More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_1636 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009715  CCV52592_1636  formate hydrogenlyase complex iron-sulfur subunit  100 
 
 
179 aa  370  1e-102  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0109811  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0712  formate hydrogenlyase complex iron-sulfur subunit  91.06 
 
 
179 aa  343  1e-93  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00445731  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1867  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  64.8 
 
 
179 aa  250  8.000000000000001e-66  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0126  formate hydrogenlyase complex iron-sulfur subunit  54.49 
 
 
176 aa  207  6e-53  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2714  hydrogenase 4 subunit H  42.17 
 
 
189 aa  149  2e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.594807  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2185  formate hydrogenlyase complex iron-sulfur subunit  42.51 
 
 
184 aa  148  4e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.233255 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1279  hydrogenase 4 subunit H  41.57 
 
 
189 aa  145  3e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.641192  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02570  formate hydrogenlyase complex iron-sulfur protein  40.98 
 
 
180 aa  144  6e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2856  formate hydrogenlyase complex iron-sulfur subunit  40.98 
 
 
180 aa  144  6e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0992  formate hydrogenlyase complex iron-sulfur subunit  40.98 
 
 
180 aa  144  6e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0453581 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3971  formate hydrogenlyase complex iron-sulfur subunit  40.98 
 
 
180 aa  144  6e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3008  formate hydrogenlyase complex iron-sulfur subunit  40.98 
 
 
180 aa  144  6e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02535  hypothetical protein  40.98 
 
 
180 aa  144  6e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2845  formate hydrogenlyase complex iron-sulfur subunit  40.44 
 
 
180 aa  143  1e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.105843 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3156  formate hydrogenlyase complex iron-sulfur subunit  40.98 
 
 
180 aa  143  1e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0969  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  40.44 
 
 
180 aa  142  2e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3158  formate hydrogenlyase complex iron-sulfur subunit  41.21 
 
 
180 aa  142  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.088865 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2969  formate hydrogenlyase complex iron-sulfur subunit  41.21 
 
 
180 aa  140  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3000  formate hydrogenlyase complex iron-sulfur subunit  40.61 
 
 
180 aa  140  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.397657  normal  0.0115018 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3035  formate hydrogenlyase complex iron-sulfur subunit  41.21 
 
 
180 aa  140  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000101448 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3051  formate hydrogenlyase complex iron-sulfur subunit  41.21 
 
 
180 aa  139  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.266242 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4569  formate hydrogenlyase complex iron-sulfur subunit  36.46 
 
 
189 aa  138  3.9999999999999997e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3193  formate hydrogenlyase complex iron-sulfur subunit  40.46 
 
 
180 aa  137  1e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2429  formate hydrogenlyase complex iron-sulfur subunit  40.12 
 
 
181 aa  134  9.999999999999999e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.839749  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2860  hydrogenase 4 subunit H  38.04 
 
 
179 aa  128  5.0000000000000004e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02380  hydrogenase 4, Fe-S subunit  37.42 
 
 
179 aa  123  1e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2622  hydrogenase 4 subunit H  37.42 
 
 
179 aa  123  1e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02342  hypothetical protein  37.42 
 
 
179 aa  123  1e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1188  hydrogenase 4 subunit H  37.42 
 
 
179 aa  123  1e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.40586 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3710  hydrogenase 4 subunit H  38.65 
 
 
181 aa  114  6e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0182  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  34.44 
 
 
194 aa  110  1.0000000000000001e-23  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01000  NADH:ubiquinone oxidoreductase chain I-like protein  40.49 
 
 
181 aa  108  5e-23  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.598496  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1181  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  39.26 
 
 
181 aa  105  3e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2770  hydrogenase 4 subunit H  38.65 
 
 
181 aa  105  3e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2635  hydrogenase 4 subunit H  38.65 
 
 
181 aa  105  4e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0318  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  32.75 
 
 
175 aa  105  5e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.188751  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2784  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  42.98 
 
 
175 aa  87.4  1e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2792  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  42.98 
 
 
175 aa  87.4  1e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1291  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  33.59 
 
 
152 aa  78.6  0.00000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.68682  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2041  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  41.11 
 
 
165 aa  78.2  0.00000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000212693  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3786  NADH ubiquinone oxidoreductase 20 kDa subunit  38.05 
 
 
256 aa  77.8  0.00000000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.531576  normal  0.312558 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2225  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  36.78 
 
 
119 aa  73.6  0.000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0597  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  43.68 
 
 
129 aa  71.6  0.000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4126  NADH dehydrogenase subunit I  39.45 
 
 
182 aa  71.6  0.000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1866  NADH dehydrogenase subunit I  39.45 
 
 
182 aa  71.6  0.000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0422789 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3698  NADH dehydrogenase subunit I  39.45 
 
 
182 aa  71.6  0.000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.380267  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1739  NADH dehydrogenase subunit I  39.45 
 
 
182 aa  71.6  0.000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.235938  normal  0.220023 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4503  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  28.14 
 
 
166 aa  70.9  0.000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.149188 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3718  NADH ubiquinone oxidoreductase 20 kDa subunit  35.14 
 
 
256 aa  70.5  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0184008  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3660  NADH ubiquinone oxidoreductase, 20 kDa subunit  36.94 
 
 
256 aa  70.5  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0966  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  31.76 
 
 
211 aa  69.7  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0635309 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2667  NADH dehydrogenase subunit I  38.53 
 
 
180 aa  69.7  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1526  NADH dehydrogenase subunit I  37.37 
 
 
218 aa  69.7  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2560  NADH dehydrogenase subunit I  38.53 
 
 
180 aa  69.7  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0213368  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0369  NADH ubiquinone oxidoreductase, 20 kDa subunit  34.48 
 
 
262 aa  70.1  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.639701  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01761  NADH dehydrogenase subunit I  38.78 
 
 
215 aa  70.1  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.273282  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2562  NADH dehydrogenase subunit I  39.05 
 
 
182 aa  70.1  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02321  NADH dehydrogenase subunit I  37.37 
 
 
218 aa  69.7  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2460  NADH dehydrogenase subunit I  38.53 
 
 
180 aa  69.7  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2505  NADH dehydrogenase subunit I  38.53 
 
 
180 aa  69.7  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29920  NADH dehydrogenase subunit I  39.05 
 
 
182 aa  70.1  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.546828  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2549  NADH dehydrogenase subunit I  38.53 
 
 
180 aa  69.7  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3522  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  42.55 
 
 
128 aa  69.7  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01771  NADH dehydrogenase subunit I  38.38 
 
 
208 aa  69.3  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.351878  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0161  NADH dehydrogenase subunit I  38.38 
 
 
208 aa  69.3  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.646634  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01791  NADH dehydrogenase subunit I  38.38 
 
 
208 aa  69.3  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01881  NADH dehydrogenase subunit I  38.38 
 
 
208 aa  69.3  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1371  NADH dehydrogenase subunit I  37.61 
 
 
180 aa  68.9  0.00000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.583652  normal  0.392913 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02206  NADH dehydrogenase subunit I  37.61 
 
 
180 aa  68.9  0.00000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1376  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  37.61 
 
 
180 aa  68.9  0.00000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00237006  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1692  NADH dehydrogenase subunit I  37.27 
 
 
182 aa  68.6  0.00000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2435  NADH dehydrogenase subunit I  37.61 
 
 
180 aa  68.9  0.00000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2430  NADH dehydrogenase subunit I  37.61 
 
 
180 aa  68.9  0.00000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0281  NADH dehydrogenase subunit I  36.36 
 
 
210 aa  68.9  0.00000000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3420  NADH dehydrogenase subunit I  37.61 
 
 
180 aa  68.9  0.00000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2574  NADH dehydrogenase subunit I  37.61 
 
 
180 aa  68.9  0.00000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1809  NADH dehydrogenase subunit I  36.94 
 
 
180 aa  68.9  0.00000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.693845 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3187  NADH ubiquinone oxidoreductase 20 kDa subunit  34.51 
 
 
252 aa  68.9  0.00000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00105058  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1567  NADH dehydrogenase subunit I  36.94 
 
 
180 aa  68.9  0.00000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.997394  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2657  NADH dehydrogenase subunit I  37.61 
 
 
180 aa  68.9  0.00000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02166  hypothetical protein  37.61 
 
 
180 aa  68.9  0.00000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1461  NADH dehydrogenase subunit I  36.94 
 
 
180 aa  68.9  0.00000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26891  NADH dehydrogenase subunit I  37.76 
 
 
218 aa  68.6  0.00000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1113  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  37.61 
 
 
170 aa  68.2  0.00000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.182151  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2419  NADH dehydrogenase subunit I  37.61 
 
 
182 aa  68.2  0.00000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.193406 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2411  NADH dehydrogenase subunit I  36.36 
 
 
215 aa  68.2  0.00000000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3301  NADH dehydrogenase subunit I  37.61 
 
 
180 aa  68.2  0.00000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.9572 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1401  NADH dehydrogenase subunit I  38.53 
 
 
180 aa  67.8  0.00000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.590324  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3814  NADH dehydrogenase subunit I  38.3 
 
 
139 aa  67.8  0.00000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0374  NADH dehydrogenase subunit I  36.84 
 
 
180 aa  68.2  0.00000000007  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2543  NADH dehydrogenase subunit I  38.53 
 
 
180 aa  67.8  0.00000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.879169  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0917  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  36.29 
 
 
179 aa  67.8  0.00000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.5865  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2825  NADH dehydrogenase subunit I  36.7 
 
 
180 aa  67.8  0.00000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.339444  normal  0.999371 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0774  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  47.3 
 
 
394 aa  67.4  0.0000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.290777  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1344  NADH dehydrogenase subunit I  35.35 
 
 
202 aa  67  0.0000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28510  NADH dehydrogenase subunit I  39.58 
 
 
182 aa  67  0.0000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.559317  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3372  NADH dehydrogenase I, I subunit  37.61 
 
 
182 aa  66.2  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.675448  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3204  NADH dehydrogenase subunit I  37.61 
 
 
182 aa  66.6  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0843328  normal  0.169624 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3610  NADH dehydrogenase subunit I  37.61 
 
 
182 aa  66.6  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.487333  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5093  NADH dehydrogenase subunit I  37.23 
 
 
139 aa  66.2  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>