More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_2792 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_2784  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  100 
 
 
175 aa  365  1e-100  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2792  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  100 
 
 
175 aa  365  1e-100  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0318  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  45.19 
 
 
175 aa  122  4e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.188751  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1279  hydrogenase 4 subunit H  36.77 
 
 
189 aa  98.6  5e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.641192  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2714  hydrogenase 4 subunit H  39.02 
 
 
189 aa  93.6  1e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.594807  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0182  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  37.98 
 
 
194 aa  89.7  2e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2429  formate hydrogenlyase complex iron-sulfur subunit  32.03 
 
 
181 aa  89  3e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.839749  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3193  formate hydrogenlyase complex iron-sulfur subunit  35.07 
 
 
180 aa  87.8  7e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3000  formate hydrogenlyase complex iron-sulfur subunit  33.56 
 
 
180 aa  87.8  7e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.397657  normal  0.0115018 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0712  formate hydrogenlyase complex iron-sulfur subunit  41.23 
 
 
179 aa  87.4  8e-17  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00445731  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2969  formate hydrogenlyase complex iron-sulfur subunit  34.69 
 
 
180 aa  87.8  8e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3035  formate hydrogenlyase complex iron-sulfur subunit  34.69 
 
 
180 aa  87.8  8e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000101448 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1636  formate hydrogenlyase complex iron-sulfur subunit  42.98 
 
 
179 aa  87.4  9e-17  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0109811  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2185  formate hydrogenlyase complex iron-sulfur subunit  36.15 
 
 
184 aa  87  1e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.233255 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3051  formate hydrogenlyase complex iron-sulfur subunit  34.69 
 
 
180 aa  87  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.266242 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3158  formate hydrogenlyase complex iron-sulfur subunit  33.56 
 
 
180 aa  87  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.088865 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3008  formate hydrogenlyase complex iron-sulfur subunit  33.56 
 
 
180 aa  86.7  2e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02570  formate hydrogenlyase complex iron-sulfur protein  33.56 
 
 
180 aa  85.5  4e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2856  formate hydrogenlyase complex iron-sulfur subunit  33.56 
 
 
180 aa  85.5  4e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3971  formate hydrogenlyase complex iron-sulfur subunit  33.56 
 
 
180 aa  85.5  4e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02535  hypothetical protein  33.56 
 
 
180 aa  85.5  4e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0992  formate hydrogenlyase complex iron-sulfur subunit  33.56 
 
 
180 aa  85.5  4e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0453581 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2845  formate hydrogenlyase complex iron-sulfur subunit  32.88 
 
 
180 aa  84.3  8e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.105843 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02380  hydrogenase 4, Fe-S subunit  38.1 
 
 
179 aa  83.6  0.000000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0969  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  32.88 
 
 
180 aa  83.6  0.000000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3156  formate hydrogenlyase complex iron-sulfur subunit  32.88 
 
 
180 aa  83.6  0.000000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02342  hypothetical protein  38.1 
 
 
179 aa  83.6  0.000000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2622  hydrogenase 4 subunit H  38.1 
 
 
179 aa  83.6  0.000000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1188  hydrogenase 4 subunit H  38.1 
 
 
179 aa  83.6  0.000000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.40586 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1867  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  33.12 
 
 
179 aa  79.3  0.00000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0126  formate hydrogenlyase complex iron-sulfur subunit  38.17 
 
 
176 aa  80.1  0.00000000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2860  hydrogenase 4 subunit H  38.58 
 
 
179 aa  79  0.00000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0597  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  36.63 
 
 
129 aa  79  0.00000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4569  formate hydrogenlyase complex iron-sulfur subunit  31.9 
 
 
189 aa  74.7  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3522  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  40.96 
 
 
128 aa  74.7  0.0000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2041  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  39.77 
 
 
165 aa  69.7  0.00000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000212693  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1210  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  37.14 
 
 
160 aa  68.2  0.00000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00161694  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2225  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  34.31 
 
 
119 aa  66.2  0.0000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3710  hydrogenase 4 subunit H  39.37 
 
 
181 aa  66.2  0.0000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3216  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  36.07 
 
 
168 aa  65.9  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1869  NADH-quinone oxidoreductase chain I  31.78 
 
 
177 aa  62.8  0.000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1181  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  38.46 
 
 
181 aa  62  0.000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2635  hydrogenase 4 subunit H  39.37 
 
 
181 aa  62  0.000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2235  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  33.62 
 
 
165 aa  62  0.000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.272952  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3814  NADH dehydrogenase subunit I  33.88 
 
 
139 aa  61.6  0.000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2770  hydrogenase 4 subunit H  39.37 
 
 
181 aa  61.6  0.000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3718  NADH ubiquinone oxidoreductase 20 kDa subunit  41.38 
 
 
256 aa  61.6  0.000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0184008  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1536  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  32.09 
 
 
170 aa  61.2  0.000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3387  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  37.5 
 
 
165 aa  60.1  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.533197  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3786  NADH ubiquinone oxidoreductase 20 kDa subunit  39.08 
 
 
256 aa  60.8  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.531576  normal  0.312558 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0371  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  31.91 
 
 
229 aa  60.1  0.00000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.839117  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3191  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  29.14 
 
 
229 aa  59.3  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.662861 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5420  NADH dehydrogenase subunit I  32.23 
 
 
139 aa  59.3  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5145  NADH dehydrogenase subunit I  32.23 
 
 
139 aa  59.3  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4977  NADH dehydrogenase subunit I  32.23 
 
 
139 aa  59.3  0.00000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4995  NADH dehydrogenase subunit I  32.23 
 
 
139 aa  59.3  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5534  NADH dehydrogenase subunit I  32.23 
 
 
139 aa  59.3  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0249659 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5416  NADH dehydrogenase subunit I  32.23 
 
 
139 aa  59.3  0.00000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5537  NADH dehydrogenase subunit I  32.23 
 
 
139 aa  59.3  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5471  NADH dehydrogenase subunit I  32.23 
 
 
139 aa  59.3  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5093  NADH dehydrogenase subunit I  32.23 
 
 
139 aa  59.3  0.00000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5386  NADH dehydrogenase subunit I  32.23 
 
 
139 aa  58.5  0.00000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.1901e-17 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0966  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  29.22 
 
 
211 aa  58.9  0.00000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0635309 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3407  F420H2 dehydrogenase subunit I  36.36 
 
 
136 aa  58.2  0.00000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00224717  normal  0.799807 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1820  NADH dehydrogenase subunit I  32.37 
 
 
211 aa  58.2  0.00000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000000189199  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1292  F420H2 dehydrogenase subunit I  34.38 
 
 
135 aa  58.2  0.00000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000000020121  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0477  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  34.58 
 
 
300 aa  58.2  0.00000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.376416  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0708  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  30.65 
 
 
153 aa  57.8  0.00000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  hitchhiker  0.00573386  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1128  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  30.23 
 
 
140 aa  57.8  0.00000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1113  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  32.74 
 
 
153 aa  57.4  0.00000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3296  NADH dehydrogenase subunit I  36.46 
 
 
139 aa  57  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0275  NADH dehydrogenase subunit I  33.61 
 
 
199 aa  57.4  0.0000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0829  NADH dehydrogenase subunit I  27.59 
 
 
163 aa  56.6  0.0000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.260339  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3251  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  31.2 
 
 
153 aa  56.6  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1275  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  30 
 
 
199 aa  56.6  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2592  NADH-plastoquinone oxidoreductase subunit  35.53 
 
 
134 aa  56.6  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3408  NADH dehydrogenase subunit I  32.11 
 
 
139 aa  56.6  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2631  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  32.17 
 
 
230 aa  56.6  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.87866  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1011  NADH dehydrogenase subunit I  34.41 
 
 
193 aa  55.8  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1040  NADH dehydrogenase subunit I  34.41 
 
 
193 aa  55.8  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000326556 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0702  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  33.33 
 
 
153 aa  55.1  0.0000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2528  NADH dehydrogenase subunit I  34.44 
 
 
200 aa  55.5  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3221  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  35.35 
 
 
254 aa  55.5  0.0000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.129277 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1043  NADH dehydrogenase subunit I  29.46 
 
 
163 aa  55.1  0.0000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1157  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  32.33 
 
 
177 aa  55.1  0.0000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01881  NADH dehydrogenase subunit I  31.52 
 
 
208 aa  54.7  0.0000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1921  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  35.56 
 
 
153 aa  54.7  0.0000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.160971  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01000  NADH:ubiquinone oxidoreductase chain I-like protein  34.96 
 
 
181 aa  54.7  0.0000006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.598496  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3218  NADH dehydrogenase subunit I  30 
 
 
163 aa  54.7  0.0000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0929  NADH dehydrogenase subunit I  30.08 
 
 
163 aa  54.7  0.0000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2715  NADH dehydrogenase subunit I  33.33 
 
 
194 aa  54.7  0.0000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.451197 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0161  NADH dehydrogenase subunit I  31.52 
 
 
208 aa  54.3  0.0000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.646634  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0711  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  33.64 
 
 
170 aa  54.3  0.0000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0425782  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0677  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  39.29 
 
 
148 aa  54.3  0.0000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01791  NADH dehydrogenase subunit I  31.52 
 
 
208 aa  54.3  0.0000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01771  NADH dehydrogenase subunit I  31.52 
 
 
208 aa  54.3  0.0000008  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.351878  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02321  NADH dehydrogenase subunit I  31.46 
 
 
218 aa  54.3  0.0000009  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1526  NADH dehydrogenase subunit I  31.46 
 
 
218 aa  54.3  0.0000009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4455  NADH dehydrogenase subunit I  33.64 
 
 
211 aa  54.3  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.829117  normal  0.833546 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1187  NADH dehydrogenase subunit I  33.05 
 
 
164 aa  53.5  0.000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.438944  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>