155 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_1284 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_1284  hypothetical protein  100 
 
 		 285 aa  576  1.0000000000000001e-163  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0995661 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1180  hypothetical protein  91.2 
 
 		 285 aa  535  1e-151  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.573551  normal  0.143297 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1365  protein of unknown function DUF519  82.11 
 
 		 285 aa  446  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.674549  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2528  hypothetical protein  77.22 
 
 		 284 aa  442  1e-123  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.435498 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0898  hypothetical protein  73.68 
 
 		 286 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.69089  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3149  hypothetical protein  75.52 
 
 		 285 aa  436  1e-121  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.264033  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1731  hypothetical protein  74.13 
 
 		 286 aa  422  1e-117  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.147763 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1564  hypothetical protein  50.74 
 
 		 283 aa  274  1.0000000000000001e-72  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0705  hypothetical protein  48.94 
 
 		 290 aa  268  1e-70  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1970  hypothetical protein  48.58 
 
 		 286 aa  268  1e-70  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.445046  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0696  hypothetical protein  48.94 
 
 		 305 aa  266  2e-70  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2581  hypothetical protein  46.02 
 
 		 290 aa  261  8e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.456932  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1236  protein of unknown function DUF519  45.88 
 
 		 289 aa  260  2e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.187373  hitchhiker  0.0000201181 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1592  protein of unknown function DUF519  51.46 
 
 		 285 aa  259  3e-68  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.495582 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1090  protein of unknown function DUF519  45.88 
 
 		 290 aa  259  5.0000000000000005e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0580192  hitchhiker  0.000491386 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0788  hypothetical protein  45.96 
 
 		 289 aa  251  1e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0241921  normal  0.12768 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0661  hypothetical protein  49.29 
 
 		 281 aa  246  4e-64  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.309668 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5822  protein of unknown function DUF519  46.62 
 
 		 282 aa  244  9.999999999999999e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0881  protein of unknown function DUF519  46.98 
 
 		 282 aa  243  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.402966  normal  0.647337 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0517  yhiR family protein  43.84 
 
 		 288 aa  237  2e-61  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.30636  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5263  hypothetical protein  46.07 
 
 		 282 aa  232  6e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.447718 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0747  hypothetical protein  44.21 
 
 		 311 aa  228  7e-59  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.141291 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2730  hypothetical protein  45.96 
 
 		 286 aa  228  1e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3970  DNA utilization protein YhiR  43.01 
 
 		 280 aa  223  3e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3789  DNA utilization protein YhiR  43.01 
 
 		 280 aa  223  3e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.201983  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3867  DNA utilization protein YhiR  43.01 
 
 		 280 aa  223  4e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3909  DNA utilization protein YhiR  43.01 
 
 		 280 aa  223  4e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3801  DNA utilization protein YhiR  43.01 
 
 		 280 aa  223  4e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4846  DNA utilization protein YhiR  42.55 
 
 		 280 aa  222  4.9999999999999996e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.780347 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2569  hypothetical protein  41.99 
 
 		 279 aa  221  9.999999999999999e-57  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001953  hypothetical protein  41.95 
 
 		 279 aa  220  1.9999999999999999e-56  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3823  DNA utilization protein YhiR  43.12 
 
 		 280 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03348  predicted DNA (exogenous) processing protein  42.18 
 
 		 280 aa  219  3e-56  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.664942  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03301  hypothetical protein  42.18 
 
 		 280 aa  219  3e-56  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.864633  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3788  DNA utilization protein YhiR  42.18 
 
 		 280 aa  219  3e-56  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.489053 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3981  DNA utilization protein YhiR  42.18 
 
 		 280 aa  219  3e-56  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2267  hypothetical protein  44.84 
 
 		 282 aa  218  6e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.28225  normal  0.352354 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3912  hypothetical protein  41.58 
 
 		 280 aa  218  7.999999999999999e-56  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0216  protein of unknown function DUF519  41.82 
 
 		 280 aa  217  2e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3699  DNA utilization protein YhiR  41.82 
 
 		 280 aa  217  2e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0217  hypothetical protein  41.82 
 
 		 280 aa  217  2e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0012  protein of unknown function DUF519  40.7 
 
 		 280 aa  215  5.9999999999999996e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1917  hypothetical protein  43.31 
 
 		 282 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3205  hypothetical protein  39.04 
 
 		 295 aa  214  9.999999999999999e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0857675  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4187  hypothetical protein  40.21 
 
 		 280 aa  214  9.999999999999999e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0009  protein of unknown function DUF519  40.21 
 
 		 280 aa  213  2.9999999999999995e-54  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4713  hypothetical protein  39.86 
 
 		 280 aa  213  2.9999999999999995e-54  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2736  hypothetical protein  39.36 
 
 		 281 aa  212  3.9999999999999995e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.855465  normal  0.779892 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1938  hypothetical protein  44.06 
 
 		 287 aa  213  3.9999999999999995e-54  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00525  hypothetical protein  39.85 
 
 		 285 aa  213  3.9999999999999995e-54  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0920  hypothetical protein  44.61 
 
 		 268 aa  212  5.999999999999999e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.027603  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0115  hypothetical protein  40.51 
 
 		 280 aa  208  9e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.795354  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4048  hypothetical protein  40.51 
 
 		 280 aa  208  9e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.421411  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4085  hypothetical protein  40.58 
 
 		 280 aa  207  2e-52  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.515626 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4472  protein of unknown function DUF519  39.15 
 
 		 280 aa  206  3e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.514564  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0856  protein of unknown function DUF519  44.61 
 
 		 268 aa  205  6e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.587944 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3858  hypothetical protein  41.25 
 
 		 285 aa  204  1e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5756  hypothetical protein  41.91 
 
 		 278 aa  204  1e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66340  hypothetical protein  41.67 
 
 		 278 aa  203  3e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4945  hypothetical protein  40.78 
 
 		 278 aa  202  5e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4817  hypothetical protein  40.78 
 
 		 278 aa  202  5e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0121  hypothetical protein  39.11 
 
 		 279 aa  200  1.9999999999999998e-50  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0293  protein of unknown function DUF519  47.45 
 
 		 275 aa  200  1.9999999999999998e-50  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.27928  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0859  protein of unknown function DUF519  41.28 
 
 		 281 aa  200  1.9999999999999998e-50  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45040  hypothetical protein  42.91 
 
 		 300 aa  200  1.9999999999999998e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4772  hypothetical protein  40.07 
 
 		 278 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.105142 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3609  hypothetical protein  38.97 
 
 		 292 aa  198  7.999999999999999e-50  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1413  hypothetical protein  38.25 
 
 		 289 aa  197  1.0000000000000001e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0027  protein of unknown function DUF519  40.29 
 
 		 312 aa  197  2.0000000000000003e-49  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0764421  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1259  hypothetical protein  35.87 
 
 		 282 aa  196  3e-49  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4050  hypothetical protein  37.82 
 
 		 280 aa  196  3e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3389  DNA (exogenous) processing protein  37.68 
 
 		 284 aa  196  4.0000000000000005e-49  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3648  hypothetical protein  37.59 
 
 		 279 aa  195  6e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1107  hypothetical protein  37.89 
 
 		 281 aa  195  7e-49  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1258  hypothetical protein  35.59 
 
 		 282 aa  195  8.000000000000001e-49  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3922  hypothetical protein  39.78 
 
 		 281 aa  194  1e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1806  hypothetical protein  39.02 
 
 		 280 aa  194  1e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000978689 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0569  hypothetical protein  43.8 
 
 		 282 aa  194  1e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000849382 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5915  hypothetical protein  38.89 
 
 		 290 aa  194  1e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.492755  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0404  hypothetical protein  38.97 
 
 		 278 aa  194  2e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0098  hypothetical protein  38.04 
 
 		 281 aa  194  2e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3829  hypothetical protein  39.42 
 
 		 281 aa  193  3e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.341276 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4038  hypothetical protein  39.78 
 
 		 281 aa  193  3e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3563  hypothetical protein  41.2 
 
 		 284 aa  193  3e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1863  hypothetical protein  42.36 
 
 		 279 aa  193  3e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.302117  normal  0.857152 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0163  hypothetical protein  39.21 
 
 		 280 aa  192  5e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.243099  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4659  hypothetical protein  39.29 
 
 		 281 aa  192  8e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4994  hypothetical protein  40.43 
 
 		 278 aa  191  1e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3566  protein of unknown function DUF519  39.72 
 
 		 285 aa  190  2e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0127057  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4204  protein of unknown function DUF519  38.32 
 
 		 281 aa  191  2e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3738  hypothetical protein  35.36 
 
 		 280 aa  190  2e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000524629 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4243  hypothetical protein  38.32 
 
 		 281 aa  191  2e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4377  hypothetical protein  38.32 
 
 		 281 aa  191  2e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0523  hypothetical protein  40.43 
 
 		 278 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0490056 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4055  hypothetical protein  38.95 
 
 		 299 aa  189  2.9999999999999997e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0458  hypothetical protein  40.44 
 
 		 279 aa  189  7e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0983546  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0602  protein of unknown function DUF519  39.12 
 
 		 296 aa  188  7e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3717  hypothetical protein  39.01 
 
 		 280 aa  187  1e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0623  hypothetical protein  39.12 
 
 		 296 aa  187  2e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.757011  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0143  hypothetical protein  37.77 
 
 		 280 aa  186  3e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>