155 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpl1258 on replicon NC_006369
Organism: Legionella pneumophila str. Lens



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006369  lpl1258  hypothetical protein  100 
 
 
282 aa  580  1.0000000000000001e-165  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1259  hypothetical protein  97.87 
 
 
282 aa  571  1.0000000000000001e-162  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2569  hypothetical protein  43.64 
 
 
279 aa  248  9e-65  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001953  hypothetical protein  42.55 
 
 
279 aa  238  9e-62  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3648  hypothetical protein  42.7 
 
 
279 aa  234  9e-61  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0121  hypothetical protein  41.09 
 
 
279 aa  234  1.0000000000000001e-60  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00525  hypothetical protein  41.82 
 
 
285 aa  234  1.0000000000000001e-60  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3563  hypothetical protein  40.36 
 
 
284 aa  226  4e-58  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4050  hypothetical protein  44.27 
 
 
280 aa  226  4e-58  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3609  hypothetical protein  42.21 
 
 
292 aa  224  2e-57  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0143  hypothetical protein  42.24 
 
 
280 aa  222  4.9999999999999996e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3858  hypothetical protein  42.05 
 
 
285 aa  219  5e-56  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3242  protein of unknown function DUF519  36.93 
 
 
285 aa  218  6e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1107  hypothetical protein  42.6 
 
 
281 aa  218  7e-56  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1668  protein of unknown function DUF519  38.49 
 
 
281 aa  218  1e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0163  hypothetical protein  42.07 
 
 
280 aa  217  1e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.243099  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3566  protein of unknown function DUF519  36.59 
 
 
285 aa  217  2e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0127057  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3981  DNA utilization protein YhiR  40.5 
 
 
280 aa  217  2e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0012  protein of unknown function DUF519  38.97 
 
 
280 aa  216  5e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3205  hypothetical protein  40.34 
 
 
295 aa  215  5.9999999999999996e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0857675  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3823  DNA utilization protein YhiR  40.14 
 
 
280 aa  215  5.9999999999999996e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4713  hypothetical protein  39.27 
 
 
280 aa  215  5.9999999999999996e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3912  hypothetical protein  40.44 
 
 
280 aa  215  7e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03348  predicted DNA (exogenous) processing protein  40.14 
 
 
280 aa  215  8e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.664942  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3788  DNA utilization protein YhiR  40.14 
 
 
280 aa  215  8e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.489053 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03301  hypothetical protein  40.14 
 
 
280 aa  215  8e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.864633  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3389  DNA (exogenous) processing protein  40.46 
 
 
284 aa  215  8e-55  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2238  hypothetical protein  38.43 
 
 
281 aa  214  9e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4038  hypothetical protein  39.35 
 
 
281 aa  214  9e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0216  protein of unknown function DUF519  40.14 
 
 
280 aa  214  9.999999999999999e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4846  DNA utilization protein YhiR  40.14 
 
 
280 aa  214  9.999999999999999e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.780347 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3829  hypothetical protein  38.99 
 
 
281 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.341276 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3789  DNA utilization protein YhiR  40 
 
 
280 aa  214  9.999999999999999e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.201983  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4204  protein of unknown function DUF519  42.46 
 
 
281 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0098  hypothetical protein  42.86 
 
 
281 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4243  hypothetical protein  42.46 
 
 
281 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3699  DNA utilization protein YhiR  40.14 
 
 
280 aa  214  9.999999999999999e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4377  hypothetical protein  42.46 
 
 
281 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0217  hypothetical protein  40.14 
 
 
280 aa  214  9.999999999999999e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3909  DNA utilization protein YhiR  39.64 
 
 
280 aa  213  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3867  DNA utilization protein YhiR  39.64 
 
 
280 aa  213  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1963  hypothetical protein  38.13 
 
 
281 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0614068  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3801  DNA utilization protein YhiR  39.64 
 
 
280 aa  213  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1063  hypothetical protein  38.1 
 
 
281 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0632007  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4659  hypothetical protein  42.06 
 
 
281 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3970  DNA utilization protein YhiR  39.64 
 
 
280 aa  213  2.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0009  protein of unknown function DUF519  38.32 
 
 
280 aa  213  2.9999999999999995e-54  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5863  hypothetical protein  38.08 
 
 
281 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2214  hypothetical protein  38.08 
 
 
281 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3922  hypothetical protein  38.99 
 
 
281 aa  212  4.9999999999999996e-54  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2252  hypothetical protein  38.04 
 
 
281 aa  211  7e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.64987  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1916  hypothetical protein  37.72 
 
 
301 aa  211  1e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0874325  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5542  hypothetical protein  37.68 
 
 
281 aa  211  1e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.467777 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2040  hypothetical protein  37.72 
 
 
304 aa  211  1e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.894173  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2581  hypothetical protein  40.07 
 
 
290 aa  211  1e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.456932  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0599  hypothetical protein  37.68 
 
 
281 aa  210  2e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.558917  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0503  hypothetical protein  37.68 
 
 
301 aa  210  2e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3738  hypothetical protein  38.55 
 
 
280 aa  209  4e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000524629 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1807  hypothetical protein  38.35 
 
 
281 aa  209  6e-53  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1888  hypothetical protein  36.49 
 
 
285 aa  209  6e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0874  hypothetical protein  37.32 
 
 
301 aa  208  7e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.148142  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0920  hypothetical protein  37.32 
 
 
281 aa  208  7e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.202828  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2131  hypothetical protein  37.73 
 
 
281 aa  208  8e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.553822  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1917  hypothetical protein  37.68 
 
 
282 aa  207  1e-52  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4187  hypothetical protein  37.18 
 
 
280 aa  207  1e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1391  protein of unknown function DUF519  39.3 
 
 
308 aa  207  1e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.443033  hitchhiker  0.00435595 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2736  hypothetical protein  35.94 
 
 
281 aa  206  4e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.855465  normal  0.779892 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3158  putative protein involved in catabolism of external DNA  39.3 
 
 
281 aa  206  4e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.334057 
 
 
-
 
NC_004310  BR0705  hypothetical protein  39.33 
 
 
290 aa  205  5e-52  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1053  hypothetical protein  41.67 
 
 
282 aa  206  5e-52  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0020  hypothetical protein  36.96 
 
 
281 aa  205  6e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4085  hypothetical protein  36.5 
 
 
280 aa  205  7e-52  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.515626 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0115  hypothetical protein  36.5 
 
 
280 aa  205  8e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.795354  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4048  hypothetical protein  36.5 
 
 
280 aa  205  8e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.421411  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4472  protein of unknown function DUF519  36.82 
 
 
280 aa  204  1e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.514564  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66340  hypothetical protein  36.13 
 
 
278 aa  204  1e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1806  hypothetical protein  36.12 
 
 
280 aa  203  2e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000978689 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5756  hypothetical protein  35.77 
 
 
278 aa  202  5e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1377  hypothetical protein  34.75 
 
 
285 aa  200  1.9999999999999998e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0826832  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0696  hypothetical protein  38.58 
 
 
305 aa  201  1.9999999999999998e-50  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1731  hypothetical protein  36.1 
 
 
286 aa  199  3e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.147763 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0898  hypothetical protein  35.74 
 
 
286 aa  199  5e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.69089  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4945  hypothetical protein  35.77 
 
 
278 aa  198  9e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4817  hypothetical protein  35.77 
 
 
278 aa  198  9e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3368  hypothetical protein  34.83 
 
 
285 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1284  hypothetical protein  35.59 
 
 
285 aa  195  8.000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0995661 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2528  hypothetical protein  34.18 
 
 
284 aa  194  1e-48  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.435498 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3149  hypothetical protein  36.23 
 
 
285 aa  194  1e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.264033  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3717  hypothetical protein  36.5 
 
 
280 aa  194  1e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45040  hypothetical protein  34.67 
 
 
300 aa  194  1e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1180  hypothetical protein  35.59 
 
 
285 aa  194  2e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.573551  normal  0.143297 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0523  hypothetical protein  37.65 
 
 
278 aa  193  2e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0490056 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1564  hypothetical protein  39.92 
 
 
283 aa  193  3e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4772  hypothetical protein  35.04 
 
 
278 aa  192  6e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.105142 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0404  hypothetical protein  35.04 
 
 
278 aa  191  1e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1236  protein of unknown function DUF519  38.72 
 
 
289 aa  191  1e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.187373  hitchhiker  0.0000201181 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0458  hypothetical protein  38.46 
 
 
279 aa  190  2e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0983546  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4994  hypothetical protein  37.65 
 
 
278 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0788  hypothetical protein  37.97 
 
 
289 aa  189  4e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0241921  normal  0.12768 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1863  hypothetical protein  38.31 
 
 
279 aa  188  7e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.302117  normal  0.857152 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>