189 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_5529 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_5529  cell wall hydrolase/autolysin  100 
 
 
246 aa  496  1e-139  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1286  cell wall hydrolase/autolysin  87.3 
 
 
245 aa  412  1e-114  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4905  cell wall hydrolase/autolysin  77.91 
 
 
251 aa  394  1e-109  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0385715  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4994  cell wall hydrolase/autolysin  77.91 
 
 
251 aa  394  1e-109  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5273  cell wall hydrolase/autolysin  77.91 
 
 
251 aa  394  1e-109  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.467188  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13749  hypothetical protein  73.31 
 
 
241 aa  366  1e-100  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.369485 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4010  cell wall hydrolase/autolysin  53.63 
 
 
254 aa  254  1.0000000000000001e-66  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.864975  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1357  cell wall hydrolase/autolysin  44.14 
 
 
286 aa  180  2e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.414025  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4394  cell wall hydrolase/autolysin  41.31 
 
 
296 aa  177  2e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0671  cell wall hydrolase/autolysin  43.19 
 
 
320 aa  177  2e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2753  cell wall hydrolase/autolysin  40.99 
 
 
254 aa  173  1.9999999999999998e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.984252  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3402  cell wall hydrolase/autolysin  41.8 
 
 
347 aa  172  2.9999999999999996e-42  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0290  cell wall hydrolase/autolysin  39.91 
 
 
283 aa  172  3.9999999999999995e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9001  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase-like protein  38.1 
 
 
283 aa  163  2.0000000000000002e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.257312  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1163  cell wall hydrolase/autolysin  44.55 
 
 
301 aa  157  2e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.914132  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3352  cell wall hydrolase/autolysin  38.81 
 
 
290 aa  155  7e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.939997 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5160  cell wall hydrolase/autolysin  41.7 
 
 
291 aa  154  1e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0130951 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4160  cell wall hydrolase/autolysin  40 
 
 
259 aa  145  7.0000000000000006e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00486305  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2975  cell wall hydrolase/autolysin  32.57 
 
 
463 aa  101  1e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1077  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  27.52 
 
 
657 aa  74.7  0.000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0200962 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1080  cell wall hydrolase/autolysin  26.37 
 
 
703 aa  73.6  0.000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000496227  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1807  cell wall hydrolase/autolysin  25.44 
 
 
268 aa  70.5  0.00000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0185  cell wall hydrolase/autolysin  25.96 
 
 
948 aa  67  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00443483  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3244  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  27.66 
 
 
815 aa  67.4  0.0000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0477  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  28 
 
 
377 aa  67  0.0000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0665  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  28.57 
 
 
399 aa  66.2  0.0000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.188608 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4667  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  28.14 
 
 
404 aa  63.2  0.000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.975026  normal  0.573813 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1398  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase domain-containing protein  22.33 
 
 
241 aa  60.8  0.00000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.373553  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9044  cell wall hydrolase/autolysin  29.78 
 
 
381 aa  60.5  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.683287 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3789  cell wall hydrolase/autolysin  25.79 
 
 
538 aa  60.5  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1016  cell wall hydrolase/autolysin  25.26 
 
 
352 aa  60.1  0.00000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000634005  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15510  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  28.04 
 
 
746 aa  58.2  0.0000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2674  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  26.55 
 
 
860 aa  58.2  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000467202  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3626  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  27.49 
 
 
476 aa  58.5  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000133632  normal  0.124331 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1153  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  26.58 
 
 
731 aa  57.4  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2693  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  25.56 
 
 
616 aa  57  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.17431  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3223  cell wall hydrolase/autolysin  21.82 
 
 
257 aa  57.4  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4581  cell wall hydrolase/autolysin  28.9 
 
 
392 aa  57  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00170729 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1576  cell wall hydrolase/autolysin  23.85 
 
 
410 aa  56.6  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000010106  n/a   
 
 
-
 
NC_007323  GBAA_pXO2_0045  surface-layer n-acetylmuramoyl-l-alanine amidase  24.55 
 
 
531 aa  56.6  0.0000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000055922  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0714  cell wall hydrolase/autolysin  25 
 
 
568 aa  56.2  0.0000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000891382  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1374  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  24.44 
 
 
529 aa  56.6  0.0000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.736006  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4802  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  23.39 
 
 
317 aa  56.6  0.0000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.344171  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1687  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase, family 3  23.85 
 
 
410 aa  56.2  0.0000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000543314  hitchhiker  0.00000000000000117907 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2296  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  24.51 
 
 
249 aa  55.8  0.0000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1272  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  25 
 
 
242 aa  55.5  0.0000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000305091 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2268  cell wall hydrolase/autolysin  23.39 
 
 
585 aa  55.5  0.0000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4521  cell wall hydrolase/autolysin  22.07 
 
 
318 aa  55.1  0.0000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2941  cell wall hydrolase/autolysin  22.57 
 
 
250 aa  55.1  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000101461  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3124  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  20.7 
 
 
471 aa  54.7  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0129818  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4484  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  27.93 
 
 
543 aa  55.1  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000290327  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0378  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  23.5 
 
 
286 aa  55.1  0.000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1534  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  23.98 
 
 
562 aa  55.1  0.000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0577934  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1194  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  23.5 
 
 
291 aa  53.9  0.000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00764454  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1798  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  25.12 
 
 
623 aa  53.9  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1472  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  24.8 
 
 
352 aa  54.3  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.764307  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0859  cell wall hydrolase/autolysin  24.9 
 
 
231 aa  53.5  0.000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.751216 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0434  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  22.94 
 
 
317 aa  53.5  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2183  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  24.07 
 
 
431 aa  53.1  0.000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000115725 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0604  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  26.05 
 
 
612 aa  53.1  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.594044  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0589  cell wall hydrolase/autolysin  26.05 
 
 
612 aa  53.1  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3732  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  24.88 
 
 
338 aa  52.8  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000534753  normal  0.117524 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3187  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  21.58 
 
 
474 aa  52.8  0.000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0462523  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0588  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  22.93 
 
 
315 aa  52.4  0.000007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0964307  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5099  cell wall hydrolase/autolysin  27.44 
 
 
387 aa  52.4  0.000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000380245 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1465  cell wall hydrolase/autolysin  25.35 
 
 
627 aa  52  0.000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000155726  normal  0.0455493 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1825  cell wall hydrolase/autolysin  24.42 
 
 
590 aa  52.4  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18931  cell wall hydrolase/autolysin  27.27 
 
 
396 aa  52  0.000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.306827 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3067  cell wall hydrolase/autolysin  23.56 
 
 
591 aa  52  0.000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3053  cell wall hydrolase/autolysin  23.56 
 
 
591 aa  52  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0425538  normal  0.806567 
 
 
-
 
NC_002620  TC0539  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase, putative  25 
 
 
268 aa  51.6  0.00001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  hitchhiker  0.000536287  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07940  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  23.57 
 
 
383 aa  51.2  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2351  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  22.36 
 
 
410 aa  51.2  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000872091  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2268  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  22.36 
 
 
410 aa  51.6  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000138501  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3678  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  24.41 
 
 
338 aa  51.6  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1466  cell wall hydrolase/autolysin  27.57 
 
 
627 aa  51.2  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.000000000100817  normal  0.166489 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2528  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  22.36 
 
 
410 aa  51.2  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000564272  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3265  cell wall hydrolase/autolysin  22.37 
 
 
556 aa  51.6  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1037  cell wall hydrolase/autolysin  23.45 
 
 
282 aa  51.6  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000520561  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2281  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  24.52 
 
 
253 aa  51.6  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0442752  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0792  cell wall hydrolase/autolysin  23.74 
 
 
530 aa  51.6  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000364595  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2543  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase, family 3  22.36 
 
 
410 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.7515e-61 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0814  cell wall hydrolase/autolysin  27.14 
 
 
255 aa  50.8  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.56957 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1034  cell wall hydrolase/autolysin  25.11 
 
 
604 aa  50.8  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00179452 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0111  putative N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  20.29 
 
 
297 aa  50.8  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0171096  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06811  cell wall hydrolase/autolysin  24.88 
 
 
364 aa  50.8  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.197381  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0113  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase domain-containing protein  21.13 
 
 
319 aa  50.1  0.00003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0368  cell wall hydrolase/autolysin  22.69 
 
 
474 aa  50.4  0.00003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000387898  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0991  cell wall hydrolase/autolysin  26.76 
 
 
308 aa  50.1  0.00004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0141429  normal  0.245512 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4053  cell wall hydrolase/autolysin  21.97 
 
 
585 aa  49.3  0.00005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.630004  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4727  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  24.77 
 
 
619 aa  49.7  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0152355  normal  0.26499 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2206  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  24.04 
 
 
358 aa  49.3  0.00005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.33492  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0254  cell wall hydrolase/autolysin  27.49 
 
 
604 aa  49.3  0.00005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.323701  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0725  cell wall hydrolase/autolysin  22.27 
 
 
520 aa  49.3  0.00006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00509624  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10331  cell wall hydrolase/autolysin  23.85 
 
 
362 aa  49.3  0.00006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.374691  normal  0.548996 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1752  cell wall hydrolase/autolysin  22.39 
 
 
419 aa  48.9  0.00007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000020425  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0339  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  23.83 
 
 
706 aa  48.9  0.00007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2236  sporulation-specific N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  27.46 
 
 
328 aa  48.9  0.00008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0143229  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2496  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  22.47 
 
 
413 aa  48.1  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4895  cell wall hydrolase/autolysin  27.14 
 
 
253 aa  48.5  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>