155 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc3368 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc3368  hypothetical protein  100 
 
 		 285 aa  580  1.0000000000000001e-165  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3566  protein of unknown function DUF519  86.32 
 
 		 285 aa  513  1e-144  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0127057  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3242  protein of unknown function DUF519  85.26 
 
 		 285 aa  507  9.999999999999999e-143  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1888  hypothetical protein  82.98 
 
 		 285 aa  484  1e-136  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1377  hypothetical protein  81.98 
 
 		 285 aa  480  1e-135  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0826832  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1963  hypothetical protein  64.06 
 
 		 281 aa  385  1e-106  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0614068  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0874  hypothetical protein  61.75 
 
 		 301 aa  380  1e-105  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.148142  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1916  hypothetical protein  62.11 
 
 		 301 aa  381  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0874325  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2040  hypothetical protein  61.05 
 
 		 304 aa  381  1e-105  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.894173  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0599  hypothetical protein  62.11 
 
 		 281 aa  383  1e-105  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.558917  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0503  hypothetical protein  62.11 
 
 		 301 aa  382  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5542  hypothetical protein  60.7 
 
 		 281 aa  379  1e-104  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.467777 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0020  hypothetical protein  61.4 
 
 		 281 aa  377  1e-104  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0920  hypothetical protein  61.75 
 
 		 281 aa  380  1e-104  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.202828  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1063  hypothetical protein  61.75 
 
 		 281 aa  380  1e-104  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0632007  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2238  hypothetical protein  60.7 
 
 		 281 aa  374  1e-103  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3158  putative protein involved in catabolism of external DNA  61.92 
 
 		 281 aa  374  1e-103  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.334057 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2131  hypothetical protein  61.4 
 
 		 281 aa  374  1e-103  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.553822  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5863  hypothetical protein  60.7 
 
 		 281 aa  375  1e-103  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2252  hypothetical protein  61.75 
 
 		 281 aa  376  1e-103  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.64987  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2214  hypothetical protein  60.7 
 
 		 281 aa  375  1e-103  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1391  protein of unknown function DUF519  61.57 
 
 		 308 aa  372  1e-102  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.443033  hitchhiker  0.00435595 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2736  hypothetical protein  60 
 
 		 281 aa  368  1e-101  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.855465  normal  0.779892 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1807  hypothetical protein  57.65 
 
 		 281 aa  340  2e-92  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5915  hypothetical protein  53.61 
 
 		 290 aa  292  4e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.492755  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1806  hypothetical protein  51.76 
 
 		 280 aa  289  4e-77  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000978689 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1668  protein of unknown function DUF519  52.31 
 
 		 281 aa  288  1e-76  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3717  hypothetical protein  51.75 
 
 		 280 aa  279  4e-74  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4055  hypothetical protein  50.87 
 
 		 299 aa  274  1.0000000000000001e-72  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1788  hypothetical protein  49.15 
 
 		 293 aa  271  7e-72  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.192563  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0720  hypothetical protein  47.47 
 
 		 318 aa  268  5.9999999999999995e-71  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.802576  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4114  hypothetical protein  45.9 
 
 		 332 aa  267  1e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1413  hypothetical protein  46.34 
 
 		 289 aa  267  1e-70  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0496  hypothetical protein  45.27 
 
 		 340 aa  267  2e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0602  protein of unknown function DUF519  50.17 
 
 		 296 aa  266  2.9999999999999995e-70  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0623  hypothetical protein  50.17 
 
 		 296 aa  265  8.999999999999999e-70  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.757011  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1053  hypothetical protein  44.73 
 
 		 282 aa  253  2.0000000000000002e-66  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3389  DNA (exogenous) processing protein  43.97 
 
 		 284 aa  249  5e-65  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3738  hypothetical protein  44.29 
 
 		 280 aa  248  9e-65  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000524629 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4679  protein of unknown function DUF519  45.51 
 
 		 320 aa  241  9e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0752119  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0121  hypothetical protein  45.11 
 
 		 279 aa  239  4e-62  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1917  hypothetical protein  43.42 
 
 		 282 aa  233  3e-60  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3205  hypothetical protein  40.88 
 
 		 295 aa  232  4.0000000000000004e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0857675  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2569  hypothetical protein  44.36 
 
 		 279 aa  232  5e-60  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1107  hypothetical protein  43.17 
 
 		 281 aa  229  3e-59  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3912  hypothetical protein  43.7 
 
 		 280 aa  229  3e-59  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3981  DNA utilization protein YhiR  43.98 
 
 		 280 aa  228  6e-59  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03348  predicted DNA (exogenous) processing protein  43.98 
 
 		 280 aa  228  1e-58  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.664942  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03301  hypothetical protein  43.98 
 
 		 280 aa  228  1e-58  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.864633  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3788  DNA utilization protein YhiR  43.98 
 
 		 280 aa  228  1e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.489053 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3823  DNA utilization protein YhiR  43.98 
 
 		 280 aa  227  2e-58  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0705  hypothetical protein  41.84 
 
 		 290 aa  226  3e-58  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4187  hypothetical protein  42.05 
 
 		 280 aa  226  3e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3789  DNA utilization protein YhiR  42.65 
 
 		 280 aa  226  4e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.201983  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001953  hypothetical protein  43.61 
 
 		 279 aa  226  4e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4846  DNA utilization protein YhiR  43.61 
 
 		 280 aa  225  5.0000000000000005e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.780347 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00525  hypothetical protein  43.23 
 
 		 285 aa  225  5.0000000000000005e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3970  DNA utilization protein YhiR  42.65 
 
 		 280 aa  225  7e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2581  hypothetical protein  40.28 
 
 		 290 aa  225  7e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.456932  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3801  DNA utilization protein YhiR  42.65 
 
 		 280 aa  225  8e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3909  DNA utilization protein YhiR  42.65 
 
 		 280 aa  225  8e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3867  DNA utilization protein YhiR  42.65 
 
 		 280 aa  225  8e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0012  protein of unknown function DUF519  42.29 
 
 		 280 aa  223  3e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0216  protein of unknown function DUF519  43.23 
 
 		 280 aa  223  4e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3699  DNA utilization protein YhiR  43.23 
 
 		 280 aa  223  4e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4713  hypothetical protein  42.22 
 
 		 280 aa  222  4e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0217  hypothetical protein  43.23 
 
 		 280 aa  223  4e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0696  hypothetical protein  41.13 
 
 		 305 aa  222  6e-57  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4472  protein of unknown function DUF519  41.34 
 
 		 280 aa  221  9.999999999999999e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.514564  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0009  protein of unknown function DUF519  42.48 
 
 		 280 aa  219  3.9999999999999997e-56  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0115  hypothetical protein  41.79 
 
 		 280 aa  217  2e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.795354  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4048  hypothetical protein  41.79 
 
 		 280 aa  217  2e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.421411  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4085  hypothetical protein  41.79 
 
 		 280 aa  217  2e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.515626 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3609  hypothetical protein  40.94 
 
 		 292 aa  216  4e-55  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3648  hypothetical protein  40 
 
 		 279 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0098  hypothetical protein  42.96 
 
 		 281 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3829  hypothetical protein  41.88 
 
 		 281 aa  212  4.9999999999999996e-54  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.341276 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3922  hypothetical protein  41.52 
 
 		 281 aa  212  4.9999999999999996e-54  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4038  hypothetical protein  42.24 
 
 		 281 aa  212  7e-54  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4204  protein of unknown function DUF519  42.6 
 
 		 281 aa  211  7.999999999999999e-54  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4243  hypothetical protein  42.6 
 
 		 281 aa  211  7.999999999999999e-54  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4377  hypothetical protein  42.6 
 
 		 281 aa  211  7.999999999999999e-54  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3858  hypothetical protein  40.29 
 
 		 285 aa  210  2e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4659  hypothetical protein  41.52 
 
 		 281 aa  209  3e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4050  hypothetical protein  39.86 
 
 		 280 aa  209  5e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3563  hypothetical protein  40 
 
 		 284 aa  206  4e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1564  hypothetical protein  44 
 
 		 283 aa  206  5e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66340  hypothetical protein  40.51 
 
 		 278 aa  205  9e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5756  hypothetical protein  40.51 
 
 		 278 aa  204  1e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1970  hypothetical protein  40.49 
 
 		 286 aa  202  5e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.445046  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1090  protein of unknown function DUF519  41.54 
 
 		 290 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0580192  hitchhiker  0.000491386 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1731  hypothetical protein  41.05 
 
 		 286 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.147763 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0569  hypothetical protein  41.97 
 
 		 282 aa  200  3e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000849382 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0788  hypothetical protein  43.07 
 
 		 289 aa  199  3e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0241921  normal  0.12768 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45040  hypothetical protein  42.34 
 
 		 300 aa  198  7e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1259  hypothetical protein  35.21 
 
 		 282 aa  197  1.0000000000000001e-49  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4772  hypothetical protein  40 
 
 		 278 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.105142 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1258  hypothetical protein  34.83 
 
 		 282 aa  197  2.0000000000000003e-49  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2039  hypothetical protein  38.8 
 
 		 293 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1236  protein of unknown function DUF519  40.44 
 
 		 289 aa  193  2e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.187373  hitchhiker  0.0000201181 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>