204 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_1163 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_1163  cell wall hydrolase/autolysin  100 
 
 
301 aa  601  1.0000000000000001e-171  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.914132  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1357  cell wall hydrolase/autolysin  59.53 
 
 
286 aa  254  1.0000000000000001e-66  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.414025  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5160  cell wall hydrolase/autolysin  58.9 
 
 
291 aa  229  3e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0130951 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2753  cell wall hydrolase/autolysin  52.04 
 
 
254 aa  213  2.9999999999999995e-54  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.984252  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4394  cell wall hydrolase/autolysin  48.39 
 
 
296 aa  197  1.0000000000000001e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0290  cell wall hydrolase/autolysin  46.05 
 
 
283 aa  189  2.9999999999999997e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3352  cell wall hydrolase/autolysin  48.39 
 
 
290 aa  187  2e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.939997 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9001  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase-like protein  39.65 
 
 
283 aa  174  9.999999999999999e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.257312  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0671  cell wall hydrolase/autolysin  45.16 
 
 
320 aa  162  9e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5529  cell wall hydrolase/autolysin  44.55 
 
 
246 aa  160  2e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4905  cell wall hydrolase/autolysin  44.5 
 
 
251 aa  157  3e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0385715  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4994  cell wall hydrolase/autolysin  44.5 
 
 
251 aa  157  3e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5273  cell wall hydrolase/autolysin  44.5 
 
 
251 aa  157  3e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.467188  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4010  cell wall hydrolase/autolysin  44.84 
 
 
254 aa  154  1e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.864975  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13749  hypothetical protein  44.09 
 
 
241 aa  152  5e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.369485 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1286  cell wall hydrolase/autolysin  41.42 
 
 
245 aa  146  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4160  cell wall hydrolase/autolysin  41.1 
 
 
259 aa  133  3.9999999999999996e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00486305  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3402  cell wall hydrolase/autolysin  37.2 
 
 
347 aa  116  3.9999999999999997e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2975  cell wall hydrolase/autolysin  32.73 
 
 
463 aa  83.6  0.000000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0113  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase domain-containing protein  28.17 
 
 
319 aa  82.8  0.000000000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0111  putative N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  30.4 
 
 
297 aa  82.8  0.000000000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0171096  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4802  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  28.89 
 
 
317 aa  81.6  0.00000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.344171  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0434  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  28.44 
 
 
317 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1807  cell wall hydrolase/autolysin  24.09 
 
 
268 aa  74.3  0.000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4521  cell wall hydrolase/autolysin  28.97 
 
 
318 aa  72  0.00000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1466  cell wall hydrolase/autolysin  27.42 
 
 
627 aa  71.2  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.000000000100817  normal  0.166489 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0802  N-acetylmuramoyl-l-alanine amidase family protein  28.16 
 
 
412 aa  70.1  0.00000000004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.535912  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3626  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  23.08 
 
 
476 aa  69.3  0.00000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000133632  normal  0.124331 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0861  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  27.15 
 
 
631 aa  68.9  0.00000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.0000195536  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0859  cell wall hydrolase/autolysin  26.67 
 
 
231 aa  68.9  0.0000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.751216 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2296  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  27.35 
 
 
249 aa  67.4  0.0000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0254  cell wall hydrolase/autolysin  29.86 
 
 
604 aa  66.2  0.0000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.323701  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4727  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  28.02 
 
 
619 aa  64.7  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0152355  normal  0.26499 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2267  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  25.84 
 
 
421 aa  63.9  0.000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0866  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  27.49 
 
 
412 aa  63.5  0.000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.139466  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1016  cell wall hydrolase/autolysin  25.64 
 
 
352 aa  63.2  0.000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000634005  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15510  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  26.09 
 
 
746 aa  63.2  0.000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2941  cell wall hydrolase/autolysin  21.95 
 
 
250 aa  62.8  0.000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000101461  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0587  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  28.82 
 
 
352 aa  62.4  0.000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0665  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  27.46 
 
 
399 aa  62.4  0.00000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.188608 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1398  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase domain-containing protein  25.88 
 
 
241 aa  62  0.00000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.373553  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0185  cell wall hydrolase/autolysin  25.81 
 
 
948 aa  61.6  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00443483  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0915  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  27.2 
 
 
422 aa  60.5  0.00000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.237056  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2134  cell wall hydrolase/autolysin  27.39 
 
 
349 aa  60.8  0.00000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.373316  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1472  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  27.84 
 
 
352 aa  60.1  0.00000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.764307  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0339  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  27.16 
 
 
706 aa  60.1  0.00000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1804  cell wall hydrolase/autolysin  22.88 
 
 
240 aa  59.7  0.00000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.052646  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0910  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  26.8 
 
 
402 aa  59.7  0.00000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0182815  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1825  cell wall hydrolase/autolysin  27.88 
 
 
590 aa  59.3  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3223  cell wall hydrolase/autolysin  23.74 
 
 
257 aa  58.5  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4550  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  26.05 
 
 
375 aa  58.5  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.368725 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3678  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  23.75 
 
 
338 aa  57.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3265  cell wall hydrolase/autolysin  25.89 
 
 
556 aa  57.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1034  cell wall hydrolase/autolysin  27.74 
 
 
604 aa  57.8  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00179452 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3732  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  24.6 
 
 
338 aa  57.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000534753  normal  0.117524 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0885  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  26.98 
 
 
300 aa  57.4  0.0000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0020686  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1080  cell wall hydrolase/autolysin  24.53 
 
 
703 aa  57.4  0.0000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000496227  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0322  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase CwlD  23.61 
 
 
246 aa  57  0.0000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0112348  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0589  cell wall hydrolase/autolysin  24.22 
 
 
612 aa  56.6  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0604  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  24.22 
 
 
612 aa  56.6  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.594044  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0609  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  26.73 
 
 
808 aa  56.2  0.0000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2317  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  30.04 
 
 
321 aa  56.2  0.0000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3053  cell wall hydrolase/autolysin  22.62 
 
 
591 aa  56.2  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0425538  normal  0.806567 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1410  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  26.17 
 
 
366 aa  56.2  0.0000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.760339 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3123  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  23.79 
 
 
332 aa  55.8  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3067  cell wall hydrolase/autolysin  22.62 
 
 
591 aa  56.2  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0477  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  27.6 
 
 
377 aa  55.5  0.000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2183  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  26.27 
 
 
431 aa  54.7  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000115725 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1374  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  24.7 
 
 
529 aa  54.7  0.000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.736006  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4484  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  27.39 
 
 
543 aa  54.7  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000290327  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0332  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  28.18 
 
 
263 aa  54.7  0.000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000783569  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0792  cell wall hydrolase/autolysin  23.56 
 
 
530 aa  54.7  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000364595  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1322  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  29.12 
 
 
364 aa  53.9  0.000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.779123  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0208  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  24.72 
 
 
232 aa  53.9  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000016019 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2615  cell wall hydrolase/autolysin  27.15 
 
 
562 aa  53.9  0.000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3028  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  24.53 
 
 
435 aa  54.3  0.000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0809739  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1798  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  25.11 
 
 
623 aa  53.9  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3124  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  23.32 
 
 
471 aa  53.5  0.000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0129818  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2148  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  26.23 
 
 
522 aa  53.5  0.000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1823  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  28.48 
 
 
422 aa  53.5  0.000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0998056  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1465  cell wall hydrolase/autolysin  23.18 
 
 
627 aa  53.1  0.000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000155726  normal  0.0455493 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0926  cell wall hydrolase/autolysin  21.88 
 
 
219 aa  53.5  0.000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1795  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  26.09 
 
 
434 aa  53.1  0.000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0743  cell wall hydrolase/autolysin  22.49 
 
 
249 aa  52.8  0.000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.508174  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0722  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  31.68 
 
 
469 aa  52.8  0.000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.033556  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2360  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  24.66 
 
 
344 aa  52.8  0.000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.26107  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1037  cell wall hydrolase/autolysin  25.46 
 
 
282 aa  52.4  0.000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000520561  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39690  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  25.91 
 
 
382 aa  52.8  0.000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.587198 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2268  cell wall hydrolase/autolysin  25.11 
 
 
585 aa  52.4  0.000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0862  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  22.97 
 
 
619 aa  51.6  0.00001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00159133  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4053  cell wall hydrolase/autolysin  23.08 
 
 
585 aa  52  0.00001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.630004  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2729  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  25.32 
 
 
436 aa  52  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.3202  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2911  cell wall hydrolase/autolysin  28.11 
 
 
259 aa  51.6  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0569075  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1135  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  35.94 
 
 
364 aa  51.2  0.00002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0223149  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2674  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  25.33 
 
 
860 aa  51.6  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000467202  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0959  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  25.4 
 
 
416 aa  51.2  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0256681 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0725  cell wall hydrolase/autolysin  24 
 
 
520 aa  50.4  0.00003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00509624  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2572  N-acetylmuramoyl-l-alanine amidase I  25.38 
 
 
289 aa  50.4  0.00003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5099  cell wall hydrolase/autolysin  29.13 
 
 
387 aa  50.8  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000380245 
 
 
-
 
NC_002620  TC0539  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase, putative  24.09 
 
 
268 aa  50.4  0.00004  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  hitchhiker  0.000536287  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>