154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE0292 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE0292  hypothetical protein  100 
 
 		 279 aa  575  1.0000000000000001e-163  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.866126  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3609  hypothetical protein  36.92 
 
 		 292 aa  189  5.999999999999999e-47  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001953  hypothetical protein  35.25 
 
 		 279 aa  187  1e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0859  protein of unknown function DUF519  37.36 
 
 		 281 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3829  hypothetical protein  37.96 
 
 		 281 aa  182  4.0000000000000006e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.341276 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3922  hypothetical protein  37.96 
 
 		 281 aa  182  4.0000000000000006e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3563  hypothetical protein  35.84 
 
 		 284 aa  183  4.0000000000000006e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4038  hypothetical protein  37.96 
 
 		 281 aa  182  7e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4243  hypothetical protein  37.28 
 
 		 281 aa  181  1e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4377  hypothetical protein  37.28 
 
 		 281 aa  181  1e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4204  protein of unknown function DUF519  37.28 
 
 		 281 aa  181  1e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4659  hypothetical protein  36.43 
 
 		 281 aa  180  2e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00525  hypothetical protein  34.17 
 
 		 285 aa  180  2e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0098  hypothetical protein  37.23 
 
 		 281 aa  179  2.9999999999999997e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01957  hypothetical protein  38.04 
 
 		 292 aa  179  4.999999999999999e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00454208  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2569  hypothetical protein  32.97 
 
 		 279 aa  178  1e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0143  hypothetical protein  37.96 
 
 		 280 aa  177  2e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3648  hypothetical protein  37.23 
 
 		 279 aa  176  5e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0163  hypothetical protein  38.01 
 
 		 280 aa  176  5e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.243099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4050  hypothetical protein  36.46 
 
 		 280 aa  176  5e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3858  hypothetical protein  34.32 
 
 		 285 aa  173  3.9999999999999995e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2039  hypothetical protein  36.59 
 
 		 293 aa  172  5.999999999999999e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1917  hypothetical protein  34.07 
 
 		 282 aa  171  1e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1107  hypothetical protein  35.23 
 
 		 281 aa  170  3e-41  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2736  hypothetical protein  35.94 
 
 		 281 aa  169  6e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.855465  normal  0.779892 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1019  hypothetical protein  37.26 
 
 		 289 aa  169  6e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4187  hypothetical protein  32.13 
 
 		 280 aa  168  8e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0579  hypothetical protein  36.8 
 
 		 257 aa  167  1e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0365448  normal  0.281222 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3205  hypothetical protein  34.48 
 
 		 295 aa  167  2e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0857675  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0121  hypothetical protein  34.41 
 
 		 279 aa  167  2e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0012  protein of unknown function DUF519  30.69 
 
 		 280 aa  167  2e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3717  hypothetical protein  33.21 
 
 		 280 aa  167  2e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2013  hypothetical protein  36.17 
 
 		 260 aa  166  4e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0102184  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3738  hypothetical protein  34.53 
 
 		 280 aa  166  4e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000524629 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0369  hypothetical protein  36.17 
 
 		 260 aa  166  5e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0009  protein of unknown function DUF519  31.69 
 
 		 280 aa  165  9e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0216  protein of unknown function DUF519  31.56 
 
 		 280 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4048  hypothetical protein  32.73 
 
 		 280 aa  163  2.0000000000000002e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.421411  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3699  DNA utilization protein YhiR  31.56 
 
 		 280 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0217  hypothetical protein  31.56 
 
 		 280 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0115  hypothetical protein  32.73 
 
 		 280 aa  163  2.0000000000000002e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.795354  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4713  hypothetical protein  32.61 
 
 		 280 aa  163  3e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4085  hypothetical protein  32.12 
 
 		 280 aa  163  3e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.515626 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03348  predicted DNA (exogenous) processing protein  31.21 
 
 		 280 aa  162  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.664942  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03301  hypothetical protein  31.21 
 
 		 280 aa  162  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.864633  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3970  DNA utilization protein YhiR  31.39 
 
 		 280 aa  162  4.0000000000000004e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3823  DNA utilization protein YhiR  31.21 
 
 		 280 aa  162  4.0000000000000004e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4472  protein of unknown function DUF519  31.77 
 
 		 280 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.514564  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3789  DNA utilization protein YhiR  31.39 
 
 		 280 aa  163  4.0000000000000004e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.201983  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3912  hypothetical protein  31.8 
 
 		 280 aa  162  4.0000000000000004e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3788  DNA utilization protein YhiR  31.21 
 
 		 280 aa  162  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.489053 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3801  DNA utilization protein YhiR  31.39 
 
 		 280 aa  162  5.0000000000000005e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3867  DNA utilization protein YhiR  31.39 
 
 		 280 aa  162  5.0000000000000005e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3909  DNA utilization protein YhiR  31.39 
 
 		 280 aa  162  5.0000000000000005e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0475  hypothetical protein  36.5 
 
 		 259 aa  162  6e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.499183  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3981  DNA utilization protein YhiR  31.21 
 
 		 280 aa  162  6e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4846  DNA utilization protein YhiR  30.85 
 
 		 280 aa  161  1e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.780347 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1668  protein of unknown function DUF519  34.19 
 
 		 281 aa  159  5e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3158  putative protein involved in catabolism of external DNA  34.66 
 
 		 281 aa  158  8e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.334057 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3566  protein of unknown function DUF519  33.21 
 
 		 285 aa  158  1e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0127057  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3242  protein of unknown function DUF519  33.46 
 
 		 285 aa  157  2e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1916  hypothetical protein  32.85 
 
 		 301 aa  155  9e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0874325  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0747  hypothetical protein  33.8 
 
 		 311 aa  155  9e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.141291 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0599  hypothetical protein  32.85 
 
 		 281 aa  155  9e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.558917  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4055  hypothetical protein  30.56 
 
 		 299 aa  155  1e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0503  hypothetical protein  32.85 
 
 		 301 aa  154  1e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0872  hypothetical protein  34.07 
 
 		 257 aa  154  2e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2040  hypothetical protein  32.85 
 
 		 304 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.894173  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0874  hypothetical protein  32.48 
 
 		 301 aa  152  4e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.148142  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2238  hypothetical protein  33.45 
 
 		 281 aa  152  4e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1391  protein of unknown function DUF519  33.21 
 
 		 308 aa  152  5e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.443033  hitchhiker  0.00435595 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5863  hypothetical protein  33.69 
 
 		 281 aa  152  5e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2214  hypothetical protein  33.69 
 
 		 281 aa  152  5e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04743  hypothetical protein  32.32 
 
 		 302 aa  152  5.9999999999999996e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0920  hypothetical protein  32.48 
 
 		 281 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.202828  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5822  protein of unknown function DUF519  31.77 
 
 		 282 aa  152  7e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5915  hypothetical protein  33.22 
 
 		 290 aa  152  8e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.492755  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1938  hypothetical protein  32.5 
 
 		 287 aa  150  2e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2832  hypothetical protein  35.06 
 
 		 280 aa  150  3e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0974694  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1413  hypothetical protein  32.99 
 
 		 289 aa  149  3e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1807  hypothetical protein  31.07 
 
 		 281 aa  149  4e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0020  hypothetical protein  32.12 
 
 		 281 aa  149  4e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1963  hypothetical protein  32.48 
 
 		 281 aa  149  4e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0614068  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0720  hypothetical protein  30.85 
 
 		 318 aa  148  8e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.802576  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3368  hypothetical protein  33.09 
 
 		 285 aa  147  1.0000000000000001e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3389  DNA (exogenous) processing protein  30.91 
 
 		 284 aa  147  1.0000000000000001e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1180  hypothetical protein  30.58 
 
 		 285 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.573551  normal  0.143297 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0898  hypothetical protein  33.45 
 
 		 286 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.69089  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5542  hypothetical protein  32.48 
 
 		 281 aa  147  3e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.467777 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1888  hypothetical protein  33.83 
 
 		 285 aa  146  3e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1483  hypothetical protein  33.7 
 
 		 273 aa  147  3e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1806  hypothetical protein  32.13 
 
 		 280 aa  146  4.0000000000000006e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000978689 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1377  hypothetical protein  31.69 
 
 		 285 aa  146  5e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0826832  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2252  hypothetical protein  31.54 
 
 		 281 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.64987  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0705  hypothetical protein  31.2 
 
 		 290 aa  145  9e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1284  hypothetical protein  30.58 
 
 		 285 aa  144  1e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0995661 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2267  hypothetical protein  33.08 
 
 		 282 aa  144  1e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.28225  normal  0.352354 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4114  hypothetical protein  30.1 
 
 		 332 aa  144  2e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2581  hypothetical protein  30.69 
 
 		 290 aa  144  2e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.456932  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2131  hypothetical protein  31.18 
 
 		 281 aa  143  2e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.553822  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>