154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_2730 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_2730  hypothetical protein  100 
 
 
286 aa  570  1.0000000000000001e-162  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2581  hypothetical protein  48.41 
 
 
290 aa  277  2e-73  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.456932  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1090  protein of unknown function DUF519  50.88 
 
 
290 aa  270  2e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0580192  hitchhiker  0.000491386 
 
 
-
 
NC_004310  BR0705  hypothetical protein  48.06 
 
 
290 aa  269  2.9999999999999997e-71  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1564  hypothetical protein  51.76 
 
 
283 aa  270  2.9999999999999997e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0788  hypothetical protein  51.24 
 
 
289 aa  269  5e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0241921  normal  0.12768 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1970  hypothetical protein  50.18 
 
 
286 aa  268  1e-70  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.445046  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1236  protein of unknown function DUF519  49.82 
 
 
289 aa  266  2.9999999999999995e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.187373  hitchhiker  0.0000201181 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0696  hypothetical protein  47.7 
 
 
305 aa  266  4e-70  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0517  yhiR family protein  43.94 
 
 
288 aa  253  2.0000000000000002e-66  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.30636  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5263  hypothetical protein  50.53 
 
 
282 aa  239  5e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.447718 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0898  hypothetical protein  44.33 
 
 
286 aa  232  6e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.69089  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1731  hypothetical protein  45.3 
 
 
286 aa  231  9e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.147763 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0661  hypothetical protein  45.99 
 
 
281 aa  229  3e-59  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.309668 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2528  hypothetical protein  45.07 
 
 
284 aa  229  4e-59  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.435498 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3149  hypothetical protein  45.77 
 
 
285 aa  228  6e-59  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.264033  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5822  protein of unknown function DUF519  48.04 
 
 
282 aa  229  6e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1180  hypothetical protein  44.83 
 
 
285 aa  228  1e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.573551  normal  0.143297 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1284  hypothetical protein  45.96 
 
 
285 aa  228  1e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0995661 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1365  protein of unknown function DUF519  47.55 
 
 
285 aa  226  3e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.674549  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45040  hypothetical protein  47 
 
 
300 aa  225  5.0000000000000005e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1592  protein of unknown function DUF519  46.4 
 
 
285 aa  219  5e-56  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.495582 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0747  hypothetical protein  40.96 
 
 
311 aa  217  2e-55  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.141291 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66340  hypothetical protein  43.66 
 
 
278 aa  216  4e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5756  hypothetical protein  44.01 
 
 
278 aa  216  5e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1863  hypothetical protein  47.06 
 
 
279 aa  214  9.999999999999999e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.302117  normal  0.857152 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0881  protein of unknown function DUF519  45.83 
 
 
282 aa  212  5.999999999999999e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.402966  normal  0.647337 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3970  DNA utilization protein YhiR  40 
 
 
280 aa  211  7.999999999999999e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3909  DNA utilization protein YhiR  40 
 
 
280 aa  211  7.999999999999999e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3867  DNA utilization protein YhiR  40 
 
 
280 aa  211  7.999999999999999e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3801  DNA utilization protein YhiR  40 
 
 
280 aa  211  7.999999999999999e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1917  hypothetical protein  40.99 
 
 
282 aa  211  1e-53  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3789  DNA utilization protein YhiR  39.65 
 
 
280 aa  210  3e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.201983  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2267  hypothetical protein  46.5 
 
 
282 aa  208  7e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.28225  normal  0.352354 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4187  hypothetical protein  38.25 
 
 
280 aa  207  1e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4846  DNA utilization protein YhiR  39.3 
 
 
280 aa  208  1e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.780347 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4085  hypothetical protein  38.6 
 
 
280 aa  207  1e-52  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.515626 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0293  protein of unknown function DUF519  45.77 
 
 
275 aa  207  2e-52  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.27928  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4048  hypothetical protein  38.6 
 
 
280 aa  207  2e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.421411  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0115  hypothetical protein  38.6 
 
 
280 aa  207  2e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.795354  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0012  protein of unknown function DUF519  37.19 
 
 
280 aa  206  3e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0216  protein of unknown function DUF519  39.3 
 
 
280 aa  206  5e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3699  DNA utilization protein YhiR  39.3 
 
 
280 aa  206  5e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0217  hypothetical protein  39.3 
 
 
280 aa  206  5e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0009  protein of unknown function DUF519  37.54 
 
 
280 aa  205  6e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4945  hypothetical protein  42.05 
 
 
278 aa  205  8e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4817  hypothetical protein  42.05 
 
 
278 aa  205  8e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03348  predicted DNA (exogenous) processing protein  38.95 
 
 
280 aa  204  1e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.664942  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3788  DNA utilization protein YhiR  38.95 
 
 
280 aa  204  1e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.489053 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03301  hypothetical protein  38.95 
 
 
280 aa  204  1e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.864633  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3823  DNA utilization protein YhiR  38.95 
 
 
280 aa  204  1e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2569  hypothetical protein  40 
 
 
279 aa  204  1e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4713  hypothetical protein  37.54 
 
 
280 aa  204  1e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3981  DNA utilization protein YhiR  38.95 
 
 
280 aa  204  2e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3912  hypothetical protein  38.95 
 
 
280 aa  203  3e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0569  hypothetical protein  45.23 
 
 
282 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000849382 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1107  hypothetical protein  38.11 
 
 
281 aa  200  1.9999999999999998e-50  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001953  hypothetical protein  37.19 
 
 
279 aa  200  3e-50  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4472  protein of unknown function DUF519  37.19 
 
 
280 aa  198  7.999999999999999e-50  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.514564  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4772  hypothetical protein  41.7 
 
 
278 aa  196  5.000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.105142 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00525  hypothetical protein  36.14 
 
 
285 aa  195  9e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0458  hypothetical protein  42.76 
 
 
279 aa  194  1e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0983546  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1938  hypothetical protein  43.86 
 
 
287 aa  193  3e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3389  DNA (exogenous) processing protein  36.62 
 
 
284 aa  193  3e-48  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0523  hypothetical protein  42.4 
 
 
278 aa  193  3e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0490056 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1483  hypothetical protein  42.75 
 
 
273 aa  193  3e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4994  hypothetical protein  41.7 
 
 
278 aa  193  3e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0121  hypothetical protein  36.84 
 
 
279 aa  192  5e-48  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0404  hypothetical protein  40.99 
 
 
278 aa  192  7e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3738  hypothetical protein  34.74 
 
 
280 aa  192  7e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000524629 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2915  hypothetical protein  40.49 
 
 
276 aa  190  2.9999999999999997e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.407499  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3368  hypothetical protein  42.39 
 
 
285 aa  189  5.999999999999999e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1888  hypothetical protein  42.03 
 
 
285 aa  189  5.999999999999999e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3609  hypothetical protein  38.87 
 
 
292 aa  188  8e-47  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2382  hypothetical protein  42.37 
 
 
297 aa  187  2e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0256369  normal  0.814662 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3242  protein of unknown function DUF519  42.75 
 
 
285 aa  187  2e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3566  protein of unknown function DUF519  42.39 
 
 
285 aa  186  3e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0127057  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0027  protein of unknown function DUF519  37.5 
 
 
312 aa  186  4e-46  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0764421  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3858  hypothetical protein  37.68 
 
 
285 aa  186  4e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2040  hypothetical protein  40.58 
 
 
304 aa  185  7e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.894173  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1377  hypothetical protein  41.09 
 
 
285 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0826832  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0599  hypothetical protein  41.88 
 
 
281 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.558917  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0503  hypothetical protein  41.88 
 
 
301 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0163  hypothetical protein  37.09 
 
 
280 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.243099  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1916  hypothetical protein  41.88 
 
 
301 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0874325  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0920  hypothetical protein  42.7 
 
 
268 aa  182  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.027603  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1019  hypothetical protein  37.76 
 
 
289 aa  182  5.0000000000000004e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1063  hypothetical protein  40.28 
 
 
281 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0632007  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0874  hypothetical protein  41.52 
 
 
301 aa  182  6e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.148142  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0920  hypothetical protein  41.52 
 
 
281 aa  182  6e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.202828  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1807  hypothetical protein  40.36 
 
 
281 aa  182  7e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3648  hypothetical protein  35.11 
 
 
279 aa  182  8.000000000000001e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5542  hypothetical protein  38.52 
 
 
281 aa  181  1e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.467777 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3205  hypothetical protein  33.22 
 
 
295 aa  179  4.999999999999999e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0857675  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0020  hypothetical protein  41.16 
 
 
281 aa  178  7e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0856  protein of unknown function DUF519  43.01 
 
 
268 aa  178  8e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.587944 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5863  hypothetical protein  37.94 
 
 
281 aa  178  1e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2214  hypothetical protein  37.94 
 
 
281 aa  178  1e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0143  hypothetical protein  35.64 
 
 
280 aa  177  2e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2238  hypothetical protein  37.94 
 
 
281 aa  177  2e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>