67.8  0.00000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.116678  normal  0.902926 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1344  NADH dehydrogenase subunit I  40.59 
 
 
202 aa  67  0.00000000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26891  NADH dehydrogenase subunit I  37.07 
 
 
218 aa  67  0.00000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0401  NADH-plastoquinone oxidoreductase subunit I  39 
 
 
194 aa  67  0.00000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0374  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  37.27 
 
 
160 aa  67  0.00000000009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0281  NADH dehydrogenase subunit I  33.08 
 
 
210 aa  67  0.00000000009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0289  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  36.84 
 
 
171 aa  67  0.00000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.998746  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2715  NADH dehydrogenase subunit I  39 
 
 
194 aa  66.2  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.451197 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1845  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  31.29 
 
 
175 aa  66.6  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0257  NADH-plastoquinone oxidoreductase subunit I  36.84 
 
 
207 aa  66.2  0.0000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0957  NADH dehydrogenase subunit I  34.85 
 
 
162 aa  66.2  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0765322  normal  0.470027 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1526  NADH dehydrogenase subunit I  33.61 
 
 
218 aa  65.5  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0786  NADH dehydrogenase subunit I  33.33 
 
 
163 aa  65.9  0.0000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.079686  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2411  NADH dehydrogenase subunit I  32.31 
 
 
215 aa  66.2  0.0000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02321  NADH dehydrogenase subunit I  33.61 
 
 
218 aa  65.5  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4383  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  31.94 
 
 
178 aa  65.5  0.0000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0812  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  36.11 
 
 
183 aa  65.5  0.0000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1043  NADH dehydrogenase subunit I  34.09 
 
 
163 aa  65.5  0.0000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1750  NADH dehydrogenase subunit I  32.09 
 
 
161 aa  65.1  0.0000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01761  NADH dehydrogenase subunit I  34.45 
 
 
215 aa  64.7  0.0000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.273282  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0829  NADH dehydrogenase subunit I  33.33 
 
 
163 aa  64.7  0.0000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.260339  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01881  NADH dehydrogenase subunit I  33.91 
 
 
208 aa  64.7  0.0000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3296  NADH dehydrogenase subunit I  31.88 
 
 
139 aa  63.9  0.0000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01771  NADH dehydrogenase subunit I  37 
 
 
208 aa  63.9  0.0000000007  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.351878  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01791  NADH dehydrogenase subunit I  37 
 
 
208 aa  63.9  0.0000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0810  NADH dehydrogenase subunit I  32.64 
 
 
163 aa  63.9  0.0000000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.719018  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0805  NADH dehydrogenase subunit I  32.64 
 
 
163 aa  63.9  0.0000000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0161  NADH dehydrogenase subunit I  37 
 
 
208 aa  63.9  0.0000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.646634  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_799  NADH:quinone oxidoreductase subunit 1 (chain I)  35.19 
 
 
183 aa  63.9  0.0000000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5950  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  35.2 
 
 
168 aa  63.9  0.0000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.240126  normal  0.851702 
 
 
-
 
NC_002936  DET0928  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, I subunit  38.04 
 
 
169 aa  63.5  0.0000000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3216  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  37.5 
 
 
168 aa  63.5  0.0000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1742  NADH dehydrogenase subunit I  34.23 
 
 
213 aa  63.2  0.000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3204  NADH dehydrogenase subunit I  30.86 
 
 
182 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0843328  normal  0.169624 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1922  NADH dehydrogenase subunit I  34.23 
 
 
213 aa  63.2  0.000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  decreased coverage  0.000283263  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1020  NADH dehydrogenase subunit I  38.1 
 
 
171 aa  63.2  0.000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.755319  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0898  NADH dehydrogenase subunit I  32.64 
 
 
163 aa  63.2  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0404509  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4410  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  35.71 
 
 
194 aa  63.5  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2390  NADH dehydrogenase subunit I  34.62 
 
 
162 aa  63.2  0.000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0000573568  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4736  NADH dehydrogenase subunit I  36.75 
 
 
173 aa  63.5  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.161018  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0320  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  32.37 
 
 
234 aa  62.4  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.562709 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3372  NADH dehydrogenase I, I subunit  30.86 
 
 
182 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.675448  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7683  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  41.23 
 
 
203 aa  62.4  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2415  NADH dehydrogenase subunit I  31.94 
 
 
163 aa  62.4  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.87535  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3130  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  34.82 
 
 
135 aa  62.4  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1743  NADH dehydrogenase subunit I  32.89 
 
 
164 aa  62.4  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00386762  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1222  putative oxidoreductase  40 
 
 
616 aa  62.8  0.000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0767368  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3814  NADH dehydrogenase subunit I  31.2 
 
 
139 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1030  NADH dehydrogenase subunit I  31.94 
 
 
163 aa  62.4  0.000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.206882  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0400  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  33.33 
 
 
216 aa  62.8  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0107  NADH dehydrogenase subunit I  32.89 
 
 
164 aa  62  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.807538  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3290  NADH dehydrogenase subunit I  32.05 
 
 
162 aa  62  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.221287  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1099  NADH dehydrogenase subunit I  33.59 
 
 
162 aa  62  0.000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1301  NADH dehydrogenase subunit I  34.35 
 
 
162 aa  62  0.000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  decreased coverage  0.00320411  normal  0.488956 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2292  NADH dehydrogenase subunit I  32.88 
 
 
161 aa  61.6  0.000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3818  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  33.81 
 
 
171 aa  61.2  0.000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.121238  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0468  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  30.77 
 
 
216 aa  61.6  0.000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0616317 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3610  NADH dehydrogenase subunit I  30.25 
 
 
182 aa  61.2  0.000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.487333  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0211  NADH dehydrogenase subunit I  35.07 
 
 
176 aa  61.2  0.000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0982  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  38.32 
 
 
214 aa  61.2  0.000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0849  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  35.59 
 
 
531 aa  61.2  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000747261  hitchhiker  0.000000428975 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4126  NADH dehydrogenase subunit I  30.86 
 
 
182 aa  60.8  0.000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1739  NADH dehydrogenase subunit I  30.86 
 
 
182 aa  60.8  0.000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.235938  normal  0.220023 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1866  NADH dehydrogenase subunit I  30.86 
 
 
182 aa  60.8  0.000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0422789 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1723  NADH dehydrogenase subunit I  31.25 
 
 
163 aa  60.8  0.000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.341479  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1556  NADH dehydrogenase subunit I  33.33 
 
 
213 aa  60.8  0.000000006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0000101443  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3698  NADH dehydrogenase subunit I  30.86 
 
 
182 aa  60.8  0.000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.380267  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0546  NADH dehydrogenase subunit I  40.17 
 
 
217 aa  60.8  0.000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.175795  normal  0.434998 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1501  NADH dehydrogenase subunit I  32.06 
 
 
177 aa  60.8  0.000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0649483  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3387  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  34.4 
 
 
165 aa  60.5  0.000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.533197  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2582  NADH dehydrogenase subunit I  32.69 
 
 
162 aa  60.5  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.561308  normal  0.2116 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1333  NADH dehydrogenase subunit I  34.46 
 
 
171 aa  60.5  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3408  NADH dehydrogenase subunit I  33.63 
 
 
139 aa  60.5  0.000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2412  NADH dehydrogenase subunit I  32.05 
 
 
162 aa  60.5  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0701412  normal  0.0109704 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1696  NADH dehydrogenase subunit I  32.24 
 
 
164 aa  60.1  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00251501  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5145  NADH dehydrogenase subunit I  29.6 
 
 
139 aa  59.7  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1879  NADH dehydrogenase subunit I  32.05 
 
 
162 aa  59.7  0.00000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.508831  normal  0.262119 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2235  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  34.4 
 
 
165 aa  60.1  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.272952  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>