155 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_2382 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_2382  hypothetical protein  100 
 
 
297 aa  592  1e-168  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0256369  normal  0.814662 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1483  hypothetical protein  47.7 
 
 
273 aa  220  1.9999999999999999e-56  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4945  hypothetical protein  40.54 
 
 
278 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4817  hypothetical protein  40.54 
 
 
278 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0523  hypothetical protein  40.2 
 
 
278 aa  211  2e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0490056 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1236  protein of unknown function DUF519  39.93 
 
 
289 aa  210  2e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.187373  hitchhiker  0.0000201181 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1564  hypothetical protein  40.74 
 
 
283 aa  209  4e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3738  hypothetical protein  34.8 
 
 
280 aa  209  4e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000524629 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0788  hypothetical protein  40.27 
 
 
289 aa  208  7e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0241921  normal  0.12768 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3981  DNA utilization protein YhiR  37.84 
 
 
280 aa  206  3e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0216  protein of unknown function DUF519  37.5 
 
 
280 aa  206  4e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0217  hypothetical protein  37.5 
 
 
280 aa  206  4e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3699  DNA utilization protein YhiR  37.5 
 
 
280 aa  206  4e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45040  hypothetical protein  42.09 
 
 
300 aa  205  7e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0012  protein of unknown function DUF519  38.51 
 
 
280 aa  205  9e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4994  hypothetical protein  40.2 
 
 
278 aa  205  9e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03348  predicted DNA (exogenous) processing protein  37.5 
 
 
280 aa  204  1e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.664942  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03301  hypothetical protein  37.5 
 
 
280 aa  204  1e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.864633  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3788  DNA utilization protein YhiR  37.5 
 
 
280 aa  204  1e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.489053 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3823  DNA utilization protein YhiR  37.5 
 
 
280 aa  204  1e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2569  hypothetical protein  37.16 
 
 
279 aa  204  2e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0517  yhiR family protein  38.13 
 
 
288 aa  203  3e-51  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.30636  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1090  protein of unknown function DUF519  38.91 
 
 
290 aa  202  4e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0580192  hitchhiker  0.000491386 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4846  DNA utilization protein YhiR  37.16 
 
 
280 aa  202  6e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.780347 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1863  hypothetical protein  43.67 
 
 
279 aa  202  6e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.302117  normal  0.857152 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5756  hypothetical protein  40.54 
 
 
278 aa  201  9e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3801  DNA utilization protein YhiR  37.84 
 
 
280 aa  201  9.999999999999999e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0293  protein of unknown function DUF519  47.12 
 
 
275 aa  201  9.999999999999999e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.27928  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3867  DNA utilization protein YhiR  37.84 
 
 
280 aa  201  9.999999999999999e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3909  DNA utilization protein YhiR  37.84 
 
 
280 aa  201  9.999999999999999e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66340  hypothetical protein  40.2 
 
 
278 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3789  DNA utilization protein YhiR  37.84 
 
 
280 aa  201  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.201983  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3970  DNA utilization protein YhiR  37.84 
 
 
280 aa  201  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0569  hypothetical protein  40.4 
 
 
282 aa  198  7.999999999999999e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000849382 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3149  hypothetical protein  41.55 
 
 
285 aa  197  1.0000000000000001e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.264033  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0121  hypothetical protein  35.47 
 
 
279 aa  198  1.0000000000000001e-49  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2581  hypothetical protein  37.16 
 
 
290 aa  197  1.0000000000000001e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.456932  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4772  hypothetical protein  39.19 
 
 
278 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.105142 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0009  protein of unknown function DUF519  37.5 
 
 
280 aa  197  2.0000000000000003e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1970  hypothetical protein  39.45 
 
 
286 aa  197  2.0000000000000003e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.445046  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1107  hypothetical protein  36.7 
 
 
281 aa  197  2.0000000000000003e-49  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3912  hypothetical protein  37.16 
 
 
280 aa  197  2.0000000000000003e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0705  hypothetical protein  37.54 
 
 
290 aa  194  1e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04743  hypothetical protein  39.81 
 
 
302 aa  194  1e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0037  transformation competence-related protein  39.54 
 
 
293 aa  194  1e-48  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.932971  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0029  hypothetical protein  39.54 
 
 
293 aa  194  1e-48  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0404  hypothetical protein  39.19 
 
 
278 aa  194  2e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0696  hypothetical protein  37.2 
 
 
305 aa  193  4e-48  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1203  protein of unknown function DUF519  38.54 
 
 
285 aa  192  5e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.478331  normal  0.221337 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001953  hypothetical protein  36.49 
 
 
279 aa  192  5e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4187  hypothetical protein  37.5 
 
 
280 aa  191  1e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0115  hypothetical protein  36.49 
 
 
280 aa  191  2e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.795354  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4048  hypothetical protein  36.49 
 
 
280 aa  191  2e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.421411  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00525  hypothetical protein  35.47 
 
 
285 aa  191  2e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4713  hypothetical protein  35.81 
 
 
280 aa  191  2e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2730  hypothetical protein  42.03 
 
 
286 aa  190  2.9999999999999997e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4085  hypothetical protein  36.49 
 
 
280 aa  189  4e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.515626 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1917  hypothetical protein  38.18 
 
 
282 aa  189  5e-47  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1938  hypothetical protein  41.28 
 
 
287 aa  189  7e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0747  hypothetical protein  39.86 
 
 
311 aa  187  2e-46  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.141291 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0898  hypothetical protein  39.66 
 
 
286 aa  186  3e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.69089  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4472  protein of unknown function DUF519  37.16 
 
 
280 aa  186  4e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.514564  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1731  hypothetical protein  40.74 
 
 
286 aa  186  5e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.147763 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2528  hypothetical protein  39.46 
 
 
284 aa  186  6e-46  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.435498 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0458  hypothetical protein  37.84 
 
 
279 aa  185  6e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0983546  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1284  hypothetical protein  39.86 
 
 
285 aa  183  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0995661 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0661  hypothetical protein  40.54 
 
 
281 aa  182  5.0000000000000004e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.309668 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5542  hypothetical protein  39.38 
 
 
281 aa  181  1e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.467777 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3609  hypothetical protein  33.45 
 
 
292 aa  181  1e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5863  hypothetical protein  38.01 
 
 
281 aa  181  1e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2214  hypothetical protein  38.01 
 
 
281 aa  181  1e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2238  hypothetical protein  38.01 
 
 
281 aa  181  1e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3242  protein of unknown function DUF519  39.73 
 
 
285 aa  181  1e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3563  hypothetical protein  32.77 
 
 
284 aa  180  2e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5822  protein of unknown function DUF519  39.52 
 
 
282 aa  181  2e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1180  hypothetical protein  37.83 
 
 
285 aa  179  2.9999999999999997e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.573551  normal  0.143297 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3566  protein of unknown function DUF519  38.83 
 
 
285 aa  180  2.9999999999999997e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0127057  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0881  protein of unknown function DUF519  38.51 
 
 
282 aa  179  4.999999999999999e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.402966  normal  0.647337 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3858  hypothetical protein  34.12 
 
 
285 aa  178  8e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3922  hypothetical protein  34.49 
 
 
281 aa  178  1e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3829  hypothetical protein  34.15 
 
 
281 aa  177  2e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.341276 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1063  hypothetical protein  37.59 
 
 
281 aa  177  2e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0632007  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1377  hypothetical protein  38.54 
 
 
285 aa  176  3e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0826832  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1807  hypothetical protein  36.79 
 
 
281 aa  176  3e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4038  hypothetical protein  34.04 
 
 
281 aa  176  3e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4659  hypothetical protein  33.56 
 
 
281 aa  176  4e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0859  protein of unknown function DUF519  38.51 
 
 
281 aa  176  4e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0027  protein of unknown function DUF519  35.95 
 
 
312 aa  174  9.999999999999999e-43  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0764421  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1365  protein of unknown function DUF519  39.2 
 
 
285 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.674549  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0098  hypothetical protein  32.77 
 
 
281 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2267  hypothetical protein  39.72 
 
 
282 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.28225  normal  0.352354 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3368  hypothetical protein  37.93 
 
 
285 aa  172  3.9999999999999995e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2040  hypothetical protein  37.46 
 
 
304 aa  172  5e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.894173  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2252  hypothetical protein  37.33 
 
 
281 aa  172  5e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.64987  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4204  protein of unknown function DUF519  32.63 
 
 
281 aa  172  5e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4243  hypothetical protein  32.63 
 
 
281 aa  172  5e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4377  hypothetical protein  32.63 
 
 
281 aa  172  5e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5263  hypothetical protein  39.22 
 
 
282 aa  172  7.999999999999999e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.447718 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2131  hypothetical protein  36.99 
 
 
281 aa  171  1e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.553822  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1258  hypothetical protein  32.76 
 
 
282 aa  171  2e-41  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>