155 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_2832 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_2832  hypothetical protein  100 
 
 
280 aa  577  1e-164  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0974694  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3310  hypothetical protein  43.82 
 
 
292 aa  210  2e-53  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3867  DNA utilization protein YhiR  38.6 
 
 
280 aa  196  3e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3909  DNA utilization protein YhiR  38.6 
 
 
280 aa  196  3e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3789  DNA utilization protein YhiR  38.6 
 
 
280 aa  196  3e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.201983  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3801  DNA utilization protein YhiR  38.6 
 
 
280 aa  196  3e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3970  DNA utilization protein YhiR  38.6 
 
 
280 aa  196  4.0000000000000005e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4846  DNA utilization protein YhiR  38.25 
 
 
280 aa  194  1e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.780347 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3912  hypothetical protein  37.89 
 
 
280 aa  192  4e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03348  predicted DNA (exogenous) processing protein  37.89 
 
 
280 aa  191  1e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.664942  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03301  hypothetical protein  37.89 
 
 
280 aa  191  1e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.864633  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3823  DNA utilization protein YhiR  37.89 
 
 
280 aa  191  1e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3788  DNA utilization protein YhiR  37.89 
 
 
280 aa  191  1e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.489053 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0216  protein of unknown function DUF519  37.89 
 
 
280 aa  190  2e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0012  protein of unknown function DUF519  37.54 
 
 
280 aa  190  2e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3699  DNA utilization protein YhiR  37.89 
 
 
280 aa  190  2e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3981  DNA utilization protein YhiR  37.89 
 
 
280 aa  191  2e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0217  hypothetical protein  37.89 
 
 
280 aa  190  2e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3205  hypothetical protein  37.32 
 
 
295 aa  187  2e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0857675  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3922  hypothetical protein  39.55 
 
 
281 aa  187  2e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4659  hypothetical protein  39.47 
 
 
281 aa  185  6e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0009  protein of unknown function DUF519  37.15 
 
 
280 aa  185  6e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3609  hypothetical protein  40 
 
 
292 aa  185  8e-46  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0369  hypothetical protein  43.12 
 
 
260 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3829  hypothetical protein  39.18 
 
 
281 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.341276 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0115  hypothetical protein  37.5 
 
 
280 aa  184  2.0000000000000003e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.795354  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4038  hypothetical protein  39.18 
 
 
281 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4187  hypothetical protein  37.93 
 
 
280 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4048  hypothetical protein  37.5 
 
 
280 aa  184  2.0000000000000003e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.421411  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4085  hypothetical protein  37.19 
 
 
280 aa  183  2.0000000000000003e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.515626 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1107  hypothetical protein  36.14 
 
 
281 aa  183  3e-45  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4472  protein of unknown function DUF519  38.64 
 
 
280 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.514564  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2013  hypothetical protein  42.75 
 
 
260 aa  182  6e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0102184  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4050  hypothetical protein  39.54 
 
 
280 aa  182  6e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3563  hypothetical protein  38.89 
 
 
284 aa  182  7e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0098  hypothetical protein  40.15 
 
 
281 aa  182  7e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4204  protein of unknown function DUF519  39.02 
 
 
281 aa  180  2e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0872  hypothetical protein  41.95 
 
 
257 aa  180  2e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4243  hypothetical protein  39.02 
 
 
281 aa  180  2e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4713  hypothetical protein  36.77 
 
 
280 aa  180  2e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4377  hypothetical protein  39.02 
 
 
281 aa  180  2e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001953  hypothetical protein  36.93 
 
 
279 aa  179  2.9999999999999997e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3648  hypothetical protein  38.85 
 
 
279 aa  180  2.9999999999999997e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0163  hypothetical protein  37.45 
 
 
280 aa  179  5.999999999999999e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.243099  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00525  hypothetical protein  36.55 
 
 
285 aa  178  7e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3858  hypothetical protein  40.39 
 
 
285 aa  177  1e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0143  hypothetical protein  37.08 
 
 
280 aa  177  2e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2569  hypothetical protein  36.24 
 
 
279 aa  177  2e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3389  DNA (exogenous) processing protein  37.41 
 
 
284 aa  176  5e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1019  hypothetical protein  38.46 
 
 
289 aa  172  6.999999999999999e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3738  hypothetical protein  35.09 
 
 
280 aa  171  1e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000524629 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1258  hypothetical protein  35.27 
 
 
282 aa  169  5e-41  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1917  hypothetical protein  36.54 
 
 
282 aa  168  9e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1259  hypothetical protein  35.23 
 
 
282 aa  167  1e-40  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0121  hypothetical protein  35.52 
 
 
279 aa  167  2e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2736  hypothetical protein  38.06 
 
 
281 aa  167  2.9999999999999998e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.855465  normal  0.779892 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0475  hypothetical protein  39.48 
 
 
259 aa  166  2.9999999999999998e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.499183  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3717  hypothetical protein  39.69 
 
 
280 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1806  hypothetical protein  37.78 
 
 
280 aa  166  4e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000978689 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5915  hypothetical protein  36.86 
 
 
290 aa  165  6.9999999999999995e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.492755  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0579  hypothetical protein  40.62 
 
 
257 aa  165  8e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0365448  normal  0.281222 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1053  hypothetical protein  36.36 
 
 
282 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0705  hypothetical protein  37.27 
 
 
290 aa  161  1e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1807  hypothetical protein  39.92 
 
 
281 aa  161  1e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0355  protein of unknown function DUF519  38.35 
 
 
285 aa  161  1e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.135984  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0176  hypothetical protein  38.35 
 
 
285 aa  161  1e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1564  hypothetical protein  35.23 
 
 
283 aa  160  2e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1668  protein of unknown function DUF519  39.69 
 
 
281 aa  160  3e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1284  hypothetical protein  35.93 
 
 
285 aa  160  3e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0995661 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2581  hypothetical protein  35.05 
 
 
290 aa  159  3e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.456932  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0859  protein of unknown function DUF519  40.21 
 
 
281 aa  159  4e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1180  hypothetical protein  35.19 
 
 
285 aa  159  5e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.573551  normal  0.143297 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0696  hypothetical protein  36.9 
 
 
305 aa  158  9e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3242  protein of unknown function DUF519  39.56 
 
 
285 aa  158  1e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3566  protein of unknown function DUF519  39.56 
 
 
285 aa  158  1e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0127057  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1788  hypothetical protein  36.5 
 
 
293 aa  156  4e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.192563  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3368  hypothetical protein  38.83 
 
 
285 aa  153  2.9999999999999998e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4055  hypothetical protein  37.17 
 
 
299 aa  153  2.9999999999999998e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1413  hypothetical protein  35.58 
 
 
289 aa  153  2.9999999999999998e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5822  protein of unknown function DUF519  39.04 
 
 
282 aa  152  4e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3149  hypothetical protein  35.69 
 
 
285 aa  152  4e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.264033  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0898  hypothetical protein  35.27 
 
 
286 aa  152  7e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.69089  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1731  hypothetical protein  33.95 
 
 
286 aa  150  2e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.147763 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0292  hypothetical protein  35.06 
 
 
279 aa  150  3e-35  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.866126  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1090  protein of unknown function DUF519  34.94 
 
 
290 aa  149  4e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0580192  hitchhiker  0.000491386 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1391  protein of unknown function DUF519  39.92 
 
 
308 aa  149  4e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.443033  hitchhiker  0.00435595 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1377  hypothetical protein  39.55 
 
 
285 aa  149  5e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0826832  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2039  hypothetical protein  32.12 
 
 
293 aa  149  6e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0881  protein of unknown function DUF519  37.45 
 
 
282 aa  148  8e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.402966  normal  0.647337 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3158  putative protein involved in catabolism of external DNA  38.43 
 
 
281 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.334057 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0602  protein of unknown function DUF519  35.58 
 
 
296 aa  146  3e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1963  hypothetical protein  38.74 
 
 
281 aa  146  3e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0614068  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1888  hypothetical protein  37.59 
 
 
285 aa  146  3e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0788  hypothetical protein  35.57 
 
 
289 aa  147  3e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0241921  normal  0.12768 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0720  hypothetical protein  33.8 
 
 
318 aa  146  4.0000000000000006e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.802576  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0623  hypothetical protein  35.58 
 
 
296 aa  146  4.0000000000000006e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.757011  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4772  hypothetical protein  35.66 
 
 
278 aa  144  1e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.105142 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2915  hypothetical protein  35.14 
 
 
276 aa  144  1e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.407499  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1863  hypothetical protein  35.13 
 
 
279 aa  145  1e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.302117  normal  0.857152 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01957  hypothetical protein  34.06 
 
 
292 aa  144  2e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00454208  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>