154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_1019 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_1019  hypothetical protein  100 
 
 		 289 aa  592  1e-168  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2039  hypothetical protein  45.21 
 
 		 293 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1917  hypothetical protein  40.56 
 
 		 282 aa  216  5e-55  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2569  hypothetical protein  40.7 
 
 		 279 aa  210  2e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0859  protein of unknown function DUF519  41.9 
 
 		 281 aa  209  6e-53  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0012  protein of unknown function DUF519  39.24 
 
 		 280 aa  205  9e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3205  hypothetical protein  35.79 
 
 		 295 aa  201  9.999999999999999e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0857675  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0121  hypothetical protein  38.46 
 
 		 279 aa  201  9.999999999999999e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3648  hypothetical protein  42.39 
 
 		 279 aa  200  1.9999999999999998e-50  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001953  hypothetical protein  39.3 
 
 		 279 aa  201  1.9999999999999998e-50  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0009  protein of unknown function DUF519  37.98 
 
 		 280 aa  199  3.9999999999999996e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0216  protein of unknown function DUF519  36.81 
 
 		 280 aa  197  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3912  hypothetical protein  36.46 
 
 		 280 aa  197  1.0000000000000001e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3699  DNA utilization protein YhiR  36.81 
 
 		 280 aa  197  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4713  hypothetical protein  37.04 
 
 		 280 aa  197  1.0000000000000001e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0217  hypothetical protein  36.81 
 
 		 280 aa  197  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3823  DNA utilization protein YhiR  37.15 
 
 		 280 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4846  DNA utilization protein YhiR  36.81 
 
 		 280 aa  197  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.780347 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3789  DNA utilization protein YhiR  36.81 
 
 		 280 aa  197  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.201983  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03348  predicted DNA (exogenous) processing protein  36.81 
 
 		 280 aa  196  3e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.664942  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3788  DNA utilization protein YhiR  36.81 
 
 		 280 aa  196  3e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.489053 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03301  hypothetical protein  36.81 
 
 		 280 aa  196  3e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.864633  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3981  DNA utilization protein YhiR  36.81 
 
 		 280 aa  196  3e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4050  hypothetical protein  39.49 
 
 		 280 aa  196  3e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3801  DNA utilization protein YhiR  36.81 
 
 		 280 aa  196  4.0000000000000005e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3909  DNA utilization protein YhiR  36.81 
 
 		 280 aa  196  4.0000000000000005e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3867  DNA utilization protein YhiR  36.81 
 
 		 280 aa  196  4.0000000000000005e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1107  hypothetical protein  36.84 
 
 		 281 aa  196  5.000000000000001e-49  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3970  DNA utilization protein YhiR  36.81 
 
 		 280 aa  196  5.000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3738  hypothetical protein  36.14 
 
 		 280 aa  196  5.000000000000001e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000524629 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00525  hypothetical protein  37.98 
 
 		 285 aa  196  5.000000000000001e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4187  hypothetical protein  39.13 
 
 		 280 aa  195  6e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3566  protein of unknown function DUF519  40.48 
 
 		 285 aa  195  7e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0127057  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2730  hypothetical protein  38.11 
 
 		 286 aa  195  7e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0163  hypothetical protein  39.79 
 
 		 280 aa  194  1e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.243099  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3609  hypothetical protein  42.64 
 
 		 292 aa  194  2e-48  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4204  protein of unknown function DUF519  40.91 
 
 		 281 aa  192  5e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4243  hypothetical protein  40.91 
 
 		 281 aa  192  5e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4377  hypothetical protein  40.91 
 
 		 281 aa  192  5e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3242  protein of unknown function DUF519  39.79 
 
 		 285 aa  191  8e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1807  hypothetical protein  41.05 
 
 		 281 aa  191  8e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4085  hypothetical protein  37.54 
 
 		 280 aa  191  1e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.515626 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4048  hypothetical protein  37.54 
 
 		 280 aa  190  2e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.421411  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0115  hypothetical protein  37.54 
 
 		 280 aa  190  2e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.795354  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01957  hypothetical protein  38.51 
 
 		 292 aa  189  2.9999999999999997e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00454208  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4472  protein of unknown function DUF519  38.77 
 
 		 280 aa  189  4e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.514564  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1377  hypothetical protein  39.58 
 
 		 285 aa  189  4e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0826832  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1970  hypothetical protein  37.15 
 
 		 286 aa  189  5.999999999999999e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.445046  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0098  hypothetical protein  40 
 
 		 281 aa  188  9e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1284  hypothetical protein  36.68 
 
 		 285 aa  188  1e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0995661 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2736  hypothetical protein  40.7 
 
 		 281 aa  186  3e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.855465  normal  0.779892 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3829  hypothetical protein  39.65 
 
 		 281 aa  186  3e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.341276 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0143  hypothetical protein  38.03 
 
 		 280 aa  186  3e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3922  hypothetical protein  39.65 
 
 		 281 aa  186  5e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4659  hypothetical protein  38.95 
 
 		 281 aa  185  7e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4038  hypothetical protein  39.65 
 
 		 281 aa  185  8e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1258  hypothetical protein  38.04 
 
 		 282 aa  183  2.0000000000000003e-45  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1180  hypothetical protein  33.8 
 
 		 285 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.573551  normal  0.143297 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1564  hypothetical protein  37.76 
 
 		 283 aa  183  2.0000000000000003e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3858  hypothetical protein  38.25 
 
 		 285 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3389  DNA (exogenous) processing protein  35.44 
 
 		 284 aa  183  2.0000000000000003e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1063  hypothetical protein  39.16 
 
 		 281 aa  183  3e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0632007  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1259  hypothetical protein  38.04 
 
 		 282 aa  182  5.0000000000000004e-45  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1888  hypothetical protein  37.72 
 
 		 285 aa  182  5.0000000000000004e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0599  hypothetical protein  38.46 
 
 		 281 aa  182  7e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.558917  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04743  hypothetical protein  36.39 
 
 		 302 aa  182  7e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3368  hypothetical protein  37.72 
 
 		 285 aa  181  1e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0881  protein of unknown function DUF519  36.93 
 
 		 282 aa  181  1e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.402966  normal  0.647337 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0503  hypothetical protein  38.46 
 
 		 301 aa  181  1e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5263  hypothetical protein  37.37 
 
 		 282 aa  180  2e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.447718 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5542  hypothetical protein  38.46 
 
 		 281 aa  181  2e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.467777 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0898  hypothetical protein  33.68 
 
 		 286 aa  181  2e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.69089  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2238  hypothetical protein  37.76 
 
 		 281 aa  180  2e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2581  hypothetical protein  35.29 
 
 		 290 aa  180  2.9999999999999997e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.456932  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0874  hypothetical protein  38.11 
 
 		 301 aa  179  4e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.148142  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0920  hypothetical protein  38.11 
 
 		 281 aa  179  4e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.202828  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2040  hypothetical protein  37.63 
 
 		 304 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.894173  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1916  hypothetical protein  38.11 
 
 		 301 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0874325  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5915  hypothetical protein  38.51 
 
 		 290 aa  179  5.999999999999999e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.492755  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1053  hypothetical protein  37.09 
 
 		 282 aa  179  7e-44  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5863  hypothetical protein  37.76 
 
 		 281 aa  178  7e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2214  hypothetical protein  37.76 
 
 		 281 aa  178  7e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1090  protein of unknown function DUF519  36.49 
 
 		 290 aa  178  8e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0580192  hitchhiker  0.000491386 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1963  hypothetical protein  37.41 
 
 		 281 aa  178  8e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0614068  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3563  hypothetical protein  35.79 
 
 		 284 aa  178  9e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1731  hypothetical protein  35.27 
 
 		 286 aa  178  9e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.147763 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2528  hypothetical protein  34.39 
 
 		 284 aa  177  2e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.435498 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0020  hypothetical protein  37.76 
 
 		 281 aa  177  2e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0788  hypothetical protein  36.93 
 
 		 289 aa  177  2e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0241921  normal  0.12768 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1806  hypothetical protein  36.97 
 
 		 280 aa  177  2e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000978689 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2252  hypothetical protein  37.76 
 
 		 281 aa  176  3e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.64987  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1413  hypothetical protein  37.72 
 
 		 289 aa  176  4e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0029  hypothetical protein  35.93 
 
 		 293 aa  176  5e-43  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0037  transformation competence-related protein  35.93 
 
 		 293 aa  176  6e-43  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.932971  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1668  protein of unknown function DUF519  38.25 
 
 		 281 aa  176  6e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3310  hypothetical protein  38.57 
 
 		 292 aa  175  6e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2131  hypothetical protein  37.41 
 
 		 281 aa  175  9e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.553822  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1236  protein of unknown function DUF519  36.84 
 
 		 289 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.187373  hitchhiker  0.0000201181 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2832  hypothetical protein  37.41 
 
 		 280 aa  174  9.999999999999999e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0974694  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5822  protein of unknown function DUF519  36.14 
 
 		 282 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>