142 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_4160 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_4160  cell wall hydrolase/autolysin  100 
 
 
259 aa  516  1.0000000000000001e-145  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00486305  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4394  cell wall hydrolase/autolysin  48.18 
 
 
296 aa  183  3e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2753  cell wall hydrolase/autolysin  46.15 
 
 
254 aa  180  2e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.984252  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9001  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase-like protein  44.78 
 
 
283 aa  179  4e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.257312  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1357  cell wall hydrolase/autolysin  47.84 
 
 
286 aa  172  6.999999999999999e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.414025  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3352  cell wall hydrolase/autolysin  47.51 
 
 
290 aa  171  2e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.939997 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0290  cell wall hydrolase/autolysin  44.14 
 
 
283 aa  160  2e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0671  cell wall hydrolase/autolysin  44.95 
 
 
320 aa  157  2e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13749  hypothetical protein  40.47 
 
 
241 aa  151  8e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.369485 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1286  cell wall hydrolase/autolysin  40.77 
 
 
245 aa  148  7e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4905  cell wall hydrolase/autolysin  40.91 
 
 
251 aa  142  4e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0385715  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4994  cell wall hydrolase/autolysin  40.91 
 
 
251 aa  142  4e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5273  cell wall hydrolase/autolysin  40.91 
 
 
251 aa  142  4e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.467188  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5529  cell wall hydrolase/autolysin  40.45 
 
 
246 aa  141  9.999999999999999e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5160  cell wall hydrolase/autolysin  44.64 
 
 
291 aa  139  3e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0130951 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4010  cell wall hydrolase/autolysin  39.73 
 
 
254 aa  132  6e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.864975  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3402  cell wall hydrolase/autolysin  37.5 
 
 
347 aa  131  1.0000000000000001e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1163  cell wall hydrolase/autolysin  41.1 
 
 
301 aa  121  9.999999999999999e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.914132  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4521  cell wall hydrolase/autolysin  30.59 
 
 
318 aa  89.7  4e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4802  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  29.33 
 
 
317 aa  86.3  4e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.344171  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0434  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  29.6 
 
 
317 aa  85.9  6e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2975  cell wall hydrolase/autolysin  31.31 
 
 
463 aa  76.3  0.0000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1807  cell wall hydrolase/autolysin  24.44 
 
 
268 aa  71.2  0.00000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0859  cell wall hydrolase/autolysin  26.15 
 
 
231 aa  67  0.0000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.751216 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1398  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase domain-containing protein  28.65 
 
 
241 aa  65.5  0.0000000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.373553  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3187  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  28.02 
 
 
474 aa  63.5  0.000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0462523  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3223  cell wall hydrolase/autolysin  23.81 
 
 
257 aa  61.6  0.00000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0477  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  29.6 
 
 
377 aa  60.8  0.00000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0111  putative N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  26.94 
 
 
297 aa  58.9  0.00000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0171096  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1194  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  24.36 
 
 
291 aa  58.5  0.0000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00764454  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2296  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  27.35 
 
 
249 aa  57.4  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1689  cell wall hydrolase/autolysin  24.34 
 
 
291 aa  57.4  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.147048  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1722  cell wall hydrolase/autolysin  24.34 
 
 
291 aa  57.4  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00111175  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0113  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase domain-containing protein  26.48 
 
 
319 aa  56.6  0.0000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0213  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  25.09 
 
 
257 aa  56.6  0.0000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00242661  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1281  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  25.33 
 
 
287 aa  55.5  0.0000008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3265  cell wall hydrolase/autolysin  24.7 
 
 
556 aa  54.7  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2324  cell wall hydrolase/autolysin  24.48 
 
 
538 aa  54.3  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000122542  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4581  cell wall hydrolase/autolysin  27.8 
 
 
392 aa  54.3  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00170729 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5099  cell wall hydrolase/autolysin  28.22 
 
 
387 aa  53.9  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000380245 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0885  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  24.12 
 
 
300 aa  54.3  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0020686  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1374  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  24.29 
 
 
529 aa  52.4  0.000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.736006  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1825  cell wall hydrolase/autolysin  26.86 
 
 
590 aa  52.4  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0587  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  26.59 
 
 
352 aa  51.6  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3645  cell wall hydrolase/autolysin  26.92 
 
 
332 aa  50.8  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0804567 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1823  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  25.09 
 
 
422 aa  50.8  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0998056  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2150  cell wall hydrolase/autolysin  27.48 
 
 
378 aa  50.1  0.00004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13950  hydrolase  26.52 
 
 
406 aa  49.7  0.00004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39690  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  23.79 
 
 
382 aa  50.1  0.00004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.587198 
 
 
-
 
NC_002620  TC0539  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase, putative  24.43 
 
 
268 aa  49.7  0.00005  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  hitchhiker  0.000536287  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0265  cell wall hydrolase/autolysin  24.03 
 
 
271 aa  48.9  0.00008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1080  cell wall hydrolase/autolysin  23.84 
 
 
703 aa  48.1  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000496227  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2539  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase AMIC precursor protein  25.1 
 
 
507 aa  48.1  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.687203 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2268  cell wall hydrolase/autolysin  26.32 
 
 
585 aa  47.4  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2148  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  27.95 
 
 
522 aa  48.1  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0837  peptidoglycan binding domain-containing protein  26.09 
 
 
395 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.265707  normal  0.357261 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2183  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  22.91 
 
 
431 aa  47.4  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000115725 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1682  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  22.99 
 
 
414 aa  47  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000845994  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2031  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  26.92 
 
 
359 aa  47  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1817  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  22.99 
 
 
414 aa  47  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000725042  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0722  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  23.64 
 
 
469 aa  47  0.0003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.033556  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2295  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase-like protein  21.83 
 
 
259 aa  47  0.0003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000158579  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1862  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase, family 3  22.99 
 
 
414 aa  47  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.72375e-61 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2027  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  24.79 
 
 
454 aa  47  0.0003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1938  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase, family 3  22.99 
 
 
414 aa  47  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000112204  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4053  cell wall hydrolase/autolysin  24.02 
 
 
585 aa  46.6  0.0004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.630004  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3244  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  25.33 
 
 
815 aa  46.6  0.0004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3053  cell wall hydrolase/autolysin  23.21 
 
 
591 aa  46.2  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0425538  normal  0.806567 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0368  cell wall hydrolase/autolysin  23.87 
 
 
474 aa  46.2  0.0005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000387898  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3067  cell wall hydrolase/autolysin  23.21 
 
 
591 aa  46.6  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3345  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  27.73 
 
 
448 aa  46.2  0.0006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1889  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  22.99 
 
 
414 aa  45.8  0.0007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000270589  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65370  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  22.86 
 
 
475 aa  45.8  0.0007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0527105  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0588  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  22.47 
 
 
315 aa  45.8  0.0007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0964307  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5676  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  22.86 
 
 
487 aa  45.8  0.0007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.538418  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2317  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  27.65 
 
 
321 aa  45.8  0.0008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07940  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  23.64 
 
 
383 aa  45.4  0.0008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7088  cell wall hydrolase/autolysin  23.38 
 
 
379 aa  45.4  0.0008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0796  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  22.75 
 
 
540 aa  44.7  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  1.06495e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1628  S-layer protein and N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase fusion protein  21.54 
 
 
413 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000159428  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0365  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  24.72 
 
 
514 aa  45.1  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.537641  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1064  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase, AMIC precursor protein  24.72 
 
 
514 aa  45.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.130481  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0722  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  25.83 
 
 
514 aa  44.7  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.180636  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5404  peptidoglycan binding domain-containing protein  24.11 
 
 
398 aa  45.4  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9044  cell wall hydrolase/autolysin  24.12 
 
 
381 aa  44.7  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.683287 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4034  cell wall hydrolase/autolysin  24.89 
 
 
636 aa  45.4  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.172478 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5493  peptidoglycan binding domain-containing protein  24.11 
 
 
398 aa  45.4  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.306054  normal  0.340156 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0665  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  24.72 
 
 
514 aa  45.1  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.292024  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2500  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  24.72 
 
 
514 aa  45.1  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0907  putative N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  24.72 
 
 
518 aa  45.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0910  putative N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  24.72 
 
 
518 aa  45.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5780  peptidoglycan binding domain-containing protein  24.11 
 
 
398 aa  45.4  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.103235  normal  0.0225993 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4202  putative N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  27.91 
 
 
436 aa  45.4  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.415108  normal  0.44949 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4667  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  26.81 
 
 
404 aa  45.4  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.975026  normal  0.573813 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2310  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  23.85 
 
 
410 aa  44.3  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  2.2191900000000004e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1719  cell wall hydrolase/autolysin  25.97 
 
 
422 aa  44.3  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.00404494  normal  0.065032 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0517  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  25 
 
 
657 aa  44.7  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000337238  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0746  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  22.39 
 
 
522 aa  44.3  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1034  cell wall hydrolase/autolysin  28.32 
 
 
604 aa  44.3  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00179452 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0866  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  23.53 
 
 
412 aa  43.9  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.139466  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>