29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_2975 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_2975  cell wall hydrolase/autolysin  100 
 
 		 463 aa  872    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3402  cell wall hydrolase/autolysin  41.2 
 
 		 347 aa  153  5e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4010  cell wall hydrolase/autolysin  38.08 
 
 		 254 aa  129  1.0000000000000001e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.864975  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0671  cell wall hydrolase/autolysin  33.86 
 
 		 320 aa  100  8e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5529  cell wall hydrolase/autolysin  32.57 
 
 		 246 aa  99.4  1e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1286  cell wall hydrolase/autolysin  33.92 
 
 		 245 aa  99  2e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13749  hypothetical protein  32.31 
 
 		 241 aa  95.1  2e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.369485 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4905  cell wall hydrolase/autolysin  30.05 
 
 		 251 aa  92.4  1e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0385715  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4994  cell wall hydrolase/autolysin  30.05 
 
 		 251 aa  92.4  1e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5273  cell wall hydrolase/autolysin  30.05 
 
 		 251 aa  92.4  1e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.467188  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4394  cell wall hydrolase/autolysin  33.71 
 
 		 296 aa  86.3  0.000000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1357  cell wall hydrolase/autolysin  36.16 
 
 		 286 aa  85.1  0.000000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.414025  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2753  cell wall hydrolase/autolysin  30.67 
 
 		 254 aa  82.4  0.00000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.984252  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5160  cell wall hydrolase/autolysin  32.23 
 
 		 291 aa  80.5  0.00000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0130951 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3352  cell wall hydrolase/autolysin  30.36 
 
 		 290 aa  80.1  0.00000000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.939997 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4160  cell wall hydrolase/autolysin  31.53 
 
 		 259 aa  79.7  0.0000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00486305  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0290  cell wall hydrolase/autolysin  28.95 
 
 		 283 aa  78.2  0.0000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2296  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  30.54 
 
 		 249 aa  73.6  0.000000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9001  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase-like protein  26.21 
 
 		 283 aa  71.6  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.257312  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1163  cell wall hydrolase/autolysin  32.73 
 
 		 301 aa  70.5  0.00000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.914132  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3223  cell wall hydrolase/autolysin  23.33 
 
 		 257 aa  58.2  0.0000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0609  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  26.25 
 
 		 808 aa  53.1  0.000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0322  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase CwlD  26.57 
 
 		 246 aa  53.1  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0112348  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0618  cell wall hydrolase/autolysin  27.43 
 
 		 451 aa  52  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000253724  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0812  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  27.72 
 
 		 406 aa  50.4  0.00006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0517  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  26.7 
 
 		 657 aa  48.1  0.0004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000337238  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3626  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  27.01 
 
 		 476 aa  47  0.0007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000133632  normal  0.124331 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0265  cell wall hydrolase/autolysin  25.49 
 
 		 271 aa  45.8  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0143  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase CwlD  25.28 
 
 		 238 aa  43.9  0.006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>