155 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_2736 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_2736  hypothetical protein  100 
 
 		 281 aa  575  1.0000000000000001e-163  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.855465  normal  0.779892 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3368  hypothetical protein  60 
 
 		 285 aa  368  1e-101  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3242  protein of unknown function DUF519  59.65 
 
 		 285 aa  366  1e-100  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3566  protein of unknown function DUF519  59.65 
 
 		 285 aa  367  1e-100  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0127057  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1888  hypothetical protein  59.57 
 
 		 285 aa  353  1e-96  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1377  hypothetical protein  57.6 
 
 		 285 aa  350  1e-95  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0826832  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3158  putative protein involved in catabolism of external DNA  56.32 
 
 		 281 aa  344  1e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.334057 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1963  hypothetical protein  55.96 
 
 		 281 aa  342  4e-93  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0614068  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1807  hypothetical protein  58.48 
 
 		 281 aa  340  2e-92  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2238  hypothetical protein  56.32 
 
 		 281 aa  340  2e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5542  hypothetical protein  55.96 
 
 		 281 aa  338  5e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.467777 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1063  hypothetical protein  55.96 
 
 		 281 aa  338  9e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0632007  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0599  hypothetical protein  54.45 
 
 		 281 aa  337  9.999999999999999e-92  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.558917  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1391  protein of unknown function DUF519  54.87 
 
 		 308 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.443033  hitchhiker  0.00435595 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2252  hypothetical protein  55.96 
 
 		 281 aa  336  2.9999999999999997e-91  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.64987  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0503  hypothetical protein  54.45 
 
 		 301 aa  335  2.9999999999999997e-91  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2131  hypothetical protein  55.6 
 
 		 281 aa  335  3.9999999999999995e-91  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.553822  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5863  hypothetical protein  55.6 
 
 		 281 aa  335  5e-91  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2214  hypothetical protein  55.6 
 
 		 281 aa  335  5e-91  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1916  hypothetical protein  54.45 
 
 		 301 aa  335  5.999999999999999e-91  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0874325  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0920  hypothetical protein  54.09 
 
 		 281 aa  334  7.999999999999999e-91  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.202828  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0874  hypothetical protein  54.09 
 
 		 301 aa  334  9e-91  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.148142  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2040  hypothetical protein  53.74 
 
 		 304 aa  333  2e-90  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.894173  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0020  hypothetical protein  53.74 
 
 		 281 aa  331  7.000000000000001e-90  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1806  hypothetical protein  49.82 
 
 		 280 aa  302  5.000000000000001e-81  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000978689 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1668  protein of unknown function DUF519  53.43 
 
 		 281 aa  299  4e-80  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3717  hypothetical protein  48.75 
 
 		 280 aa  284  1.0000000000000001e-75  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5915  hypothetical protein  47.22 
 
 		 290 aa  265  8e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.492755  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1788  hypothetical protein  47.08 
 
 		 293 aa  263  3e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.192563  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3981  DNA utilization protein YhiR  48.53 
 
 		 280 aa  262  4.999999999999999e-69  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0602  protein of unknown function DUF519  47.96 
 
 		 296 aa  262  6e-69  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03348  predicted DNA (exogenous) processing protein  48.53 
 
 		 280 aa  261  8.999999999999999e-69  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.664942  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03301  hypothetical protein  48.53 
 
 		 280 aa  261  8.999999999999999e-69  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.864633  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3788  DNA utilization protein YhiR  48.53 
 
 		 280 aa  261  8.999999999999999e-69  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.489053 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3823  DNA utilization protein YhiR  48.53 
 
 		 280 aa  260  1e-68  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4846  DNA utilization protein YhiR  48.53 
 
 		 280 aa  261  1e-68  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.780347 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3970  DNA utilization protein YhiR  48.16 
 
 		 280 aa  260  2e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3867  DNA utilization protein YhiR  48.16 
 
 		 280 aa  259  2e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3801  DNA utilization protein YhiR  48.16 
 
 		 280 aa  259  2e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3909  DNA utilization protein YhiR  48.16 
 
 		 280 aa  259  2e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0623  hypothetical protein  47.96 
 
 		 296 aa  259  2e-68  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.757011  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3789  DNA utilization protein YhiR  48.16 
 
 		 280 aa  260  2e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.201983  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4055  hypothetical protein  46.8 
 
 		 299 aa  258  6e-68  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3912  hypothetical protein  47.74 
 
 		 280 aa  258  6e-68  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0012  protein of unknown function DUF519  47.74 
 
 		 280 aa  258  7e-68  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1413  hypothetical protein  47.22 
 
 		 289 aa  258  8e-68  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0216  protein of unknown function DUF519  47.79 
 
 		 280 aa  256  4e-67  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3699  DNA utilization protein YhiR  47.79 
 
 		 280 aa  256  4e-67  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0217  hypothetical protein  47.79 
 
 		 280 aa  256  4e-67  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0009  protein of unknown function DUF519  48.12 
 
 		 280 aa  253  2.0000000000000002e-66  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4713  hypothetical protein  48.12 
 
 		 280 aa  253  2.0000000000000002e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4085  hypothetical protein  48.5 
 
 		 280 aa  253  2.0000000000000002e-66  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.515626 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4187  hypothetical protein  46.74 
 
 		 280 aa  253  3e-66  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0115  hypothetical protein  48.5 
 
 		 280 aa  252  4.0000000000000004e-66  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.795354  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4048  hypothetical protein  48.5 
 
 		 280 aa  252  4.0000000000000004e-66  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.421411  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3738  hypothetical protein  45.29 
 
 		 280 aa  252  6e-66  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000524629 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1107  hypothetical protein  47.25 
 
 		 281 aa  249  5e-65  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4472  protein of unknown function DUF519  46.01 
 
 		 280 aa  246  2e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.514564  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0720  hypothetical protein  43.35 
 
 		 318 aa  246  2e-64  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.802576  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3389  DNA (exogenous) processing protein  44.24 
 
 		 284 aa  246  4e-64  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3648  hypothetical protein  45.76 
 
 		 279 aa  246  4e-64  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1917  hypothetical protein  46.89 
 
 		 282 aa  244  9e-64  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3563  hypothetical protein  45.77 
 
 		 284 aa  242  5e-63  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0121  hypothetical protein  45.39 
 
 		 279 aa  242  5e-63  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1053  hypothetical protein  44.73 
 
 		 282 aa  241  7.999999999999999e-63  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4659  hypothetical protein  46.15 
 
 		 281 aa  241  9e-63  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4114  hypothetical protein  41.64 
 
 		 332 aa  241  1e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2569  hypothetical protein  45.39 
 
 		 279 aa  241  1e-62  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3829  hypothetical protein  46.52 
 
 		 281 aa  240  2e-62  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.341276 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3922  hypothetical protein  46.52 
 
 		 281 aa  240  2e-62  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4038  hypothetical protein  46.52 
 
 		 281 aa  240  2e-62  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0098  hypothetical protein  46.89 
 
 		 281 aa  239  2e-62  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3609  hypothetical protein  45.96 
 
 		 292 aa  239  4e-62  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001953  hypothetical protein  45.02 
 
 		 279 aa  238  6.999999999999999e-62  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4204  protein of unknown function DUF519  46.15 
 
 		 281 aa  237  1e-61  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4243  hypothetical protein  46.15 
 
 		 281 aa  237  1e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4377  hypothetical protein  46.15 
 
 		 281 aa  237  1e-61  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3858  hypothetical protein  45.05 
 
 		 285 aa  236  3e-61  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66340  hypothetical protein  43.33 
 
 		 278 aa  236  4e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4050  hypothetical protein  45 
 
 		 280 aa  235  8e-61  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5756  hypothetical protein  43.33 
 
 		 278 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00525  hypothetical protein  43.91 
 
 		 285 aa  233  2.0000000000000002e-60  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0496  hypothetical protein  39.47 
 
 		 340 aa  232  5e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0143  hypothetical protein  43.57 
 
 		 280 aa  231  9e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45040  hypothetical protein  45.56 
 
 		 300 aa  230  2e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0163  hypothetical protein  44.48 
 
 		 280 aa  229  3e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.243099  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4679  protein of unknown function DUF519  41.82 
 
 		 320 aa  226  4e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0752119  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3205  hypothetical protein  39.38 
 
 		 295 aa  220  1.9999999999999999e-56  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0857675  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0569  hypothetical protein  43.7 
 
 		 282 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000849382 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4772  hypothetical protein  43.33 
 
 		 278 aa  218  6e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.105142 
 
 
-
 
NC_004310  BR0705  hypothetical protein  41.49 
 
 		 290 aa  218  8.999999999999998e-56  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1564  hypothetical protein  43.17 
 
 		 283 aa  218  1e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2581  hypothetical protein  40.28 
 
 		 290 aa  216  2.9999999999999998e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.456932  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0404  hypothetical protein  42.8 
 
 		 278 aa  215  7e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1090  protein of unknown function DUF519  41.48 
 
 		 290 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0580192  hitchhiker  0.000491386 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1731  hypothetical protein  39.79 
 
 		 286 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.147763 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0696  hypothetical protein  40.78 
 
 		 305 aa  213  1.9999999999999998e-54  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1284  hypothetical protein  39.36 
 
 		 285 aa  212  3.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0995661 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1236  protein of unknown function DUF519  41.11 
 
 		 289 aa  211  7e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.187373  hitchhiker  0.0000201181 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4945  hypothetical protein  41.7 
 
 		 278 aa  210  2e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>