178 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_5273 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_4905  cell wall hydrolase/autolysin  100 
 
 
251 aa  506  9.999999999999999e-143  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0385715  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4994  cell wall hydrolase/autolysin  100 
 
 
251 aa  506  9.999999999999999e-143  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5273  cell wall hydrolase/autolysin  100 
 
 
251 aa  506  9.999999999999999e-143  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.467188  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5529  cell wall hydrolase/autolysin  84.44 
 
 
246 aa  385  1e-106  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1286  cell wall hydrolase/autolysin  77.91 
 
 
245 aa  382  1e-105  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13749  hypothetical protein  73.62 
 
 
241 aa  364  1e-100  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.369485 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4010  cell wall hydrolase/autolysin  53.39 
 
 
254 aa  251  1e-65  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.864975  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0671  cell wall hydrolase/autolysin  42.25 
 
 
320 aa  184  9e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2753  cell wall hydrolase/autolysin  40.47 
 
 
254 aa  169  5e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.984252  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1357  cell wall hydrolase/autolysin  40.99 
 
 
286 aa  169  5e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.414025  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3402  cell wall hydrolase/autolysin  39.53 
 
 
347 aa  168  6e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4394  cell wall hydrolase/autolysin  38.25 
 
 
296 aa  163  2.0000000000000002e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0290  cell wall hydrolase/autolysin  38.53 
 
 
283 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9001  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase-like protein  38.03 
 
 
283 aa  157  1e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.257312  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1163  cell wall hydrolase/autolysin  44.87 
 
 
301 aa  155  8e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.914132  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3352  cell wall hydrolase/autolysin  37.44 
 
 
290 aa  150  2e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.939997 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5160  cell wall hydrolase/autolysin  39.37 
 
 
291 aa  150  2e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0130951 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4160  cell wall hydrolase/autolysin  39.91 
 
 
259 aa  145  4.0000000000000006e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00486305  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2975  cell wall hydrolase/autolysin  30.05 
 
 
463 aa  94.4  2e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1077  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  29.11 
 
 
657 aa  75.5  0.0000000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0200962 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1080  cell wall hydrolase/autolysin  26.13 
 
 
703 aa  71.6  0.00000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000496227  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0185  cell wall hydrolase/autolysin  26.32 
 
 
948 aa  67.8  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00443483  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1398  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase domain-containing protein  22.33 
 
 
241 aa  66.2  0.0000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.373553  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1016  cell wall hydrolase/autolysin  28.02 
 
 
352 aa  66.2  0.0000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000634005  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3244  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  27.91 
 
 
815 aa  63.5  0.000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1807  cell wall hydrolase/autolysin  23.32 
 
 
268 aa  62.4  0.000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4802  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  26.94 
 
 
317 aa  62  0.000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.344171  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1576  cell wall hydrolase/autolysin  25.23 
 
 
410 aa  62  0.000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000010106  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3626  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  27.4 
 
 
476 aa  61.6  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000133632  normal  0.124331 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0434  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  25.35 
 
 
317 aa  61.6  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3789  cell wall hydrolase/autolysin  25.45 
 
 
538 aa  61.6  0.00000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1687  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase, family 3  25.11 
 
 
410 aa  60.5  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000543314  hitchhiker  0.00000000000000117907 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4521  cell wall hydrolase/autolysin  26.42 
 
 
318 aa  60.8  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007323  GBAA_pXO2_0045  surface-layer n-acetylmuramoyl-l-alanine amidase  25 
 
 
531 aa  59.7  0.00000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000055922  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2674  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  27.95 
 
 
860 aa  59.7  0.00000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000467202  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0539  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase, putative  25.35 
 
 
268 aa  58.5  0.0000001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  hitchhiker  0.000536287  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2941  cell wall hydrolase/autolysin  23.44 
 
 
250 aa  58.5  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000101461  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15510  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  25.88 
 
 
746 aa  58.2  0.0000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1374  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  23.93 
 
 
529 aa  57.8  0.0000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.736006  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0477  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  25.93 
 
 
377 aa  57.8  0.0000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2351  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  24.05 
 
 
410 aa  57.4  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000872091  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2268  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  24.05 
 
 
410 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000138501  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2528  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  24.05 
 
 
410 aa  57.4  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000564272  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9044  cell wall hydrolase/autolysin  29.68 
 
 
381 aa  57.4  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.683287 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2543  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase, family 3  24.05 
 
 
410 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.7515e-61 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3053  cell wall hydrolase/autolysin  24.66 
 
 
591 aa  56.6  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0425538  normal  0.806567 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3067  cell wall hydrolase/autolysin  24.66 
 
 
591 aa  56.6  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2296  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  25.46 
 
 
249 aa  56.6  0.0000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3223  cell wall hydrolase/autolysin  22.32 
 
 
257 aa  56.2  0.0000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3265  cell wall hydrolase/autolysin  24.12 
 
 
556 aa  56.2  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1153  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  26.46 
 
 
731 aa  55.8  0.0000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1272  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  25.12 
 
 
242 aa  55.5  0.0000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000305091 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0665  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  24.9 
 
 
399 aa  55.5  0.0000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.188608 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0368  cell wall hydrolase/autolysin  24.76 
 
 
474 aa  55.5  0.0000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000387898  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4667  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  25.61 
 
 
404 aa  55.5  0.0000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.975026  normal  0.573813 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2310  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  23.63 
 
 
410 aa  54.3  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  2.2191900000000004e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1034  cell wall hydrolase/autolysin  26.15 
 
 
604 aa  54.3  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00179452 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3187  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  21.78 
 
 
474 aa  53.9  0.000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0462523  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0111  putative N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  20.28 
 
 
297 aa  53.9  0.000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0171096  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2150  cell wall hydrolase/autolysin  27.15 
 
 
378 aa  53.5  0.000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1194  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  22.03 
 
 
291 aa  53.1  0.000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00764454  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0588  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  22.49 
 
 
315 aa  53.1  0.000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0964307  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0113  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase domain-containing protein  21.3 
 
 
319 aa  52.8  0.000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0859  cell wall hydrolase/autolysin  23.89 
 
 
231 aa  52.4  0.000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.751216 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1472  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  24.28 
 
 
352 aa  52.4  0.000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.764307  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4581  cell wall hydrolase/autolysin  28.04 
 
 
392 aa  52  0.000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00170729 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0714  cell wall hydrolase/autolysin  24.42 
 
 
568 aa  52  0.00001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000891382  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0378  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  23 
 
 
286 aa  51.6  0.00001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1465  cell wall hydrolase/autolysin  25.24 
 
 
627 aa  51.2  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000155726  normal  0.0455493 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2615  cell wall hydrolase/autolysin  27.6 
 
 
562 aa  50.8  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0213  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  22.27 
 
 
257 aa  50.8  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00242661  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2281  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  24.64 
 
 
253 aa  50.8  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0442752  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1825  cell wall hydrolase/autolysin  25.35 
 
 
590 aa  50.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0792  cell wall hydrolase/autolysin  23.72 
 
 
530 aa  50.8  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000364595  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2268  cell wall hydrolase/autolysin  24.54 
 
 
585 aa  50.1  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5403  cell wall hydrolase/autolysin  24.06 
 
 
383 aa  50.1  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1654  cell wall hydrolase/autolysin  23.75 
 
 
239 aa  49.7  0.00004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0588  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  26.56 
 
 
299 aa  50.1  0.00004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.155092  hitchhiker  0.000000157897 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2183  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  28.92 
 
 
431 aa  49.7  0.00005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000115725 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1534  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  23.02 
 
 
562 aa  49.7  0.00005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0577934  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3028  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  22.75 
 
 
435 aa  49.7  0.00005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0809739  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1037  cell wall hydrolase/autolysin  25.47 
 
 
282 aa  49.7  0.00005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000520561  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4550  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  24.68 
 
 
375 aa  49.3  0.00006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.368725 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1297  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  23.4 
 
 
410 aa  49.3  0.00006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.111917  normal  0.539437 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0864  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  22.51 
 
 
476 aa  49.3  0.00006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.721049  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0926  cell wall hydrolase/autolysin  19.92 
 
 
219 aa  49.3  0.00006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3345  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  25.36 
 
 
448 aa  48.9  0.00007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2693  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  23.6 
 
 
616 aa  49.3  0.00007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.17431  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0322  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase CwlD  20.23 
 
 
246 aa  48.5  0.00009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0112348  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5099  cell wall hydrolase/autolysin  27.7 
 
 
387 aa  48.5  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000380245 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4538  cell wall hydrolase/autolysin  25.84 
 
 
438 aa  47.4  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2611  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  26.05 
 
 
505 aa  47.4  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1305  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  29.15 
 
 
517 aa  47.4  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.274894  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0837  peptidoglycan binding domain-containing protein  26.27 
 
 
395 aa  47.8  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.265707  normal  0.357261 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10331  cell wall hydrolase/autolysin  22.79 
 
 
362 aa  47.4  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.374691  normal  0.548996 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2482  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  26.05 
 
 
515 aa  47.4  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0672514 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0587  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  21.1 
 
 
352 aa  47  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2385  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  24.31 
 
 
458 aa  47  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.282435  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0812  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  24.86 
 
 
406 aa  47  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2258  cell wall hydrolase/autolysin  22.69 
 
 
876 aa  47  0.0003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000147959  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>