155 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_2915 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_2915  hypothetical protein  100 
 
 		 276 aa  561  1.0000000000000001e-159  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.407499  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1970  hypothetical protein  43.22 
 
 		 286 aa  204  9e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.445046  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4945  hypothetical protein  40.43 
 
 		 278 aa  203  3e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4817  hypothetical protein  40.43 
 
 		 278 aa  203  3e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2581  hypothetical protein  42.03 
 
 		 290 aa  201  9.999999999999999e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.456932  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4994  hypothetical protein  42.11 
 
 		 278 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0705  hypothetical protein  40.48 
 
 		 290 aa  196  5.000000000000001e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0523  hypothetical protein  42.11 
 
 		 278 aa  193  3e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0490056 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1564  hypothetical protein  42.31 
 
 		 283 aa  192  3e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0696  hypothetical protein  40.14 
 
 		 305 aa  193  3e-48  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1236  protein of unknown function DUF519  42.22 
 
 		 289 aa  192  6e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.187373  hitchhiker  0.0000201181 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0293  protein of unknown function DUF519  45.26 
 
 		 275 aa  192  6e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.27928  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1090  protein of unknown function DUF519  41.85 
 
 		 290 aa  192  7e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0580192  hitchhiker  0.000491386 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0788  hypothetical protein  41.26 
 
 		 289 aa  191  8e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0241921  normal  0.12768 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45040  hypothetical protein  42.09 
 
 		 300 aa  191  9e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1917  hypothetical protein  37.28 
 
 		 282 aa  191  1e-47  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0458  hypothetical protein  41.7 
 
 		 279 aa  191  1e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0983546  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5756  hypothetical protein  41.16 
 
 		 278 aa  191  1e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2730  hypothetical protein  40.49 
 
 		 286 aa  190  2.9999999999999997e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4772  hypothetical protein  39.35 
 
 		 278 aa  189  5e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.105142 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66340  hypothetical protein  40.43 
 
 		 278 aa  189  5e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0404  hypothetical protein  38.99 
 
 		 278 aa  187  1e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0569  hypothetical protein  40.65 
 
 		 282 aa  187  2e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000849382 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1483  hypothetical protein  43.51 
 
 		 273 aa  182  4.0000000000000006e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3789  DNA utilization protein YhiR  36.69 
 
 		 280 aa  180  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.201983  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3909  DNA utilization protein YhiR  36.69 
 
 		 280 aa  179  4e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3801  DNA utilization protein YhiR  36.69 
 
 		 280 aa  179  4e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3970  DNA utilization protein YhiR  36.69 
 
 		 280 aa  179  4e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3867  DNA utilization protein YhiR  36.69 
 
 		 280 aa  179  4e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00525  hypothetical protein  34.53 
 
 		 285 aa  179  4.999999999999999e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001953  hypothetical protein  35.61 
 
 		 279 aa  178  9e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0475  hypothetical protein  40 
 
 		 259 aa  177  1e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.499183  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0012  protein of unknown function DUF519  37.41 
 
 		 280 aa  177  1e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1938  hypothetical protein  39.43 
 
 		 287 aa  177  2e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2569  hypothetical protein  34.89 
 
 		 279 aa  175  7e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0517  yhiR family protein  35.89 
 
 		 288 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.30636  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4846  DNA utilization protein YhiR  35.61 
 
 		 280 aa  172  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.780347 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4187  hypothetical protein  36.94 
 
 		 280 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03348  predicted DNA (exogenous) processing protein  35.61 
 
 		 280 aa  172  5.999999999999999e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.664942  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1107  hypothetical protein  34.05 
 
 		 281 aa  172  5.999999999999999e-42  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03301  hypothetical protein  35.61 
 
 		 280 aa  172  5.999999999999999e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.864633  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3981  DNA utilization protein YhiR  35.61 
 
 		 280 aa  172  5.999999999999999e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3823  DNA utilization protein YhiR  35.61 
 
 		 280 aa  172  5.999999999999999e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4713  hypothetical protein  36.06 
 
 		 280 aa  172  5.999999999999999e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3788  DNA utilization protein YhiR  35.61 
 
 		 280 aa  172  5.999999999999999e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.489053 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4055  hypothetical protein  40.49 
 
 		 299 aa  171  1e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0216  protein of unknown function DUF519  35.25 
 
 		 280 aa  170  2e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2238  hypothetical protein  37.45 
 
 		 281 aa  171  2e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5863  hypothetical protein  37.17 
 
 		 281 aa  170  2e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2214  hypothetical protein  37.17 
 
 		 281 aa  170  2e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5822  protein of unknown function DUF519  40.21 
 
 		 282 aa  170  2e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0009  protein of unknown function DUF519  36.69 
 
 		 280 aa  170  2e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3912  hypothetical protein  36.92 
 
 		 280 aa  170  2e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3699  DNA utilization protein YhiR  35.25 
 
 		 280 aa  170  2e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0217  hypothetical protein  35.25 
 
 		 280 aa  170  2e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1063  hypothetical protein  38.35 
 
 		 281 aa  170  3e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0632007  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0859  protein of unknown function DUF519  39.85 
 
 		 281 aa  168  7e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2252  hypothetical protein  38.35 
 
 		 281 aa  168  8e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.64987  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1284  hypothetical protein  37.59 
 
 		 285 aa  168  1e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0995661 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0115  hypothetical protein  35.25 
 
 		 280 aa  168  1e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.795354  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2131  hypothetical protein  37.97 
 
 		 281 aa  167  1e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.553822  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4048  hypothetical protein  35.25 
 
 		 280 aa  168  1e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.421411  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3609  hypothetical protein  36.2 
 
 		 292 aa  167  2e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4472  protein of unknown function DUF519  36.57 
 
 		 280 aa  167  2e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.514564  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2528  hypothetical protein  39.35 
 
 		 284 aa  166  4e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.435498 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1203  protein of unknown function DUF519  34.86 
 
 		 285 aa  166  4e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.478331  normal  0.221337 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0121  hypothetical protein  33.45 
 
 		 279 aa  166  4e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4085  hypothetical protein  34.89 
 
 		 280 aa  166  5e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.515626 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0602  protein of unknown function DUF519  38.28 
 
 		 296 aa  165  6.9999999999999995e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5915  hypothetical protein  38.06 
 
 		 290 aa  165  6.9999999999999995e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.492755  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5542  hypothetical protein  37.22 
 
 		 281 aa  165  8e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.467777 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3205  hypothetical protein  32.51 
 
 		 295 aa  165  9e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0857675  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0623  hypothetical protein  38.97 
 
 		 296 aa  165  9e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.757011  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04743  hypothetical protein  35.67 
 
 		 302 aa  165  9e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5263  hypothetical protein  39.85 
 
 		 282 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.447718 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1377  hypothetical protein  37.13 
 
 		 285 aa  163  2.0000000000000002e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0826832  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1180  hypothetical protein  35.4 
 
 		 285 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.573551  normal  0.143297 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3149  hypothetical protein  39.35 
 
 		 285 aa  163  3e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.264033  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2040  hypothetical protein  35.19 
 
 		 304 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.894173  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0881  protein of unknown function DUF519  38.93 
 
 		 282 aa  162  6e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.402966  normal  0.647337 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1731  hypothetical protein  37.82 
 
 		 286 aa  162  6e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.147763 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1916  hypothetical protein  36.47 
 
 		 301 aa  161  9e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0874325  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0898  hypothetical protein  38.46 
 
 		 286 aa  161  9e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.69089  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3158  putative protein involved in catabolism of external DNA  33.93 
 
 		 281 aa  160  2e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.334057 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1888  hypothetical protein  37.83 
 
 		 285 aa  159  4e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1963  hypothetical protein  35.94 
 
 		 281 aa  159  4e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0614068  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0503  hypothetical protein  36.09 
 
 		 301 aa  159  4e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1391  protein of unknown function DUF519  34.29 
 
 		 308 aa  159  5e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.443033  hitchhiker  0.00435595 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2039  hypothetical protein  33.22 
 
 		 293 aa  159  6e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0355  protein of unknown function DUF519  39.03 
 
 		 285 aa  159  6e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.135984  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0176  hypothetical protein  39.03 
 
 		 285 aa  159  6e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1788  hypothetical protein  36.52 
 
 		 293 aa  159  7e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.192563  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0599  hypothetical protein  35.71 
 
 		 281 aa  158  9e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.558917  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0920  hypothetical protein  35.71 
 
 		 281 aa  158  9e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.202828  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0874  hypothetical protein  35.71 
 
 		 301 aa  158  1e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.148142  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0661  hypothetical protein  38.03 
 
 		 281 aa  157  1e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.309668 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1863  hypothetical protein  41.11 
 
 		 279 aa  157  1e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.302117  normal  0.857152 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2382  hypothetical protein  40.07 
 
 		 297 aa  157  2e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0256369  normal  0.814662 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1365  protein of unknown function DUF519  38.38 
 
 		 285 aa  156  3e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.674549  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3563  hypothetical protein  35.31 
 
 		 284 aa  156  3e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>