More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcHS_A2622 on replicon NC_009800
Organism: Escherichia coli HS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_02380  hydrogenase 4, Fe-S subunit  100 
 
 
179 aa  368  1e-101  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1188  hydrogenase 4 subunit H  100 
 
 
179 aa  368  1e-101  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.40586 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2622  hydrogenase 4 subunit H  100 
 
 
179 aa  368  1e-101  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02342  hypothetical protein  100 
 
 
179 aa  368  1e-101  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2860  hydrogenase 4 subunit H  96.09 
 
 
179 aa  353  6.999999999999999e-97  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3710  hydrogenase 4 subunit H  95.58 
 
 
181 aa  327  7e-89  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1181  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  93.92 
 
 
181 aa  319  9.999999999999999e-87  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2770  hydrogenase 4 subunit H  94.48 
 
 
181 aa  318  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2635  hydrogenase 4 subunit H  92.82 
 
 
181 aa  312  9.999999999999999e-85  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2714  hydrogenase 4 subunit H  58.08 
 
 
189 aa  196  2.0000000000000003e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.594807  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1279  hydrogenase 4 subunit H  56.55 
 
 
189 aa  195  3e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.641192  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4569  formate hydrogenlyase complex iron-sulfur subunit  47.62 
 
 
189 aa  170  1e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2185  formate hydrogenlyase complex iron-sulfur subunit  50 
 
 
184 aa  167  8e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.233255 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2429  formate hydrogenlyase complex iron-sulfur subunit  48.82 
 
 
181 aa  162  2.0000000000000002e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.839749  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3158  formate hydrogenlyase complex iron-sulfur subunit  45.93 
 
 
180 aa  155  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.088865 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3000  formate hydrogenlyase complex iron-sulfur subunit  45.93 
 
 
180 aa  156  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.397657  normal  0.0115018 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2969  formate hydrogenlyase complex iron-sulfur subunit  45.35 
 
 
180 aa  152  2.9999999999999998e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3051  formate hydrogenlyase complex iron-sulfur subunit  45.35 
 
 
180 aa  152  2.9999999999999998e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.266242 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3035  formate hydrogenlyase complex iron-sulfur subunit  45.35 
 
 
180 aa  152  2.9999999999999998e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000101448 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02570  formate hydrogenlyase complex iron-sulfur protein  44.71 
 
 
180 aa  151  4e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0992  formate hydrogenlyase complex iron-sulfur subunit  44.71 
 
 
180 aa  151  4e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0453581 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2856  formate hydrogenlyase complex iron-sulfur subunit  44.71 
 
 
180 aa  151  4e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02535  hypothetical protein  44.71 
 
 
180 aa  151  4e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2845  formate hydrogenlyase complex iron-sulfur subunit  44.71 
 
 
180 aa  152  4e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.105843 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3971  formate hydrogenlyase complex iron-sulfur subunit  44.71 
 
 
180 aa  151  4e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3008  formate hydrogenlyase complex iron-sulfur subunit  44.71 
 
 
180 aa  151  5e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3193  formate hydrogenlyase complex iron-sulfur subunit  44.77 
 
 
180 aa  150  7e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0969  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  44.12 
 
 
180 aa  150  1e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3156  formate hydrogenlyase complex iron-sulfur subunit  42.31 
 
 
180 aa  147  6e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0182  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  41.92 
 
 
194 aa  141  4e-33  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1867  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  39.55 
 
 
179 aa  141  6e-33  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01000  NADH:ubiquinone oxidoreductase chain I-like protein  45.68 
 
 
181 aa  136  1e-31  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.598496  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0712  formate hydrogenlyase complex iron-sulfur subunit  39.26 
 
 
179 aa  131  5e-30  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00445731  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1636  formate hydrogenlyase complex iron-sulfur subunit  37.42 
 
 
179 aa  123  1e-27  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0109811  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0126  formate hydrogenlyase complex iron-sulfur subunit  36.31 
 
 
176 aa  121  7e-27  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0318  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  34.59 
 
 
175 aa  102  4e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.188751  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1921  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  44.34 
 
 
153 aa  90.5  1e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.160971  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3251  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  43.4 
 
 
153 aa  90.1  2e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0708  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  43.4 
 
 
153 aa  89.4  2e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  hitchhiker  0.00573386  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0702  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  44.34 
 
 
153 aa  89.4  3e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1113  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  40.57 
 
 
153 aa  86.3  2e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2784  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  38.1 
 
 
175 aa  83.6  0.000000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2792  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  38.1 
 
 
175 aa  83.6  0.000000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2225  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  37.61 
 
 
119 aa  78.2  0.00000000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1723  NADH dehydrogenase subunit I  37.9 
 
 
163 aa  75.9  0.0000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.341479  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1361  NADH dehydrogenase subunit I  36.22 
 
 
163 aa  75.1  0.0000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.182164  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4503  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  29.59 
 
 
166 aa  74.3  0.0000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.149188 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1269  NADH dehydrogenase subunit I  36.22 
 
 
163 aa  74.3  0.0000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.142775  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1809  NADH dehydrogenase subunit I  39.22 
 
 
180 aa  73.9  0.000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.693845 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1461  NADH dehydrogenase subunit I  39.22 
 
 
180 aa  73.9  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1542  NADH dehydrogenase subunit I  37.96 
 
 
174 aa  73.9  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.383544  normal  0.0726132 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2212  NADH dehydrogenase subunit I  36.59 
 
 
162 aa  73.9  0.000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.199823  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1567  NADH dehydrogenase subunit I  39.22 
 
 
180 aa  73.9  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.997394  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1572  NADH dehydrogenase subunit I  37.96 
 
 
174 aa  73.6  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1596  NADH dehydrogenase subunit I  37.96 
 
 
174 aa  73.6  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.557888  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1879  NADH dehydrogenase subunit I  36.07 
 
 
162 aa  72.8  0.000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.508831  normal  0.262119 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2412  NADH dehydrogenase subunit I  35.77 
 
 
162 aa  72.8  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0701412  normal  0.0109704 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3125  NADH dehydrogenase subunit I  38.24 
 
 
179 aa  73.6  0.000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1363  NADH dehydrogenase subunit I  35.2 
 
 
162 aa  73.2  0.000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.353821  normal  0.140777 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1206  NADH dehydrogenase subunit I  35.43 
 
 
162 aa  72.4  0.000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1077  NADH dehydrogenase subunit I  35.43 
 
 
162 aa  72.4  0.000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.280148 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2041  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  37.5 
 
 
165 aa  72.4  0.000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000212693  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2582  NADH dehydrogenase subunit I  35.77 
 
 
162 aa  72.4  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.561308  normal  0.2116 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2877  NADH dehydrogenase subunit I  35.77 
 
 
162 aa  72.4  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.670141  normal  0.245456 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3290  NADH dehydrogenase subunit I  36.07 
 
 
162 aa  72.8  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.221287  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2562  NADH dehydrogenase subunit I  38.24 
 
 
182 aa  72  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4126  NADH dehydrogenase subunit I  38.24 
 
 
182 aa  72  0.000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3301  NADH dehydrogenase subunit I  39.22 
 
 
180 aa  72  0.000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.9572 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1011  NADH dehydrogenase subunit I  34.65 
 
 
162 aa  72  0.000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.210818  normal  0.566427 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1692  NADH dehydrogenase subunit I  42.55 
 
 
182 aa  72  0.000000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4398  NADH dehydrogenase subunit I  36.29 
 
 
162 aa  72  0.000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4625  NADH dehydrogenase subunit I  36.29 
 
 
162 aa  72  0.000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.11536 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1866  NADH dehydrogenase subunit I  38.24 
 
 
182 aa  72  0.000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0422789 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3698  NADH dehydrogenase subunit I  38.24 
 
 
182 aa  72  0.000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.380267  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29920  NADH dehydrogenase subunit I  38.24 
 
 
182 aa  72  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.546828  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0898  NADH dehydrogenase subunit I  35.48 
 
 
163 aa  72.4  0.000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0404509  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28510  NADH dehydrogenase subunit I  37.25 
 
 
182 aa  72.4  0.000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.559317  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1739  NADH dehydrogenase subunit I  38.24 
 
 
182 aa  72  0.000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.235938  normal  0.220023 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4553  NADH dehydrogenase subunit I  35.94 
 
 
162 aa  71.6  0.000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.128776 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4134  NADH dehydrogenase subunit I  36.29 
 
 
162 aa  72  0.000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.181277  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4550  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  35.71 
 
 
211 aa  71.6  0.000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0810  NADH dehydrogenase subunit I  36.22 
 
 
163 aa  71.2  0.000000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.719018  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2543  NADH dehydrogenase subunit I  39.22 
 
 
180 aa  71.2  0.000000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.879169  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0805  NADH dehydrogenase subunit I  36.22 
 
 
163 aa  71.2  0.000000000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2419  NADH dehydrogenase subunit I  38.24 
 
 
182 aa  71.2  0.000000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.193406 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1401  NADH dehydrogenase subunit I  39.22 
 
 
180 aa  71.2  0.000000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.590324  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2415  NADH dehydrogenase subunit I  36.22 
 
 
163 aa  70.9  0.000000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.87535  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2460  NADH dehydrogenase subunit I  39.22 
 
 
180 aa  70.5  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2560  NADH dehydrogenase subunit I  39.22 
 
 
180 aa  70.5  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0213368  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0711  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  36.57 
 
 
170 aa  70.9  0.00000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0425782  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0394  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  37.19 
 
 
175 aa  70.9  0.00000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3818  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  37.25 
 
 
171 aa  70.9  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.121238  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2667  NADH dehydrogenase subunit I  39.22 
 
 
180 aa  70.5  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2505  NADH dehydrogenase subunit I  39.22 
 
 
180 aa  70.5  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2549  NADH dehydrogenase subunit I  39.22 
 
 
180 aa  70.5  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2051  NADH dehydrogenase subunit I  35.48 
 
 
162 aa  70.5  0.00000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.100158  normal  0.722093 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1376  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  38.24 
 
 
180 aa  69.7  0.00000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00237006  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2430  NADH dehydrogenase subunit I  38.24 
 
 
180 aa  69.7  0.00000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1563  NADH dehydrogenase subunit I  38.68 
 
 
162 aa  69.7  0.00000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.339949  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2657  NADH dehydrogenase subunit I  38.24 
 
 
180 aa  69.7  0.00000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>