155 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_3310 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007963  Csal_3310  hypothetical protein  100 
 
 
292 aa  594  1e-169  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2832  hypothetical protein  43.82 
 
 
280 aa  210  2e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0974694  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1259  hypothetical protein  37.32 
 
 
282 aa  186  3e-46  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1258  hypothetical protein  37.32 
 
 
282 aa  186  3e-46  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3609  hypothetical protein  36.65 
 
 
292 aa  178  8e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3389  DNA (exogenous) processing protein  35.93 
 
 
284 aa  177  2e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3648  hypothetical protein  34.75 
 
 
279 aa  177  2e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1053  hypothetical protein  35.61 
 
 
282 aa  172  5.999999999999999e-42  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1888  hypothetical protein  38.27 
 
 
285 aa  172  5.999999999999999e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2736  hypothetical protein  35.36 
 
 
281 aa  171  1e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.855465  normal  0.779892 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1019  hypothetical protein  40.23 
 
 
289 aa  171  1e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4050  hypothetical protein  34.81 
 
 
280 aa  171  1e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0143  hypothetical protein  33.8 
 
 
280 aa  169  7e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3242  protein of unknown function DUF519  38.69 
 
 
285 aa  168  8e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0163  hypothetical protein  33.57 
 
 
280 aa  168  8e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.243099  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4659  hypothetical protein  34.04 
 
 
281 aa  168  1e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3566  protein of unknown function DUF519  38.04 
 
 
285 aa  167  1e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0127057  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2569  hypothetical protein  35.56 
 
 
279 aa  167  2e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3368  hypothetical protein  37.28 
 
 
285 aa  166  2.9999999999999998e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3738  hypothetical protein  34.14 
 
 
280 aa  166  5e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000524629 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1377  hypothetical protein  36.62 
 
 
285 aa  165  8e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0826832  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4204  protein of unknown function DUF519  32.5 
 
 
281 aa  165  8e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4243  hypothetical protein  32.5 
 
 
281 aa  165  8e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4377  hypothetical protein  32.5 
 
 
281 aa  165  8e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0012  protein of unknown function DUF519  34.74 
 
 
280 aa  165  9e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1807  hypothetical protein  36.36 
 
 
281 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3858  hypothetical protein  34.88 
 
 
285 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0098  hypothetical protein  33.45 
 
 
281 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5915  hypothetical protein  37.23 
 
 
290 aa  164  2.0000000000000002e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.492755  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0369  hypothetical protein  39.41 
 
 
260 aa  163  3e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1107  hypothetical protein  32.28 
 
 
281 aa  163  3e-39  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3205  hypothetical protein  33.78 
 
 
295 aa  162  6e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0857675  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4085  hypothetical protein  34.38 
 
 
280 aa  162  7e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.515626 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0115  hypothetical protein  34.38 
 
 
280 aa  162  9e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.795354  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01957  hypothetical protein  36.82 
 
 
292 aa  162  9e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00454208  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4048  hypothetical protein  34.38 
 
 
280 aa  162  9e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.421411  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0216  protein of unknown function DUF519  34.74 
 
 
280 aa  161  1e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0009  protein of unknown function DUF519  33.68 
 
 
280 aa  161  1e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001953  hypothetical protein  33.8 
 
 
279 aa  161  1e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3789  DNA utilization protein YhiR  34.39 
 
 
280 aa  161  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.201983  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3717  hypothetical protein  35.97 
 
 
280 aa  161  1e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3699  DNA utilization protein YhiR  34.74 
 
 
280 aa  161  1e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0217  hypothetical protein  34.74 
 
 
280 aa  161  1e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03348  predicted DNA (exogenous) processing protein  34.39 
 
 
280 aa  160  2e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.664942  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3909  DNA utilization protein YhiR  34.39 
 
 
280 aa  160  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3867  DNA utilization protein YhiR  34.39 
 
 
280 aa  160  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3801  DNA utilization protein YhiR  34.39 
 
 
280 aa  160  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3970  DNA utilization protein YhiR  34.39 
 
 
280 aa  160  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2013  hypothetical protein  39.06 
 
 
260 aa  160  2e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0102184  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03301  hypothetical protein  34.39 
 
 
280 aa  160  2e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.864633  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0872  hypothetical protein  38.28 
 
 
257 aa  161  2e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3912  hypothetical protein  33.68 
 
 
280 aa  161  2e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3823  DNA utilization protein YhiR  34.74 
 
 
280 aa  161  2e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3788  DNA utilization protein YhiR  34.39 
 
 
280 aa  160  2e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.489053 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3563  hypothetical protein  33.1 
 
 
284 aa  160  3e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3981  DNA utilization protein YhiR  34.39 
 
 
280 aa  160  3e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1963  hypothetical protein  34.56 
 
 
281 aa  159  6e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0614068  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00525  hypothetical protein  33.1 
 
 
285 aa  159  6e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45040  hypothetical protein  37.94 
 
 
300 aa  158  8e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3922  hypothetical protein  33.33 
 
 
281 aa  158  8e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4038  hypothetical protein  33.33 
 
 
281 aa  158  9e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3829  hypothetical protein  32.98 
 
 
281 aa  158  1e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.341276 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0121  hypothetical protein  32.75 
 
 
279 aa  158  1e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4846  DNA utilization protein YhiR  34.04 
 
 
280 aa  157  2e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.780347 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0720  hypothetical protein  35.5 
 
 
318 aa  156  3e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.802576  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0602  protein of unknown function DUF519  35.93 
 
 
296 aa  157  3e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0623  hypothetical protein  35.93 
 
 
296 aa  156  4e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.757011  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4713  hypothetical protein  33.33 
 
 
280 aa  156  4e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4055  hypothetical protein  36.36 
 
 
299 aa  156  5.0000000000000005e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2039  hypothetical protein  33.11 
 
 
293 aa  155  8e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1668  protein of unknown function DUF519  35.42 
 
 
281 aa  155  8e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0475  hypothetical protein  37.89 
 
 
259 aa  154  1e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.499183  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3158  putative protein involved in catabolism of external DNA  33.82 
 
 
281 aa  153  4e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.334057 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0579  hypothetical protein  39.53 
 
 
257 aa  152  4e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0365448  normal  0.281222 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1391  protein of unknown function DUF519  31.67 
 
 
308 aa  152  5e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.443033  hitchhiker  0.00435595 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1806  hypothetical protein  34.17 
 
 
280 aa  152  8e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000978689 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2040  hypothetical protein  32.6 
 
 
304 aa  151  1e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.894173  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66340  hypothetical protein  36.16 
 
 
278 aa  151  1e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5756  hypothetical protein  36.16 
 
 
278 aa  151  1e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1063  hypothetical protein  33.81 
 
 
281 aa  151  2e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0632007  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4772  hypothetical protein  34.29 
 
 
278 aa  150  3e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.105142 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4945  hypothetical protein  34.03 
 
 
278 aa  150  4e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4817  hypothetical protein  34.03 
 
 
278 aa  150  4e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1916  hypothetical protein  32.97 
 
 
301 aa  149  6e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0874325  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5542  hypothetical protein  32.85 
 
 
281 aa  149  6e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.467777 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5863  hypothetical protein  33.57 
 
 
281 aa  148  8e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2214  hypothetical protein  33.57 
 
 
281 aa  148  8e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0503  hypothetical protein  32.97 
 
 
301 aa  149  8e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0037  transformation competence-related protein  34.48 
 
 
293 aa  148  8e-35  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.932971  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4187  hypothetical protein  32.28 
 
 
280 aa  148  9e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4114  hypothetical protein  32.29 
 
 
332 aa  148  1.0000000000000001e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2252  hypothetical protein  33.1 
 
 
281 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.64987  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0874  hypothetical protein  32.6 
 
 
301 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.148142  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2238  hypothetical protein  33.21 
 
 
281 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2131  hypothetical protein  33.1 
 
 
281 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.553822  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0404  hypothetical protein  33.93 
 
 
278 aa  146  3e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1788  hypothetical protein  36.62 
 
 
293 aa  147  3e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.192563  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0599  hypothetical protein  32.84 
 
 
281 aa  147  3e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.558917  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1413  hypothetical protein  34.15 
 
 
289 aa  147  3e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0569  hypothetical protein  36.16 
 
 
282 aa  147  3e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000849382 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>