More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_2429 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009832  Spro_2429  formate hydrogenlyase complex iron-sulfur subunit  100 
 
 
181 aa  376  1e-104  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.839749  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02570  formate hydrogenlyase complex iron-sulfur protein  60 
 
 
180 aa  234  5.0000000000000005e-61  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3158  formate hydrogenlyase complex iron-sulfur subunit  60.8 
 
 
180 aa  234  5.0000000000000005e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.088865 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2856  formate hydrogenlyase complex iron-sulfur subunit  60 
 
 
180 aa  234  5.0000000000000005e-61  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0992  formate hydrogenlyase complex iron-sulfur subunit  60 
 
 
180 aa  234  5.0000000000000005e-61  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0453581 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2845  formate hydrogenlyase complex iron-sulfur subunit  60 
 
 
180 aa  234  5.0000000000000005e-61  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.105843 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02535  hypothetical protein  60 
 
 
180 aa  234  5.0000000000000005e-61  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3971  formate hydrogenlyase complex iron-sulfur subunit  60 
 
 
180 aa  234  5.0000000000000005e-61  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0969  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  59.44 
 
 
180 aa  232  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3008  formate hydrogenlyase complex iron-sulfur subunit  59.44 
 
 
180 aa  232  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3000  formate hydrogenlyase complex iron-sulfur subunit  60.23 
 
 
180 aa  232  2.0000000000000002e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.397657  normal  0.0115018 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3156  formate hydrogenlyase complex iron-sulfur subunit  59.44 
 
 
180 aa  231  5e-60  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2969  formate hydrogenlyase complex iron-sulfur subunit  60.23 
 
 
180 aa  230  7.000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3035  formate hydrogenlyase complex iron-sulfur subunit  60.23 
 
 
180 aa  230  7.000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000101448 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3193  formate hydrogenlyase complex iron-sulfur subunit  60.23 
 
 
180 aa  230  8.000000000000001e-60  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3051  formate hydrogenlyase complex iron-sulfur subunit  60.23 
 
 
180 aa  230  1e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.266242 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2714  hydrogenase 4 subunit H  56.42 
 
 
189 aa  218  5e-56  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.594807  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1279  hydrogenase 4 subunit H  56.18 
 
 
189 aa  213  1.9999999999999998e-54  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.641192  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2185  formate hydrogenlyase complex iron-sulfur subunit  53.66 
 
 
184 aa  182  3e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.233255 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4569  formate hydrogenlyase complex iron-sulfur subunit  49.72 
 
 
189 aa  180  8.000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2860  hydrogenase 4 subunit H  49.41 
 
 
179 aa  167  9e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02380  hydrogenase 4, Fe-S subunit  48.82 
 
 
179 aa  162  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2622  hydrogenase 4 subunit H  48.82 
 
 
179 aa  162  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02342  hypothetical protein  48.82 
 
 
179 aa  162  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1188  hydrogenase 4 subunit H  48.82 
 
 
179 aa  162  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.40586 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3710  hydrogenase 4 subunit H  50.59 
 
 
181 aa  149  2e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2635  hydrogenase 4 subunit H  51.18 
 
 
181 aa  141  4e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2770  hydrogenase 4 subunit H  50.59 
 
 
181 aa  140  8e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1181  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  50.59 
 
 
181 aa  138  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01000  NADH:ubiquinone oxidoreductase chain I-like protein  47.2 
 
 
181 aa  137  7e-32  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.598496  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0712  formate hydrogenlyase complex iron-sulfur subunit  39.77 
 
 
179 aa  134  5e-31  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00445731  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0182  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  40 
 
 
194 aa  134  5e-31  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1636  formate hydrogenlyase complex iron-sulfur subunit  40.12 
 
 
179 aa  134  9.999999999999999e-31  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0109811  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0126  formate hydrogenlyase complex iron-sulfur subunit  41.61 
 
 
176 aa  133  9.999999999999999e-31  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1867  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  37.64 
 
 
179 aa  128  4.0000000000000003e-29  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0318  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  36.5 
 
 
175 aa  102  4e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.188751  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2784  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  32.03 
 
 
175 aa  89  3e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2792  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  32.03 
 
 
175 aa  89  3e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1921  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  38.68 
 
 
153 aa  88.6  4e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.160971  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0702  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  40.57 
 
 
153 aa  89  4e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0708  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  37.74 
 
 
153 aa  86.7  2e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  hitchhiker  0.00573386  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2225  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  38.94 
 
 
119 aa  86.7  2e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3251  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  38.68 
 
 
153 aa  86.3  2e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1113  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  36.79 
 
 
153 aa  84.3  9e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3814  NADH dehydrogenase subunit I  37.39 
 
 
139 aa  80.1  0.00000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0369  NADH ubiquinone oxidoreductase, 20 kDa subunit  30.68 
 
 
262 aa  79.7  0.00000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.639701  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3718  NADH ubiquinone oxidoreductase 20 kDa subunit  31.87 
 
 
256 aa  79.3  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0184008  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3125  NADH dehydrogenase subunit I  37.5 
 
 
179 aa  78.6  0.00000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3698  NADH dehydrogenase subunit I  38.39 
 
 
182 aa  78.2  0.00000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.380267  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4126  NADH dehydrogenase subunit I  38.39 
 
 
182 aa  78.2  0.00000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2041  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  36.46 
 
 
165 aa  78.2  0.00000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000212693  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2560  NADH dehydrogenase subunit I  38.39 
 
 
180 aa  78.2  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0213368  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2460  NADH dehydrogenase subunit I  38.39 
 
 
180 aa  78.2  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2505  NADH dehydrogenase subunit I  38.39 
 
 
180 aa  78.2  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1866  NADH dehydrogenase subunit I  38.39 
 
 
182 aa  78.2  0.00000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0422789 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2667  NADH dehydrogenase subunit I  38.39 
 
 
180 aa  78.2  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2549  NADH dehydrogenase subunit I  38.39 
 
 
180 aa  78.2  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1739  NADH dehydrogenase subunit I  38.39 
 
 
182 aa  78.2  0.00000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.235938  normal  0.220023 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5420  NADH dehydrogenase subunit I  35.65 
 
 
139 aa  77.8  0.00000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5145  NADH dehydrogenase subunit I  35.65 
 
 
139 aa  77.8  0.00000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4977  NADH dehydrogenase subunit I  35.65 
 
 
139 aa  77.8  0.00000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4995  NADH dehydrogenase subunit I  35.65 
 
 
139 aa  77.8  0.00000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5416  NADH dehydrogenase subunit I  35.65 
 
 
139 aa  77.8  0.00000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5537  NADH dehydrogenase subunit I  35.65 
 
 
139 aa  77.8  0.00000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5471  NADH dehydrogenase subunit I  35.65 
 
 
139 aa  77.8  0.00000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5093  NADH dehydrogenase subunit I  35.65 
 
 
139 aa  77.8  0.00000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5534  NADH dehydrogenase subunit I  35.65 
 
 
139 aa  77.8  0.00000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0249659 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1536  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  38.46 
 
 
170 aa  77.8  0.00000000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2562  NADH dehydrogenase subunit I  37.5 
 
 
182 aa  77  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02206  NADH dehydrogenase subunit I  37.5 
 
 
180 aa  77.4  0.0000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1376  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  37.5 
 
 
180 aa  77.4  0.0000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00237006  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2430  NADH dehydrogenase subunit I  37.5 
 
 
180 aa  77.4  0.0000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3420  NADH dehydrogenase subunit I  37.5 
 
 
180 aa  77.4  0.0000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2435  NADH dehydrogenase subunit I  37.5 
 
 
180 aa  77.4  0.0000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2574  NADH dehydrogenase subunit I  37.5 
 
 
180 aa  77.4  0.0000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5386  NADH dehydrogenase subunit I  35.65 
 
 
139 aa  77.4  0.0000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.1901e-17 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02166  hypothetical protein  37.5 
 
 
180 aa  77.4  0.0000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2825  NADH dehydrogenase subunit I  37.5 
 
 
180 aa  77.4  0.0000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.339444  normal  0.999371 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2657  NADH dehydrogenase subunit I  37.5 
 
 
180 aa  77.4  0.0000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0917  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  34.45 
 
 
179 aa  77  0.0000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.5865  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1371  NADH dehydrogenase subunit I  37.5 
 
 
180 aa  77.4  0.0000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.583652  normal  0.392913 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29920  NADH dehydrogenase subunit I  37.5 
 
 
182 aa  77  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.546828  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0346  NADH dehydrogenase I, I subunit  34.51 
 
 
132 aa  76.3  0.0000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1461  NADH dehydrogenase subunit I  36.61 
 
 
180 aa  76.3  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1809  NADH dehydrogenase subunit I  36.61 
 
 
180 aa  76.3  0.0000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.693845 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1567  NADH dehydrogenase subunit I  36.61 
 
 
180 aa  76.3  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.997394  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2419  NADH dehydrogenase subunit I  37.5 
 
 
182 aa  76.6  0.0000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.193406 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1014  NADH dehydrogenase subunit I  37.5 
 
 
180 aa  75.9  0.0000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3786  NADH ubiquinone oxidoreductase 20 kDa subunit  35.71 
 
 
256 aa  75.9  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.531576  normal  0.312558 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3660  NADH ubiquinone oxidoreductase, 20 kDa subunit  30.22 
 
 
256 aa  75.9  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0597  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  37 
 
 
129 aa  75.5  0.0000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1411  NADH dehydrogenase subunit I  33.11 
 
 
165 aa  75.1  0.0000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0328529 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1692  NADH dehydrogenase subunit I  39.29 
 
 
182 aa  75.5  0.0000000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2543  NADH dehydrogenase subunit I  38.05 
 
 
180 aa  75.1  0.0000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.879169  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3818  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  36.36 
 
 
171 aa  75.1  0.0000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.121238  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1401  NADH dehydrogenase subunit I  38.05 
 
 
180 aa  75.1  0.0000000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.590324  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1128  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  33.33 
 
 
140 aa  74.7  0.0000000000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1499  NADH dehydrogenase subunit I  37.5 
 
 
180 aa  75.1  0.0000000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2765  NADH dehydrogenase subunit I  37.5 
 
 
180 aa  75.1  0.0000000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.128685  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3204  NADH dehydrogenase subunit I  37.5 
 
 
182 aa  74.7  0.0000000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0843328  normal  0.169624 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>