156 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_5263 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_5263  hypothetical protein  100 
 
 		 282 aa  550  1e-156  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.447718 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5822  protein of unknown function DUF519  86.83 
 
 		 282 aa  487  1e-136  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0881  protein of unknown function DUF519  73.67 
 
 		 282 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.402966  normal  0.647337 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2267  hypothetical protein  75.44 
 
 		 282 aa  394  1e-108  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.28225  normal  0.352354 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0920  hypothetical protein  71.16 
 
 		 268 aa  375  1e-103  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.027603  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0856  protein of unknown function DUF519  72.45 
 
 		 268 aa  363  1e-99  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.587944 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1970  hypothetical protein  51.61 
 
 		 286 aa  279  5e-74  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.445046  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0788  hypothetical protein  49.82 
 
 		 289 aa  259  2e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0241921  normal  0.12768 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1564  hypothetical protein  48.19 
 
 		 283 aa  247  1e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2581  hypothetical protein  46.81 
 
 		 290 aa  245  4.9999999999999997e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.456932  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1090  protein of unknown function DUF519  48.38 
 
 		 290 aa  245  6e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0580192  hitchhiker  0.000491386 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3149  hypothetical protein  50 
 
 		 285 aa  245  6.999999999999999e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.264033  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0705  hypothetical protein  47.12 
 
 		 290 aa  243  1.9999999999999999e-63  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0696  hypothetical protein  47.12 
 
 		 305 aa  243  3e-63  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1236  protein of unknown function DUF519  47.46 
 
 		 289 aa  242  5e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.187373  hitchhiker  0.0000201181 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1180  hypothetical protein  46.07 
 
 		 285 aa  242  6e-63  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.573551  normal  0.143297 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0898  hypothetical protein  47.14 
 
 		 286 aa  240  2e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.69089  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0517  yhiR family protein  43.94 
 
 		 288 aa  239  4e-62  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.30636  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2730  hypothetical protein  50.53 
 
 		 286 aa  239  5e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2528  hypothetical protein  47.84 
 
 		 284 aa  236  2e-61  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.435498 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1284  hypothetical protein  46.07 
 
 		 285 aa  236  2e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0995661 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0747  hypothetical protein  47.14 
 
 		 311 aa  232  4.0000000000000004e-60  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.141291 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1731  hypothetical protein  46.26 
 
 		 286 aa  228  7e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.147763 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1365  protein of unknown function DUF519  47.67 
 
 		 285 aa  224  2e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.674549  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45040  hypothetical protein  46.67 
 
 		 300 aa  221  9.999999999999999e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0859  protein of unknown function DUF519  48.91 
 
 		 281 aa  216  2e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2569  hypothetical protein  42.32 
 
 		 279 aa  215  5e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4945  hypothetical protein  41.82 
 
 		 278 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4817  hypothetical protein  41.82 
 
 		 278 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3789  DNA utilization protein YhiR  42.65 
 
 		 280 aa  211  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.201983  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3912  hypothetical protein  42.28 
 
 		 280 aa  211  1e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3801  DNA utilization protein YhiR  42.65 
 
 		 280 aa  210  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0661  hypothetical protein  45.49 
 
 		 281 aa  210  2e-53  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.309668 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3970  DNA utilization protein YhiR  42.65 
 
 		 280 aa  210  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4187  hypothetical protein  40.59 
 
 		 280 aa  210  2e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3867  DNA utilization protein YhiR  42.65 
 
 		 280 aa  210  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3909  DNA utilization protein YhiR  42.65 
 
 		 280 aa  210  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0115  hypothetical protein  41.54 
 
 		 280 aa  209  6e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.795354  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4048  hypothetical protein  41.54 
 
 		 280 aa  209  6e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.421411  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4713  hypothetical protein  40.59 
 
 		 280 aa  208  6e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1938  hypothetical protein  47.64 
 
 		 287 aa  208  8e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0009  protein of unknown function DUF519  40.59 
 
 		 280 aa  208  8e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4085  hypothetical protein  41.54 
 
 		 280 aa  208  8e-53  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.515626 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0293  protein of unknown function DUF519  46.95 
 
 		 275 aa  206  2e-52  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.27928  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66340  hypothetical protein  42.8 
 
 		 278 aa  207  2e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4846  DNA utilization protein YhiR  41.33 
 
 		 280 aa  207  2e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.780347 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001953  hypothetical protein  40.59 
 
 		 279 aa  205  8e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5756  hypothetical protein  43.17 
 
 		 278 aa  205  8e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4472  protein of unknown function DUF519  40.96 
 
 		 280 aa  205  9e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.514564  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0523  hypothetical protein  42.18 
 
 		 278 aa  204  9e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0490056 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00525  hypothetical protein  40.52 
 
 		 285 aa  204  1e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03348  predicted DNA (exogenous) processing protein  40.96 
 
 		 280 aa  204  2e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.664942  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0216  protein of unknown function DUF519  40.96 
 
 		 280 aa  203  2e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03301  hypothetical protein  40.96 
 
 		 280 aa  204  2e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.864633  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3788  DNA utilization protein YhiR  40.96 
 
 		 280 aa  204  2e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.489053 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3823  DNA utilization protein YhiR  40.96 
 
 		 280 aa  204  2e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3699  DNA utilization protein YhiR  40.96 
 
 		 280 aa  203  2e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3981  DNA utilization protein YhiR  40.96 
 
 		 280 aa  204  2e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4994  hypothetical protein  41.82 
 
 		 278 aa  203  2e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0217  hypothetical protein  40.96 
 
 		 280 aa  203  2e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0012  protein of unknown function DUF519  38.91 
 
 		 280 aa  202  4e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0569  hypothetical protein  46.15 
 
 		 282 aa  202  6e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000849382 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0121  hypothetical protein  39.63 
 
 		 279 aa  201  9.999999999999999e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0404  hypothetical protein  42.07 
 
 		 278 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4772  hypothetical protein  41.39 
 
 		 278 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.105142 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1863  hypothetical protein  48.73 
 
 		 279 aa  200  1.9999999999999998e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.302117  normal  0.857152 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3389  DNA (exogenous) processing protein  37.59 
 
 		 284 aa  199  3e-50  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1483  hypothetical protein  44.4 
 
 		 273 aa  198  7e-50  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1592  protein of unknown function DUF519  45.99 
 
 		 285 aa  198  7.999999999999999e-50  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.495582 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1917  hypothetical protein  42.6 
 
 		 282 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3738  hypothetical protein  34.75 
 
 		 280 aa  196  4.0000000000000005e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000524629 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1107  hypothetical protein  38.08 
 
 		 281 aa  195  7e-49  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0458  hypothetical protein  42.07 
 
 		 279 aa  194  1e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0983546  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3205  hypothetical protein  35.59 
 
 		 295 aa  193  3e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0857675  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1807  hypothetical protein  40.44 
 
 		 281 aa  189  7e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1053  hypothetical protein  37.5 
 
 		 282 aa  181  1e-44  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1806  hypothetical protein  39.48 
 
 		 280 aa  180  2e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000978689 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0143  hypothetical protein  37.96 
 
 		 280 aa  179  7e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3858  hypothetical protein  38.6 
 
 		 285 aa  178  9e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1203  protein of unknown function DUF519  41.37 
 
 		 285 aa  178  9e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.478331  normal  0.221337 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3648  hypothetical protein  36.86 
 
 		 279 aa  177  1e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4050  hypothetical protein  36.06 
 
 		 280 aa  177  1e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0027  protein of unknown function DUF519  41.26 
 
 		 312 aa  177  2e-43  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0764421  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04743  hypothetical protein  41.5 
 
 		 302 aa  177  2e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0163  hypothetical protein  37.23 
 
 		 280 aa  176  4e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.243099  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3609  hypothetical protein  38.15 
 
 		 292 aa  176  5e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3922  hypothetical protein  37.5 
 
 		 281 aa  176  5e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0098  hypothetical protein  38.1 
 
 		 281 aa  176  5e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0475  hypothetical protein  41.5 
 
 		 259 aa  175  9e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.499183  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3563  hypothetical protein  39.39 
 
 		 284 aa  175  9.999999999999999e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2382  hypothetical protein  39.22 
 
 		 297 aa  174  1.9999999999999998e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0256369  normal  0.814662 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4038  hypothetical protein  37.13 
 
 		 281 aa  173  1.9999999999999998e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0579  hypothetical protein  43.58 
 
 		 257 aa  173  1.9999999999999998e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0365448  normal  0.281222 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4204  protein of unknown function DUF519  36.73 
 
 		 281 aa  173  2.9999999999999996e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4243  hypothetical protein  36.73 
 
 		 281 aa  173  2.9999999999999996e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4377  hypothetical protein  36.73 
 
 		 281 aa  173  2.9999999999999996e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1391  protein of unknown function DUF519  37.01 
 
 		 308 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.443033  hitchhiker  0.00435595 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2736  hypothetical protein  38.24 
 
 		 281 aa  172  5e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.855465  normal  0.779892 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2238  hypothetical protein  37.68 
 
 		 281 aa  172  5e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5863  hypothetical protein  37.68 
 
 		 281 aa  172  5e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>