155 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_1888 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_1888  hypothetical protein  100 
 
 		 285 aa  583  1.0000000000000001e-165  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1377  hypothetical protein  85.82 
 
 		 285 aa  501  1e-141  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0826832  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3368  hypothetical protein  82.98 
 
 		 285 aa  484  1e-136  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3242  protein of unknown function DUF519  81.49 
 
 		 285 aa  481  1e-135  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3566  protein of unknown function DUF519  81.85 
 
 		 285 aa  482  1e-135  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0127057  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2252  hypothetical protein  66.19 
 
 		 281 aa  395  1e-109  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.64987  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5542  hypothetical protein  64.41 
 
 		 281 aa  391  1e-108  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.467777 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5863  hypothetical protein  64.77 
 
 		 281 aa  389  1e-107  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2214  hypothetical protein  64.77 
 
 		 281 aa  389  1e-107  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2131  hypothetical protein  65.48 
 
 		 281 aa  390  1e-107  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.553822  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2238  hypothetical protein  64.41 
 
 		 281 aa  387  1e-106  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1063  hypothetical protein  64.41 
 
 		 281 aa  387  1e-106  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0632007  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1963  hypothetical protein  64.77 
 
 		 281 aa  383  1e-105  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0614068  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0874  hypothetical protein  63.35 
 
 		 301 aa  378  1e-104  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.148142  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1916  hypothetical protein  63.7 
 
 		 301 aa  379  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0874325  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2040  hypothetical protein  62.63 
 
 		 304 aa  379  1e-104  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.894173  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0599  hypothetical protein  63.7 
 
 		 281 aa  380  1e-104  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.558917  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0503  hypothetical protein  63.7 
 
 		 301 aa  380  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0920  hypothetical protein  63.35 
 
 		 281 aa  378  1e-104  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.202828  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0020  hypothetical protein  62.99 
 
 		 281 aa  375  1e-103  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3158  putative protein involved in catabolism of external DNA  62.28 
 
 		 281 aa  368  1e-101  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.334057 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1391  protein of unknown function DUF519  61.92 
 
 		 308 aa  367  1e-100  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.443033  hitchhiker  0.00435595 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2736  hypothetical protein  59.57 
 
 		 281 aa  353  1e-96  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.855465  normal  0.779892 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1807  hypothetical protein  55.52 
 
 		 281 aa  331  7.000000000000001e-90  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5915  hypothetical protein  53.45 
 
 		 290 aa  285  4e-76  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.492755  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1806  hypothetical protein  52.67 
 
 		 280 aa  284  1.0000000000000001e-75  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000978689 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1413  hypothetical protein  47.93 
 
 		 289 aa  273  2.0000000000000002e-72  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1788  hypothetical protein  50.51 
 
 		 293 aa  273  3e-72  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.192563  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1668  protein of unknown function DUF519  50.53 
 
 		 281 aa  270  2e-71  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4055  hypothetical protein  51.52 
 
 		 299 aa  270  2e-71  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0602  protein of unknown function DUF519  51.19 
 
 		 296 aa  265  7e-70  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0623  hypothetical protein  51.19 
 
 		 296 aa  262  4e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.757011  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0496  hypothetical protein  45.56 
 
 		 340 aa  261  1e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4114  hypothetical protein  46.2 
 
 		 332 aa  259  3e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3717  hypothetical protein  48.41 
 
 		 280 aa  257  2e-67  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0720  hypothetical protein  46.71 
 
 		 318 aa  256  4e-67  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.802576  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3389  DNA (exogenous) processing protein  45.23 
 
 		 284 aa  252  4.0000000000000004e-66  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1053  hypothetical protein  45.82 
 
 		 282 aa  250  2e-65  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3205  hypothetical protein  41.47 
 
 		 295 aa  234  1.0000000000000001e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0857675  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0121  hypothetical protein  43.64 
 
 		 279 aa  231  7.000000000000001e-60  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4679  protein of unknown function DUF519  44.97 
 
 		 320 aa  231  9e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0752119  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0012  protein of unknown function DUF519  42.35 
 
 		 280 aa  231  1e-59  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3912  hypothetical protein  43.56 
 
 		 280 aa  229  3e-59  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4187  hypothetical protein  40.64 
 
 		 280 aa  227  2e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3981  DNA utilization protein YhiR  43.56 
 
 		 280 aa  227  2e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03348  predicted DNA (exogenous) processing protein  43.56 
 
 		 280 aa  226  3e-58  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.664942  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03301  hypothetical protein  43.56 
 
 		 280 aa  226  3e-58  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.864633  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3823  DNA utilization protein YhiR  43.56 
 
 		 280 aa  226  3e-58  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3788  DNA utilization protein YhiR  43.56 
 
 		 280 aa  226  3e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.489053 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2569  hypothetical protein  43.64 
 
 		 279 aa  226  4e-58  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3789  DNA utilization protein YhiR  41.61 
 
 		 280 aa  225  5.0000000000000005e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.201983  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0216  protein of unknown function DUF519  43.56 
 
 		 280 aa  225  6e-58  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3699  DNA utilization protein YhiR  43.56 
 
 		 280 aa  225  6e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0217  hypothetical protein  43.56 
 
 		 280 aa  225  6e-58  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3867  DNA utilization protein YhiR  41.61 
 
 		 280 aa  224  1e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3970  DNA utilization protein YhiR  41.61 
 
 		 280 aa  224  1e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3909  DNA utilization protein YhiR  41.61 
 
 		 280 aa  224  1e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4846  DNA utilization protein YhiR  43.18 
 
 		 280 aa  224  1e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.780347 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3801  DNA utilization protein YhiR  41.61 
 
 		 280 aa  224  1e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0098  hypothetical protein  44.77 
 
 		 281 aa  224  2e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3738  hypothetical protein  41.43 
 
 		 280 aa  224  2e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000524629 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1917  hypothetical protein  42.11 
 
 		 282 aa  222  4.9999999999999996e-57  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4472  protein of unknown function DUF519  40.28 
 
 		 280 aa  222  7e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.514564  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0009  protein of unknown function DUF519  42.42 
 
 		 280 aa  221  9.999999999999999e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4713  hypothetical protein  41.61 
 
 		 280 aa  220  1.9999999999999999e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1107  hypothetical protein  40.07 
 
 		 281 aa  219  5e-56  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3648  hypothetical protein  40.36 
 
 		 279 aa  218  1e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2581  hypothetical protein  40.28 
 
 		 290 aa  216  2e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.456932  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001953  hypothetical protein  41.58 
 
 		 279 aa  216  4e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3563  hypothetical protein  41.07 
 
 		 284 aa  215  5e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4204  protein of unknown function DUF519  43.32 
 
 		 281 aa  215  7e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0115  hypothetical protein  41.29 
 
 		 280 aa  215  7e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.795354  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4243  hypothetical protein  43.32 
 
 		 281 aa  215  7e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4048  hypothetical protein  41.29 
 
 		 280 aa  215  7e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.421411  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4377  hypothetical protein  43.32 
 
 		 281 aa  215  7e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4085  hypothetical protein  41.29 
 
 		 280 aa  215  8e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.515626 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4659  hypothetical protein  42.6 
 
 		 281 aa  214  9e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3922  hypothetical protein  42.24 
 
 		 281 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00525  hypothetical protein  41.09 
 
 		 285 aa  214  9.999999999999999e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3829  hypothetical protein  42.24 
 
 		 281 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.341276 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4038  hypothetical protein  42.24 
 
 		 281 aa  212  4.9999999999999996e-54  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3609  hypothetical protein  40.44 
 
 		 292 aa  210  2e-53  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4050  hypothetical protein  39.86 
 
 		 280 aa  209  4e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1259  hypothetical protein  36.84 
 
 		 282 aa  209  5e-53  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1258  hypothetical protein  36.49 
 
 		 282 aa  209  6e-53  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3858  hypothetical protein  40.79 
 
 		 285 aa  207  1e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0705  hypothetical protein  39.37 
 
 		 290 aa  207  2e-52  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1970  hypothetical protein  41.49 
 
 		 286 aa  206  3e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.445046  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0696  hypothetical protein  38.68 
 
 		 305 aa  203  3e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0788  hypothetical protein  44.16 
 
 		 289 aa  202  5e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0241921  normal  0.12768 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1731  hypothetical protein  41.75 
 
 		 286 aa  202  6e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.147763 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66340  hypothetical protein  39.78 
 
 		 278 aa  199  3e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5756  hypothetical protein  39.78 
 
 		 278 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0569  hypothetical protein  42.34 
 
 		 282 aa  198  9e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000849382 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1564  hypothetical protein  42.55 
 
 		 283 aa  196  2.0000000000000003e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4945  hypothetical protein  39.64 
 
 		 278 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45040  hypothetical protein  41.24 
 
 		 300 aa  196  4.0000000000000005e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4817  hypothetical protein  39.64 
 
 		 278 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2039  hypothetical protein  38.93 
 
 		 293 aa  195  7e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1090  protein of unknown function DUF519  41.18 
 
 		 290 aa  194  1e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0580192  hitchhiker  0.000491386 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>