154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_04743 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_04743  hypothetical protein  100 
 
 		 302 aa  617  1e-176  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0037  transformation competence-related protein  65.89 
 
 		 293 aa  405  1.0000000000000001e-112  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.932971  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1203  protein of unknown function DUF519  64.55 
 
 		 285 aa  402  1e-111  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.478331  normal  0.221337 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0029  hypothetical protein  65.22 
 
 		 293 aa  399  9.999999999999999e-111  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3789  DNA utilization protein YhiR  38.46 
 
 		 280 aa  219  3.9999999999999997e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.201983  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3801  DNA utilization protein YhiR  38.46 
 
 		 280 aa  218  7e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3867  DNA utilization protein YhiR  38.46 
 
 		 280 aa  218  7e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3909  DNA utilization protein YhiR  38.46 
 
 		 280 aa  218  7e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3970  DNA utilization protein YhiR  38.46 
 
 		 280 aa  218  7.999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3981  DNA utilization protein YhiR  39.51 
 
 		 280 aa  216  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4945  hypothetical protein  41.28 
 
 		 278 aa  215  9e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4817  hypothetical protein  41.28 
 
 		 278 aa  215  9e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03348  predicted DNA (exogenous) processing protein  39.16 
 
 		 280 aa  214  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.664942  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03301  hypothetical protein  39.16 
 
 		 280 aa  214  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.864633  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3788  DNA utilization protein YhiR  39.16 
 
 		 280 aa  214  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.489053 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3823  DNA utilization protein YhiR  39.16 
 
 		 280 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4048  hypothetical protein  37.79 
 
 		 280 aa  213  1.9999999999999998e-54  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.421411  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0115  hypothetical protein  37.79 
 
 		 280 aa  213  1.9999999999999998e-54  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.795354  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4846  DNA utilization protein YhiR  39.16 
 
 		 280 aa  213  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.780347 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3912  hypothetical protein  38.81 
 
 		 280 aa  213  2.9999999999999995e-54  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0216  protein of unknown function DUF519  39.16 
 
 		 280 aa  213  3.9999999999999995e-54  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0012  protein of unknown function DUF519  38.13 
 
 		 280 aa  213  3.9999999999999995e-54  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0217  hypothetical protein  39.16 
 
 		 280 aa  213  3.9999999999999995e-54  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3699  DNA utilization protein YhiR  39.16 
 
 		 280 aa  213  3.9999999999999995e-54  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1917  hypothetical protein  39.8 
 
 		 282 aa  211  1e-53  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4085  hypothetical protein  37.46 
 
 		 280 aa  211  1e-53  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.515626 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4994  hypothetical protein  41.28 
 
 		 278 aa  210  2e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1107  hypothetical protein  36.12 
 
 		 281 aa  209  6e-53  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5756  hypothetical protein  41.28 
 
 		 278 aa  208  9e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0523  hypothetical protein  41.61 
 
 		 278 aa  208  1e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0490056 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4187  hypothetical protein  37.29 
 
 		 280 aa  207  1e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0569  hypothetical protein  43.62 
 
 		 282 aa  207  1e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000849382 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66340  hypothetical protein  40.94 
 
 		 278 aa  207  2e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4713  hypothetical protein  37.63 
 
 		 280 aa  207  2e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0009  protein of unknown function DUF519  37.12 
 
 		 280 aa  206  3e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1938  hypothetical protein  40.4 
 
 		 287 aa  206  4e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2569  hypothetical protein  36.24 
 
 		 279 aa  205  6e-52  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45040  hypothetical protein  41.95 
 
 		 300 aa  205  7e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0121  hypothetical protein  35.91 
 
 		 279 aa  203  3e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4472  protein of unknown function DUF519  36.61 
 
 		 280 aa  203  3e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.514564  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1970  hypothetical protein  40.6 
 
 		 286 aa  202  6e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.445046  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2581  hypothetical protein  37.54 
 
 		 290 aa  202  7e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.456932  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001953  hypothetical protein  34.9 
 
 		 279 aa  201  9.999999999999999e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3738  hypothetical protein  35.12 
 
 		 280 aa  201  9.999999999999999e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000524629 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0458  hypothetical protein  39.93 
 
 		 279 aa  200  3e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0983546  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00525  hypothetical protein  34.23 
 
 		 285 aa  199  3.9999999999999996e-50  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0027  protein of unknown function DUF519  40.06 
 
 		 312 aa  199  6e-50  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0764421  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0705  hypothetical protein  37.79 
 
 		 290 aa  197  2.0000000000000003e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1090  protein of unknown function DUF519  41.45 
 
 		 290 aa  196  6e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0580192  hitchhiker  0.000491386 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4772  hypothetical protein  38.59 
 
 		 278 aa  195  7e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.105142 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0293  protein of unknown function DUF519  43 
 
 		 275 aa  195  1e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.27928  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1236  protein of unknown function DUF519  41.12 
 
 		 289 aa  193  3e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.187373  hitchhiker  0.0000201181 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0696  hypothetical protein  37.13 
 
 		 305 aa  193  3e-48  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1668  protein of unknown function DUF519  41.41 
 
 		 281 aa  193  4e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0404  hypothetical protein  38.26 
 
 		 278 aa  192  6e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0898  hypothetical protein  37.91 
 
 		 286 aa  190  2e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.69089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1863  hypothetical protein  41.29 
 
 		 279 aa  190  2e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.302117  normal  0.857152 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0098  hypothetical protein  35.35 
 
 		 281 aa  189  4e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4050  hypothetical protein  36.18 
 
 		 280 aa  189  4e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0788  hypothetical protein  39.74 
 
 		 289 aa  189  5.999999999999999e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0241921  normal  0.12768 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2528  hypothetical protein  40.13 
 
 		 284 aa  188  7e-47  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.435498 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1483  hypothetical protein  39.6 
 
 		 273 aa  188  8e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3149  hypothetical protein  40.07 
 
 		 285 aa  188  1e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.264033  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2382  hypothetical protein  39.8 
 
 		 297 aa  187  1e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0256369  normal  0.814662 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0859  protein of unknown function DUF519  39.4 
 
 		 281 aa  187  2e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3205  hypothetical protein  33.89 
 
 		 295 aa  186  5e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0857675  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01957  hypothetical protein  35.33 
 
 		 292 aa  184  1.0000000000000001e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00454208  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3242  protein of unknown function DUF519  39.27 
 
 		 285 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4204  protein of unknown function DUF519  34.34 
 
 		 281 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4243  hypothetical protein  34.34 
 
 		 281 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4377  hypothetical protein  34.34 
 
 		 281 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3922  hypothetical protein  34.68 
 
 		 281 aa  183  4.0000000000000006e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0644  hypothetical protein  35.36 
 
 		 291 aa  182  4.0000000000000006e-45  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00103865  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3563  hypothetical protein  33.33 
 
 		 284 aa  182  8.000000000000001e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1564  hypothetical protein  38.28 
 
 		 283 aa  182  9.000000000000001e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1413  hypothetical protein  36.7 
 
 		 289 aa  181  1e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3566  protein of unknown function DUF519  38.61 
 
 		 285 aa  181  2e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0127057  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1180  hypothetical protein  38.24 
 
 		 285 aa  181  2e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.573551  normal  0.143297 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3609  hypothetical protein  35.02 
 
 		 292 aa  181  2e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3829  hypothetical protein  34.34 
 
 		 281 aa  180  2e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.341276 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1731  hypothetical protein  39.09 
 
 		 286 aa  180  2e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.147763 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4038  hypothetical protein  34.34 
 
 		 281 aa  179  4e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1377  hypothetical protein  38.61 
 
 		 285 aa  179  4.999999999999999e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0826832  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5542  hypothetical protein  37.67 
 
 		 281 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.467777 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2238  hypothetical protein  37.12 
 
 		 281 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2040  hypothetical protein  36.82 
 
 		 304 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.894173  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5822  protein of unknown function DUF519  41.22 
 
 		 282 aa  178  9e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4659  hypothetical protein  34.01 
 
 		 281 aa  178  1e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1284  hypothetical protein  37.83 
 
 		 285 aa  177  1e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0995661 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2736  hypothetical protein  36.45 
 
 		 281 aa  177  2e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.855465  normal  0.779892 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5863  hypothetical protein  37.33 
 
 		 281 aa  177  2e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2252  hypothetical protein  38 
 
 		 281 aa  177  2e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.64987  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2214  hypothetical protein  37.33 
 
 		 281 aa  177  2e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3389  DNA (exogenous) processing protein  33.44 
 
 		 284 aa  177  2e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1063  hypothetical protein  38.33 
 
 		 281 aa  177  2e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0632007  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2131  hypothetical protein  37.67 
 
 		 281 aa  177  3e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.553822  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2039  hypothetical protein  34.28 
 
 		 293 aa  176  3e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3648  hypothetical protein  31.99 
 
 		 279 aa  176  3e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2730  hypothetical protein  38.06 
 
 		 286 aa  176  5e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5263  hypothetical protein  40.55 
 
 		 282 aa  176  6e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.447718 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>