More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pisl_1632 on replicon NC_008701
Organism: Pyrobaculum islandicum DSM 4184



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008701  Pisl_1632  NADH dehydrogenase subunit I  100 
 
 
159 aa  327  3e-89  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.285912  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0657  NADH dehydrogenase subunit I  78.21 
 
 
156 aa  267  4e-71  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0516  NADH dehydrogenase subunit I  76.16 
 
 
155 aa  259  2e-68  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0647  NADH dehydrogenase subunit I  77.78 
 
 
154 aa  257  5.0000000000000005e-68  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.413211  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0304  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  44.35 
 
 
166 aa  112  2.0000000000000002e-24  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.792307 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1899  NADH dehydrogenase subunit I  34.93 
 
 
169 aa  109  2.0000000000000002e-23  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.00550248  normal  0.26939 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1302  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  40.32 
 
 
167 aa  108  4.0000000000000004e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2276  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  44.17 
 
 
132 aa  103  1e-21  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0276213  normal  0.374891 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1083  NADH dehydrogenase subunit I  40.65 
 
 
156 aa  98.6  3e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2049  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  45.61 
 
 
132 aa  96.7  1e-19  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0933914 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1794  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  41.03 
 
 
132 aa  96.7  1e-19  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.178845  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0327  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  40.87 
 
 
132 aa  96.3  2e-19  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2528  NADH dehydrogenase subunit I  35.34 
 
 
200 aa  73.6  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0374  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  35.83 
 
 
160 aa  72.4  0.000000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1011  NADH dehydrogenase subunit I  34.59 
 
 
193 aa  72  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1040  NADH dehydrogenase subunit I  34.59 
 
 
193 aa  72  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000326556 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0786  NADH dehydrogenase subunit I  35.66 
 
 
163 aa  70.9  0.000000000006  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.079686  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1667  NADH dehydrogenase subunit I  33.59 
 
 
193 aa  69.3  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4736  NADH dehydrogenase subunit I  37.61 
 
 
173 aa  68.2  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.161018  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3290  NADH dehydrogenase subunit I  31.9 
 
 
162 aa  67.8  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.221287  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1128  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  38.32 
 
 
140 aa  67.8  0.00000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0401  NADH-plastoquinone oxidoreductase subunit I  39 
 
 
194 aa  67.4  0.00000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3407  F420H2 dehydrogenase subunit I  36.89 
 
 
136 aa  67.4  0.00000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00224717  normal  0.799807 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1879  NADH dehydrogenase subunit I  31.9 
 
 
162 aa  66.6  0.0000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.508831  normal  0.262119 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2715  NADH dehydrogenase subunit I  38 
 
 
194 aa  66.6  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.451197 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2582  NADH dehydrogenase subunit I  31.9 
 
 
162 aa  66.6  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.561308  normal  0.2116 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2415  NADH dehydrogenase subunit I  30.25 
 
 
163 aa  65.9  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.87535  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0281  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  30.53 
 
 
165 aa  66.2  0.0000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000516884 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1344  NADH dehydrogenase subunit I  39.6 
 
 
202 aa  66.2  0.0000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0898  NADH dehydrogenase subunit I  31.61 
 
 
163 aa  66.2  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0404509  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1043  NADH dehydrogenase subunit I  34.35 
 
 
163 aa  65.9  0.0000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1292  F420H2 dehydrogenase subunit I  38.52 
 
 
135 aa  66.2  0.0000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000000020121  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2877  NADH dehydrogenase subunit I  31.29 
 
 
162 aa  65.9  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.670141  normal  0.245456 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1030  NADH dehydrogenase subunit I  31.61 
 
 
163 aa  66.2  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.206882  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1578  NADH dehydrogenase subunit I  32.33 
 
 
209 aa  66.2  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.116678  normal  0.902926 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0257  NADH-plastoquinone oxidoreductase subunit I  36.61 
 
 
207 aa  66.2  0.0000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02321  NADH dehydrogenase subunit I  36 
 
 
218 aa  65.5  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1526  NADH dehydrogenase subunit I  31.93 
 
 
218 aa  65.5  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0805  NADH dehydrogenase subunit I  30.25 
 
 
163 aa  65.5  0.0000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2412  NADH dehydrogenase subunit I  31.29 
 
 
162 aa  65.1  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0701412  normal  0.0109704 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2212  NADH dehydrogenase subunit I  30.67 
 
 
162 aa  65.5  0.0000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.199823  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26891  NADH dehydrogenase subunit I  38 
 
 
218 aa  65.1  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0829  NADH dehydrogenase subunit I  33.59 
 
 
163 aa  65.1  0.0000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.260339  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0810  NADH dehydrogenase subunit I  32.87 
 
 
163 aa  65.1  0.0000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.719018  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1743  NADH dehydrogenase subunit I  35.43 
 
 
164 aa  64.7  0.0000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00386762  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0107  NADH dehydrogenase subunit I  35.43 
 
 
164 aa  64.7  0.0000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.807538  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1736  putative oxidoreductase  36.72 
 
 
615 aa  64.7  0.0000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1750  NADH dehydrogenase subunit I  31.3 
 
 
161 aa  64.3  0.0000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1054  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  35.58 
 
 
180 aa  64.3  0.0000000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2390  NADH dehydrogenase subunit I  32.03 
 
 
162 aa  64.3  0.0000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0000573568  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0289  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  40.5 
 
 
171 aa  63.9  0.0000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.998746  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0281  NADH dehydrogenase subunit I  35.43 
 
 
210 aa  63.9  0.0000000008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1361  NADH dehydrogenase subunit I  31.06 
 
 
163 aa  63.9  0.0000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.182164  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0957  NADH dehydrogenase subunit I  32.82 
 
 
162 aa  63.5  0.000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0765322  normal  0.470027 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4553  NADH dehydrogenase subunit I  30.06 
 
 
162 aa  63.5  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.128776 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1011  NADH dehydrogenase subunit I  31.13 
 
 
162 aa  63.5  0.000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.210818  normal  0.566427 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2411  NADH dehydrogenase subunit I  36 
 
 
215 aa  63.5  0.000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1206  NADH dehydrogenase subunit I  31.13 
 
 
162 aa  63.5  0.000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1077  NADH dehydrogenase subunit I  31.13 
 
 
162 aa  63.5  0.000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.280148 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2051  NADH dehydrogenase subunit I  29.45 
 
 
162 aa  63.5  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.100158  normal  0.722093 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1723  NADH dehydrogenase subunit I  32.17 
 
 
163 aa  63.5  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.341479  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01881  NADH dehydrogenase subunit I  33.04 
 
 
208 aa  63.2  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01771  NADH dehydrogenase subunit I  36 
 
 
208 aa  62.8  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.351878  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0161  NADH dehydrogenase subunit I  36 
 
 
208 aa  62.8  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.646634  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2292  NADH dehydrogenase subunit I  31.91 
 
 
161 aa  62.4  0.000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01761  NADH dehydrogenase subunit I  36 
 
 
215 aa  63.2  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.273282  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1333  NADH dehydrogenase subunit I  36.75 
 
 
171 aa  62.8  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1845  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  34.88 
 
 
175 aa  63.2  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3296  NADH dehydrogenase subunit I  34.17 
 
 
139 aa  62.8  0.000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1696  NADH dehydrogenase subunit I  34.65 
 
 
164 aa  62.8  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00251501  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01791  NADH dehydrogenase subunit I  35 
 
 
208 aa  62.8  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4410  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  40.7 
 
 
194 aa  62  0.000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3218  NADH dehydrogenase subunit I  31.61 
 
 
163 aa  62  0.000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3818  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  36.04 
 
 
171 aa  62.4  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.121238  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3216  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  32.65 
 
 
168 aa  62  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4625  NADH dehydrogenase subunit I  28.83 
 
 
162 aa  62  0.000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.11536 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1354  NADH dehydrogenase subunit I  35.9 
 
 
171 aa  61.6  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.253044  normal  0.161644 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3814  NADH dehydrogenase subunit I  31.2 
 
 
139 aa  61.2  0.000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0982  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  35.19 
 
 
214 aa  61.2  0.000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4134  NADH dehydrogenase subunit I  30.46 
 
 
162 aa  61.2  0.000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.181277  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0546  NADH dehydrogenase subunit I  38.52 
 
 
217 aa  61.2  0.000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.175795  normal  0.434998 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4383  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  30.5 
 
 
178 aa  61.2  0.000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3408  NADH dehydrogenase subunit I  36.11 
 
 
139 aa  61.2  0.000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2238  NADH dehydrogenase subunit I  31.97 
 
 
163 aa  61.2  0.000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.180184 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0592  Formate hydrogenlyase subunit 6/NADH:ubiquinone oxidoreductase 23 kD subunit (chain I)-like protein  41.86 
 
 
171 aa  61.2  0.000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0320  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  32.56 
 
 
234 aa  61.2  0.000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.562709 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1921  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  29.75 
 
 
153 aa  60.8  0.000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.160971  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2205  putative oxidoreductase  34.26 
 
 
598 aa  60.8  0.000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.204646  normal  0.261416 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0468  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  36.28 
 
 
216 aa  60.8  0.000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0616317 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4398  NADH dehydrogenase subunit I  29.8 
 
 
162 aa  60.5  0.000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1187  NADH dehydrogenase subunit I  31.11 
 
 
164 aa  60.5  0.000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.438944  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1301  NADH dehydrogenase subunit I  31.88 
 
 
162 aa  60.5  0.000000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  decreased coverage  0.00320411  normal  0.488956 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_14260  predicted protein  36.8 
 
 
163 aa  60.5  0.00000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2926  NADH dehydrogenase subunit I  29.45 
 
 
162 aa  60.5  0.00000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006681  CNL05770  conserved hypothetical protein  31.34 
 
 
273 aa  60.5  0.00000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3387  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  32.45 
 
 
165 aa  60.1  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.533197  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1322  NADH dehydrogenase subunit I  31.72 
 
 
164 aa  60.1  0.00000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.323962  normal  0.0547108 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6674  NADH dehydrogenase subunit I  35.24 
 
 
188 aa  59.3  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1020  NADH dehydrogenase subunit I  36.11 
 
 
171 aa  58.9  0.00000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.755319  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0400  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  35.4 
 
 
216 aa  58.9  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>