More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_0516 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009073  Pcal_0516  NADH dehydrogenase subunit I  100 
 
 
155 aa  320  5e-87  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0647  NADH dehydrogenase subunit I  84.77 
 
 
154 aa  273  8e-73  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.413211  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0657  NADH dehydrogenase subunit I  82.35 
 
 
156 aa  272  1.0000000000000001e-72  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1632  NADH dehydrogenase subunit I  76.16 
 
 
159 aa  259  1e-68  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.285912  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1899  NADH dehydrogenase subunit I  36.67 
 
 
169 aa  111  5e-24  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.00550248  normal  0.26939 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0304  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  47.15 
 
 
166 aa  109  1.0000000000000001e-23  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.792307 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1302  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  34.9 
 
 
167 aa  108  3e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2276  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  43.07 
 
 
132 aa  102  1e-21  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0276213  normal  0.374891 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1794  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  43.2 
 
 
132 aa  99.4  1e-20  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.178845  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1083  NADH dehydrogenase subunit I  42.65 
 
 
156 aa  99.8  1e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0327  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  43.1 
 
 
132 aa  97.4  6e-20  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2049  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  49 
 
 
132 aa  93.6  8e-19  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0933914 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1667  NADH dehydrogenase subunit I  38.6 
 
 
193 aa  73.9  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1292  F420H2 dehydrogenase subunit I  40.8 
 
 
135 aa  73.2  0.000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000000020121  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1040  NADH dehydrogenase subunit I  36.84 
 
 
193 aa  70.1  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000326556 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1011  NADH dehydrogenase subunit I  36.84 
 
 
193 aa  70.1  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0281  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  29.37 
 
 
165 aa  69.7  0.00000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000516884 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2528  NADH dehydrogenase subunit I  31.45 
 
 
200 aa  70.1  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0401  NADH-plastoquinone oxidoreductase subunit I  39 
 
 
194 aa  68.9  0.00000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2715  NADH dehydrogenase subunit I  39 
 
 
194 aa  68.2  0.00000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.451197 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0898  NADH dehydrogenase subunit I  34.51 
 
 
163 aa  67.8  0.00000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0404509  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3407  F420H2 dehydrogenase subunit I  34.15 
 
 
136 aa  67.4  0.00000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00224717  normal  0.799807 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0374  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  36.44 
 
 
160 aa  67  0.00000000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2415  NADH dehydrogenase subunit I  33.8 
 
 
163 aa  67.4  0.00000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.87535  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1578  NADH dehydrogenase subunit I  36 
 
 
209 aa  67.4  0.00000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.116678  normal  0.902926 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0257  NADH-plastoquinone oxidoreductase subunit I  36.84 
 
 
207 aa  66.6  0.0000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1344  NADH dehydrogenase subunit I  39.6 
 
 
202 aa  66.2  0.0000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1736  putative oxidoreductase  45.16 
 
 
615 aa  66.6  0.0000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4736  NADH dehydrogenase subunit I  39.32 
 
 
173 aa  66.6  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.161018  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4383  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  31.82 
 
 
178 aa  65.9  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02321  NADH dehydrogenase subunit I  36 
 
 
218 aa  66.2  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1526  NADH dehydrogenase subunit I  37 
 
 
218 aa  66.2  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0812  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  36.13 
 
 
183 aa  66.2  0.0000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26891  NADH dehydrogenase subunit I  39 
 
 
218 aa  65.9  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_799  NADH:quinone oxidoreductase subunit 1 (chain I)  31.65 
 
 
183 aa  65.5  0.0000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1030  NADH dehydrogenase subunit I  33.1 
 
 
163 aa  65.5  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.206882  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1054  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  32.2 
 
 
180 aa  66.2  0.0000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1750  NADH dehydrogenase subunit I  31.85 
 
 
161 aa  65.1  0.0000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0928  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, I subunit  36.96 
 
 
169 aa  64.7  0.0000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0281  NADH dehydrogenase subunit I  32.8 
 
 
210 aa  65.1  0.0000000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2411  NADH dehydrogenase subunit I  32.54 
 
 
215 aa  64.7  0.0000000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0786  NADH dehydrogenase subunit I  35.04 
 
 
163 aa  64.7  0.0000000004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.079686  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0289  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  35 
 
 
171 aa  65.1  0.0000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.998746  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1361  NADH dehydrogenase subunit I  31.82 
 
 
163 aa  64.7  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.182164  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1043  NADH dehydrogenase subunit I  33.85 
 
 
163 aa  64.7  0.0000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01761  NADH dehydrogenase subunit I  37 
 
 
215 aa  64.3  0.0000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.273282  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0810  NADH dehydrogenase subunit I  32.39 
 
 
163 aa  64.3  0.0000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.719018  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3290  NADH dehydrogenase subunit I  33.12 
 
 
162 aa  63.9  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.221287  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0805  NADH dehydrogenase subunit I  32.39 
 
 
163 aa  63.9  0.0000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2390  NADH dehydrogenase subunit I  35.38 
 
 
162 aa  63.9  0.0000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0000573568  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1845  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  37.65 
 
 
175 aa  63.5  0.0000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1128  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  33.64 
 
 
140 aa  63.2  0.000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0829  NADH dehydrogenase subunit I  33.08 
 
 
163 aa  63.5  0.000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.260339  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0161  NADH dehydrogenase subunit I  36 
 
 
208 aa  63.2  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.646634  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01881  NADH dehydrogenase subunit I  36 
 
 
208 aa  63.2  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01771  NADH dehydrogenase subunit I  36 
 
 
208 aa  63.2  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.351878  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1222  putative oxidoreductase  39.8 
 
 
616 aa  63.2  0.000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0767368  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01791  NADH dehydrogenase subunit I  36 
 
 
208 aa  63.2  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3372  NADH dehydrogenase I, I subunit  32.34 
 
 
182 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.675448  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3204  NADH dehydrogenase subunit I  32.34 
 
 
182 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0843328  normal  0.169624 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0320  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  34.88 
 
 
234 aa  62.4  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.562709 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1723  NADH dehydrogenase subunit I  32.39 
 
 
163 aa  62.4  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.341479  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1354  NADH dehydrogenase subunit I  33.77 
 
 
171 aa  62.4  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.253044  normal  0.161644 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2582  NADH dehydrogenase subunit I  33.77 
 
 
162 aa  62.4  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.561308  normal  0.2116 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2412  NADH dehydrogenase subunit I  33.12 
 
 
162 aa  62.4  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0701412  normal  0.0109704 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1333  NADH dehydrogenase subunit I  39.32 
 
 
171 aa  62.8  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3216  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  37.5 
 
 
168 aa  62.4  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1742  NADH dehydrogenase subunit I  31.5 
 
 
213 aa  62  0.000000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3610  NADH dehydrogenase subunit I  31.74 
 
 
182 aa  62  0.000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.487333  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3387  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  31.33 
 
 
165 aa  61.6  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.533197  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1020  NADH dehydrogenase subunit I  38.1 
 
 
171 aa  62  0.000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.755319  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4625  NADH dehydrogenase subunit I  33.58 
 
 
162 aa  61.6  0.000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.11536 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1922  NADH dehydrogenase subunit I  31.5 
 
 
213 aa  62  0.000000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  decreased coverage  0.000283263  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4126  NADH dehydrogenase subunit I  32.12 
 
 
182 aa  61.6  0.000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1269  NADH dehydrogenase subunit I  31.58 
 
 
163 aa  61.2  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.142775  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1206  NADH dehydrogenase subunit I  31.82 
 
 
162 aa  61.6  0.000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1011  NADH dehydrogenase subunit I  31.17 
 
 
162 aa  61.6  0.000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.210818  normal  0.566427 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2926  NADH dehydrogenase subunit I  35.2 
 
 
162 aa  61.6  0.000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1739  NADH dehydrogenase subunit I  32.12 
 
 
182 aa  61.6  0.000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.235938  normal  0.220023 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1077  NADH dehydrogenase subunit I  31.82 
 
 
162 aa  61.6  0.000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.280148 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2877  NADH dehydrogenase subunit I  33.12 
 
 
162 aa  61.2  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.670141  normal  0.245456 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2212  NADH dehydrogenase subunit I  32.47 
 
 
162 aa  61.6  0.000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.199823  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3698  NADH dehydrogenase subunit I  32.12 
 
 
182 aa  61.6  0.000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.380267  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2235  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  32 
 
 
165 aa  61.6  0.000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.272952  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1866  NADH dehydrogenase subunit I  32.12 
 
 
182 aa  61.6  0.000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0422789 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2051  NADH dehydrogenase subunit I  31.29 
 
 
162 aa  61.2  0.000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.100158  normal  0.722093 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3218  NADH dehydrogenase subunit I  32.89 
 
 
163 aa  60.8  0.000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0957  NADH dehydrogenase subunit I  33.08 
 
 
162 aa  60.5  0.000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0765322  normal  0.470027 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1879  NADH dehydrogenase subunit I  31.82 
 
 
162 aa  60.5  0.000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.508831  normal  0.262119 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4553  NADH dehydrogenase subunit I  31.17 
 
 
162 aa  60.5  0.000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.128776 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3814  NADH dehydrogenase subunit I  30.65 
 
 
139 aa  60.5  0.000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0371  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  31.62 
 
 
229 aa  60.5  0.000000009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.839117  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4410  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  43.53 
 
 
194 aa  60.5  0.000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1411  NADH dehydrogenase subunit I  30.08 
 
 
165 aa  60.1  0.00000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0328529 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3296  NADH dehydrogenase subunit I  32.5 
 
 
139 aa  59.7  0.00000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1099  NADH dehydrogenase subunit I  29.85 
 
 
162 aa  59.7  0.00000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0468  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  34.21 
 
 
216 aa  60.1  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0616317 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2292  NADH dehydrogenase subunit I  33.59 
 
 
161 aa  60.1  0.00000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1301  NADH dehydrogenase subunit I  33.59 
 
 
162 aa  60.1  0.00000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  decreased coverage  0.00320411  normal  0.488956 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0885  putative oxidoreductase  43.21 
 
 
612 aa  60.1  0.00000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>