More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_0961 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008942  Mlab_0961  NADH-plastoquinone oxidoreductase subunit  100 
 
 
146 aa  298  1e-80  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.195043  normal  0.804187 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2592  NADH-plastoquinone oxidoreductase subunit  51.03 
 
 
134 aa  149  1e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0677  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  45.86 
 
 
148 aa  120  8e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0597  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  31.85 
 
 
129 aa  72.8  0.000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3522  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  33.58 
 
 
128 aa  71.6  0.000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0182  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  37.84 
 
 
194 aa  69.7  0.00000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0982  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  39.29 
 
 
134 aa  66.2  0.0000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2185  formate hydrogenlyase complex iron-sulfur subunit  34.51 
 
 
184 aa  65.1  0.0000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.233255 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3407  F420H2 dehydrogenase subunit I  37.35 
 
 
136 aa  63.5  0.0000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00224717  normal  0.799807 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0885  putative oxidoreductase  36.84 
 
 
612 aa  62.8  0.000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1279  hydrogenase 4 subunit H  33.7 
 
 
189 aa  61.6  0.000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.641192  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1344  NADH dehydrogenase subunit I  34.88 
 
 
202 aa  59.7  0.00000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2714  hydrogenase 4 subunit H  32.61 
 
 
189 aa  59.7  0.00000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.594807  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2715  NADH dehydrogenase subunit I  34.83 
 
 
194 aa  58.5  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.451197 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1128  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  32.35 
 
 
140 aa  58.2  0.00000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0712  formate hydrogenlyase complex iron-sulfur subunit  33.64 
 
 
179 aa  58.5  0.00000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00445731  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01791  NADH dehydrogenase subunit I  32.56 
 
 
208 aa  57.8  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01881  NADH dehydrogenase subunit I  32.56 
 
 
208 aa  57.8  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0161  NADH dehydrogenase subunit I  32.56 
 
 
208 aa  57.8  0.00000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.646634  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0318  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  34.78 
 
 
175 aa  57.8  0.00000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.188751  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01771  NADH dehydrogenase subunit I  32.56 
 
 
208 aa  57.8  0.00000005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.351878  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0980  NADH dehydrogenase subunit I  41.89 
 
 
169 aa  57.4  0.00000006  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1619  ech hydrogenase subunit F  28.12 
 
 
124 aa  57.4  0.00000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1601  putative oxidoreductase  33.71 
 
 
615 aa  57.4  0.00000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1636  formate hydrogenlyase complex iron-sulfur subunit  34.55 
 
 
179 aa  57.8  0.00000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0109811  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2467  NADH ubiquinone oxidoreductase 20 kDa subunit  33.68 
 
 
285 aa  57.4  0.00000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.65286  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1867  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  35.29 
 
 
179 aa  57.4  0.00000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2225  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  32.82 
 
 
119 aa  57  0.00000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01761  NADH dehydrogenase subunit I  30.68 
 
 
215 aa  57  0.00000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.273282  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1222  putative oxidoreductase  36.9 
 
 
616 aa  56.6  0.0000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0767368  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1302  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  28.12 
 
 
167 aa  56.6  0.0000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26891  NADH dehydrogenase subunit I  30.68 
 
 
218 aa  56.2  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0197  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  39.13 
 
 
491 aa  56.6  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0114933 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0257  NADH-plastoquinone oxidoreductase subunit I  33.72 
 
 
207 aa  56.2  0.0000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1736  putative oxidoreductase  34.48 
 
 
615 aa  56.6  0.0000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1526  NADH dehydrogenase subunit I  29.55 
 
 
218 aa  55.8  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2429  formate hydrogenlyase complex iron-sulfur subunit  32.61 
 
 
181 aa  55.5  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.839749  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0281  NADH dehydrogenase subunit I  31.46 
 
 
210 aa  55.8  0.0000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2292  NADH dehydrogenase subunit I  43.24 
 
 
161 aa  55.8  0.0000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0691  NADH dehydrogenase subunit I  32.58 
 
 
169 aa  56.2  0.0000002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.438917  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02321  NADH dehydrogenase subunit I  29.55 
 
 
218 aa  55.8  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1899  NADH dehydrogenase subunit I  28.83 
 
 
169 aa  55.5  0.0000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.00550248  normal  0.26939 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2411  NADH dehydrogenase subunit I  31.46 
 
 
215 aa  55.1  0.0000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4569  formate hydrogenlyase complex iron-sulfur subunit  31.52 
 
 
189 aa  55.1  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1292  F420H2 dehydrogenase subunit I  35.37 
 
 
135 aa  55.1  0.0000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000000020121  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1040  NADH dehydrogenase subunit I  32.58 
 
 
193 aa  55.1  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000326556 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0929  NADH dehydrogenase subunit I  40.54 
 
 
163 aa  55.1  0.0000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1011  NADH dehydrogenase subunit I  32.58 
 
 
193 aa  55.1  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2623  NADH ubiquinone oxidoreductase 20 kDa subunit  36.17 
 
 
263 aa  55.1  0.0000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0754  NADH dehydrogenase subunit I  41.89 
 
 
164 aa  54.7  0.0000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.180315  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1187  NADH dehydrogenase subunit I  40.54 
 
 
164 aa  54.3  0.0000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.438944  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4236  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  30.72 
 
 
132 aa  54.3  0.0000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000114859  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0361  NADH dehydrogenase subunit I  31.82 
 
 
167 aa  54.3  0.0000006  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.326031  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_18502  predicted protein  37.04 
 
 
167 aa  54.3  0.0000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0613487 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2238  NADH dehydrogenase subunit I  41.89 
 
 
163 aa  54.3  0.0000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.180184 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2528  NADH dehydrogenase subunit I  31.46 
 
 
200 aa  53.9  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1185  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  31.63 
 
 
202 aa  53.9  0.0000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.150574  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1282  NADH-quinone oxidoreductase chain I  33.33 
 
 
185 aa  53.5  0.0000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.425102 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2523  NADH dehydrogenase subunit I  40.54 
 
 
167 aa  53.5  0.0000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.208294  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1185  NADH dehydrogenase subunit I  40.54 
 
 
167 aa  53.5  0.0000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0684834  normal  0.389473 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1072  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  35.11 
 
 
233 aa  53.5  0.0000009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3130  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  31.51 
 
 
135 aa  53.1  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1322  NADH dehydrogenase subunit I  39.19 
 
 
164 aa  52.8  0.000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.323962  normal  0.0547108 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0369  NADH ubiquinone oxidoreductase, 20 kDa subunit  33.33 
 
 
262 aa  52.8  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.639701  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2993  NADH dehydrogenase subunit I  40.54 
 
 
161 aa  53.1  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0374  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  32.28 
 
 
160 aa  53.5  0.000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1301  NADH dehydrogenase subunit I  40.54 
 
 
162 aa  53.1  0.000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  decreased coverage  0.00320411  normal  0.488956 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1083  NADH dehydrogenase subunit I  38.27 
 
 
156 aa  53.5  0.000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0884  hydrogenase large subunit domain protein  31.31 
 
 
507 aa  52.4  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.139599  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1521  NADH dehydrogenase subunit I  36.49 
 
 
231 aa  52.4  0.000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00088837  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0966  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  28.24 
 
 
211 aa  52.8  0.000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0635309 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_14260  predicted protein  40.28 
 
 
163 aa  52.4  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1423  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  35.29 
 
 
166 aa  52  0.000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.796142  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0401  NADH-plastoquinone oxidoreductase subunit I  33.72 
 
 
194 aa  52  0.000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3918  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  28.77 
 
 
132 aa  52  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1054  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  35.87 
 
 
180 aa  52.4  0.000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4002  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  28.77 
 
 
132 aa  52  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.89067e-17 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0636  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  35.56 
 
 
186 aa  52.8  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1631  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  35.56 
 
 
186 aa  52.8  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3185  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  35.56 
 
 
186 aa  52.8  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1997  NADH dehydrogenase subunit I  39.19 
 
 
167 aa  51.6  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0446418  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2235  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  29.71 
 
 
165 aa  52  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.272952  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1363  NADH dehydrogenase subunit I  33.67 
 
 
162 aa  52  0.000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.353821  normal  0.140777 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0126  formate hydrogenlyase complex iron-sulfur subunit  34 
 
 
176 aa  52  0.000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1275  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  40 
 
 
199 aa  51.2  0.000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3191  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  33.33 
 
 
229 aa  51.6  0.000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.662861 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0554  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  39.73 
 
 
127 aa  51.6  0.000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0189  NADH dehydrogenase subunit I  33.78 
 
 
200 aa  51.6  0.000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1667  NADH dehydrogenase subunit I  30.23 
 
 
193 aa  51.2  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3216  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  41.25 
 
 
168 aa  51.6  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2276  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  32.14 
 
 
132 aa  51.6  0.000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0276213  normal  0.374891 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1879  NADH dehydrogenase subunit I  39.19 
 
 
162 aa  51.2  0.000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.508831  normal  0.262119 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3387  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  40.54 
 
 
165 aa  50.8  0.000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.533197  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4553  NADH dehydrogenase subunit I  39.19 
 
 
162 aa  51.2  0.000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.128776 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1820  NADH dehydrogenase subunit I  30.11 
 
 
211 aa  51.2  0.000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000000189199  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1563  NADH dehydrogenase subunit I  33.67 
 
 
162 aa  50.8  0.000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.339949  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4550  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  34.62 
 
 
211 aa  51.2  0.000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3218  NADH dehydrogenase subunit I  37.84 
 
 
163 aa  51.2  0.000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2412  NADH dehydrogenase subunit I  39.19 
 
 
162 aa  51.2  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0701412  normal  0.0109704 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4080  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  31.62 
 
 
197 aa  51.2  0.000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0562629 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>