154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_01957 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_01957  hypothetical protein  100 
 
 		 292 aa  610  9.999999999999999e-175  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00454208  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2039  hypothetical protein  43.23 
 
 		 293 aa  238  9e-62  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001953  hypothetical protein  40.52 
 
 		 279 aa  208  7e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3789  DNA utilization protein YhiR  38.7 
 
 		 280 aa  204  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.201983  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3801  DNA utilization protein YhiR  38.7 
 
 		 280 aa  203  3e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3867  DNA utilization protein YhiR  38.7 
 
 		 280 aa  203  3e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3909  DNA utilization protein YhiR  38.7 
 
 		 280 aa  203  3e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3970  DNA utilization protein YhiR  38.7 
 
 		 280 aa  203  3e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2569  hypothetical protein  39.03 
 
 		 279 aa  203  3e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3912  hypothetical protein  40.89 
 
 		 280 aa  202  4e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3205  hypothetical protein  36.57 
 
 		 295 aa  200  1.9999999999999998e-50  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0857675  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3738  hypothetical protein  38.49 
 
 		 280 aa  201  1.9999999999999998e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000524629 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00525  hypothetical protein  39.03 
 
 		 285 aa  200  1.9999999999999998e-50  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1668  protein of unknown function DUF519  40.29 
 
 		 281 aa  199  3.9999999999999996e-50  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4713  hypothetical protein  39.41 
 
 		 280 aa  199  6e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0009  protein of unknown function DUF519  38.81 
 
 		 280 aa  198  7e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03348  predicted DNA (exogenous) processing protein  39.78 
 
 		 280 aa  197  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.664942  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03301  hypothetical protein  39.78 
 
 		 280 aa  197  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.864633  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4846  DNA utilization protein YhiR  39.78 
 
 		 280 aa  197  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.780347 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3823  DNA utilization protein YhiR  39.78 
 
 		 280 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3981  DNA utilization protein YhiR  39.78 
 
 		 280 aa  197  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3788  DNA utilization protein YhiR  39.78 
 
 		 280 aa  197  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.489053 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0216  protein of unknown function DUF519  39.78 
 
 		 280 aa  196  3e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3699  DNA utilization protein YhiR  39.78 
 
 		 280 aa  196  3e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0217  hypothetical protein  39.78 
 
 		 280 aa  196  3e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0121  hypothetical protein  39.41 
 
 		 279 aa  195  1e-48  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1203  protein of unknown function DUF519  39.6 
 
 		 285 aa  193  2e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.478331  normal  0.221337 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1806  hypothetical protein  40.79 
 
 		 280 aa  193  3e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000978689 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4187  hypothetical protein  39.41 
 
 		 280 aa  192  7e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3566  protein of unknown function DUF519  37.28 
 
 		 285 aa  192  8e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0127057  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3368  hypothetical protein  38.35 
 
 		 285 aa  191  1e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1413  hypothetical protein  37.72 
 
 		 289 aa  189  4e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4085  hypothetical protein  36.05 
 
 		 280 aa  189  5e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.515626 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4472  protein of unknown function DUF519  38.66 
 
 		 280 aa  189  5.999999999999999e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.514564  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0012  protein of unknown function DUF519  36.8 
 
 		 280 aa  189  5.999999999999999e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4048  hypothetical protein  37.31 
 
 		 280 aa  188  7e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.421411  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0115  hypothetical protein  37.31 
 
 		 280 aa  188  7e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.795354  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3242  protein of unknown function DUF519  36.92 
 
 		 285 aa  188  1e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2238  hypothetical protein  37.37 
 
 		 281 aa  187  2e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5542  hypothetical protein  37.02 
 
 		 281 aa  186  5e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.467777 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5863  hypothetical protein  37.37 
 
 		 281 aa  186  5e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2214  hypothetical protein  37.37 
 
 		 281 aa  186  5e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3717  hypothetical protein  38.6 
 
 		 280 aa  185  6e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2131  hypothetical protein  36.55 
 
 		 281 aa  185  6e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.553822  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1807  hypothetical protein  39.85 
 
 		 281 aa  185  8e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2252  hypothetical protein  36.55 
 
 		 281 aa  185  9e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.64987  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04743  hypothetical protein  35.33 
 
 		 302 aa  184  1.0000000000000001e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3858  hypothetical protein  36.86 
 
 		 285 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1063  hypothetical protein  37.28 
 
 		 281 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0632007  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2040  hypothetical protein  36.9 
 
 		 304 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.894173  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0503  hypothetical protein  37.24 
 
 		 301 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0599  hypothetical protein  37.24 
 
 		 281 aa  183  3e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.558917  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0874  hypothetical protein  36.9 
 
 		 301 aa  182  6e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.148142  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0920  hypothetical protein  36.9 
 
 		 281 aa  182  7e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.202828  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1916  hypothetical protein  36.9 
 
 		 301 aa  182  8.000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0874325  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1019  hypothetical protein  39.62 
 
 		 289 aa  181  9.000000000000001e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0859  protein of unknown function DUF519  38.33 
 
 		 281 aa  180  2.9999999999999997e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4055  hypothetical protein  36.61 
 
 		 299 aa  180  2.9999999999999997e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4050  hypothetical protein  36.99 
 
 		 280 aa  179  2.9999999999999997e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2736  hypothetical protein  38.23 
 
 		 281 aa  179  4e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.855465  normal  0.779892 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3158  putative protein involved in catabolism of external DNA  36.3 
 
 		 281 aa  179  4e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.334057 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1107  hypothetical protein  34.69 
 
 		 281 aa  179  4e-44  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0020  hypothetical protein  36.55 
 
 		 281 aa  179  4e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0292  hypothetical protein  38.04 
 
 		 279 aa  179  4.999999999999999e-44  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.866126  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1963  hypothetical protein  36.56 
 
 		 281 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0614068  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3648  hypothetical protein  37.41 
 
 		 279 aa  179  7e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1888  hypothetical protein  37.05 
 
 		 285 aa  177  1e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1377  hypothetical protein  36.3 
 
 		 285 aa  177  2e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0826832  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0898  hypothetical protein  36.2 
 
 		 286 aa  177  2e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.69089  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1391  protein of unknown function DUF519  35.27 
 
 		 308 aa  176  6e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.443033  hitchhiker  0.00435595 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1053  hypothetical protein  34.46 
 
 		 282 aa  175  9e-43  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3389  DNA (exogenous) processing protein  37.18 
 
 		 284 aa  175  9e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3609  hypothetical protein  35.48 
 
 		 292 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3563  hypothetical protein  36.19 
 
 		 284 aa  173  3.9999999999999995e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1917  hypothetical protein  36.3 
 
 		 282 aa  171  1e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5915  hypothetical protein  35.94 
 
 		 290 aa  171  1e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.492755  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0029  hypothetical protein  35.06 
 
 		 293 aa  171  2e-41  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1938  hypothetical protein  34.68 
 
 		 287 aa  170  2e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1258  hypothetical protein  33.69 
 
 		 282 aa  170  3e-41  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66340  hypothetical protein  34.02 
 
 		 278 aa  170  3e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5756  hypothetical protein  33.79 
 
 		 278 aa  169  4e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1259  hypothetical protein  33.69 
 
 		 282 aa  168  7e-41  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0602  protein of unknown function DUF519  36.45 
 
 		 296 aa  169  7e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0037  transformation competence-related protein  35.06 
 
 		 293 aa  167  2e-40  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.932971  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0720  hypothetical protein  33.22 
 
 		 318 aa  167  2e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.802576  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1180  hypothetical protein  33.1 
 
 		 285 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.573551  normal  0.143297 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4945  hypothetical protein  32.65 
 
 		 278 aa  166  4e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3149  hypothetical protein  35 
 
 		 285 aa  166  4e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.264033  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4817  hypothetical protein  32.65 
 
 		 278 aa  166  4e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0623  hypothetical protein  36.45 
 
 		 296 aa  166  5.9999999999999996e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.757011  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0098  hypothetical protein  33.79 
 
 		 281 aa  165  9e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1284  hypothetical protein  32.74 
 
 		 285 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0995661 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0163  hypothetical protein  35.42 
 
 		 280 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.243099  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0143  hypothetical protein  35.66 
 
 		 280 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4204  protein of unknown function DUF519  33.11 
 
 		 281 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4243  hypothetical protein  33.11 
 
 		 281 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4377  hypothetical protein  33.11 
 
 		 281 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0369  hypothetical protein  37.59 
 
 		 260 aa  163  3e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2013  hypothetical protein  37.59 
 
 		 260 aa  163  3e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0102184  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3310  hypothetical protein  36.82 
 
 		 292 aa  162  9e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>