155 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_1863 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_1863  hypothetical protein  100 
 
 		 279 aa  563  1e-160  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.302117  normal  0.857152 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0788  hypothetical protein  50.17 
 
 		 289 aa  255  6e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0241921  normal  0.12768 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1564  hypothetical protein  49.83 
 
 		 283 aa  249  3e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2581  hypothetical protein  46.92 
 
 		 290 aa  249  3e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.456932  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0705  hypothetical protein  46.39 
 
 		 290 aa  244  9.999999999999999e-64  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1090  protein of unknown function DUF519  48.78 
 
 		 290 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0580192  hitchhiker  0.000491386 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0696  hypothetical protein  46.05 
 
 		 305 aa  242  3.9999999999999997e-63  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1938  hypothetical protein  48.94 
 
 		 287 aa  240  2e-62  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1970  hypothetical protein  50.79 
 
 		 286 aa  240  2e-62  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.445046  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0747  hypothetical protein  45.77 
 
 		 311 aa  240  2e-62  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.141291 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2730  hypothetical protein  48.79 
 
 		 286 aa  239  4e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0517  yhiR family protein  43.99 
 
 		 288 aa  238  1e-61  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.30636  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1236  protein of unknown function DUF519  47.04 
 
 		 289 aa  235  7e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.187373  hitchhiker  0.0000201181 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3912  hypothetical protein  42.05 
 
 		 280 aa  233  2.0000000000000002e-60  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0293  protein of unknown function DUF519  49.81 
 
 		 275 aa  231  8.000000000000001e-60  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.27928  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2267  hypothetical protein  51.59 
 
 		 282 aa  227  2e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.28225  normal  0.352354 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45040  hypothetical protein  45.77 
 
 		 300 aa  225  5.0000000000000005e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5263  hypothetical protein  49.64 
 
 		 282 aa  225  5.0000000000000005e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.447718 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0661  hypothetical protein  43.75 
 
 		 281 aa  224  9e-58  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.309668 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1483  hypothetical protein  50.41 
 
 		 273 aa  222  4.9999999999999996e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5822  protein of unknown function DUF519  49.4 
 
 		 282 aa  221  7e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3789  DNA utilization protein YhiR  40.28 
 
 		 280 aa  221  9.999999999999999e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.201983  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3909  DNA utilization protein YhiR  40.28 
 
 		 280 aa  220  1.9999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4846  DNA utilization protein YhiR  39.58 
 
 		 280 aa  220  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.780347 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3801  DNA utilization protein YhiR  40.28 
 
 		 280 aa  220  1.9999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3867  DNA utilization protein YhiR  40.28 
 
 		 280 aa  220  1.9999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3970  DNA utilization protein YhiR  40.28 
 
 		 280 aa  220  1.9999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0012  protein of unknown function DUF519  39.93 
 
 		 280 aa  220  1.9999999999999999e-56  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3981  DNA utilization protein YhiR  39.58 
 
 		 280 aa  220  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2382  hypothetical protein  43 
 
 		 297 aa  219  3e-56  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0256369  normal  0.814662 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0881  protein of unknown function DUF519  45.67 
 
 		 282 aa  219  3.9999999999999997e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.402966  normal  0.647337 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4713  hypothetical protein  38.52 
 
 		 280 aa  219  3.9999999999999997e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3823  DNA utilization protein YhiR  39.58 
 
 		 280 aa  218  7e-56  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03348  predicted DNA (exogenous) processing protein  39.22 
 
 		 280 aa  217  1e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.664942  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4187  hypothetical protein  41.7 
 
 		 280 aa  218  1e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03301  hypothetical protein  39.22 
 
 		 280 aa  217  1e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.864633  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3788  DNA utilization protein YhiR  39.22 
 
 		 280 aa  217  1e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.489053 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3609  hypothetical protein  43.48 
 
 		 292 aa  216  2e-55  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0115  hypothetical protein  39.93 
 
 		 280 aa  217  2e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.795354  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4048  hypothetical protein  39.93 
 
 		 280 aa  217  2e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.421411  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00525  hypothetical protein  41.09 
 
 		 285 aa  216  2e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001953  hypothetical protein  41.82 
 
 		 279 aa  216  2.9999999999999998e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0009  protein of unknown function DUF519  39.93 
 
 		 280 aa  216  2.9999999999999998e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5756  hypothetical protein  43.11 
 
 		 278 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4085  hypothetical protein  39.93 
 
 		 280 aa  216  2.9999999999999998e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.515626 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66340  hypothetical protein  43.11 
 
 		 278 aa  215  5e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1917  hypothetical protein  40.28 
 
 		 282 aa  215  7e-55  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0216  protein of unknown function DUF519  38.87 
 
 		 280 aa  214  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0217  hypothetical protein  38.87 
 
 		 280 aa  214  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4204  protein of unknown function DUF519  42.6 
 
 		 281 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4243  hypothetical protein  42.6 
 
 		 281 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3699  DNA utilization protein YhiR  38.87 
 
 		 280 aa  214  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4377  hypothetical protein  42.6 
 
 		 281 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3149  hypothetical protein  43.49 
 
 		 285 aa  213  2.9999999999999995e-54  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.264033  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4472  protein of unknown function DUF519  40.96 
 
 		 280 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.514564  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4945  hypothetical protein  41.9 
 
 		 278 aa  211  7.999999999999999e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1107  hypothetical protein  38.73 
 
 		 281 aa  211  7.999999999999999e-54  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4817  hypothetical protein  41.9 
 
 		 278 aa  211  7.999999999999999e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0569  hypothetical protein  43.11 
 
 		 282 aa  211  1e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000849382 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0404  hypothetical protein  42.4 
 
 		 278 aa  210  2e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04743  hypothetical protein  41.29 
 
 		 302 aa  211  2e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2569  hypothetical protein  40.64 
 
 		 279 aa  210  2e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1731  hypothetical protein  41.38 
 
 		 286 aa  210  2e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.147763 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1284  hypothetical protein  42.36 
 
 		 285 aa  210  3e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0995661 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0098  hypothetical protein  42.24 
 
 		 281 aa  209  3e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4772  hypothetical protein  43.66 
 
 		 278 aa  209  6e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.105142 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1180  hypothetical protein  41.67 
 
 		 285 aa  208  6e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.573551  normal  0.143297 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3858  hypothetical protein  41.88 
 
 		 285 aa  208  8e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1806  hypothetical protein  39.71 
 
 		 280 aa  207  2e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000978689 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3738  hypothetical protein  38.87 
 
 		 280 aa  206  3e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000524629 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4994  hypothetical protein  41.9 
 
 		 278 aa  206  4e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0859  protein of unknown function DUF519  42.91 
 
 		 281 aa  206  5e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2528  hypothetical protein  42.61 
 
 		 284 aa  205  7e-52  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.435498 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4659  hypothetical protein  40.43 
 
 		 281 aa  204  1e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3922  hypothetical protein  40.07 
 
 		 281 aa  204  1e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0523  hypothetical protein  41.34 
 
 		 278 aa  204  2e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0490056 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3829  hypothetical protein  40.07 
 
 		 281 aa  204  2e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.341276 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4038  hypothetical protein  40.07 
 
 		 281 aa  203  2e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3205  hypothetical protein  38.49 
 
 		 295 aa  202  6e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0857675  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0458  hypothetical protein  40.99 
 
 		 279 aa  201  9e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0983546  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0898  hypothetical protein  42.19 
 
 		 286 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.69089  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1203  protein of unknown function DUF519  40.89 
 
 		 285 aa  199  3e-50  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.478331  normal  0.221337 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3563  hypothetical protein  38.33 
 
 		 284 aa  199  5e-50  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0037  transformation competence-related protein  39.79 
 
 		 293 aa  198  7.999999999999999e-50  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.932971  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1259  hypothetical protein  39.52 
 
 		 282 aa  197  1.0000000000000001e-49  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1258  hypothetical protein  39.11 
 
 		 282 aa  198  1.0000000000000001e-49  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0121  hypothetical protein  38.16 
 
 		 279 aa  197  1.0000000000000001e-49  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0029  hypothetical protein  39.79 
 
 		 293 aa  197  2.0000000000000003e-49  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3648  hypothetical protein  38.18 
 
 		 279 aa  195  6e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4050  hypothetical protein  38.41 
 
 		 280 aa  194  1e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1807  hypothetical protein  41.9 
 
 		 281 aa  193  3e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1592  protein of unknown function DUF519  42.91 
 
 		 285 aa  192  5e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.495582 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1668  protein of unknown function DUF519  41.49 
 
 		 281 aa  191  8e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0163  hypothetical protein  38.41 
 
 		 280 aa  191  9e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.243099  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0920  hypothetical protein  42.91 
 
 		 268 aa  191  2e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.027603  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1365  protein of unknown function DUF519  44.36 
 
 		 285 aa  189  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.674549  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3389  DNA (exogenous) processing protein  39.6 
 
 		 284 aa  190  2.9999999999999997e-47  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3717  hypothetical protein  39.56 
 
 		 280 aa  189  5.999999999999999e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0143  hypothetical protein  37.68 
 
 		 280 aa  188  8e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3566  protein of unknown function DUF519  39.93 
 
 		 285 aa  186  3e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0127057  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>