154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_2039 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_2039  hypothetical protein  100 
 
 		 293 aa  613  1e-175  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01957  hypothetical protein  43.23 
 
 		 292 aa  238  9e-62  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00454208  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1019  hypothetical protein  45.21 
 
 		 289 aa  232  7.000000000000001e-60  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4713  hypothetical protein  40.54 
 
 		 280 aa  228  1e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3970  DNA utilization protein YhiR  40.2 
 
 		 280 aa  223  2e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3909  DNA utilization protein YhiR  40.2 
 
 		 280 aa  224  2e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3801  DNA utilization protein YhiR  40.2 
 
 		 280 aa  224  2e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3912  hypothetical protein  42.95 
 
 		 280 aa  223  2e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3867  DNA utilization protein YhiR  40.2 
 
 		 280 aa  224  2e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001953  hypothetical protein  40.88 
 
 		 279 aa  223  4e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3789  DNA utilization protein YhiR  39.86 
 
 		 280 aa  222  6e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.201983  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0216  protein of unknown function DUF519  40.54 
 
 		 280 aa  222  7e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3699  DNA utilization protein YhiR  40.54 
 
 		 280 aa  222  7e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0217  hypothetical protein  40.54 
 
 		 280 aa  222  7e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00525  hypothetical protein  41.28 
 
 		 285 aa  220  1.9999999999999999e-56  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3823  DNA utilization protein YhiR  40.54 
 
 		 280 aa  219  3.9999999999999997e-56  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03348  predicted DNA (exogenous) processing protein  40.2 
 
 		 280 aa  218  7e-56  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.664942  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03301  hypothetical protein  40.2 
 
 		 280 aa  218  7e-56  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.864633  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3788  DNA utilization protein YhiR  40.2 
 
 		 280 aa  218  7e-56  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.489053 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3981  DNA utilization protein YhiR  40.2 
 
 		 280 aa  218  7.999999999999999e-56  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0012  protein of unknown function DUF519  40.2 
 
 		 280 aa  218  8.999999999999998e-56  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0009  protein of unknown function DUF519  40.54 
 
 		 280 aa  218  1e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4846  DNA utilization protein YhiR  39.86 
 
 		 280 aa  217  2e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.780347 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1107  hypothetical protein  39.73 
 
 		 281 aa  216  2.9999999999999998e-55  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4085  hypothetical protein  39.19 
 
 		 280 aa  215  7e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.515626 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2569  hypothetical protein  40.6 
 
 		 279 aa  215  8e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4048  hypothetical protein  38.85 
 
 		 280 aa  214  1.9999999999999998e-54  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.421411  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0115  hypothetical protein  38.85 
 
 		 280 aa  214  1.9999999999999998e-54  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.795354  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4187  hypothetical protein  39.53 
 
 		 280 aa  212  7e-54  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0121  hypothetical protein  40.07 
 
 		 279 aa  208  9e-53  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2736  hypothetical protein  40.54 
 
 		 281 aa  207  1e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.855465  normal  0.779892 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4472  protein of unknown function DUF519  39.86 
 
 		 280 aa  207  2e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.514564  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3389  DNA (exogenous) processing protein  38.59 
 
 		 284 aa  202  5e-51  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2581  hypothetical protein  35.97 
 
 		 290 aa  202  5e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.456932  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1391  protein of unknown function DUF519  38.98 
 
 		 308 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.443033  hitchhiker  0.00435595 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4050  hypothetical protein  39.78 
 
 		 280 aa  200  1.9999999999999998e-50  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3717  hypothetical protein  39.93 
 
 		 280 aa  199  5e-50  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3205  hypothetical protein  35.26 
 
 		 295 aa  198  7e-50  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0857675  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3158  putative protein involved in catabolism of external DNA  38.31 
 
 		 281 aa  199  7e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.334057 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1917  hypothetical protein  36.82 
 
 		 282 aa  198  9e-50  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3368  hypothetical protein  38.8 
 
 		 285 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3738  hypothetical protein  37.16 
 
 		 280 aa  197  2.0000000000000003e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000524629 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1970  hypothetical protein  38 
 
 		 286 aa  195  6e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.445046  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1888  hypothetical protein  38.93 
 
 		 285 aa  195  8.000000000000001e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2040  hypothetical protein  38.98 
 
 		 304 aa  194  1e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.894173  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3242  protein of unknown function DUF519  38.46 
 
 		 285 aa  194  1e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3858  hypothetical protein  37.67 
 
 		 285 aa  194  1e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0599  hypothetical protein  38.23 
 
 		 281 aa  194  1e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.558917  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1963  hypothetical protein  37.07 
 
 		 281 aa  194  2e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0614068  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0503  hypothetical protein  37.88 
 
 		 301 aa  193  3e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1916  hypothetical protein  37.88 
 
 		 301 aa  192  7e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0874325  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0874  hypothetical protein  37.54 
 
 		 301 aa  191  1e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.148142  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3566  protein of unknown function DUF519  36.67 
 
 		 285 aa  191  1e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0127057  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2238  hypothetical protein  38.57 
 
 		 281 aa  191  1e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0920  hypothetical protein  37.54 
 
 		 281 aa  191  1e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.202828  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5915  hypothetical protein  37.46 
 
 		 290 aa  190  2e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.492755  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1063  hypothetical protein  37.88 
 
 		 281 aa  190  2e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0632007  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1377  hypothetical protein  37.79 
 
 		 285 aa  189  2.9999999999999997e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0826832  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5863  hypothetical protein  38.23 
 
 		 281 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2214  hypothetical protein  38.23 
 
 		 281 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1806  hypothetical protein  37.46 
 
 		 280 aa  189  4e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000978689 
 
 
-
 
NC_004310  BR0705  hypothetical protein  34.21 
 
 		 290 aa  189  5.999999999999999e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1564  hypothetical protein  37.58 
 
 		 283 aa  189  7e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0020  hypothetical protein  37.2 
 
 		 281 aa  188  8e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0143  hypothetical protein  37.1 
 
 		 280 aa  188  9e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5542  hypothetical protein  38.06 
 
 		 281 aa  187  2e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.467777 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3609  hypothetical protein  36.75 
 
 		 292 aa  187  2e-46  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0163  hypothetical protein  36.75 
 
 		 280 aa  187  2e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.243099  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1236  protein of unknown function DUF519  36.58 
 
 		 289 aa  186  5e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.187373  hitchhiker  0.0000201181 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3563  hypothetical protein  35.44 
 
 		 284 aa  186  5e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0696  hypothetical protein  33.88 
 
 		 305 aa  186  5e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1668  protein of unknown function DUF519  37.24 
 
 		 281 aa  186  6e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0859  protein of unknown function DUF519  37.37 
 
 		 281 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0788  hypothetical protein  36.88 
 
 		 289 aa  184  2.0000000000000003e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0241921  normal  0.12768 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2252  hypothetical protein  37.72 
 
 		 281 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.64987  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0898  hypothetical protein  36.3 
 
 		 286 aa  182  6e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.69089  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0475  hypothetical protein  38.7 
 
 		 259 aa  182  8.000000000000001e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.499183  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1090  protein of unknown function DUF519  36.12 
 
 		 290 aa  181  1e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0580192  hitchhiker  0.000491386 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2131  hypothetical protein  37.37 
 
 		 281 aa  181  1e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.553822  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1807  hypothetical protein  36.95 
 
 		 281 aa  181  2e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4055  hypothetical protein  36.3 
 
 		 299 aa  181  2e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3648  hypothetical protein  36.71 
 
 		 279 aa  179  4e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0517  yhiR family protein  34.54 
 
 		 288 aa  179  4.999999999999999e-44  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.30636  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1203  protein of unknown function DUF519  37.01 
 
 		 285 aa  179  5.999999999999999e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.478331  normal  0.221337 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4204  protein of unknown function DUF519  35.23 
 
 		 281 aa  178  8e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4243  hypothetical protein  35.23 
 
 		 281 aa  178  8e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4377  hypothetical protein  35.23 
 
 		 281 aa  178  8e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1413  hypothetical protein  34.45 
 
 		 289 aa  177  2e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4945  hypothetical protein  35.76 
 
 		 278 aa  176  3e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04743  hypothetical protein  34.28 
 
 		 302 aa  176  3e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0098  hypothetical protein  35.23 
 
 		 281 aa  176  3e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4817  hypothetical protein  35.76 
 
 		 278 aa  176  3e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1788  hypothetical protein  33.11 
 
 		 293 aa  176  4e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.192563  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0569  hypothetical protein  35.93 
 
 		 282 aa  176  5e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000849382 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4038  hypothetical protein  34.56 
 
 		 281 aa  176  6e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3829  hypothetical protein  34.23 
 
 		 281 aa  175  9.999999999999999e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.341276 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3922  hypothetical protein  34.23 
 
 		 281 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5756  hypothetical protein  36.36 
 
 		 278 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2730  hypothetical protein  33.33 
 
 		 286 aa  174  9.999999999999999e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66340  hypothetical protein  35.79 
 
 		 278 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>