156 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A1938 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A1938  hypothetical protein  100 
 
 		 287 aa  571  1.0000000000000001e-162  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66340  hypothetical protein  49.29 
 
 		 278 aa  249  4e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5756  hypothetical protein  49.29 
 
 		 278 aa  247  1e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45040  hypothetical protein  50.18 
 
 		 300 aa  247  2e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0747  hypothetical protein  48.25 
 
 		 311 aa  243  3e-63  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.141291 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0859  protein of unknown function DUF519  50.36 
 
 		 281 aa  243  3e-63  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1917  hypothetical protein  46.48 
 
 		 282 aa  235  5.0000000000000005e-61  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0569  hypothetical protein  49.47 
 
 		 282 aa  235  7e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000849382 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1090  protein of unknown function DUF519  48.4 
 
 		 290 aa  233  2.0000000000000002e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0580192  hitchhiker  0.000491386 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0788  hypothetical protein  49.29 
 
 		 289 aa  233  2.0000000000000002e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0241921  normal  0.12768 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1236  protein of unknown function DUF519  48.04 
 
 		 289 aa  233  4.0000000000000004e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.187373  hitchhiker  0.0000201181 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2581  hypothetical protein  44.44 
 
 		 290 aa  233  4.0000000000000004e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.456932  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4945  hypothetical protein  45.36 
 
 		 278 aa  231  1e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1564  hypothetical protein  48.57 
 
 		 283 aa  231  1e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4817  hypothetical protein  45.36 
 
 		 278 aa  231  1e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0705  hypothetical protein  44.72 
 
 		 290 aa  229  5e-59  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0404  hypothetical protein  46.79 
 
 		 278 aa  229  5e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1483  hypothetical protein  50.75 
 
 		 273 aa  228  8e-59  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4772  hypothetical protein  46.43 
 
 		 278 aa  228  1e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.105142 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0523  hypothetical protein  46.07 
 
 		 278 aa  225  6e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0490056 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0696  hypothetical protein  44.01 
 
 		 305 aa  225  6e-58  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0458  hypothetical protein  45 
 
 		 279 aa  224  2e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0983546  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00525  hypothetical protein  40.71 
 
 		 285 aa  223  4e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001953  hypothetical protein  41.07 
 
 		 279 aa  222  4.9999999999999996e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3801  DNA utilization protein YhiR  41.07 
 
 		 280 aa  221  9.999999999999999e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3789  DNA utilization protein YhiR  41.07 
 
 		 280 aa  221  9.999999999999999e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.201983  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3970  DNA utilization protein YhiR  41.07 
 
 		 280 aa  221  9.999999999999999e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3867  DNA utilization protein YhiR  41.07 
 
 		 280 aa  221  9.999999999999999e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3909  DNA utilization protein YhiR  41.07 
 
 		 280 aa  221  9.999999999999999e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4994  hypothetical protein  45.36 
 
 		 278 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3912  hypothetical protein  41.43 
 
 		 280 aa  221  1.9999999999999999e-56  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5822  protein of unknown function DUF519  48.01 
 
 		 282 aa  219  3e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1863  hypothetical protein  48.94 
 
 		 279 aa  219  3.9999999999999997e-56  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.302117  normal  0.857152 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2569  hypothetical protein  41.07 
 
 		 279 aa  218  1e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0121  hypothetical protein  40.93 
 
 		 279 aa  217  2e-55  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1180  hypothetical protein  44.41 
 
 		 285 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.573551  normal  0.143297 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4713  hypothetical protein  39.29 
 
 		 280 aa  215  5e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1970  hypothetical protein  43.46 
 
 		 286 aa  215  5.9999999999999996e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.445046  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4846  DNA utilization protein YhiR  40.36 
 
 		 280 aa  215  7e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.780347 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3981  DNA utilization protein YhiR  40.36 
 
 		 280 aa  214  9.999999999999999e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3149  hypothetical protein  45.96 
 
 		 285 aa  213  1.9999999999999998e-54  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.264033  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1107  hypothetical protein  38.57 
 
 		 281 aa  213  2.9999999999999995e-54  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1284  hypothetical protein  44.06 
 
 		 285 aa  213  3.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0995661 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03348  predicted DNA (exogenous) processing protein  40 
 
 		 280 aa  211  7.999999999999999e-54  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.664942  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3823  DNA utilization protein YhiR  40 
 
 		 280 aa  211  7.999999999999999e-54  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03301  hypothetical protein  40 
 
 		 280 aa  211  7.999999999999999e-54  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.864633  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3788  DNA utilization protein YhiR  40 
 
 		 280 aa  211  7.999999999999999e-54  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.489053 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0293  protein of unknown function DUF519  47.18 
 
 		 275 aa  211  1e-53  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.27928  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1203  protein of unknown function DUF519  42.76 
 
 		 285 aa  211  1e-53  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.478331  normal  0.221337 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4472  protein of unknown function DUF519  39.64 
 
 		 280 aa  209  3e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.514564  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4085  hypothetical protein  38.93 
 
 		 280 aa  209  3e-53  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.515626 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0216  protein of unknown function DUF519  39.64 
 
 		 280 aa  209  4e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0217  hypothetical protein  39.64 
 
 		 280 aa  209  4e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3699  DNA utilization protein YhiR  39.64 
 
 		 280 aa  209  4e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0009  protein of unknown function DUF519  39.64 
 
 		 280 aa  209  5e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0012  protein of unknown function DUF519  40 
 
 		 280 aa  209  6e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4187  hypothetical protein  39.29 
 
 		 280 aa  209  6e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0115  hypothetical protein  38.57 
 
 		 280 aa  207  1e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.795354  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4048  hypothetical protein  38.57 
 
 		 280 aa  207  1e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.421411  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0881  protein of unknown function DUF519  45.21 
 
 		 282 aa  207  2e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.402966  normal  0.647337 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0661  hypothetical protein  46.1 
 
 		 281 aa  206  3e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.309668 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04743  hypothetical protein  40.4 
 
 		 302 aa  206  3e-52  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0898  hypothetical protein  43.11 
 
 		 286 aa  205  9e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.69089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1731  hypothetical protein  44.37 
 
 		 286 aa  204  1e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.147763 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5263  hypothetical protein  47.64 
 
 		 282 aa  204  2e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.447718 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0517  yhiR family protein  38.6 
 
 		 288 aa  203  2e-51  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.30636  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0037  transformation competence-related protein  42.41 
 
 		 293 aa  203  3e-51  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.932971  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3205  hypothetical protein  35.25 
 
 		 295 aa  202  4e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0857675  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2528  hypothetical protein  45.04 
 
 		 284 aa  202  7e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.435498 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0029  hypothetical protein  42.32 
 
 		 293 aa  200  3e-50  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2736  hypothetical protein  40.79 
 
 		 281 aa  198  7.999999999999999e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.855465  normal  0.779892 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1365  protein of unknown function DUF519  44.88 
 
 		 285 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.674549  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1592  protein of unknown function DUF519  44.41 
 
 		 285 aa  195  8.000000000000001e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.495582 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0599  hypothetical protein  41.88 
 
 		 281 aa  194  2e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.558917  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2730  hypothetical protein  43.86 
 
 		 286 aa  193  4e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1916  hypothetical protein  41.52 
 
 		 301 aa  192  5e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0874325  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3738  hypothetical protein  36.43 
 
 		 280 aa  192  6e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000524629 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0503  hypothetical protein  41.52 
 
 		 301 aa  192  7e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0355  protein of unknown function DUF519  43.12 
 
 		 285 aa  191  1e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.135984  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2040  hypothetical protein  41.52 
 
 		 304 aa  191  1e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.894173  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0176  hypothetical protein  43.12 
 
 		 285 aa  191  1e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0874  hypothetical protein  41.16 
 
 		 301 aa  190  2e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.148142  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2267  hypothetical protein  43.68 
 
 		 282 aa  190  2e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.28225  normal  0.352354 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0920  hypothetical protein  41.16 
 
 		 281 aa  190  2e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.202828  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3389  DNA (exogenous) processing protein  34.64 
 
 		 284 aa  189  5.999999999999999e-47  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3717  hypothetical protein  40.82 
 
 		 280 aa  187  2e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0020  hypothetical protein  40.79 
 
 		 281 aa  187  2e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5863  hypothetical protein  40.86 
 
 		 281 aa  186  3e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2214  hypothetical protein  40.86 
 
 		 281 aa  186  3e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1063  hypothetical protein  41.91 
 
 		 281 aa  186  3e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0632007  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1963  hypothetical protein  41.22 
 
 		 281 aa  186  4e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0614068  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0027  protein of unknown function DUF519  39.86 
 
 		 312 aa  186  4e-46  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0764421  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3158  putative protein involved in catabolism of external DNA  41.07 
 
 		 281 aa  186  5e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.334057 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2238  hypothetical protein  40.86 
 
 		 281 aa  185  6e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1258  hypothetical protein  34.72 
 
 		 282 aa  184  1.0000000000000001e-45  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5542  hypothetical protein  40.5 
 
 		 281 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.467777 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2382  hypothetical protein  40.94 
 
 		 297 aa  184  1.0000000000000001e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0256369  normal  0.814662 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4050  hypothetical protein  36.8 
 
 		 280 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1806  hypothetical protein  38.03 
 
 		 280 aa  183  2.0000000000000003e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000978689 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1259  hypothetical protein  34.78 
 
 		 282 aa  183  3e-45  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>